MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM02

Total Repeats: 348

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019958	GC	3	6	614	619	0 %	0 %	50 %	50 %	433644439
2	NC_019958	GC	3	6	714	719	0 %	0 %	50 %	50 %	433644439
3	NC_019958	GC	3	6	2229	2234	0 %	0 %	50 %	50 %	433644442
4	NC_019958	CG	3	6	2706	2711	0 %	0 %	50 %	50 %	433644443
5	NC_019958	GC	3	6	2750	2755	0 %	0 %	50 %	50 %	433644443
6	NC_019958	CA	3	6	3175	3180	50 %	0 %	0 %	50 %	433644444
7	NC_019958	GC	3	6	4116	4121	0 %	0 %	50 %	50 %	433644446
8	NC_019958	TG	3	6	4347	4352	0 %	50 %	50 %	0 %	433644446
9	NC_019958	CA	3	6	4505	4510	50 %	0 %	0 %	50 %	433644446
10	NC_019958	AC	3	6	5028	5033	50 %	0 %	0 %	50 %	433644447
11	NC_019958	CG	3	6	5051	5056	0 %	0 %	50 %	50 %	433644447
12	NC_019958	CG	3	6	5509	5514	0 %	0 %	50 %	50 %	433644448
13	NC_019958	CG	3	6	7200	7205	0 %	0 %	50 %	50 %	433644448
14	NC_019958	GC	3	6	10140	10145	0 %	0 %	50 %	50 %	433644454
15	NC_019958	GC	4	8	11084	11091	0 %	0 %	50 %	50 %	433644455
16	NC_019958	CT	3	6	11114	11119	0 %	50 %	0 %	50 %	433644455
17	NC_019958	GC	3	6	12492	12497	0 %	0 %	50 %	50 %	433644457
18	NC_019958	GT	3	6	13271	13276	0 %	50 %	50 %	0 %	433644457
19	NC_019958	CA	3	6	14948	14953	50 %	0 %	0 %	50 %	433644459
20	NC_019958	GC	3	6	15387	15392	0 %	0 %	50 %	50 %	433644460
21	NC_019958	CG	3	6	16967	16972	0 %	0 %	50 %	50 %	433644462
22	NC_019958	CG	3	6	17503	17508	0 %	0 %	50 %	50 %	433644463
23	NC_019958	CG	3	6	18833	18838	0 %	0 %	50 %	50 %	433644464
24	NC_019958	CG	3	6	19212	19217	0 %	0 %	50 %	50 %	433644465
25	NC_019958	CT	3	6	20665	20670	0 %	50 %	0 %	50 %	433644466
26	NC_019958	GC	3	6	20679	20684	0 %	0 %	50 %	50 %	433644466
27	NC_019958	GC	3	6	20906	20911	0 %	0 %	50 %	50 %	433644466
28	NC_019958	AC	3	6	20941	20946	50 %	0 %	0 %	50 %	433644466
29	NC_019958	AC	3	6	20985	20990	50 %	0 %	0 %	50 %	433644466
30	NC_019958	CT	3	6	21573	21578	0 %	50 %	0 %	50 %	433644468
31	NC_019958	CG	3	6	21739	21744	0 %	0 %	50 %	50 %	433644468
32	NC_019958	CG	3	6	21858	21863	0 %	0 %	50 %	50 %	433644468
33	NC_019958	GT	3	6	22095	22100	0 %	50 %	50 %	0 %	433644469
34	NC_019958	CG	3	6	23422	23427	0 %	0 %	50 %	50 %	433644470
35	NC_019958	CG	3	6	23553	23558	0 %	0 %	50 %	50 %	433644470
36	NC_019958	AC	4	8	24218	24225	50 %	0 %	0 %	50 %	433644472
37	NC_019958	GT	3	6	24240	24245	0 %	50 %	50 %	0 %	433644472
38	NC_019958	GC	3	6	24728	24733	0 %	0 %	50 %	50 %	433644473
39	NC_019958	CA	3	6	24829	24834	50 %	0 %	0 %	50 %	433644473
40	NC_019958	TG	3	6	25343	25348	0 %	50 %	50 %	0 %	433644473
41	NC_019958	GA	3	6	25676	25681	50 %	0 %	50 %	0 %	433644474
42	NC_019958	GT	3	6	26627	26632	0 %	50 %	50 %	0 %	433644475
43	NC_019958	CG	3	6	26964	26969	0 %	0 %	50 %	50 %	433644475
44	NC_019958	CG	3	6	26971	26976	0 %	0 %	50 %	50 %	433644475
45	NC_019958	AC	3	6	27020	27025	50 %	0 %	0 %	50 %	433644475
46	NC_019958	GC	3	6	27105	27110	0 %	0 %	50 %	50 %	433644475
47	NC_019958	CG	3	6	28408	28413	0 %	0 %	50 %	50 %	433644477
48	NC_019958	GC	3	6	28446	28451	0 %	0 %	50 %	50 %	433644477
49	NC_019958	TG	3	6	31784	31789	0 %	50 %	50 %	0 %	433644484
50	NC_019958	CT	3	6	32780	32785	0 %	50 %	0 %	50 %	433644487
51	NC_019958	GT	3	6	33251	33256	0 %	50 %	50 %	0 %	433644488
52	NC_019958	GC	3	6	33288	33293	0 %	0 %	50 %	50 %	433644488
53	NC_019958	GT	4	8	33316	33323	0 %	50 %	50 %	0 %	433644488
54	NC_019958	CG	3	6	33569	33574	0 %	0 %	50 %	50 %	433644489
55	NC_019958	GC	3	6	33584	33589	0 %	0 %	50 %	50 %	433644489
56	NC_019958	GA	3	6	33920	33925	50 %	0 %	50 %	0 %	433644490
57	NC_019958	CG	3	6	33968	33973	0 %	0 %	50 %	50 %	433644490
58	NC_019958	CG	3	6	34610	34615	0 %	0 %	50 %	50 %	433644492
59	NC_019958	GC	3	6	34859	34864	0 %	0 %	50 %	50 %	433644493
60	NC_019958	CG	3	6	36616	36621	0 %	0 %	50 %	50 %	433644495
61	NC_019958	CG	3	6	36667	36672	0 %	0 %	50 %	50 %	433644495
62	NC_019958	GC	3	6	36758	36763	0 %	0 %	50 %	50 %	433644495
63	NC_019958	GC	3	6	37313	37318	0 %	0 %	50 %	50 %	433644495
64	NC_019958	CG	4	8	37391	37398	0 %	0 %	50 %	50 %	433644495
65	NC_019958	CG	3	6	37746	37751	0 %	0 %	50 %	50 %	433644496
66	NC_019958	GC	3	6	38723	38728	0 %	0 %	50 %	50 %	433644497
67	NC_019958	CT	3	6	38943	38948	0 %	50 %	0 %	50 %	433644497
68	NC_019958	GC	4	8	40229	40236	0 %	0 %	50 %	50 %	433644499
69	NC_019958	CG	3	6	41011	41016	0 %	0 %	50 %	50 %	433644500
70	NC_019958	CG	3	6	41444	41449	0 %	0 %	50 %	50 %	433644500
71	NC_019958	CG	3	6	41641	41646	0 %	0 %	50 %	50 %	433644501
72	NC_019958	GC	3	6	41743	41748	0 %	0 %	50 %	50 %	433644501
73	NC_019958	AC	3	6	43661	43666	50 %	0 %	0 %	50 %	433644503
74	NC_019958	CG	3	6	43725	43730	0 %	0 %	50 %	50 %	433644503
75	NC_019958	CG	3	6	43755	43760	0 %	0 %	50 %	50 %	433644503
76	NC_019958	GC	3	6	43810	43815	0 %	0 %	50 %	50 %	433644503
77	NC_019958	GC	4	8	44040	44047	0 %	0 %	50 %	50 %	433644504
78	NC_019958	GC	3	6	44349	44354	0 %	0 %	50 %	50 %	433644504
79	NC_019958	GC	3	6	45650	45655	0 %	0 %	50 %	50 %	433644505
80	NC_019958	GC	3	6	46126	46131	0 %	0 %	50 %	50 %	433644505
81	NC_019958	GC	4	8	46234	46241	0 %	0 %	50 %	50 %	433644505
82	NC_019958	GC	3	6	46378	46383	0 %	0 %	50 %	50 %	433644505
83	NC_019958	AC	3	6	47164	47169	50 %	0 %	0 %	50 %	433644506
84	NC_019958	CG	3	6	47541	47546	0 %	0 %	50 %	50 %	433644506
85	NC_019958	GC	3	6	48008	48013	0 %	0 %	50 %	50 %	433644506
86	NC_019958	GC	3	6	48134	48139	0 %	0 %	50 %	50 %	433644507
87	NC_019958	CG	3	6	48951	48956	0 %	0 %	50 %	50 %	433644508
88	NC_019958	CT	3	6	50118	50123	0 %	50 %	0 %	50 %	433644510
89	NC_019958	CG	3	6	50820	50825	0 %	0 %	50 %	50 %	433644512
90	NC_019958	CG	3	6	51353	51358	0 %	0 %	50 %	50 %	433644514
91	NC_019958	GC	3	6	51400	51405	0 %	0 %	50 %	50 %	433644514
92	NC_019958	GC	3	6	52064	52069	0 %	0 %	50 %	50 %	433644515
93	NC_019958	GC	3	6	52322	52327	0 %	0 %	50 %	50 %	433644515
94	NC_019958	GC	3	6	52493	52498	0 %	0 %	50 %	50 %	433644515
95	NC_019958	CG	3	6	53077	53082	0 %	0 %	50 %	50 %	433644516
96	NC_019958	CG	3	6	53194	53199	0 %	0 %	50 %	50 %	433644516
97	NC_019958	GC	3	6	53714	53719	0 %	0 %	50 %	50 %	433644517
98	NC_019958	CA	3	6	56044	56049	50 %	0 %	0 %	50 %	433644520
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100	NC_019958	CG	3	6	56985	56990	0 %	0 %	50 %	50 %	433644521
101	NC_019958	GC	3	6	56999	57004	0 %	0 %	50 %	50 %	433644521
102	NC_019958	CG	3	6	57431	57436	0 %	0 %	50 %	50 %	433644522
103	NC_019958	GC	3	6	58180	58185	0 %	0 %	50 %	50 %	433644523
104	NC_019958	GC	3	6	58328	58333	0 %	0 %	50 %	50 %	433644523
105	NC_019958	CG	3	6	59313	59318	0 %	0 %	50 %	50 %	433644525
106	NC_019958	CG	3	6	59843	59848	0 %	0 %	50 %	50 %	433644527
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108	NC_019958	CG	3	6	60494	60499	0 %	0 %	50 %	50 %	433644528
109	NC_019958	CG	3	6	63140	63145	0 %	0 %	50 %	50 %	433644535
110	NC_019958	GC	3	6	64140	64145	0 %	0 %	50 %	50 %	433644536
111	NC_019958	GC	4	8	64902	64909	0 %	0 %	50 %	50 %	433644537
112	NC_019958	GT	4	8	65589	65596	0 %	50 %	50 %	0 %	433644538
113	NC_019958	GC	3	6	66741	66746	0 %	0 %	50 %	50 %	433644542
114	NC_019958	GC	3	6	67534	67539	0 %	0 %	50 %	50 %	433644544
115	NC_019958	TG	3	6	68364	68369	0 %	50 %	50 %	0 %	433644544
116	NC_019958	CG	3	6	69476	69481	0 %	0 %	50 %	50 %	433644546
117	NC_019958	AG	3	6	69992	69997	50 %	0 %	50 %	0 %	433644546
118	NC_019958	GC	3	6	70045	70050	0 %	0 %	50 %	50 %	433644546
119	NC_019958	GC	3	6	70117	70122	0 %	0 %	50 %	50 %	433644546
120	NC_019958	CG	3	6	70581	70586	0 %	0 %	50 %	50 %	433644546
121	NC_019958	CG	3	6	70602	70607	0 %	0 %	50 %	50 %	433644546
122	NC_019958	CA	3	6	71162	71167	50 %	0 %	0 %	50 %	433644547
123	NC_019958	GC	3	6	71216	71221	0 %	0 %	50 %	50 %	433644547
124	NC_019958	GC	4	8	71661	71668	0 %	0 %	50 %	50 %	433644548
125	NC_019958	TG	3	6	71955	71960	0 %	50 %	50 %	0 %	433644549
126	NC_019958	CG	3	6	72322	72327	0 %	0 %	50 %	50 %	433644550
127	NC_019958	GC	3	6	72540	72545	0 %	0 %	50 %	50 %	433644550
128	NC_019958	CG	3	6	72655	72660	0 %	0 %	50 %	50 %	433644550
129	NC_019958	CG	3	6	72986	72991	0 %	0 %	50 %	50 %	433644550
130	NC_019958	CA	3	6	74385	74390	50 %	0 %	0 %	50 %	433644551
131	NC_019958	GA	3	6	74403	74408	50 %	0 %	50 %	0 %	433644551
132	NC_019958	AC	3	6	74629	74634	50 %	0 %	0 %	50 %	433644551
133	NC_019958	GC	3	6	77785	77790	0 %	0 %	50 %	50 %	433644554
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135	NC_019958	CG	3	6	78867	78872	0 %	0 %	50 %	50 %	433644555
136	NC_019958	CG	3	6	78932	78937	0 %	0 %	50 %	50 %	433644555
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138	NC_019958	CG	4	8	79929	79936	0 %	0 %	50 %	50 %	433644556
139	NC_019958	CG	3	6	80193	80198	0 %	0 %	50 %	50 %	433644556
140	NC_019958	GC	3	6	80701	80706	0 %	0 %	50 %	50 %	433644557
141	NC_019958	CG	3	6	82758	82763	0 %	0 %	50 %	50 %	433644560
142	NC_019958	GC	3	6	82780	82785	0 %	0 %	50 %	50 %	433644560
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.