MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM03

Total Repeats: 391

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019959	CCGC	2	8	82	89	0 %	0 %	25 %	75 %	433644685
2	NC_019959	GCCG	2	8	337	344	0 %	0 %	50 %	50 %	433644686
3	NC_019959	CGGC	2	8	1645	1652	0 %	0 %	50 %	50 %	433644688
4	NC_019959	CCGC	2	8	1701	1708	0 %	0 %	25 %	75 %	433644688
5	NC_019959	CGCA	2	8	2310	2317	25 %	0 %	25 %	50 %	433644690
6	NC_019959	ACGC	2	8	2343	2350	25 %	0 %	25 %	50 %	433644690
7	NC_019959	GGTC	2	8	3192	3199	0 %	25 %	50 %	25 %	433644691
8	NC_019959	GCGA	2	8	3459	3466	25 %	0 %	50 %	25 %	433644691
9	NC_019959	GGCC	2	8	3822	3829	0 %	0 %	50 %	50 %	433644692
10	NC_019959	CCCG	2	8	3906	3913	0 %	0 %	25 %	75 %	433644692
11	NC_019959	GACC	2	8	4032	4039	25 %	0 %	25 %	50 %	433644692
12	NC_019959	CCGC	2	8	4588	4595	0 %	0 %	25 %	75 %	433644693
13	NC_019959	CCCA	2	8	4686	4693	25 %	0 %	0 %	75 %	433644693
14	NC_019959	GGCC	2	8	4721	4728	0 %	0 %	50 %	50 %	433644693
15	NC_019959	CGTA	2	8	6767	6774	25 %	25 %	25 %	25 %	433644697
16	NC_019959	ACCT	2	8	6825	6832	25 %	25 %	0 %	50 %	433644697
17	NC_019959	GCTG	2	8	7630	7637	0 %	25 %	50 %	25 %	433644698
18	NC_019959	GCTG	2	8	7720	7727	0 %	25 %	50 %	25 %	433644698
19	NC_019959	CAGC	2	8	8715	8722	25 %	0 %	25 %	50 %	433644699
20	NC_019959	CGCC	2	8	8840	8847	0 %	0 %	25 %	75 %	433644700
21	NC_019959	CCAC	2	8	9080	9087	25 %	0 %	0 %	75 %	433644700
22	NC_019959	CGCC	2	8	9317	9324	0 %	0 %	25 %	75 %	433644700
23	NC_019959	GGTC	2	8	9469	9476	0 %	25 %	50 %	25 %	433644701
24	NC_019959	GATC	2	8	9493	9500	25 %	25 %	25 %	25 %	433644701
25	NC_019959	CTGC	2	8	9693	9700	0 %	25 %	25 %	50 %	433644701
26	NC_019959	GCCC	2	8	9716	9723	0 %	0 %	25 %	75 %	433644701
27	NC_019959	TGGT	2	8	11879	11886	0 %	50 %	50 %	0 %	433644701
28	NC_019959	ATGC	2	8	12141	12148	25 %	25 %	25 %	25 %	433644701
29	NC_019959	GCCG	2	8	12555	12562	0 %	0 %	50 %	50 %	433644702
30	NC_019959	TGGC	2	8	13313	13320	0 %	25 %	50 %	25 %	433644702
31	NC_019959	ACGA	2	8	14053	14060	50 %	0 %	25 %	25 %	433644702
32	NC_019959	GGCG	2	8	14069	14076	0 %	0 %	75 %	25 %	433644702
33	NC_019959	CCGT	2	8	14382	14389	0 %	25 %	25 %	50 %	433644702
34	NC_019959	TGCC	2	8	14646	14653	0 %	25 %	25 %	50 %	433644702
35	NC_019959	TGGC	2	8	14950	14957	0 %	25 %	50 %	25 %	433644702
36	NC_019959	CCGC	2	8	15865	15872	0 %	0 %	25 %	75 %	433644703
37	NC_019959	CTGG	2	8	16451	16458	0 %	25 %	50 %	25 %	433644703
38	NC_019959	ACCC	2	8	16754	16761	25 %	0 %	0 %	75 %	433644703
39	NC_019959	CTGC	2	8	16834	16841	0 %	25 %	25 %	50 %	433644703
40	NC_019959	GTCG	2	8	16865	16872	0 %	25 %	50 %	25 %	433644703
41	NC_019959	CCGC	2	8	17170	17177	0 %	0 %	25 %	75 %	433644703
42	NC_019959	CGAG	2	8	17833	17840	25 %	0 %	50 %	25 %	433644703
43	NC_019959	GGCC	2	8	18019	18026	0 %	0 %	50 %	50 %	433644703
44	NC_019959	CATC	2	8	18178	18185	25 %	25 %	0 %	50 %	433644703
45	NC_019959	GCAT	2	8	18870	18877	25 %	25 %	25 %	25 %	433644704
46	NC_019959	CGGG	2	8	18994	19001	0 %	0 %	75 %	25 %	433644704
47	NC_019959	AAAG	2	8	19063	19070	75 %	0 %	25 %	0 %	433644704
48	NC_019959	ATAC	2	8	19417	19424	50 %	25 %	0 %	25 %	433644704
49	NC_019959	GTGA	2	8	20443	20450	25 %	25 %	50 %	0 %	433644705
50	NC_019959	CCGC	2	8	20540	20547	0 %	0 %	25 %	75 %	433644705
51	NC_019959	CGAA	2	8	21716	21723	50 %	0 %	25 %	25 %	433644706
52	NC_019959	CACC	2	8	22291	22298	25 %	0 %	0 %	75 %	433644707
53	NC_019959	ACCG	2	8	22406	22413	25 %	0 %	25 %	50 %	433644707
54	NC_019959	ACCG	2	8	22827	22834	25 %	0 %	25 %	50 %	433644708
55	NC_019959	ACCG	2	8	22863	22870	25 %	0 %	25 %	50 %	433644708
56	NC_019959	CGAC	2	8	23428	23435	25 %	0 %	25 %	50 %	433644710
57	NC_019959	GTCA	2	8	23931	23938	25 %	25 %	25 %	25 %	433644711
58	NC_019959	GCCG	2	8	23983	23990	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
59	NC_019959	CCGC	2	8	24095	24102	0 %	0 %	25 %	75 %	433644711
60	NC_019959	GGCC	2	8	24189	24196	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
61	NC_019959	CGGC	2	8	24311	24318	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
62	NC_019959	AGTC	2	8	24806	24813	25 %	25 %	25 %	25 %	433644711
63	NC_019959	GCCG	2	8	24967	24974	0 %	0 %	50 %	50 %	433644711
64	NC_019959	GCTG	2	8	27202	27209	0 %	25 %	50 %	25 %	433644713
65	NC_019959	CCTG	2	8	27427	27434	0 %	25 %	25 %	50 %	433644713
66	NC_019959	GCCG	2	8	28560	28567	0 %	0 %	50 %	50 %	433644715
67	NC_019959	CGGC	2	8	29629	29636	0 %	0 %	50 %	50 %	433644717
68	NC_019959	GTGA	2	8	30073	30080	25 %	25 %	50 %	0 %	433644719
69	NC_019959	CTCA	2	8	31958	31965	25 %	25 %	0 %	50 %	433644723
70	NC_019959	CGGC	2	8	32128	32135	0 %	0 %	50 %	50 %	433644723
71	NC_019959	TGCC	2	8	32160	32167	0 %	25 %	25 %	50 %	433644723
72	NC_019959	ATCT	2	8	32295	32302	25 %	50 %	0 %	25 %	433644723
73	NC_019959	ACCG	2	8	32505	32512	25 %	0 %	25 %	50 %	433644723
74	NC_019959	AGCC	2	8	32837	32844	25 %	0 %	25 %	50 %	433644724
75	NC_019959	ACGC	2	8	33089	33096	25 %	0 %	25 %	50 %	433644725
76	NC_019959	AGTG	2	8	33812	33819	25 %	25 %	50 %	0 %	433644727
77	NC_019959	GCCG	2	8	33981	33988	0 %	0 %	50 %	50 %	433644727
78	NC_019959	TGCG	2	8	33999	34006	0 %	25 %	50 %	25 %	433644727
79	NC_019959	GCCG	2	8	34201	34208	0 %	0 %	50 %	50 %	433644728
80	NC_019959	CGGT	2	8	35051	35058	0 %	25 %	50 %	25 %	433644729
81	NC_019959	GCCA	2	8	35504	35511	25 %	0 %	25 %	50 %	433644729
82	NC_019959	CGGC	2	8	35615	35622	0 %	0 %	50 %	50 %	433644729
83	NC_019959	GCCG	2	8	35722	35729	0 %	0 %	50 %	50 %	433644729
84	NC_019959	GCCG	2	8	35806	35813	0 %	0 %	50 %	50 %	433644729
85	NC_019959	CCAC	2	8	35843	35850	25 %	0 %	0 %	75 %	433644729
86	NC_019959	GTTG	2	8	35995	36002	0 %	50 %	50 %	0 %	433644729
87	NC_019959	CGGC	2	8	36101	36108	0 %	0 %	50 %	50 %	433644729
88	NC_019959	ATCC	2	8	37584	37591	25 %	25 %	0 %	50 %	433644730
89	NC_019959	CGGT	2	8	37617	37624	0 %	25 %	50 %	25 %	433644730
90	NC_019959	TCCC	2	8	38552	38559	0 %	25 %	0 %	75 %	433644731
91	NC_019959	GTAG	2	8	38663	38670	25 %	25 %	50 %	0 %	433644732
92	NC_019959	CAGC	2	8	38869	38876	25 %	0 %	25 %	50 %	433644732
93	NC_019959	GGAT	2	8	39355	39362	25 %	25 %	50 %	0 %	433644733
94	NC_019959	TCGA	2	8	39991	39998	25 %	25 %	25 %	25 %	433644734
95	NC_019959	CTGG	2	8	40078	40085	0 %	25 %	50 %	25 %	433644734
96	NC_019959	CGGC	2	8	40828	40835	0 %	0 %	50 %	50 %	433644734
97	NC_019959	GGTC	2	8	40965	40972	0 %	25 %	50 %	25 %	433644734
98	NC_019959	GCGG	2	8	41149	41156	0 %	0 %	75 %	25 %	433644734
99	NC_019959	ACGC	2	8	42283	42290	25 %	0 %	25 %	50 %	433644737
100	NC_019959	GGTG	2	8	42352	42359	0 %	25 %	75 %	0 %	433644737
101	NC_019959	TCGA	2	8	42397	42404	25 %	25 %	25 %	25 %	433644737
102	NC_019959	GCCG	2	8	42411	42418	0 %	0 %	50 %	50 %	433644737
103	NC_019959	CCGG	2	8	43822	43829	0 %	0 %	50 %	50 %	433644739
104	NC_019959	GTGG	2	8	44134	44141	0 %	25 %	75 %	0 %	433644739
105	NC_019959	GCTG	2	8	44455	44462	0 %	25 %	50 %	25 %	433644740
106	NC_019959	GTGG	2	8	44558	44565	0 %	25 %	75 %	0 %	433644740
107	NC_019959	GCCC	2	8	45105	45112	0 %	0 %	25 %	75 %	433644742
108	NC_019959	GCGG	2	8	46301	46308	0 %	0 %	75 %	25 %	433644744
109	NC_019959	GCCG	2	8	47013	47020	0 %	0 %	50 %	50 %	433644744
110	NC_019959	GTCG	2	8	47815	47822	0 %	25 %	50 %	25 %	433644746
111	NC_019959	ACCG	2	8	48305	48312	25 %	0 %	25 %	50 %	433644746
112	NC_019959	ATGG	2	8	48317	48324	25 %	25 %	50 %	0 %	433644746
113	NC_019959	GCCC	2	8	48798	48805	0 %	0 %	25 %	75 %	433644746
114	NC_019959	GGCT	2	8	49007	49014	0 %	25 %	50 %	25 %	433644746
115	NC_019959	GCCG	2	8	49216	49223	0 %	0 %	50 %	50 %	433644746
116	NC_019959	GCCG	2	8	49417	49424	0 %	0 %	50 %	50 %	433644746
117	NC_019959	CCAC	2	8	49907	49914	25 %	0 %	0 %	75 %	433644748
118	NC_019959	GCGT	2	8	51581	51588	0 %	25 %	50 %	25 %	433644749
119	NC_019959	AAGC	2	8	51658	51665	50 %	0 %	25 %	25 %	433644749
120	NC_019959	CCAG	2	8	51866	51873	25 %	0 %	25 %	50 %	433644749
121	NC_019959	GGCC	2	8	51896	51903	0 %	0 %	50 %	50 %	433644749
122	NC_019959	GGGC	2	8	51914	51921	0 %	0 %	75 %	25 %	433644749
123	NC_019959	CGCT	2	8	51996	52003	0 %	25 %	25 %	50 %	433644749
124	NC_019959	TGGC	2	8	52464	52471	0 %	25 %	50 %	25 %	433644750
125	NC_019959	GTGG	2	8	52838	52845	0 %	25 %	75 %	0 %	433644750
126	NC_019959	CGGG	2	8	53132	53139	0 %	0 %	75 %	25 %	433644750
127	NC_019959	GTGC	2	8	53751	53758	0 %	25 %	50 %	25 %	433644752
128	NC_019959	GCGG	2	8	54064	54071	0 %	0 %	75 %	25 %	433644753
129	NC_019959	GCGG	2	8	54100	54107	0 %	0 %	75 %	25 %	433644753
130	NC_019959	GGTC	2	8	55398	55405	0 %	25 %	50 %	25 %	433644755
131	NC_019959	CGAC	2	8	55682	55689	25 %	0 %	25 %	50 %	433644755
132	NC_019959	GCCA	2	8	55714	55721	25 %	0 %	25 %	50 %	433644755
133	NC_019959	CCCA	2	8	55845	55852	25 %	0 %	0 %	75 %	433644755
134	NC_019959	GGCG	2	8	56258	56265	0 %	0 %	75 %	25 %	433644755
135	NC_019959	GCGG	2	8	56924	56931	0 %	0 %	75 %	25 %	433644756
136	NC_019959	ACCC	2	8	58090	58097	25 %	0 %	0 %	75 %	433644757
137	NC_019959	CGAG	2	8	58800	58807	25 %	0 %	50 %	25 %	433644758
138	NC_019959	CAAA	2	8	58810	58817	75 %	0 %	0 %	25 %	433644758
139	NC_019959	GTCG	2	8	58938	58945	0 %	25 %	50 %	25 %	433644758
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.