MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624

Total Repeats: 2947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019962	CGGAG	2	10	206	215	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019962	GATCA	2	10	1353	1362	40 %	20 %	20 %	20 %	433589360
3	NC_019962	CGAGA	2	10	1965	1974	40 %	0 %	40 %	20 %	433589360
4	NC_019962	TCCCG	2	10	5005	5014	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_019962	GATCG	2	10	6992	7001	20 %	20 %	40 %	20 %	433589364
6	NC_019962	ACCGG	2	10	7051	7060	20 %	0 %	40 %	40 %	433589364
7	NC_019962	CCGCG	2	10	7599	7608	0 %	0 %	40 %	60 %	433589365
8	NC_019962	CGACG	2	10	9213	9222	20 %	0 %	40 %	40 %	433589366
9	NC_019962	GGCGA	2	10	9337	9346	20 %	0 %	60 %	20 %	433589366
10	NC_019962	CGCGG	2	10	9931	9940	0 %	0 %	60 %	40 %	433589367
11	NC_019962	CGGCG	2	10	10680	10689	0 %	0 %	60 %	40 %	433589367
12	NC_019962	CGACG	2	10	11658	11667	20 %	0 %	40 %	40 %	433589369
13	NC_019962	GGCGA	2	10	15534	15543	20 %	0 %	60 %	20 %	433589373
14	NC_019962	ACACA	2	10	15739	15748	60 %	0 %	0 %	40 %	433589373
15	NC_019962	CGTCG	2	10	17970	17979	0 %	20 %	40 %	40 %	433589375
16	NC_019962	GGACC	2	10	18839	18848	20 %	0 %	40 %	40 %	433589376
17	NC_019962	CGTTC	2	10	21105	21114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_019962	GTCGC	2	10	22399	22408	0 %	20 %	40 %	40 %	433589379
19	NC_019962	CGGAC	2	10	22975	22984	20 %	0 %	40 %	40 %	433589380
20	NC_019962	GGCGA	2	10	24521	24530	20 %	0 %	60 %	20 %	433589381
21	NC_019962	GATCG	2	10	25553	25562	20 %	20 %	40 %	20 %	433589383
22	NC_019962	ATCGA	2	10	25758	25767	40 %	20 %	20 %	20 %	433589383
23	NC_019962	TTATT	2	10	29368	29377	20 %	80 %	0 %	0 %	433589387
24	NC_019962	GTCCC	2	10	31974	31983	0 %	20 %	20 %	60 %	433589390
25	NC_019962	CCGGG	2	10	32033	32042	0 %	0 %	60 %	40 %	433589390
26	NC_019962	TCGTC	2	10	35379	35388	0 %	40 %	20 %	40 %	433589394
27	NC_019962	AATGT	2	10	37008	37017	40 %	40 %	20 %	0 %	433589396
28	NC_019962	GGTGA	2	10	38622	38631	20 %	20 %	60 %	0 %	433589398
29	NC_019962	GTCGC	2	10	39069	39078	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019962	CCCGT	2	10	40334	40343	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_019962	GACGC	2	10	40640	40649	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_019962	CACAG	2	10	40705	40714	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019962	TAGTG	2	10	42173	42182	20 %	40 %	40 %	0 %	433589402
34	NC_019962	CCGAG	2	10	47889	47898	20 %	0 %	40 %	40 %	433589405
35	NC_019962	CGGCC	2	10	47948	47957	0 %	0 %	40 %	60 %	433589406
36	NC_019962	GACGG	2	10	48456	48465	20 %	0 %	60 %	20 %	433589406
37	NC_019962	CGGGA	2	10	50297	50306	20 %	0 %	60 %	20 %	433589409
38	NC_019962	CCGAT	2	10	51363	51372	20 %	20 %	20 %	40 %	433589411
39	NC_019962	CTCGT	2	10	53095	53104	0 %	40 %	20 %	40 %	433589413
40	NC_019962	CGGCC	2	10	53561	53570	0 %	0 %	40 %	60 %	433589414
41	NC_019962	CGTGG	2	10	55333	55342	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019962	GGCTG	2	10	56382	56391	0 %	20 %	60 %	20 %	433589416
43	NC_019962	CCGAA	2	10	56998	57007	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_019962	GAAGA	2	10	57295	57304	60 %	0 %	40 %	0 %	433589417
45	NC_019962	ACTCT	2	10	62049	62058	20 %	40 %	0 %	40 %	433589423
46	NC_019962	CGCCC	2	10	62141	62150	0 %	0 %	20 %	80 %	433589424
47	NC_019962	GCCGC	2	10	62630	62639	0 %	0 %	40 %	60 %	433589425
48	NC_019962	GGCGA	2	10	64254	64263	20 %	0 %	60 %	20 %	433589428
49	NC_019962	GCCGA	2	10	65777	65786	20 %	0 %	40 %	40 %	433589430
50	NC_019962	CGACC	2	10	67024	67033	20 %	0 %	20 %	60 %	433589430
51	NC_019962	GTCGA	2	10	68842	68851	20 %	20 %	40 %	20 %	433589431
52	NC_019962	GACCG	2	10	69616	69625	20 %	0 %	40 %	40 %	433589431
53	NC_019962	GACGC	2	10	69826	69835	20 %	0 %	40 %	40 %	433589431
54	NC_019962	GACGG	2	10	70402	70411	20 %	0 %	60 %	20 %	433589431
55	NC_019962	CGTCG	2	10	70690	70699	0 %	20 %	40 %	40 %	433589432
56	NC_019962	CCCGT	2	10	71577	71586	0 %	20 %	20 %	60 %	433589433
57	NC_019962	TTCCG	2	10	73205	73214	0 %	40 %	20 %	40 %	433589435
58	NC_019962	GGACG	2	10	73635	73644	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019962	ACGCG	2	10	74875	74884	20 %	0 %	40 %	40 %	433589436
60	NC_019962	TTCGT	2	10	78502	78511	0 %	60 %	20 %	20 %	433589442
61	NC_019962	GATCG	2	10	78751	78760	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019962	CGAGT	2	10	79913	79922	20 %	20 %	40 %	20 %	433589443
63	NC_019962	CCGGC	2	10	80181	80190	0 %	0 %	40 %	60 %	433589443
64	NC_019962	GGAAC	2	10	80663	80672	40 %	0 %	40 %	20 %	433589444
65	NC_019962	TCGCG	2	10	81013	81022	0 %	20 %	40 %	40 %	433589444
66	NC_019962	GTCCC	2	10	81764	81773	0 %	20 %	20 %	60 %	433589445
67	NC_019962	TTCGG	2	10	82887	82896	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019962	ACCAC	2	10	84218	84227	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_019962	TCCCG	2	10	84837	84846	0 %	20 %	20 %	60 %	433589448
70	NC_019962	TCATC	2	10	88056	88065	20 %	40 %	0 %	40 %	433589451
71	NC_019962	CTCGG	2	10	88397	88406	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_019962	CCGAC	2	10	88637	88646	20 %	0 %	20 %	60 %	433589452
73	NC_019962	GCGAC	2	10	89411	89420	20 %	0 %	40 %	40 %	433589453
74	NC_019962	TGTCG	2	10	91609	91618	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019962	CCGAC	2	10	95926	95935	20 %	0 %	20 %	60 %	433589457
76	NC_019962	TCGCG	2	10	98877	98886	0 %	20 %	40 %	40 %	433589460
77	NC_019962	CCCGG	2	10	102358	102367	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_019962	CGCAG	2	10	103074	103083	20 %	0 %	40 %	40 %	433589463
79	NC_019962	GGTCG	2	10	104858	104867	0 %	20 %	60 %	20 %	433589464
80	NC_019962	CTCGT	2	10	104889	104898	0 %	40 %	20 %	40 %	433589464
81	NC_019962	TCGAC	2	10	105945	105954	20 %	20 %	20 %	40 %	433589465
82	NC_019962	CGTTC	2	10	106271	106280	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_019962	TTCGC	2	10	106283	106292	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_019962	TCTCG	2	10	109312	109321	0 %	40 %	20 %	40 %	433589469
85	NC_019962	CTGGT	2	10	112321	112330	0 %	40 %	40 %	20 %	433589472
86	NC_019962	CGCTC	2	10	114381	114390	0 %	20 %	20 %	60 %	433589473
87	NC_019962	TCGCG	2	10	114770	114779	0 %	20 %	40 %	40 %	433589474
88	NC_019962	TCCGT	2	10	115269	115278	0 %	40 %	20 %	40 %	433589474
89	NC_019962	ACGAG	2	10	117286	117295	40 %	0 %	40 %	20 %	433589476
90	NC_019962	ACCGC	2	10	119543	119552	20 %	0 %	20 %	60 %	433589478
91	NC_019962	CTCGA	2	10	125139	125148	20 %	20 %	20 %	40 %	433589480
92	NC_019962	TCGGT	2	10	127489	127498	0 %	40 %	40 %	20 %	433589484
93	NC_019962	GCGCG	2	10	127503	127512	0 %	0 %	60 %	40 %	433589484
94	NC_019962	GGTGA	2	10	127520	127529	20 %	20 %	60 %	0 %	433589484
95	NC_019962	CGACG	2	10	127990	127999	20 %	0 %	40 %	40 %	433589485
96	NC_019962	GAACG	2	10	128017	128026	40 %	0 %	40 %	20 %	433589485
97	NC_019962	TCGAC	2	10	128878	128887	20 %	20 %	20 %	40 %	433589486
98	NC_019962	TGTCG	2	10	128900	128909	0 %	40 %	40 %	20 %	433589486
99	NC_019962	GCGCG	2	10	130796	130805	0 %	0 %	60 %	40 %	433589489
100	NC_019962	ATCGA	2	10	131472	131481	40 %	20 %	20 %	20 %	433589489
101	NC_019962	GCCGC	2	10	135317	135326	0 %	0 %	40 %	60 %	433589493
102	NC_019962	CCGGC	2	10	138454	138463	0 %	0 %	40 %	60 %	433589495
103	NC_019962	GTCGC	2	10	142087	142096	0 %	20 %	40 %	40 %	433589497
104	NC_019962	CCGGT	2	10	142980	142989	0 %	20 %	40 %	40 %	433589499
105	NC_019962	GCGCG	2	10	144814	144823	0 %	0 %	60 %	40 %	433589501
106	NC_019962	GGCGA	2	10	145155	145164	20 %	0 %	60 %	20 %	433589501
107	NC_019962	GCCCG	2	10	145395	145404	0 %	0 %	40 %	60 %	433589501
108	NC_019962	CCGAC	2	10	146401	146410	20 %	0 %	20 %	60 %	433589502
109	NC_019962	CGAGG	2	10	147124	147133	20 %	0 %	60 %	20 %	433589502
110	NC_019962	TCGTC	2	10	148033	148042	0 %	40 %	20 %	40 %	433589503
111	NC_019962	ACTCG	2	10	148912	148921	20 %	20 %	20 %	40 %	433589504
112	NC_019962	GCCGG	2	10	149112	149121	0 %	0 %	60 %	40 %	433589504
113	NC_019962	GGGGC	2	10	149401	149410	0 %	0 %	80 %	20 %	433589504
114	NC_019962	GACGT	2	10	150353	150362	20 %	20 %	40 %	20 %	433589506
115	NC_019962	CCGAC	2	10	150917	150926	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_019962	TGCGG	2	10	151640	151649	0 %	20 %	60 %	20 %	433589507
117	NC_019962	GGATC	2	10	152945	152954	20 %	20 %	40 %	20 %	433589507
118	NC_019962	GGAGC	2	10	153250	153259	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019962	CGCTC	2	10	153969	153978	0 %	20 %	20 %	60 %	433589509
120	NC_019962	GCCGC	2	10	154437	154446	0 %	0 %	40 %	60 %	433589510
121	NC_019962	CGAGG	2	10	157160	157169	20 %	0 %	60 %	20 %	433589512
122	NC_019962	TCGGC	2	10	157591	157600	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_019962	AGCCC	2	10	157766	157775	20 %	0 %	20 %	60 %	433589513
124	NC_019962	GCCGA	2	10	157876	157885	20 %	0 %	40 %	40 %	433589513
125	NC_019962	TCGAT	2	10	158380	158389	20 %	40 %	20 %	20 %	433589514
126	NC_019962	CTCGC	2	10	158699	158708	0 %	20 %	20 %	60 %	433589515
127	NC_019962	CCCGA	2	10	159912	159921	20 %	0 %	20 %	60 %	433589515
128	NC_019962	GACCG	2	10	161415	161424	20 %	0 %	40 %	40 %	433589517
129	NC_019962	CGCAG	2	10	162717	162726	20 %	0 %	40 %	40 %	433589519
130	NC_019962	ACCCG	2	10	163243	163252	20 %	0 %	20 %	60 %	433589519
131	NC_019962	GGCGA	2	10	167744	167753	20 %	0 %	60 %	20 %	433589524
132	NC_019962	CGAAC	2	10	168409	168418	40 %	0 %	20 %	40 %	433589525
133	NC_019962	CAGCG	2	10	170441	170450	20 %	0 %	40 %	40 %	433589527
134	NC_019962	TGACC	2	10	174957	174966	20 %	20 %	20 %	40 %	433589531
135	NC_019962	GGACG	2	10	176396	176405	20 %	0 %	60 %	20 %	433589532
136	NC_019962	TCGAC	2	10	176959	176968	20 %	20 %	20 %	40 %	433589532
137	NC_019962	TCGCT	2	10	180892	180901	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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252	NC_019962	ACGGT	2	10	328382	328391	20 %	20 %	40 %	20 %	433589678
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255	NC_019962	ACGAT	2	10	331762	331771	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
256	NC_019962	CGGCG	2	10	333253	333262	0 %	0 %	60 %	40 %	433589684
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261	NC_019962	TCTCG	2	10	336348	336357	0 %	40 %	20 %	40 %	433589686
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389	NC_019962	GTCGA	2	10	503016	503025	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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391	NC_019962	CGGAA	2	10	510146	510155	40 %	0 %	40 %	20 %	433589853
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393	NC_019962	CGGGC	2	10	514785	514794	0 %	0 %	60 %	40 %	433589857
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