MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halovivax ruber XH-70

Total Repeats: 55108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019964	GAC	2	6	188	193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
2	NC_019964	GAG	2	6	254	259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637029
3	NC_019964	CGA	2	6	298	303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
4	NC_019964	GTG	2	6	312	317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637029
5	NC_019964	CGT	2	6	351	356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
6	NC_019964	CAA	2	6	394	399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637029
7	NC_019964	CGA	2	6	405	410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
8	NC_019964	TCG	2	6	524	529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
9	NC_019964	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637029
10	NC_019964	CGA	2	6	643	648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
11	NC_019964	ACG	2	6	696	701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
12	NC_019964	CGA	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
13	NC_019964	CGA	2	6	745	750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
14	NC_019964	CGG	2	6	768	773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637029
15	NC_019964	GAC	2	6	812	817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
16	NC_019964	CGA	2	6	823	828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
17	NC_019964	AGG	2	6	879	884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637029
18	NC_019964	GAC	2	6	908	913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
19	NC_019964	CGG	2	6	919	924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637029
20	NC_019964	CGA	2	6	949	954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
21	NC_019964	GAC	2	6	1034	1039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
22	NC_019964	GAA	2	6	1052	1057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637029
23	NC_019964	TCT	2	6	1098	1103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433637029
24	NC_019964	ACT	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637029
25	NC_019964	TCG	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
26	NC_019964	AGA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637029
27	NC_019964	GCG	2	6	1176	1181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637029
28	NC_019964	GAA	2	6	1310	1315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637029
29	NC_019964	ACG	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
30	NC_019964	GCG	2	6	1427	1432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637029
31	NC_019964	CGC	2	6	1435	1440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637029
32	NC_019964	TCG	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
33	NC_019964	CGT	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
34	NC_019964	GTC	2	6	1583	1588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
35	NC_019964	ATC	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637029
36	NC_019964	ACA	2	6	1680	1685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637029
37	NC_019964	TCA	2	6	1749	1754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637029
38	NC_019964	CGT	3	9	1786	1794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
39	NC_019964	TCC	2	6	1863	1868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637029
40	NC_019964	CGA	2	6	1894	1899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
41	NC_019964	CGC	2	6	2217	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637030
42	NC_019964	CCG	3	9	2235	2243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637030
43	NC_019964	GCG	2	6	2247	2252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637030
44	NC_019964	TGC	2	6	2258	2263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
45	NC_019964	CGT	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
46	NC_019964	GAC	2	6	2369	2374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637030
47	NC_019964	CGT	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
48	NC_019964	GCC	2	6	2588	2593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637030
49	NC_019964	GAT	2	6	2603	2608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637030
50	NC_019964	CGA	2	6	2698	2703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637030
51	NC_019964	CGA	3	9	2716	2724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637030
52	NC_019964	TGC	2	6	2758	2763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
53	NC_019964	CCA	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433637030
54	NC_019964	CGG	2	6	2783	2788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637030
55	NC_019964	GAC	2	6	2867	2872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637030
56	NC_019964	CGT	2	6	2911	2916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
57	NC_019964	TCG	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
58	NC_019964	CGT	3	9	3037	3045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
59	NC_019964	CGA	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637030
60	NC_019964	GCT	2	6	3427	3432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
61	NC_019964	GGC	2	6	3700	3705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637031
62	NC_019964	ACC	2	6	3882	3887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433637031
63	NC_019964	CGG	2	6	3916	3921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637031
64	NC_019964	GAT	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637031
65	NC_019964	TGA	2	6	4026	4031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637031
66	NC_019964	TCG	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
67	NC_019964	CGA	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637031
68	NC_019964	TCG	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
69	NC_019964	CCG	2	6	4176	4181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637031
70	NC_019964	GAG	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637031
71	NC_019964	CAT	2	6	4369	4374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637031
72	NC_019964	TGA	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637031
73	NC_019964	ACG	2	6	4461	4466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637031
74	NC_019964	GAG	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637031
75	NC_019964	CGA	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637031
76	NC_019964	ACG	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637031
77	NC_019964	GCT	2	6	4678	4683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
78	NC_019964	CGG	2	6	4711	4716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637031
79	NC_019964	ACG	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637031
80	NC_019964	GCT	2	6	4845	4850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
81	NC_019964	AGA	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637031
82	NC_019964	TCG	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
83	NC_019964	CGA	2	6	6328	6333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
84	NC_019964	GAC	2	6	6379	6384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
85	NC_019964	TCG	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637032
86	NC_019964	ACG	2	6	6542	6547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
87	NC_019964	GAG	2	6	6560	6565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637032
88	NC_019964	CGA	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
89	NC_019964	GAC	2	6	6587	6592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
90	NC_019964	GGA	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637032
91	NC_019964	ATC	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637032
92	NC_019964	CGA	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
93	NC_019964	GCA	2	6	6823	6828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
94	NC_019964	ACA	2	6	6861	6866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637032
95	NC_019964	ACA	2	6	6882	6887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637032
96	NC_019964	GAC	2	6	6932	6937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637033
97	NC_019964	ACG	2	6	7029	7034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637033
98	NC_019964	CGA	2	6	7069	7074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637033
99	NC_019964	TCG	2	6	7172	7177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637033
100	NC_019964	TCG	2	6	7191	7196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637033
101	NC_019964	GCG	2	6	7197	7202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637033
102	NC_019964	CTC	2	6	7204	7209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637033
103	NC_019964	CAA	2	6	7386	7391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637034
104	NC_019964	CGA	2	6	7479	7484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637034
105	NC_019964	CGT	2	6	7487	7492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637034
106	NC_019964	CTG	2	6	7493	7498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637034
107	NC_019964	GAC	2	6	7651	7656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637034
108	NC_019964	GAC	2	6	7681	7686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637034
109	NC_019964	CGT	2	6	7710	7715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637034
110	NC_019964	CGA	2	6	7722	7727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637034
111	NC_019964	CAC	3	9	7737	7745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433637034
112	NC_019964	CGA	2	6	7781	7786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637034
113	NC_019964	CGT	2	6	7845	7850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637034
114	NC_019964	CAG	2	6	7906	7911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637034
115	NC_019964	GAA	2	6	7978	7983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637034
116	NC_019964	TCA	2	6	8018	8023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637034
117	NC_019964	GTC	2	6	8497	8502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637035
118	NC_019964	TCG	2	6	8513	8518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637035
119	NC_019964	CTG	2	6	8530	8535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637035
120	NC_019964	CCG	2	6	8562	8567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637036
121	NC_019964	GCG	2	6	8616	8621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637036
122	NC_019964	GCC	2	6	8639	8644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637036
123	NC_019964	TCG	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637036
124	NC_019964	CCG	2	6	8715	8720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637036
125	NC_019964	ACG	2	6	8754	8759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637036
126	NC_019964	CGT	2	6	8789	8794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637036
127	NC_019964	GAC	2	6	8807	8812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637036
128	NC_019964	CCG	2	6	8814	8819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637036
129	NC_019964	TCG	2	6	8863	8868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637036
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247	NC_019964	CGC	2	6	16455	16460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637042
248	NC_019964	GAC	2	6	16464	16469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637042
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250	NC_019964	GAA	2	6	16533	16538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637042
251	NC_019964	CGA	2	6	16556	16561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637042
252	NC_019964	GTC	2	6	16776	16781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637043
253	NC_019964	GGT	2	6	16785	16790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637043
254	NC_019964	CGA	2	6	16815	16820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637043
255	NC_019964	TCG	2	6	16862	16867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637043
256	NC_019964	GAC	2	6	16870	16875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637043
257	NC_019964	TGA	2	6	16964	16969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637043
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259	NC_019964	CGA	2	6	16994	16999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637043
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271	NC_019964	CGA	2	6	17714	17719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637045
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281	NC_019964	GTC	2	6	18296	18301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637046
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373	NC_019964	CGG	2	6	22748	22753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637050
374	NC_019964	GGC	2	6	22872	22877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637050
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495	NC_019964	ACG	2	6	30942	30947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637059
496	NC_019964	CGC	2	6	31050	31055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637059
497	NC_019964	GTG	2	6	31104	31109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637059
498	NC_019964	ACG	2	6	31131	31136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637059
499	NC_019964	CGT	2	6	31156	31161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637059
500	NC_019964	CGA	2	6	31183	31188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637059

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