MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM02

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019958	CG	3	6	77	82	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019958	GC	3	6	130	135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019958	AC	4	8	256	263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019958	CG	3	6	1123	1128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019958	TG	3	6	1437	1442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019958	CG	3	6	8371	8376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019958	TG	3	6	9920	9925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019958	GC	3	6	14210	14215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019958	GC	3	6	18070	18075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019958	GC	3	6	19656	19661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019958	CA	3	6	20272	20277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019958	CG	3	6	25961	25966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019958	CG	3	6	28135	28140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019958	AC	3	6	28160	28165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019958	GC	3	6	29438	29443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019958	GC	3	6	34148	34153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019958	GC	3	6	35104	35109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019958	CG	3	6	37423	37428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019958	CA	3	6	38591	38596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019958	CG	3	6	39333	39338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019958	CA	3	6	39364	39369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019958	CG	3	6	46775	46780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019958	GC	5	10	48643	48652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019958	CT	3	6	49153	49158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019958	GC	3	6	49178	49183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019958	CG	3	6	51589	51594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019958	GT	3	6	52714	52719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019958	AC	3	6	56361	56366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019958	CA	3	6	57080	57085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019958	GT	3	6	57735	57740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019958	CG	3	6	59992	59997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019958	CG	3	6	60102	60107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019958	CG	3	6	61086	61091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019958	CG	3	6	61809	61814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019958	CG	3	6	61862	61867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019958	TC	3	6	62444	62449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019958	GC	3	6	64794	64799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019958	GT	3	6	66393	66398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019958	CG	3	6	70985	70990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019958	GC	3	6	74849	74854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019958	AC	4	8	74978	74985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019958	GT	3	6	75098	75103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019958	CG	3	6	77180	77185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019958	CG	3	6	79429	79434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019958	CG	3	6	79480	79485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019958	CA	3	6	91323	91328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019958	GC	3	6	92025	92030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019958	GC	3	6	92199	92204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019958	GA	3	6	92344	92349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019958	GC	4	8	93659	93666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019958	GC	3	6	93729	93734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019958	CG	4	8	94790	94797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019958	CG	3	6	94904	94909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019958	GC	3	6	95078	95083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019958	CG	3	6	102746	102751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019958	CA	3	6	103729	103734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019958	AC	3	6	105413	105418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019958	CG	3	6	105443	105448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019958	TG	3	6	109409	109414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019958	CG	3	6	111375	111380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019958	GC	3	6	111403	111408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019958	CG	3	6	111426	111431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019958	CG	3	6	113490	113495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019958	GC	3	6	113508	113513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019958	GA	3	6	113560	113565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019958	GC	3	6	119198	119203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019958	GC	3	6	133336	133341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019958	GT	3	6	133375	133380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019958	CG	3	6	133608	133613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019958	AC	4	8	133857	133864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019958	GT	3	6	133892	133897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019958	CG	3	6	134842	134847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019958	CG	3	6	135375	135380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019958	TC	3	6	135469	135474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019958	GT	3	6	135641	135646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019958	CG	3	6	135718	135723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019958	CG	3	6	136889	136894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019958	CA	3	6	153390	153395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019958	AC	3	6	157226	157231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019958	CA	3	6	157282	157287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019958	GC	3	6	159690	159695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019958	GC	3	6	159925	159930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019958	CG	3	6	164527	164532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019958	CG	3	6	168787	168792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019958	GT	3	6	168828	168833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019958	GC	3	6	170223	170228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019958	CG	3	6	170398	170403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019958	CG	3	6	170406	170411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019958	GC	3	6	170429	170434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019958	GT	3	6	171004	171009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019958	GC	3	6	174508	174513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019958	GC	3	6	178474	178479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019958	GC	3	6	179225	179230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019958	GC	3	6	183589	183594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019958	CG	3	6	188751	188756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019958	TG	3	6	190803	190808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019958	GT	3	6	197754	197759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019958	GT	4	8	198109	198116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019958	GC	3	6	198287	198292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.