MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halovivax ruber XH-70

Total Repeats: 2592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019964	CGAGT	2	10	277	286	20 %	20 %	40 %	20 %	433637029
2	NC_019964	GCGTC	2	10	1732	1741	0 %	20 %	40 %	40 %	433637029
3	NC_019964	TCGAC	2	10	3841	3850	20 %	20 %	20 %	40 %	433637031
4	NC_019964	TTTCC	2	10	4013	4022	0 %	60 %	0 %	40 %	433637031
5	NC_019964	ACGAG	2	10	4069	4078	40 %	0 %	40 %	20 %	433637031
6	NC_019964	GGTGG	2	10	5633	5642	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019964	ACTGG	2	10	6408	6417	20 %	20 %	40 %	20 %	433637032
8	NC_019964	GGCGA	2	10	7441	7450	20 %	0 %	60 %	20 %	433637034
9	NC_019964	CTCGA	2	10	9106	9115	20 %	20 %	20 %	40 %	433637036
10	NC_019964	CGACG	2	10	14819	14828	20 %	0 %	40 %	40 %	433637041
11	NC_019964	TTCGG	2	10	16187	16196	0 %	40 %	40 %	20 %	433637041
12	NC_019964	TCGTA	2	10	16367	16376	20 %	40 %	20 %	20 %	433637042
13	NC_019964	CGCGC	2	10	16503	16512	0 %	0 %	40 %	60 %	433637042
14	NC_019964	CGACG	2	10	17835	17844	20 %	0 %	40 %	40 %	433637045
15	NC_019964	TCGGC	2	10	18023	18032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019964	CGCGA	2	10	18751	18760	20 %	0 %	40 %	40 %	433637046
17	NC_019964	TATGA	2	10	19915	19924	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019964	GATGG	2	10	20366	20375	20 %	20 %	60 %	0 %	433637047
19	NC_019964	TGGAA	2	10	20508	20517	40 %	20 %	40 %	0 %	433637047
20	NC_019964	CGTTT	2	10	21645	21654	0 %	60 %	20 %	20 %	433637049
21	NC_019964	GTCGC	2	10	25738	25747	0 %	20 %	40 %	40 %	433637053
22	NC_019964	GATTG	2	10	28659	28668	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019964	TTATA	2	10	28800	28809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019964	CGATA	2	10	29100	29109	40 %	20 %	20 %	20 %	433637057
25	NC_019964	TCGAT	2	10	30912	30921	20 %	40 %	20 %	20 %	433637059
26	NC_019964	CACCG	2	10	32720	32729	20 %	0 %	20 %	60 %	433637061
27	NC_019964	GCCGG	2	10	35200	35209	0 %	0 %	60 %	40 %	433637065
28	NC_019964	CCGCC	2	10	35468	35477	0 %	0 %	20 %	80 %	433637065
29	NC_019964	ACTCC	2	10	35653	35662	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_019964	ATCCA	2	10	38829	38838	40 %	20 %	0 %	40 %	433637069
31	NC_019964	CGGAA	2	10	42069	42078	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019964	CCCAA	2	10	46062	46071	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_019964	GGGCG	2	10	46996	47005	0 %	0 %	80 %	20 %	433637078
34	NC_019964	CCGGC	2	10	47259	47268	0 %	0 %	40 %	60 %	433637078
35	NC_019964	CGGCG	2	10	47413	47422	0 %	0 %	60 %	40 %	433637078
36	NC_019964	AGGGA	2	10	47823	47832	40 %	0 %	60 %	0 %	433637078
37	NC_019964	CGCCC	2	10	55327	55336	0 %	0 %	20 %	80 %	433637087
38	NC_019964	GCCGA	2	10	55849	55858	20 %	0 %	40 %	40 %	433637087
39	NC_019964	AACGA	2	10	58456	58465	60 %	0 %	20 %	20 %	433637089
40	NC_019964	GTCGA	2	10	60448	60457	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019964	AGCCG	2	10	61006	61015	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_019964	ACGCG	2	10	61488	61497	20 %	0 %	40 %	40 %	433637092
43	NC_019964	CTCGA	2	10	61547	61556	20 %	20 %	20 %	40 %	433637092
44	NC_019964	GACGC	2	10	61826	61835	20 %	0 %	40 %	40 %	433637092
45	NC_019964	CGAGC	2	10	61864	61873	20 %	0 %	40 %	40 %	433637092
46	NC_019964	CGGAT	2	10	64481	64490	20 %	20 %	40 %	20 %	433637094
47	NC_019964	GCGCC	2	10	65164	65173	0 %	0 %	40 %	60 %	433637095
48	NC_019964	GCCAC	2	10	66316	66325	20 %	0 %	20 %	60 %	433637095
49	NC_019964	CTCGC	2	10	67267	67276	0 %	20 %	20 %	60 %	433637096
50	NC_019964	GGACG	2	10	70183	70192	20 %	0 %	60 %	20 %	433637098
51	NC_019964	GGCGA	2	10	71006	71015	20 %	0 %	60 %	20 %	433637098
52	NC_019964	CCGAG	2	10	74478	74487	20 %	0 %	40 %	40 %	433637102
53	NC_019964	TCGAC	2	10	81732	81741	20 %	20 %	20 %	40 %	433637113
54	NC_019964	TGCGG	2	10	82053	82062	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_019964	CGATG	2	10	84670	84679	20 %	20 %	40 %	20 %	433637116
56	NC_019964	CGGCT	2	10	88563	88572	0 %	20 %	40 %	40 %	433637119
57	NC_019964	TCGGC	2	10	90253	90262	0 %	20 %	40 %	40 %	433637122
58	NC_019964	TTCGA	2	10	91034	91043	20 %	40 %	20 %	20 %	433637122
59	NC_019964	CGCTC	2	10	91286	91295	0 %	20 %	20 %	60 %	433637122
60	NC_019964	CGACG	2	10	92688	92697	20 %	0 %	40 %	40 %	433637124
61	NC_019964	CGTCG	2	10	92782	92791	0 %	20 %	40 %	40 %	433637124
62	NC_019964	GTCGA	2	10	104217	104226	20 %	20 %	40 %	20 %	433637134
63	NC_019964	TCGTT	2	10	104397	104406	0 %	60 %	20 %	20 %	433637134
64	NC_019964	AGCGA	2	10	104412	104421	40 %	0 %	40 %	20 %	433637134
65	NC_019964	GTCGA	2	10	107022	107031	20 %	20 %	40 %	20 %	433637137
66	NC_019964	CCGCG	2	10	107044	107053	0 %	0 %	40 %	60 %	433637137
67	NC_019964	CGATC	2	10	110735	110744	20 %	20 %	20 %	40 %	433637142
68	NC_019964	CGAGC	2	10	112166	112175	20 %	0 %	40 %	40 %	433637143
69	NC_019964	GGCCG	2	10	114185	114194	0 %	0 %	60 %	40 %	433637144
70	NC_019964	CCGAC	2	10	114411	114420	20 %	0 %	20 %	60 %	433637144
71	NC_019964	ACCGA	2	10	115597	115606	40 %	0 %	20 %	40 %	433637145
72	NC_019964	CGCTG	2	10	117418	117427	0 %	20 %	40 %	40 %	433637147
73	NC_019964	CCAGC	2	10	117797	117806	20 %	0 %	20 %	60 %	433637147
74	NC_019964	CCGTC	2	10	117891	117900	0 %	20 %	20 %	60 %	433637147
75	NC_019964	GCTCG	2	10	118441	118450	0 %	20 %	40 %	40 %	433637147
76	NC_019964	CGGCC	2	10	121552	121561	0 %	0 %	40 %	60 %	433637151
77	NC_019964	CGTCC	2	10	121817	121826	0 %	20 %	20 %	60 %	433637151
78	NC_019964	CGGCG	2	10	122162	122171	0 %	0 %	60 %	40 %	433637151
79	NC_019964	TCCGG	2	10	122725	122734	0 %	20 %	40 %	40 %	433637152
80	NC_019964	CGAGT	2	10	124237	124246	20 %	20 %	40 %	20 %	433637153
81	NC_019964	GACTC	2	10	125953	125962	20 %	20 %	20 %	40 %	433637154
82	NC_019964	GGGTC	2	10	126050	126059	0 %	20 %	60 %	20 %	433637154
83	NC_019964	GGACT	2	10	127716	127725	20 %	20 %	40 %	20 %	433637154
84	NC_019964	GGCAG	2	10	128305	128314	20 %	0 %	60 %	20 %	433637154
85	NC_019964	CCCGC	2	10	128355	128364	0 %	0 %	20 %	80 %	433637154
86	NC_019964	TGCGA	2	10	128800	128809	20 %	20 %	40 %	20 %	433637154
87	NC_019964	ACGCG	2	10	130130	130139	20 %	0 %	40 %	40 %	433637156
88	NC_019964	CGGTT	2	10	130145	130154	0 %	40 %	40 %	20 %	433637156
89	NC_019964	ACGAG	2	10	130368	130377	40 %	0 %	40 %	20 %	433637156
90	NC_019964	CGGAT	2	10	132469	132478	20 %	20 %	40 %	20 %	433637160
91	NC_019964	CGGGA	2	10	134427	134436	20 %	0 %	60 %	20 %	433637160
92	NC_019964	GCACC	2	10	135326	135335	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_019964	CGGGA	2	10	136142	136151	20 %	0 %	60 %	20 %	433637161
94	NC_019964	CGATC	2	10	136848	136857	20 %	20 %	20 %	40 %	433637161
95	NC_019964	GGGTG	2	10	137310	137319	0 %	20 %	80 %	0 %	433637161
96	NC_019964	TGGCG	2	10	138253	138262	0 %	20 %	60 %	20 %	433637162
97	NC_019964	GATGA	2	10	141935	141944	40 %	20 %	40 %	0 %	433637165
98	NC_019964	TCGAT	2	10	142668	142677	20 %	40 %	20 %	20 %	433637165
99	NC_019964	TGCGG	2	10	144199	144208	0 %	20 %	60 %	20 %	433637166
100	NC_019964	AGCGT	2	10	144793	144802	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019964	CTTCT	2	10	146823	146832	0 %	60 %	0 %	40 %	433637168
102	NC_019964	TCGTG	2	10	149430	149439	0 %	40 %	40 %	20 %	433637170
103	NC_019964	GACCG	2	10	150222	150231	20 %	0 %	40 %	40 %	433637171
104	NC_019964	GACCG	2	10	150915	150924	20 %	0 %	40 %	40 %	433637171
105	NC_019964	CGATC	2	10	151487	151496	20 %	20 %	20 %	40 %	433637172
106	NC_019964	CGTCG	2	10	154686	154695	0 %	20 %	40 %	40 %	433637174
107	NC_019964	CCATC	2	10	155505	155514	20 %	20 %	0 %	60 %	433637175
108	NC_019964	CGATC	2	10	159509	159518	20 %	20 %	20 %	40 %	433637176
109	NC_019964	TCGAC	2	10	162178	162187	20 %	20 %	20 %	40 %	433637176
110	NC_019964	GTGAC	2	10	163969	163978	20 %	20 %	40 %	20 %	433637176
111	NC_019964	GACGA	2	10	164187	164196	40 %	0 %	40 %	20 %	433637176
112	NC_019964	TCGGC	2	10	166277	166286	0 %	20 %	40 %	40 %	433637176
113	NC_019964	CGATC	2	10	170103	170112	20 %	20 %	20 %	40 %	433637178
114	NC_019964	GCCCG	2	10	171168	171177	0 %	0 %	40 %	60 %	433637178
115	NC_019964	GTCCG	2	10	171338	171347	0 %	20 %	40 %	40 %	433637178
116	NC_019964	TCGGT	2	10	171401	171410	0 %	40 %	40 %	20 %	433637178
117	NC_019964	GACTC	2	10	172485	172494	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_019964	CAGCA	2	10	172601	172610	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_019964	CCACG	2	10	173380	173389	20 %	0 %	20 %	60 %	433637179
120	NC_019964	GGTCG	2	10	174289	174298	0 %	20 %	60 %	20 %	433637180
121	NC_019964	TGGCG	2	10	175394	175403	0 %	20 %	60 %	20 %	433637180
122	NC_019964	GGCGC	2	10	177432	177441	0 %	0 %	60 %	40 %	433637182
123	NC_019964	GCCGA	2	10	179647	179656	20 %	0 %	40 %	40 %	433637186
124	NC_019964	CGTCG	2	10	181083	181092	0 %	20 %	40 %	40 %	433637186
125	NC_019964	TCTCG	2	10	181145	181154	0 %	40 %	20 %	40 %	433637186
126	NC_019964	CTCGT	2	10	182533	182542	0 %	40 %	20 %	40 %	433637187
127	NC_019964	CGCGA	2	10	183306	183315	20 %	0 %	40 %	40 %	433637188
128	NC_019964	GCGCC	2	10	185226	185235	0 %	0 %	40 %	60 %	433637190
129	NC_019964	CGCGT	2	10	185974	185983	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_019964	CGGGA	2	10	186073	186082	20 %	0 %	60 %	20 %	433637191
131	NC_019964	GCCGC	2	10	189320	189329	0 %	0 %	40 %	60 %	433637193
132	NC_019964	GTCGA	2	10	190443	190452	20 %	20 %	40 %	20 %	433637194
133	NC_019964	ACGCC	2	10	190867	190876	20 %	0 %	20 %	60 %	433637194
134	NC_019964	TCGAC	2	10	191543	191552	20 %	20 %	20 %	40 %	433637195
135	NC_019964	CGACG	2	10	191589	191598	20 %	0 %	40 %	40 %	433637195
136	NC_019964	GGGCA	2	10	191728	191737	20 %	0 %	60 %	20 %	433637195
137	NC_019964	CGGCG	2	10	192099	192108	0 %	0 %	60 %	40 %	433637195
138	NC_019964	CGAAT	2	10	192489	192498	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019964	GGTCA	2	10	195094	195103	20 %	20 %	40 %	20 %	433637197
140	NC_019964	AATTC	2	10	195435	195444	40 %	40 %	0 %	20 %	433637197
141	NC_019964	GCTTC	2	10	195621	195630	0 %	40 %	20 %	40 %	433637197
142	NC_019964	GGTCC	2	10	196950	196959	0 %	20 %	40 %	40 %	433637200
143	NC_019964	TCGCC	2	10	197604	197613	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_019964	GGATC	2	10	197929	197938	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019964	CTGTG	2	10	199080	199089	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019964	TCCGA	2	10	200172	200181	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_019964	GCTCG	2	10	200213	200222	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_019964	TGTAG	2	10	200532	200541	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019964	GAGCG	2	10	203794	203803	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
150	NC_019964	GGAGC	2	10	203905	203914	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
151	NC_019964	GCTCG	2	10	204000	204009	0 %	20 %	40 %	40 %	433637201
152	NC_019964	CGTTC	2	10	204687	204696	0 %	40 %	20 %	40 %	433637201
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154	NC_019964	CGGTG	2	10	205413	205422	0 %	20 %	60 %	20 %	433637202
155	NC_019964	CGGGC	2	10	207188	207197	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
156	NC_019964	TCGCT	2	10	207225	207234	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
157	NC_019964	CGGGC	2	10	207301	207310	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
158	NC_019964	CTCGC	2	10	207341	207350	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
159	NC_019964	TCGCT	2	10	207455	207464	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_019964	CGGGC	2	10	207490	207499	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
161	NC_019964	GCCAG	2	10	210801	210810	20 %	0 %	40 %	40 %	433637207
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163	NC_019964	CTCGA	2	10	212970	212979	20 %	20 %	20 %	40 %	433637209
164	NC_019964	CGGCG	2	10	214322	214331	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
165	NC_019964	GGACG	2	10	215630	215639	20 %	0 %	60 %	20 %	433637211
166	NC_019964	CTCGA	2	10	215698	215707	20 %	20 %	20 %	40 %	433637211
167	NC_019964	GCGAC	2	10	219727	219736	20 %	0 %	40 %	40 %	433637214
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171	NC_019964	CTCGC	2	10	227504	227513	0 %	20 %	20 %	60 %	433637222
172	NC_019964	CGGCC	2	10	231611	231620	0 %	0 %	40 %	60 %	433637225
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176	NC_019964	TCCGA	2	10	235660	235669	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
177	NC_019964	TCGGA	2	10	237195	237204	20 %	20 %	40 %	20 %	433637230
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187	NC_019964	TCGAC	2	10	254046	254055	20 %	20 %	20 %	40 %	433637245
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196	NC_019964	ACGAG	2	10	263078	263087	40 %	0 %	40 %	20 %	433637250
197	NC_019964	CCGTG	2	10	266042	266051	0 %	20 %	40 %	40 %	433637254
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220	NC_019964	AGGCG	2	10	294697	294706	20 %	0 %	60 %	20 %	433637281
221	NC_019964	CGGCT	2	10	295489	295498	0 %	20 %	40 %	40 %	433637282
222	NC_019964	ACTAT	2	10	297281	297290	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
223	NC_019964	TCCAT	2	10	297345	297354	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
224	NC_019964	CGTCG	2	10	299689	299698	0 %	20 %	40 %	40 %	433637285
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226	NC_019964	CGACC	2	10	300922	300931	20 %	0 %	20 %	60 %	433637286
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232	NC_019964	GTCGC	2	10	304026	304035	0 %	20 %	40 %	40 %	433637290
233	NC_019964	GATCG	2	10	305273	305282	20 %	20 %	40 %	20 %	433637291
234	NC_019964	TCGAT	2	10	306619	306628	20 %	40 %	20 %	20 %	433637292
235	NC_019964	TCACA	2	10	307782	307791	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
236	NC_019964	CGTCA	2	10	307990	307999	20 %	20 %	20 %	40 %	433637295
237	NC_019964	GCTCG	2	10	308073	308082	0 %	20 %	40 %	40 %	433637295
238	NC_019964	ACGAA	2	10	309159	309168	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
239	NC_019964	GTTCG	2	10	311093	311102	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
240	NC_019964	CGACC	2	10	311634	311643	20 %	0 %	20 %	60 %	433637299
241	NC_019964	CGGTC	2	10	311805	311814	0 %	20 %	40 %	40 %	433637299
242	NC_019964	CACGT	2	10	311894	311903	20 %	20 %	20 %	40 %	433637299
243	NC_019964	CCTGT	2	10	312210	312219	0 %	40 %	20 %	40 %	433637299
244	NC_019964	CCGGA	2	10	313887	313896	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
245	NC_019964	TCGCG	2	10	316529	316538	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
246	NC_019964	GTGTA	2	10	319417	319426	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
247	NC_019964	ATCGG	2	10	319669	319678	20 %	20 %	40 %	20 %	433637308
248	NC_019964	GTGTT	2	10	319749	319758	0 %	60 %	40 %	0 %	433637308
249	NC_019964	CCTGC	2	10	320335	320344	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
250	NC_019964	ATCGA	2	10	320726	320735	40 %	20 %	20 %	20 %	433637310
251	NC_019964	CCGCT	2	10	323288	323297	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
252	NC_019964	GCCGA	2	10	323612	323621	20 %	0 %	40 %	40 %	433637312
253	NC_019964	CCGCC	2	10	324525	324534	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
254	NC_019964	GACGG	2	10	324589	324598	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
255	NC_019964	TCGCG	2	10	324686	324695	0 %	20 %	40 %	40 %	433637313
256	NC_019964	TCGAC	2	10	325710	325719	20 %	20 %	20 %	40 %	433637313
257	NC_019964	GGTCG	2	10	326151	326160	0 %	20 %	60 %	20 %	433637314
258	NC_019964	AAGCC	2	10	328531	328540	40 %	0 %	20 %	40 %	433637316
259	NC_019964	CCGCC	2	10	328736	328745	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
260	NC_019964	CGTCT	2	10	330034	330043	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
261	NC_019964	CGTCG	2	10	330712	330721	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_019964	CGGTG	2	10	330733	330742	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
263	NC_019964	CTCGC	2	10	331820	331829	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
264	NC_019964	CCGGG	2	10	332600	332609	0 %	0 %	60 %	40 %	433637319
265	NC_019964	GCGTC	2	10	332973	332982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
266	NC_019964	CGACG	2	10	335620	335629	20 %	0 %	40 %	40 %	433637322
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268	NC_019964	TGGCG	2	10	340049	340058	0 %	20 %	60 %	20 %	433637327
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