MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM02

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019958	CGAT	3	12	938	949	25 %	25 %	25 %	25 %	433644439
2	NC_019958	CGCC	2	8	1024	1031	0 %	0 %	25 %	75 %	433644439
3	NC_019958	GAGT	2	8	3035	3042	25 %	25 %	50 %	0 %	433644444
4	NC_019958	GTAC	2	8	3485	3492	25 %	25 %	25 %	25 %	433644445
5	NC_019958	CTGG	2	8	3525	3532	0 %	25 %	50 %	25 %	433644445
6	NC_019958	GGCC	2	8	4102	4109	0 %	0 %	50 %	50 %	433644446
7	NC_019958	GCCG	2	8	4165	4172	0 %	0 %	50 %	50 %	433644446
8	NC_019958	GGGC	2	8	4430	4437	0 %	0 %	75 %	25 %	433644446
9	NC_019958	CCGA	2	8	4515	4522	25 %	0 %	25 %	50 %	433644446
10	NC_019958	GGTC	2	8	4561	4568	0 %	25 %	50 %	25 %	433644446
11	NC_019958	AGCG	2	8	4814	4821	25 %	0 %	50 %	25 %	433644446
12	NC_019958	CCGA	2	8	5075	5082	25 %	0 %	25 %	50 %	433644447
13	NC_019958	TCGA	2	8	5189	5196	25 %	25 %	25 %	25 %	433644447
14	NC_019958	CGGC	2	8	5399	5406	0 %	0 %	50 %	50 %	433644448
15	NC_019958	GTCG	2	8	5743	5750	0 %	25 %	50 %	25 %	433644448
16	NC_019958	ACCC	2	8	6053	6060	25 %	0 %	0 %	75 %	433644448
17	NC_019958	ATCG	2	8	6079	6086	25 %	25 %	25 %	25 %	433644448
18	NC_019958	TGGC	2	8	7115	7122	0 %	25 %	50 %	25 %	433644448
19	NC_019958	TGGT	2	8	7280	7287	0 %	50 %	50 %	0 %	433644448
20	NC_019958	CTCA	2	8	7828	7835	25 %	25 %	0 %	50 %	433644449
21	NC_019958	CGGG	2	8	8124	8131	0 %	0 %	75 %	25 %	433644450
22	NC_019958	CGAC	2	8	9620	9627	25 %	0 %	25 %	50 %	433644453
23	NC_019958	TGCG	2	8	10156	10163	0 %	25 %	50 %	25 %	433644454
24	NC_019958	GGCC	2	8	12313	12320	0 %	0 %	50 %	50 %	433644457
25	NC_019958	GCAG	2	8	13195	13202	25 %	0 %	50 %	25 %	433644457
26	NC_019958	CTTG	2	8	13496	13503	0 %	50 %	25 %	25 %	433644458
27	NC_019958	AGCC	2	8	13678	13685	25 %	0 %	25 %	50 %	433644458
28	NC_019958	TCCT	2	8	13815	13822	0 %	50 %	0 %	50 %	433644458
29	NC_019958	CGGT	2	8	13955	13962	0 %	25 %	50 %	25 %	433644458
30	NC_019958	CGAG	2	8	14003	14010	25 %	0 %	50 %	25 %	433644458
31	NC_019958	TGAG	2	8	16283	16290	25 %	25 %	50 %	0 %	433644461
32	NC_019958	TCCC	2	8	16341	16348	0 %	25 %	0 %	75 %	433644461
33	NC_019958	TCGC	2	8	17055	17062	0 %	25 %	25 %	50 %	433644462
34	NC_019958	ATCC	2	8	17325	17332	25 %	25 %	0 %	50 %	433644463
35	NC_019958	CAGT	2	8	18207	18214	25 %	25 %	25 %	25 %	433644464
36	NC_019958	TGCC	2	8	18391	18398	0 %	25 %	25 %	50 %	433644464
37	NC_019958	CCGG	2	8	19259	19266	0 %	0 %	50 %	50 %	433644465
38	NC_019958	CGAG	2	8	19366	19373	25 %	0 %	50 %	25 %	433644465
39	NC_019958	CGGA	2	8	20356	20363	25 %	0 %	50 %	25 %	433644466
40	NC_019958	ACCG	2	8	20393	20400	25 %	0 %	25 %	50 %	433644466
41	NC_019958	CAAC	2	8	20618	20625	50 %	0 %	0 %	50 %	433644466
42	NC_019958	TGGG	2	8	20650	20657	0 %	25 %	75 %	0 %	433644466
43	NC_019958	CGCA	2	8	21194	21201	25 %	0 %	25 %	50 %	433644466
44	NC_019958	GCGT	2	8	21838	21845	0 %	25 %	50 %	25 %	433644468
45	NC_019958	GCTG	2	8	23168	23175	0 %	25 %	50 %	25 %	433644470
46	NC_019958	CGGG	2	8	24575	24582	0 %	0 %	75 %	25 %	433644473
47	NC_019958	CCGG	2	8	26054	26061	0 %	0 %	50 %	50 %	433644475
48	NC_019958	CGGC	2	8	26344	26351	0 %	0 %	50 %	50 %	433644475
49	NC_019958	TCCG	2	8	27287	27294	0 %	25 %	25 %	50 %	433644475
50	NC_019958	CCGG	2	8	27588	27595	0 %	0 %	50 %	50 %	433644476
51	NC_019958	GTCG	2	8	27924	27931	0 %	25 %	50 %	25 %	433644476
52	NC_019958	AACC	2	8	28011	28018	50 %	0 %	0 %	50 %	433644476
53	NC_019958	CATT	2	8	28075	28082	25 %	50 %	0 %	25 %	433644476
54	NC_019958	ATCG	2	8	28418	28425	25 %	25 %	25 %	25 %	433644477
55	NC_019958	TTGG	2	8	28556	28563	0 %	50 %	50 %	0 %	433644477
56	NC_019958	GGCC	2	8	28605	28612	0 %	0 %	50 %	50 %	433644477
57	NC_019958	GCTC	2	8	28708	28715	0 %	25 %	25 %	50 %	433644477
58	NC_019958	CCAG	2	8	30765	30772	25 %	0 %	25 %	50 %	433644481
59	NC_019958	TGCG	2	8	30895	30902	0 %	25 %	50 %	25 %	433644481
60	NC_019958	TGCC	2	8	31591	31598	0 %	25 %	25 %	50 %	433644484
61	NC_019958	CCAC	2	8	32096	32103	25 %	0 %	0 %	75 %	433644485
62	NC_019958	TGCA	2	8	32227	32234	25 %	25 %	25 %	25 %	433644485
63	NC_019958	GCGT	2	8	32696	32703	0 %	25 %	50 %	25 %	433644487
64	NC_019958	TGGC	2	8	37046	37053	0 %	25 %	50 %	25 %	433644495
65	NC_019958	GCAA	2	8	38364	38371	50 %	0 %	25 %	25 %	433644496
66	NC_019958	CCAC	2	8	39133	39140	25 %	0 %	0 %	75 %	433644497
67	NC_019958	GGTG	2	8	41319	41326	0 %	25 %	75 %	0 %	433644500
68	NC_019958	GACG	2	8	41652	41659	25 %	0 %	50 %	25 %	433644501
69	NC_019958	GTTG	2	8	42200	42207	0 %	50 %	50 %	0 %	433644502
70	NC_019958	AGCG	2	8	42552	42559	25 %	0 %	50 %	25 %	433644502
71	NC_019958	TTGG	2	8	43502	43509	0 %	50 %	50 %	0 %	433644503
72	NC_019958	GTCG	2	8	43627	43634	0 %	25 %	50 %	25 %	433644503
73	NC_019958	CCCA	2	8	44135	44142	25 %	0 %	0 %	75 %	433644504
74	NC_019958	CCGG	2	8	44166	44173	0 %	0 %	50 %	50 %	433644504
75	NC_019958	GATC	2	8	45600	45607	25 %	25 %	25 %	25 %	433644505
76	NC_019958	GTGG	2	8	45609	45616	0 %	25 %	75 %	0 %	433644505
77	NC_019958	CGGC	2	8	45768	45775	0 %	0 %	50 %	50 %	433644505
78	NC_019958	CGGT	2	8	46003	46010	0 %	25 %	50 %	25 %	433644505
79	NC_019958	GATG	2	8	46313	46320	25 %	25 %	50 %	0 %	433644505
80	NC_019958	CGAA	2	8	46537	46544	50 %	0 %	25 %	25 %	433644505
81	NC_019958	CGGC	2	8	46875	46882	0 %	0 %	50 %	50 %	433644506
82	NC_019958	CGGC	2	8	46960	46967	0 %	0 %	50 %	50 %	433644506
83	NC_019958	TGCC	2	8	47428	47435	0 %	25 %	25 %	50 %	433644506
84	NC_019958	GATG	2	8	49303	49310	25 %	25 %	50 %	0 %	433644509
85	NC_019958	GCCA	2	8	49335	49342	25 %	0 %	25 %	50 %	433644509
86	NC_019958	CTGA	2	8	49605	49612	25 %	25 %	25 %	25 %	433644509
87	NC_019958	GCTG	2	8	52842	52849	0 %	25 %	50 %	25 %	433644516
88	NC_019958	ACGG	2	8	52943	52950	25 %	0 %	50 %	25 %	433644516
89	NC_019958	TGGG	2	8	53215	53222	0 %	25 %	75 %	0 %	433644517
90	NC_019958	CGGT	2	8	53695	53702	0 %	25 %	50 %	25 %	433644517
91	NC_019958	CCCA	2	8	53817	53824	25 %	0 %	0 %	75 %	433644517
92	NC_019958	GTCT	2	8	54716	54723	0 %	50 %	25 %	25 %	433644519
93	NC_019958	CGCC	2	8	54907	54914	0 %	0 %	25 %	75 %	433644519
94	NC_019958	CGAC	2	8	55430	55437	25 %	0 %	25 %	50 %	433644520
95	NC_019958	CCGC	2	8	55762	55769	0 %	0 %	25 %	75 %	433644520
96	NC_019958	CGCA	2	8	56701	56708	25 %	0 %	25 %	50 %	433644521
97	NC_019958	GTAC	2	8	58295	58302	25 %	25 %	25 %	25 %	433644523
98	NC_019958	CTCG	2	8	58626	58633	0 %	25 %	25 %	50 %	433644524
99	NC_019958	ACTG	2	8	58868	58875	25 %	25 %	25 %	25 %	433644524
100	NC_019958	TCGA	2	8	59201	59208	25 %	25 %	25 %	25 %	433644525
101	NC_019958	CCGG	2	8	59479	59486	0 %	0 %	50 %	50 %	433644526
102	NC_019958	GCCC	2	8	60416	60423	0 %	0 %	25 %	75 %	433644528
103	NC_019958	CGGC	2	8	60647	60654	0 %	0 %	50 %	50 %	433644528
104	NC_019958	GCTG	2	8	60927	60934	0 %	25 %	50 %	25 %	433644529
105	NC_019958	CGTT	2	8	62552	62559	0 %	50 %	25 %	25 %	433644533
106	NC_019958	CGTC	2	8	62735	62742	0 %	25 %	25 %	50 %	433644534
107	NC_019958	GTCT	2	8	63015	63022	0 %	50 %	25 %	25 %	433644535
108	NC_019958	GGCG	2	8	63265	63272	0 %	0 %	75 %	25 %	433644535
109	NC_019958	GCCA	2	8	63517	63524	25 %	0 %	25 %	50 %	433644535
110	NC_019958	GTGG	2	8	63778	63785	0 %	25 %	75 %	0 %	433644536
111	NC_019958	GCGA	2	8	63998	64005	25 %	0 %	50 %	25 %	433644536
112	NC_019958	CACT	2	8	65140	65147	25 %	25 %	0 %	50 %	433644538
113	NC_019958	GGTG	2	8	65300	65307	0 %	25 %	75 %	0 %	433644538
114	NC_019958	GACG	2	8	65447	65454	25 %	0 %	50 %	25 %	433644538
115	NC_019958	CTTG	2	8	66005	66012	0 %	50 %	25 %	25 %	433644540
116	NC_019958	AGTT	2	8	66726	66733	25 %	50 %	25 %	0 %	433644542
117	NC_019958	TCGA	2	8	67181	67188	25 %	25 %	25 %	25 %	433644543
118	NC_019958	GCCG	2	8	67787	67794	0 %	0 %	50 %	50 %	433644544
119	NC_019958	GCGA	2	8	67931	67938	25 %	0 %	50 %	25 %	433644544
120	NC_019958	GCGG	2	8	68170	68177	0 %	0 %	75 %	25 %	433644544
121	NC_019958	GCCC	2	8	69685	69692	0 %	0 %	25 %	75 %	433644546
122	NC_019958	GCCG	2	8	70022	70029	0 %	0 %	50 %	50 %	433644546
123	NC_019958	TGGC	2	8	71340	71347	0 %	25 %	50 %	25 %	433644547
124	NC_019958	GCCG	2	8	71484	71491	0 %	0 %	50 %	50 %	433644548
125	NC_019958	CGGT	2	8	71497	71504	0 %	25 %	50 %	25 %	433644548
126	NC_019958	GCGG	2	8	71589	71596	0 %	0 %	75 %	25 %	433644548
127	NC_019958	GTGG	2	8	71637	71644	0 %	25 %	75 %	0 %	433644548
128	NC_019958	CCGC	2	8	72001	72008	0 %	0 %	25 %	75 %	433644549
129	NC_019958	GGCC	2	8	72159	72166	0 %	0 %	50 %	50 %	433644550
130	NC_019958	GACC	2	8	72207	72214	25 %	0 %	25 %	50 %	433644550
131	NC_019958	CCCG	2	8	72816	72823	0 %	0 %	25 %	75 %	433644550
132	NC_019958	TCGC	2	8	73748	73755	0 %	25 %	25 %	50 %	433644551
133	NC_019958	ACGC	2	8	73997	74004	25 %	0 %	25 %	50 %	433644551
134	NC_019958	CACC	2	8	74521	74528	25 %	0 %	0 %	75 %	433644551
135	NC_019958	CCGC	2	8	74605	74612	0 %	0 %	25 %	75 %	433644551
136	NC_019958	ACGA	2	8	75134	75141	50 %	0 %	25 %	25 %	433644552
137	NC_019958	CCGG	2	8	75174	75181	0 %	0 %	50 %	50 %	433644552
138	NC_019958	GCCC	2	8	75406	75413	0 %	0 %	25 %	75 %	433644552
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140	NC_019958	CCCG	2	8	76036	76043	0 %	0 %	25 %	75 %	433644552
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.