MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE02

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019963	ATCA	2	8	3	10	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019963	ACTG	2	8	6032	6039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019963	TCCG	2	8	9454	9461	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019963	AGGG	2	8	9488	9495	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019963	CAAC	2	8	17155	17162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019963	CCAC	2	8	17490	17497	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_019963	GACA	2	8	17507	17514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019963	TGAT	2	8	18093	18100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019963	ATCA	2	8	26628	26635	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019963	TAGG	2	8	27834	27841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019963	TCGC	2	8	29617	29624	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019963	ACCA	2	8	31332	31339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019963	TCAC	2	8	32123	32130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019963	GTCG	2	8	32258	32265	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019963	GCCG	2	8	32458	32465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019963	GGAG	2	8	32469	32476	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019963	AAAG	2	8	32528	32535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019963	GCCG	2	8	34341	34348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019963	CCAT	2	8	34380	34387	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019963	CTCG	2	8	34513	34520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019963	ACGG	2	8	34559	34566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019963	ATGG	2	8	34625	34632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019963	GCCG	2	8	36094	36101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019963	TTCG	2	8	37861	37868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019963	CACT	2	8	40669	40676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019963	CGAT	2	8	54724	54731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019963	CGAC	2	8	62425	62432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019963	TAGT	2	8	63988	63995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019963	GCCG	2	8	72230	72237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019963	TGTC	2	8	72565	72572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019963	TATT	2	8	74168	74175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019963	GACC	2	8	74745	74752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019963	CAGA	2	8	76397	76404	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019963	GATA	2	8	76867	76874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019963	CATT	2	8	78461	78468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019963	GATT	2	8	85282	85289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019963	TCGA	2	8	85725	85732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019963	GCTG	2	8	88943	88950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019963	TCGG	2	8	90415	90422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019963	CAGT	2	8	90469	90476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019963	AGAA	2	8	90913	90920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019963	CAGT	2	8	96840	96847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019963	TTCT	2	8	101422	101429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019963	ACCG	2	8	101618	101625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019963	CGGA	2	8	101683	101690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019963	CCTG	2	8	102849	102856	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019963	ATCA	2	8	103172	103179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019963	GACC	2	8	108073	108080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019963	GGCA	2	8	108232	108239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019963	GCGA	2	8	108342	108349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019963	GCGA	2	8	108513	108520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019963	GACG	2	8	108548	108555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019963	TCGC	2	8	109321	109328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019963	AACC	2	8	110145	110152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019963	CTCC	2	8	111852	111859	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_019963	AGTT	2	8	111922	111929	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019963	CTGT	2	8	112522	112529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019963	GCCG	2	8	113927	113934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019963	TAGA	2	8	116007	116014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019963	GTTC	2	8	118518	118525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019963	GACT	2	8	125370	125377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019963	GTCT	2	8	131602	131609	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019963	GCCT	2	8	131673	131680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019963	TCGT	2	8	132160	132167	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019963	GTGG	2	8	132216	132223	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019963	TCCA	2	8	132231	132238	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019963	TCGG	2	8	134418	134425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019963	CCTC	2	8	134441	134448	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_019963	GAAG	2	8	136609	136616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019963	CGTT	2	8	136776	136783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019963	GACC	2	8	137044	137051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019963	ACCG	2	8	143433	143440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019963	GGAT	2	8	144409	144416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019963	GTTA	2	8	146078	146085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019963	TAGA	2	8	146112	146119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019963	AGCG	2	8	146593	146600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019963	CGGT	2	8	147480	147487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019963	GCCC	2	8	147512	147519	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_019963	ACCG	2	8	147746	147753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019963	CCAC	2	8	148254	148261	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_019963	GGCT	2	8	155786	155793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019963	CGGT	2	8	155988	155995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019963	TTCA	2	8	159011	159018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019963	GAAA	2	8	164582	164589	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019963	AGCG	2	8	165739	165746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019963	GGTC	2	8	167939	167946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019963	GCGA	2	8	167947	167954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019963	GTAC	2	8	167989	167996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019963	GGGT	2	8	174000	174007	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019963	CGGG	2	8	174055	174062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019963	TCAC	2	8	175074	175081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019963	TGGG	2	8	175098	175105	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019963	GCTG	2	8	175235	175242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019963	TCCC	2	8	175938	175945	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_019963	ATCC	2	8	176737	176744	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019963	CTTT	2	8	176833	176840	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019963	ACCG	2	8	180332	180339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019963	ACTC	2	8	180380	180387	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019963	CGGC	2	8	180672	180679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019963	GTAG	2	8	180837	180844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019963	CTTG	2	8	181184	181191	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019963	CAGT	2	8	181387	181394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019963	TCGC	2	8	183643	183650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019963	GCGA	2	8	183675	183682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019963	CGTC	2	8	183764	183771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019963	GAGC	2	8	183772	183779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019963	GCCC	2	8	183857	183864	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_019963	GCAG	3	12	183871	183882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019963	GGTC	2	8	183891	183898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019963	GCGA	2	8	183899	183906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019963	TGTT	2	8	184988	184995	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019963	GAGG	2	8	185112	185119	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019963	GAAA	2	8	185488	185495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019963	GCGA	2	8	197948	197955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019963	GGTC	2	8	201473	201480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019963	GACC	2	8	206122	206129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019963	GGAG	2	8	209661	209668	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019963	GACA	2	8	209767	209774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019963	TCGC	2	8	213996	214003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019963	GACC	2	8	218745	218752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019963	GAAA	2	8	218811	218818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019963	GGCT	2	8	218923	218930	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019963	CCCG	2	8	218967	218974	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_019963	ACGT	2	8	219112	219119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019963	ATCG	2	8	220874	220881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019963	TCTG	2	8	221116	221123	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019963	CAGA	2	8	221896	221903	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019963	ACCG	2	8	227377	227384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019963	GGAG	2	8	227534	227541	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019963	GATG	2	8	234179	234186	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019963	AGTG	2	8	236900	236907	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019963	GTGA	2	8	237193	237200	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019963	GAAC	2	8	237228	237235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019963	GACT	2	8	237633	237640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019963	CGGA	2	8	238858	238865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019963	GTTC	2	8	238874	238881	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019963	GTTG	2	8	247436	247443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019963	CTAA	2	8	256546	256553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019963	GACT	2	8	257308	257315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019963	TGAC	2	8	259934	259941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019963	CATC	2	8	268090	268097	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019963	GCAG	2	8	268188	268195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019963	CCTC	2	8	270058	270065	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_019963	CGCC	2	8	270286	270293	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145	NC_019963	CGAG	2	8	270483	270490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019963	CTCG	2	8	270616	270623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019963	CCGG	2	8	271371	271378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.