MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM03

Total Repeats: 3335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019959	GCC	2	6	60	65	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644685
2	NC_019959	CGC	2	6	120	125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644685
3	NC_019959	CGT	2	6	135	140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644685
4	NC_019959	CCG	2	6	165	170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644685
5	NC_019959	CGG	2	6	249	254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644685
6	NC_019959	CTG	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644686
7	NC_019959	CAC	2	6	330	335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644686
8	NC_019959	CGC	3	9	350	358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644686
9	NC_019959	TTC	2	6	406	411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644686
10	NC_019959	CGC	2	6	560	565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644686
11	NC_019959	GGT	2	6	677	682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644686
12	NC_019959	ACG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644686
13	NC_019959	TTG	3	9	756	764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019959	CAG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019959	CGG	2	6	816	821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644687
16	NC_019959	GCT	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644687
17	NC_019959	CCG	2	6	874	879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644687
18	NC_019959	CAT	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644687
19	NC_019959	GCC	2	6	1050	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644687
20	NC_019959	GCC	2	6	1136	1141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644687
21	NC_019959	ACC	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644687
22	NC_019959	AGC	2	6	1158	1163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644687
23	NC_019959	CAG	2	6	1271	1276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644687
24	NC_019959	TGG	2	6	1363	1368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644687
25	NC_019959	CGC	2	6	1400	1405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644687
26	NC_019959	GCA	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644688
27	NC_019959	CTG	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644688
28	NC_019959	GGC	2	6	1806	1811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644689
29	NC_019959	CCG	2	6	1853	1858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644689
30	NC_019959	CGT	2	6	1868	1873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644689
31	NC_019959	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644689
32	NC_019959	CGG	2	6	1964	1969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644689
33	NC_019959	CTG	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644689
34	NC_019959	GGC	2	6	2049	2054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644689
35	NC_019959	TCG	2	6	2104	2109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644689
36	NC_019959	TGG	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644689
37	NC_019959	TGG	2	6	2237	2242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644689
38	NC_019959	CAG	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644689
39	NC_019959	CCG	2	6	2284	2289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644690
40	NC_019959	GCT	2	6	2425	2430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644690
41	NC_019959	GTC	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644690
42	NC_019959	TCT	2	6	2628	2633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019959	CTG	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019959	GCC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_019959	GGC	2	6	2758	2763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019959	AGC	3	9	2776	2784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019959	GTC	2	6	2854	2859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
48	NC_019959	GCG	2	6	2878	2883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644691
49	NC_019959	CGT	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
50	NC_019959	GCG	3	9	3023	3031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644691
51	NC_019959	TGC	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
52	NC_019959	GGC	2	6	3073	3078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644691
53	NC_019959	CCA	2	6	3079	3084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644691
54	NC_019959	GCT	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
55	NC_019959	GCA	2	6	3186	3191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644691
56	NC_019959	GGT	2	6	3214	3219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644691
57	NC_019959	GCC	2	6	3237	3242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644691
58	NC_019959	GTC	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
59	NC_019959	CGG	2	6	3302	3307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644691
60	NC_019959	CGA	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644691
61	NC_019959	CCA	2	6	3421	3426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644691
62	NC_019959	CGG	2	6	3447	3452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644691
63	NC_019959	CGT	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
64	NC_019959	CTC	2	6	3566	3571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_019959	GGA	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019959	CGC	2	6	3679	3684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644692
67	NC_019959	CCG	2	6	3699	3704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644692
68	NC_019959	TCG	2	6	3744	3749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644692
69	NC_019959	CGC	2	6	3786	3791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644692
70	NC_019959	CTG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644692
71	NC_019959	ACC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644692
72	NC_019959	GCC	2	6	4093	4098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644692
73	NC_019959	GCG	2	6	4166	4171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019959	GCG	2	6	4245	4250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019959	TGG	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019959	CTC	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_019959	GTG	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019959	TCG	4	12	4546	4557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644693
79	NC_019959	CGC	2	6	4607	4612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
80	NC_019959	GCC	2	6	4629	4634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
81	NC_019959	CTG	2	6	4767	4772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644693
82	NC_019959	CGC	2	6	4823	4828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
83	NC_019959	CGC	2	6	4836	4841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
84	NC_019959	GCG	2	6	4843	4848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644693
85	NC_019959	CGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
86	NC_019959	CAG	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644693
87	NC_019959	ACG	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644693
88	NC_019959	CGA	2	6	4982	4987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644693
89	NC_019959	GCC	2	6	5001	5006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
90	NC_019959	CGC	2	6	5030	5035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
91	NC_019959	GCC	2	6	5078	5083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
92	NC_019959	CGG	2	6	5095	5100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644693
93	NC_019959	GCC	2	6	5108	5113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
94	NC_019959	CGT	2	6	5379	5384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644694
95	NC_019959	GGC	2	6	5507	5512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644695
96	NC_019959	CGG	2	6	5590	5595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644695
97	NC_019959	CGC	2	6	5600	5605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644695
98	NC_019959	CGA	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644695
99	NC_019959	GCG	2	6	5827	5832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644695
100	NC_019959	CAG	2	6	5873	5878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644695
101	NC_019959	ACC	2	6	5896	5901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644695
102	NC_019959	GCC	2	6	5956	5961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644695
103	NC_019959	CGA	2	6	5981	5986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644695
104	NC_019959	TCG	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644695
105	NC_019959	CGA	2	6	6038	6043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644695
106	NC_019959	CAC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644695
107	NC_019959	GCA	3	9	6174	6182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644695
108	NC_019959	CCG	2	6	6193	6198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644696
109	NC_019959	CAT	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644696
110	NC_019959	CAC	2	6	6217	6222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644696
111	NC_019959	CGC	2	6	6232	6237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644696
112	NC_019959	GCT	2	6	6240	6245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644696
113	NC_019959	ACT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644696
114	NC_019959	CGC	2	6	6329	6334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644697
115	NC_019959	CCA	2	6	6391	6396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644697
116	NC_019959	CGA	2	6	6422	6427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644697
117	NC_019959	CGA	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644697
118	NC_019959	GCA	2	6	6462	6467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644697
119	NC_019959	CGC	2	6	6552	6557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644697
120	NC_019959	CGC	2	6	6704	6709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644697
121	NC_019959	GCC	3	9	6720	6728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644697
122	NC_019959	GCT	2	6	6782	6787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644697
123	NC_019959	GTG	2	6	6898	6903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644697
124	NC_019959	TCA	2	6	6940	6945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644697
125	NC_019959	GCC	2	6	6973	6978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644697
126	NC_019959	CAC	2	6	6980	6985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644697
127	NC_019959	GCC	3	9	7005	7013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644697
128	NC_019959	TGA	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644698
129	NC_019959	CGA	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644698
130	NC_019959	GCC	2	6	7174	7179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644698
131	NC_019959	TGG	2	6	7182	7187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644698
132	NC_019959	CCG	3	9	7201	7209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644698
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259	NC_019959	TCC	2	6	12448	12453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_019959	TGG	2	6	12474	12479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_019959	CGC	2	6	19488	19493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644704
384	NC_019959	ACG	2	6	19569	19574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644704
385	NC_019959	GAC	2	6	19635	19640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644705
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387	NC_019959	CGC	2	6	19709	19714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644705
388	NC_019959	CGC	2	6	19724	19729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644705
389	NC_019959	ATC	2	6	19783	19788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644705
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392	NC_019959	GCC	2	6	19871	19876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644705
393	NC_019959	CGC	2	6	19930	19935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644705
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401	NC_019959	CGA	2	6	20217	20222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644705
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403	NC_019959	TCA	2	6	20249	20254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644705
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406	NC_019959	CGC	2	6	20506	20511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644705
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410	NC_019959	CGC	2	6	20659	20664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644705
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427	NC_019959	CGC	2	6	21455	21460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644706
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429	NC_019959	CCA	2	6	21556	21561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644706
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431	NC_019959	GCG	2	6	21639	21644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644706
432	NC_019959	TCC	2	6	21660	21665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644706
433	NC_019959	CGT	2	6	21814	21819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644706
434	NC_019959	GAT	2	6	21860	21865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NC_019959	ACG	2	6	22008	22013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644707
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440	NC_019959	GCT	2	6	22216	22221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644707
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442	NC_019959	TCA	2	6	22236	22241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644707
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482	NC_019959	CGC	2	6	23719	23724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644711
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484	NC_019959	TCA	2	6	23750	23755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644711
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499	NC_019959	CAG	2	6	25205	25210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644711
500	NC_019959	CGC	2	6	25269	25274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644711

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