MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM03

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019959	TTGA	2	8	2636	2643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019959	CCGC	2	8	4204	4211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_019959	AGCC	2	8	26719	26726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019959	GCCC	2	8	28976	28983	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_019959	CCCA	2	8	33009	33016	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_019959	TCCT	2	8	37234	37241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019959	CAGC	2	8	39032	39039	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019959	GCAA	3	12	39615	39626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019959	CCGG	3	12	39693	39704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019959	AGTC	2	8	41452	41459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019959	TCTG	2	8	41936	41943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019959	GTGC	2	8	43155	43162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019959	CGGG	2	8	44697	44704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019959	GTAC	2	8	47357	47364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019959	GCGG	2	8	52255	52262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019959	GAAT	2	8	54709	54716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019959	GTGC	2	8	57562	57569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019959	GACC	2	8	59456	59463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019959	CAGC	2	8	74937	74944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019959	AGGG	2	8	75616	75623	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019959	ACCG	2	8	78278	78285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019959	CGGC	2	8	95644	95651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019959	GGCT	2	8	95774	95781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019959	AGTG	2	8	97325	97332	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019959	CCGC	2	8	100535	100542	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_019959	TCGC	2	8	100575	100582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019959	AGCC	2	8	103938	103945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019959	AGTG	2	8	104421	104428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019959	CACG	2	8	104440	104447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019959	TGCG	2	8	104450	104457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019959	CGGC	2	8	112334	112341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019959	TCCT	2	8	116297	116304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019959	CAGC	2	8	116404	116411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019959	CCAC	2	8	119942	119949	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_019959	GTGG	2	8	119975	119982	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019959	GGGC	2	8	120068	120075	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019959	ACCG	2	8	121447	121454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019959	CCGA	2	8	128314	128321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019959	GTTT	2	8	128415	128422	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019959	TCGA	2	8	129337	129344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019959	CGGG	2	8	129359	129366	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019959	GCCC	2	8	136137	136144	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_019959	CGGG	2	8	136163	136170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019959	GGCC	2	8	136184	136191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019959	CGGG	2	8	138608	138615	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019959	GCCC	2	8	138619	138626	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_019959	AGAC	2	8	138659	138666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019959	CGGG	2	8	138695	138702	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019959	GCCC	2	8	138706	138713	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_019959	CCCG	2	8	140326	140333	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_019959	CTCA	2	8	143660	143667	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019959	GCCC	2	8	143699	143706	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_019959	GGCC	2	8	143711	143718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019959	CAGC	2	8	144700	144707	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019959	GGCT	2	8	147183	147190	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019959	GGCA	2	8	149904	149911	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.