MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE02

Total Repeats: 413

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019963	CA	3	6	76	81	50 %	0 %	0 %	50 %	433593058
2	NC_019963	AG	3	6	1755	1760	50 %	0 %	50 %	0 %	433593059
3	NC_019963	TA	3	6	2320	2325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019963	CT	3	6	2445	2450	0 %	50 %	0 %	50 %	433593061
5	NC_019963	CA	3	6	3036	3041	50 %	0 %	0 %	50 %	433593061
6	NC_019963	TC	3	6	4018	4023	0 %	50 %	0 %	50 %	433593062
7	NC_019963	CG	3	6	5260	5265	0 %	0 %	50 %	50 %	433593064
8	NC_019963	CT	3	6	6168	6173	0 %	50 %	0 %	50 %	433593065
9	NC_019963	CG	3	6	6848	6853	0 %	0 %	50 %	50 %	433593065
10	NC_019963	GC	3	6	8029	8034	0 %	0 %	50 %	50 %	433593067
11	NC_019963	AC	3	6	11677	11682	50 %	0 %	0 %	50 %	433593072
12	NC_019963	CT	3	6	11795	11800	0 %	50 %	0 %	50 %	433593072
13	NC_019963	AT	3	6	12296	12301	50 %	50 %	0 %	0 %	433593073
14	NC_019963	GC	4	8	13024	13031	0 %	0 %	50 %	50 %	433593073
15	NC_019963	CG	3	6	14201	14206	0 %	0 %	50 %	50 %	433593075
16	NC_019963	CG	3	6	15259	15264	0 %	0 %	50 %	50 %	433593076
17	NC_019963	CA	3	6	16709	16714	50 %	0 %	0 %	50 %	433593079
18	NC_019963	CT	3	6	18124	18129	0 %	50 %	0 %	50 %	433593083
19	NC_019963	GT	3	6	18463	18468	0 %	50 %	50 %	0 %	433593083
20	NC_019963	GT	4	8	18481	18488	0 %	50 %	50 %	0 %	433593083
21	NC_019963	TC	3	6	18826	18831	0 %	50 %	0 %	50 %	433593084
22	NC_019963	TG	3	6	18852	18857	0 %	50 %	50 %	0 %	433593084
23	NC_019963	AC	3	6	18874	18879	50 %	0 %	0 %	50 %	433593084
24	NC_019963	GT	3	6	21867	21872	0 %	50 %	50 %	0 %	433593088
25	NC_019963	CG	3	6	22588	22593	0 %	0 %	50 %	50 %	433593088
26	NC_019963	GC	3	6	24368	24373	0 %	0 %	50 %	50 %	433593091
27	NC_019963	TC	3	6	24386	24391	0 %	50 %	0 %	50 %	433593091
28	NC_019963	GC	3	6	25207	25212	0 %	0 %	50 %	50 %	433593092
29	NC_019963	GC	3	6	25499	25504	0 %	0 %	50 %	50 %	433593093
30	NC_019963	TG	3	6	25541	25546	0 %	50 %	50 %	0 %	433593093
31	NC_019963	CG	3	6	27012	27017	0 %	0 %	50 %	50 %	433593095
32	NC_019963	CT	3	6	27958	27963	0 %	50 %	0 %	50 %	433593096
33	NC_019963	AT	3	6	28181	28186	50 %	50 %	0 %	0 %	433593096
34	NC_019963	TC	3	6	28594	28599	0 %	50 %	0 %	50 %	433593096
35	NC_019963	GT	3	6	29473	29478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019963	GA	3	6	30118	30123	50 %	0 %	50 %	0 %	433593097
37	NC_019963	AG	3	6	30180	30185	50 %	0 %	50 %	0 %	433593097
38	NC_019963	AT	3	6	31419	31424	50 %	50 %	0 %	0 %	433593100
39	NC_019963	TC	3	6	33033	33038	0 %	50 %	0 %	50 %	433593101
40	NC_019963	GC	3	6	33516	33521	0 %	0 %	50 %	50 %	433593102
41	NC_019963	GC	3	6	33565	33570	0 %	0 %	50 %	50 %	433593102
42	NC_019963	CG	3	6	33595	33600	0 %	0 %	50 %	50 %	433593102
43	NC_019963	CG	3	6	33693	33698	0 %	0 %	50 %	50 %	433593102
44	NC_019963	GC	4	8	33709	33716	0 %	0 %	50 %	50 %	433593102
45	NC_019963	GC	3	6	35947	35952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019963	AT	3	6	36085	36090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019963	GC	3	6	36349	36354	0 %	0 %	50 %	50 %	433593106
48	NC_019963	GT	3	6	38556	38561	0 %	50 %	50 %	0 %	433593107
49	NC_019963	CA	3	6	38739	38744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019963	CT	3	6	41204	41209	0 %	50 %	0 %	50 %	433593110
51	NC_019963	GT	4	8	41399	41406	0 %	50 %	50 %	0 %	433593110
52	NC_019963	CG	3	6	41467	41472	0 %	0 %	50 %	50 %	433593110
53	NC_019963	GA	3	6	41862	41867	50 %	0 %	50 %	0 %	433593110
54	NC_019963	GA	3	6	42828	42833	50 %	0 %	50 %	0 %	433593110
55	NC_019963	CG	3	6	43176	43181	0 %	0 %	50 %	50 %	433593110
56	NC_019963	AG	3	6	43672	43677	50 %	0 %	50 %	0 %	433593110
57	NC_019963	CT	3	6	43980	43985	0 %	50 %	0 %	50 %	433593110
58	NC_019963	CG	3	6	44292	44297	0 %	0 %	50 %	50 %	433593111
59	NC_019963	TG	3	6	45121	45126	0 %	50 %	50 %	0 %	433593111
60	NC_019963	CG	3	6	45591	45596	0 %	0 %	50 %	50 %	433593112
61	NC_019963	TG	3	6	46397	46402	0 %	50 %	50 %	0 %	433593112
62	NC_019963	GA	3	6	47600	47605	50 %	0 %	50 %	0 %	433593112
63	NC_019963	GC	3	6	48030	48035	0 %	0 %	50 %	50 %	433593112
64	NC_019963	AG	3	6	50417	50422	50 %	0 %	50 %	0 %	433593114
65	NC_019963	AC	3	6	51867	51872	50 %	0 %	0 %	50 %	433593115
66	NC_019963	GC	3	6	52478	52483	0 %	0 %	50 %	50 %	433593116
67	NC_019963	AT	3	6	52484	52489	50 %	50 %	0 %	0 %	433593116
68	NC_019963	TG	3	6	53102	53107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019963	TG	3	6	53120	53125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019963	AT	3	6	53141	53146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019963	TA	3	6	53193	53198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019963	AC	3	6	54355	54360	50 %	0 %	0 %	50 %	433593119
73	NC_019963	AG	3	6	55217	55222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019963	CG	3	6	57833	57838	0 %	0 %	50 %	50 %	433593124
75	NC_019963	GC	3	6	57877	57882	0 %	0 %	50 %	50 %	433593124
76	NC_019963	GC	3	6	58434	58439	0 %	0 %	50 %	50 %	433593124
77	NC_019963	TG	3	6	58529	58534	0 %	50 %	50 %	0 %	433593124
78	NC_019963	CT	3	6	59465	59470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019963	AC	3	6	59770	59775	50 %	0 %	0 %	50 %	433593126
80	NC_019963	GA	3	6	59949	59954	50 %	0 %	50 %	0 %	433593126
81	NC_019963	GT	3	6	60389	60394	0 %	50 %	50 %	0 %	433593127
82	NC_019963	GC	3	6	61217	61222	0 %	0 %	50 %	50 %	433593129
83	NC_019963	AC	3	6	61550	61555	50 %	0 %	0 %	50 %	433593130
84	NC_019963	TC	3	6	63404	63409	0 %	50 %	0 %	50 %	433593132
85	NC_019963	AC	3	6	65071	65076	50 %	0 %	0 %	50 %	433593134
86	NC_019963	GC	3	6	66580	66585	0 %	0 %	50 %	50 %	433593137
87	NC_019963	GC	3	6	66640	66645	0 %	0 %	50 %	50 %	433593137
88	NC_019963	GC	3	6	66862	66867	0 %	0 %	50 %	50 %	433593137
89	NC_019963	GC	3	6	69363	69368	0 %	0 %	50 %	50 %	433593139
90	NC_019963	TC	3	6	71205	71210	0 %	50 %	0 %	50 %	433593141
91	NC_019963	GA	3	6	71225	71230	50 %	0 %	50 %	0 %	433593141
92	NC_019963	TC	3	6	72116	72121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019963	GA	3	6	72953	72958	50 %	0 %	50 %	0 %	433593142
94	NC_019963	GA	3	6	73217	73222	50 %	0 %	50 %	0 %	433593142
95	NC_019963	AG	4	8	74674	74681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019963	CT	3	6	75040	75045	0 %	50 %	0 %	50 %	433593144
97	NC_019963	CG	3	6	75476	75481	0 %	0 %	50 %	50 %	433593145
98	NC_019963	GA	3	6	78524	78529	50 %	0 %	50 %	0 %	433593148
99	NC_019963	CT	3	6	79055	79060	0 %	50 %	0 %	50 %	433593148
100	NC_019963	GA	3	6	80821	80826	50 %	0 %	50 %	0 %	433593149
101	NC_019963	CG	3	6	81046	81051	0 %	0 %	50 %	50 %	433593149
102	NC_019963	CG	3	6	81159	81164	0 %	0 %	50 %	50 %	433593149
103	NC_019963	GC	3	6	83054	83059	0 %	0 %	50 %	50 %	433593150
104	NC_019963	GC	3	6	83473	83478	0 %	0 %	50 %	50 %	433593151
105	NC_019963	AG	3	6	84304	84309	50 %	0 %	50 %	0 %	433593151
106	NC_019963	CA	3	6	84499	84504	50 %	0 %	0 %	50 %	433593151
107	NC_019963	TC	3	6	84514	84519	0 %	50 %	0 %	50 %	433593151
108	NC_019963	TG	3	6	85716	85721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019963	GC	3	6	85944	85949	0 %	0 %	50 %	50 %	433593153
110	NC_019963	CG	3	6	86272	86277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019963	CA	3	6	86332	86337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019963	AC	3	6	88120	88125	50 %	0 %	0 %	50 %	433593158
113	NC_019963	TC	3	6	88875	88880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019963	TC	3	6	88926	88931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019963	GA	3	6	89696	89701	50 %	0 %	50 %	0 %	433593159
116	NC_019963	AC	3	6	90515	90520	50 %	0 %	0 %	50 %	433593161
117	NC_019963	CT	3	6	91169	91174	0 %	50 %	0 %	50 %	433593162
118	NC_019963	AG	3	6	91330	91335	50 %	0 %	50 %	0 %	433593162
119	NC_019963	GT	3	6	91880	91885	0 %	50 %	50 %	0 %	433593163
120	NC_019963	GC	3	6	92060	92065	0 %	0 %	50 %	50 %	433593163
121	NC_019963	GT	3	6	92365	92370	0 %	50 %	50 %	0 %	433593163
122	NC_019963	CA	3	6	93247	93252	50 %	0 %	0 %	50 %	433593163
123	NC_019963	AC	3	6	93738	93743	50 %	0 %	0 %	50 %	433593163
124	NC_019963	TC	3	6	94514	94519	0 %	50 %	0 %	50 %	433593164
125	NC_019963	TC	3	6	95765	95770	0 %	50 %	0 %	50 %	433593164
126	NC_019963	GC	3	6	95820	95825	0 %	0 %	50 %	50 %	433593164
127	NC_019963	GA	3	6	97968	97973	50 %	0 %	50 %	0 %	433593166
128	NC_019963	CG	3	6	98967	98972	0 %	0 %	50 %	50 %	433593167
129	NC_019963	CG	3	6	100069	100074	0 %	0 %	50 %	50 %	433593167
130	NC_019963	CG	3	6	101199	101204	0 %	0 %	50 %	50 %	433593167
131	NC_019963	AG	5	10	101385	101394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019963	GA	3	6	102024	102029	50 %	0 %	50 %	0 %	433593169
133	NC_019963	AG	3	6	102437	102442	50 %	0 %	50 %	0 %	433593169
134	NC_019963	CT	3	6	102693	102698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019963	CA	3	6	104910	104915	50 %	0 %	0 %	50 %	433593171
136	NC_019963	TA	3	6	105261	105266	50 %	50 %	0 %	0 %	433593172
137	NC_019963	AG	4	8	105276	105283	50 %	0 %	50 %	0 %	433593172
138	NC_019963	GT	4	8	105737	105744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019963	TG	4	8	105956	105963	0 %	50 %	50 %	0 %	433593173
140	NC_019963	GT	4	8	106039	106046	0 %	50 %	50 %	0 %	433593173
141	NC_019963	GA	3	6	106048	106053	50 %	0 %	50 %	0 %	433593173
142	NC_019963	CA	3	6	107140	107145	50 %	0 %	0 %	50 %	433593174
143	NC_019963	CG	4	8	109133	109140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019963	GC	3	6	109555	109560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.