MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624

Total Repeats: 65962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019962	GAC	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
2	NC_019962	CGA	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
3	NC_019962	GAT	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589360
4	NC_019962	GCG	2	6	1279	1284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589360
5	NC_019962	AGG	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589360
6	NC_019962	CGA	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
7	NC_019962	CGC	2	6	1385	1390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
8	NC_019962	CGA	2	6	1610	1615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
9	NC_019962	CGA	2	6	1622	1627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
10	NC_019962	CTG	2	6	1638	1643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
11	NC_019962	CGA	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
12	NC_019962	CGG	2	6	1864	1869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589360
13	NC_019962	GCC	2	6	1914	1919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
14	NC_019962	CGA	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
15	NC_019962	GAC	2	6	2001	2006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
16	NC_019962	TCT	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589360
17	NC_019962	ACG	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
18	NC_019962	GTC	3	9	2097	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
19	NC_019962	TCG	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
20	NC_019962	GAC	2	6	2148	2153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
21	NC_019962	ATC	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589360
22	NC_019962	ACG	2	6	2302	2307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
23	NC_019962	CGC	2	6	2402	2407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
24	NC_019962	CTG	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
25	NC_019962	CCG	2	6	2452	2457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
26	NC_019962	TCG	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
27	NC_019962	GTC	2	6	2541	2546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
28	NC_019962	GTC	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
29	NC_019962	ATC	2	6	2595	2600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589360
30	NC_019962	GAG	2	6	2670	2675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589360
31	NC_019962	TCA	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589360
32	NC_019962	CGT	3	9	2753	2761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
33	NC_019962	GAG	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589360
34	NC_019962	TCC	2	6	2830	2835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589360
35	NC_019962	CGA	2	6	2861	2866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
36	NC_019962	CCG	2	6	3025	3030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589361
37	NC_019962	GAC	2	6	3150	3155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
38	NC_019962	GCC	2	6	3159	3164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589361
39	NC_019962	GAC	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
40	NC_019962	GTT	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433589361
41	NC_019962	CGT	2	6	3320	3325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
42	NC_019962	CGA	2	6	3368	3373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
43	NC_019962	CTC	2	6	3375	3380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589361
44	NC_019962	TTC	2	6	3409	3414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589361
45	NC_019962	CGT	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
46	NC_019962	TTC	2	6	3519	3524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589361
47	NC_019962	CGA	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
48	NC_019962	GCG	2	6	3656	3661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589361
49	NC_019962	AAC	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433589361
50	NC_019962	AGG	2	6	3688	3693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589361
51	NC_019962	CGA	2	6	3695	3700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
52	NC_019962	CGA	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
53	NC_019962	GCT	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
54	NC_019962	TCG	3	9	3751	3759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
55	NC_019962	GAC	2	6	3777	3782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
56	NC_019962	CGT	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
57	NC_019962	CGT	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
58	NC_019962	GCT	2	6	3836	3841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
59	NC_019962	CGC	2	6	3885	3890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589361
60	NC_019962	CGA	2	6	4102	4107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
61	NC_019962	CAG	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
62	NC_019962	GAC	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
63	NC_019962	TGA	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589362
64	NC_019962	CGT	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
65	NC_019962	TCG	2	6	4417	4422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
66	NC_019962	ACG	3	9	4455	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
67	NC_019962	TCG	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
68	NC_019962	TGC	2	6	4609	4614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
69	NC_019962	CCA	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589362
70	NC_019962	GCG	2	6	4633	4638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589362
71	NC_019962	CAG	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
72	NC_019962	CGA	2	6	4672	4677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
73	NC_019962	CGA	2	6	4681	4686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
74	NC_019962	CGC	2	6	4697	4702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589362
75	NC_019962	CCG	2	6	4720	4725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589362
76	NC_019962	GTC	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
77	NC_019962	CGT	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
78	NC_019962	GCC	2	6	4833	4838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589362
79	NC_019962	CGG	2	6	4852	4857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589362
80	NC_019962	CGG	2	6	4859	4864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589362
81	NC_019962	TCG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
82	NC_019962	TCG	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
83	NC_019962	GTC	2	6	5250	5255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
84	NC_019962	GGC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
85	NC_019962	CGG	2	6	5284	5289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
86	NC_019962	CGC	2	6	5297	5302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
87	NC_019962	CCG	2	6	5314	5319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
88	NC_019962	GCC	2	6	5325	5330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
89	NC_019962	CGA	2	6	5387	5392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
90	NC_019962	TCG	2	6	5476	5481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
91	NC_019962	GGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
92	NC_019962	ACC	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589363
93	NC_019962	GGC	2	6	5622	5627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
94	NC_019962	TGA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589363
95	NC_019962	CGA	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
96	NC_019962	GAC	2	6	5811	5816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
97	NC_019962	TCG	2	6	5830	5835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
98	NC_019962	GGC	2	6	5900	5905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
99	NC_019962	CTG	3	9	6009	6017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
100	NC_019962	TCG	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
101	NC_019962	AAG	2	6	6120	6125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433589363
102	NC_019962	ACG	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
103	NC_019962	CGA	2	6	6203	6208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
104	NC_019962	ACG	2	6	6355	6360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
105	NC_019962	CCT	2	6	6383	6388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589363
106	NC_019962	AAG	2	6	6390	6395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433589363
107	NC_019962	CGC	2	6	6406	6411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
108	NC_019962	AGG	2	6	6445	6450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589363
109	NC_019962	CGA	2	6	6464	6469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
110	NC_019962	ACG	2	6	6526	6531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
111	NC_019962	GCT	2	6	6550	6555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
112	NC_019962	AGA	2	6	6577	6582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433589363
113	NC_019962	TCG	2	6	6619	6624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
114	NC_019962	CGG	3	9	6979	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589364
115	NC_019962	GGC	2	6	7010	7015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589364
116	NC_019962	CAG	2	6	7067	7072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589364
117	NC_019962	TCC	2	6	7158	7163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589364
118	NC_019962	CGT	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589364
119	NC_019962	CGT	2	6	7548	7553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589365
120	NC_019962	CGG	2	6	7563	7568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589365
121	NC_019962	GCG	2	6	7583	7588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589365
122	NC_019962	CGC	3	9	7617	7625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589365
123	NC_019962	GTC	2	6	7651	7656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589365
124	NC_019962	ACC	2	6	7675	7680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589365
125	NC_019962	GAG	2	6	7693	7698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589365
126	NC_019962	CGA	2	6	7713	7718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589365
127	NC_019962	CGT	2	6	7839	7844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589365
128	NC_019962	CGA	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589365
129	NC_019962	TCA	2	6	7931	7936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589365
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371	NC_019962	CGA	2	6	20087	20092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589376
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373	NC_019962	TCG	2	6	20138	20143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589376
374	NC_019962	CCA	2	6	20159	20164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589376
375	NC_019962	CGC	2	6	20189	20194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589376
376	NC_019962	CTC	2	6	20249	20254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589376
377	NC_019962	ACA	2	6	20338	20343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433589376
378	NC_019962	CCG	2	6	20421	20426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589376
379	NC_019962	CGA	2	6	20453	20458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589376
380	NC_019962	GCG	2	6	20473	20478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589376
381	NC_019962	GCC	2	6	20580	20585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589376
382	NC_019962	GCC	2	6	20625	20630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589376
383	NC_019962	CCG	2	6	20668	20673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589376
384	NC_019962	TTC	2	6	20679	20684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589376
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386	NC_019962	CGC	2	6	20735	20740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589376
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388	NC_019962	GGC	3	9	20760	20768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589376
389	NC_019962	GAG	2	6	20769	20774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589376
390	NC_019962	GAC	2	6	20789	20794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589376
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393	NC_019962	GCG	2	6	20896	20901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589376
394	NC_019962	TCG	3	9	20908	20916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589376
395	NC_019962	CGA	2	6	20924	20929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589376
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399	NC_019962	GCG	2	6	21016	21021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589376
400	NC_019962	CGA	2	6	21032	21037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589376
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403	NC_019962	CGA	2	6	21482	21487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589377
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406	NC_019962	CCG	2	6	21613	21618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589378
407	NC_019962	CGC	2	6	21703	21708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589378
408	NC_019962	TGC	2	6	21770	21775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589378
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496	NC_019962	TCG	2	6	26224	26229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589384
497	NC_019962	CTC	2	6	26307	26312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589384
498	NC_019962	CGT	3	9	26360	26368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589384
499	NC_019962	TCG	2	6	26377	26382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589384
500	NC_019962	CAT	2	6	26394	26399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589384

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