MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM01

Total Repeats: 988

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019957	ACAG	2	8	561	568	50 %	0 %	25 %	25 %	433644117
2	NC_019957	GCCG	2	8	659	666	0 %	0 %	50 %	50 %	433644117
3	NC_019957	TTGC	2	8	1164	1171	0 %	50 %	25 %	25 %	433644117
4	NC_019957	GCAC	2	8	1381	1388	25 %	0 %	25 %	50 %	433644118
5	NC_019957	GCAG	2	8	1407	1414	25 %	0 %	50 %	25 %	433644118
6	NC_019957	GGAT	2	8	2114	2121	25 %	25 %	50 %	0 %	433644118
7	NC_019957	CCTA	2	8	2586	2593	25 %	25 %	0 %	50 %	433644118
8	NC_019957	CATG	2	8	2926	2933	25 %	25 %	25 %	25 %	433644119
9	NC_019957	CGAG	2	8	3383	3390	25 %	0 %	50 %	25 %	433644119
10	NC_019957	GTCG	2	8	3802	3809	0 %	25 %	50 %	25 %	433644119
11	NC_019957	TGCC	2	8	3966	3973	0 %	25 %	25 %	50 %	433644119
12	NC_019957	AGAT	2	8	4911	4918	50 %	25 %	25 %	0 %	433644120
13	NC_019957	ACCC	2	8	5465	5472	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_019957	TTGC	2	8	5640	5647	0 %	50 %	25 %	25 %	433644121
15	NC_019957	GGTC	2	8	5762	5769	0 %	25 %	50 %	25 %	433644121
16	NC_019957	TCAT	2	8	5978	5985	25 %	50 %	0 %	25 %	433644121
17	NC_019957	CTTT	2	8	6431	6438	0 %	75 %	0 %	25 %	433644121
18	NC_019957	TCGG	2	8	6929	6936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019957	GATC	2	8	7504	7511	25 %	25 %	25 %	25 %	433644122
20	NC_019957	GCTG	2	8	8416	8423	0 %	25 %	50 %	25 %	433644123
21	NC_019957	GCTC	2	8	8932	8939	0 %	25 %	25 %	50 %	433644123
22	NC_019957	TCGT	2	8	9775	9782	0 %	50 %	25 %	25 %	433644124
23	NC_019957	TGGT	2	8	10356	10363	0 %	50 %	50 %	0 %	433644124
24	NC_019957	GGCG	2	8	10959	10966	0 %	0 %	75 %	25 %	433644125
25	NC_019957	CAGT	2	8	10973	10980	25 %	25 %	25 %	25 %	433644125
26	NC_019957	GGAC	2	8	11775	11782	25 %	0 %	50 %	25 %	433644125
27	NC_019957	GCCG	2	8	12383	12390	0 %	0 %	50 %	50 %	433644126
28	NC_019957	TGAC	2	8	12640	12647	25 %	25 %	25 %	25 %	433644126
29	NC_019957	ACGA	2	8	12713	12720	50 %	0 %	25 %	25 %	433644126
30	NC_019957	CCGA	2	8	13622	13629	25 %	0 %	25 %	50 %	433644127
31	NC_019957	GTCG	2	8	13962	13969	0 %	25 %	50 %	25 %	433644127
32	NC_019957	TGAA	2	8	14271	14278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019957	CCGA	2	8	14429	14436	25 %	0 %	25 %	50 %	433644128
34	NC_019957	CCCA	2	8	14936	14943	25 %	0 %	0 %	75 %	433644128
35	NC_019957	CAGA	2	8	15545	15552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019957	CAGC	2	8	16446	16453	25 %	0 %	25 %	50 %	433644129
37	NC_019957	CCAC	2	8	16476	16483	25 %	0 %	0 %	75 %	433644129
38	NC_019957	ATGA	2	8	16696	16703	50 %	25 %	25 %	0 %	433644129
39	NC_019957	CGCC	2	8	16869	16876	0 %	0 %	25 %	75 %	433644129
40	NC_019957	CCGA	2	8	16986	16993	25 %	0 %	25 %	50 %	433644129
41	NC_019957	GGCA	2	8	17384	17391	25 %	0 %	50 %	25 %	433644129
42	NC_019957	TGCC	2	8	17846	17853	0 %	25 %	25 %	50 %	433644130
43	NC_019957	GGGC	2	8	18008	18015	0 %	0 %	75 %	25 %	433644130
44	NC_019957	CGAC	2	8	18155	18162	25 %	0 %	25 %	50 %	433644130
45	NC_019957	GGTC	2	8	18230	18237	0 %	25 %	50 %	25 %	433644130
46	NC_019957	CTGT	2	8	19311	19318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019957	CGCC	2	8	19455	19462	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_019957	GCTG	2	8	19480	19487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019957	CCAT	2	8	19739	19746	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019957	CAAG	2	8	20512	20519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019957	GTCG	2	8	20579	20586	0 %	25 %	50 %	25 %	433644131
52	NC_019957	GCAT	2	8	20631	20638	25 %	25 %	25 %	25 %	433644131
53	NC_019957	GTCG	2	8	20678	20685	0 %	25 %	50 %	25 %	433644131
54	NC_019957	GAGT	2	8	21781	21788	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019957	CTGC	2	8	21806	21813	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019957	GATC	2	8	22748	22755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019957	TCGC	2	8	22859	22866	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019957	GCTT	2	8	23009	23016	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019957	GTCT	2	8	23297	23304	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019957	GTCA	2	8	23770	23777	25 %	25 %	25 %	25 %	433644132
61	NC_019957	CCGC	2	8	23970	23977	0 %	0 %	25 %	75 %	433644132
62	NC_019957	GCAC	2	8	24210	24217	25 %	0 %	25 %	50 %	433644132
63	NC_019957	GTCG	2	8	24801	24808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019957	GACT	2	8	25002	25009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019957	GACA	2	8	25043	25050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019957	CCGA	2	8	25192	25199	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019957	CGCC	2	8	25926	25933	0 %	0 %	25 %	75 %	433644133
68	NC_019957	CGAA	2	8	26033	26040	50 %	0 %	25 %	25 %	433644133
69	NC_019957	GCCG	2	8	26131	26138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019957	CTGG	2	8	26529	26536	0 %	25 %	50 %	25 %	433644134
71	NC_019957	TCGC	2	8	27386	27393	0 %	25 %	25 %	50 %	433644134
72	NC_019957	CCAC	2	8	27739	27746	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_019957	ACAG	2	8	27866	27873	50 %	0 %	25 %	25 %	433644135
74	NC_019957	TCTG	2	8	28374	28381	0 %	50 %	25 %	25 %	433644135
75	NC_019957	CTGA	2	8	28475	28482	25 %	25 %	25 %	25 %	433644136
76	NC_019957	ACCA	2	8	29276	29283	50 %	0 %	0 %	50 %	433644136
77	NC_019957	CCAC	2	8	29309	29316	25 %	0 %	0 %	75 %	433644136
78	NC_019957	CGGG	2	8	30560	30567	0 %	0 %	75 %	25 %	433644136
79	NC_019957	CCGG	2	8	30711	30718	0 %	0 %	50 %	50 %	433644136
80	NC_019957	CAGG	2	8	30933	30940	25 %	0 %	50 %	25 %	433644137
81	NC_019957	TCAG	2	8	31973	31980	25 %	25 %	25 %	25 %	433644138
82	NC_019957	CACC	2	8	32150	32157	25 %	0 %	0 %	75 %	433644138
83	NC_019957	GCCG	2	8	32439	32446	0 %	0 %	50 %	50 %	433644138
84	NC_019957	GGTT	2	8	32731	32738	0 %	50 %	50 %	0 %	433644139
85	NC_019957	CCGC	2	8	33477	33484	0 %	0 %	25 %	75 %	433644139
86	NC_019957	GCCC	2	8	33651	33658	0 %	0 %	25 %	75 %	433644139
87	NC_019957	TGGC	3	12	33767	33778	0 %	25 %	50 %	25 %	433644139
88	NC_019957	GGGT	2	8	34483	34490	0 %	25 %	75 %	0 %	433644139
89	NC_019957	CAGC	2	8	34624	34631	25 %	0 %	25 %	50 %	433644139
90	NC_019957	TAAT	2	8	34840	34847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019957	CGAG	2	8	35025	35032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019957	ACCT	2	8	35388	35395	25 %	25 %	0 %	50 %	433644140
93	NC_019957	TGGC	2	8	35678	35685	0 %	25 %	50 %	25 %	433644140
94	NC_019957	GATC	2	8	36616	36623	25 %	25 %	25 %	25 %	433644141
95	NC_019957	GTTG	2	8	36734	36741	0 %	50 %	50 %	0 %	433644141
96	NC_019957	GGAT	2	8	36834	36841	25 %	25 %	50 %	0 %	433644141
97	NC_019957	GCAG	2	8	36948	36955	25 %	0 %	50 %	25 %	433644141
98	NC_019957	CGAA	2	8	37391	37398	50 %	0 %	25 %	25 %	433644141
99	NC_019957	CGAC	2	8	37927	37934	25 %	0 %	25 %	50 %	433644141
100	NC_019957	CGCC	2	8	37990	37997	0 %	0 %	25 %	75 %	433644141
101	NC_019957	ACGC	2	8	38333	38340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019957	ATCC	2	8	38442	38449	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019957	CCGG	2	8	38488	38495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019957	GCTG	2	8	38739	38746	0 %	25 %	50 %	25 %	433644142
105	NC_019957	TGCC	2	8	38948	38955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019957	CGAC	2	8	39569	39576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019957	AGGC	2	8	39936	39943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019957	CAGG	2	8	40400	40407	25 %	0 %	50 %	25 %	433644144
109	NC_019957	GGCC	2	8	40558	40565	0 %	0 %	50 %	50 %	433644144
110	NC_019957	GTTG	2	8	41339	41346	0 %	50 %	50 %	0 %	433644144
111	NC_019957	GTCG	2	8	41588	41595	0 %	25 %	50 %	25 %	433644144
112	NC_019957	CGGG	2	8	41631	41638	0 %	0 %	75 %	25 %	433644144
113	NC_019957	CGGT	2	8	41898	41905	0 %	25 %	50 %	25 %	433644144
114	NC_019957	GGCC	2	8	41932	41939	0 %	0 %	50 %	50 %	433644144
115	NC_019957	CCGC	2	8	43050	43057	0 %	0 %	25 %	75 %	433644145
116	NC_019957	CAAC	2	8	43264	43271	50 %	0 %	0 %	50 %	433644145
117	NC_019957	ATTG	2	8	43388	43395	25 %	50 %	25 %	0 %	433644145
118	NC_019957	AGAT	2	8	43762	43769	50 %	25 %	25 %	0 %	433644145
119	NC_019957	TCCG	2	8	43997	44004	0 %	25 %	25 %	50 %	433644145
120	NC_019957	GGTC	2	8	44054	44061	0 %	25 %	50 %	25 %	433644145
121	NC_019957	GATC	2	8	44117	44124	25 %	25 %	25 %	25 %	433644145
122	NC_019957	ACCG	2	8	44199	44206	25 %	0 %	25 %	50 %	433644145
123	NC_019957	AGCC	2	8	44679	44686	25 %	0 %	25 %	50 %	433644145
124	NC_019957	AGAT	2	8	44950	44957	50 %	25 %	25 %	0 %	433644145
125	NC_019957	AGCC	2	8	45708	45715	25 %	0 %	25 %	50 %	433644145
126	NC_019957	GGCA	2	8	46155	46162	25 %	0 %	50 %	25 %	433644145
127	NC_019957	GCCG	2	8	46617	46624	0 %	0 %	50 %	50 %	433644145
128	NC_019957	TCCA	2	8	47136	47143	25 %	25 %	0 %	50 %	433644145
129	NC_019957	CCGA	2	8	47281	47288	25 %	0 %	25 %	50 %	433644145
130	NC_019957	GATG	2	8	47309	47316	25 %	25 %	50 %	0 %	433644145
131	NC_019957	CACC	2	8	47813	47820	25 %	0 %	0 %	75 %	433644145
132	NC_019957	GCGG	2	8	47836	47843	0 %	0 %	75 %	25 %	433644145
133	NC_019957	GGCG	2	8	47853	47860	0 %	0 %	75 %	25 %	433644145
134	NC_019957	CCAG	2	8	48155	48162	25 %	0 %	25 %	50 %	433644145
135	NC_019957	GGCG	2	8	48283	48290	0 %	0 %	75 %	25 %	433644145
136	NC_019957	GCGG	2	8	48358	48365	0 %	0 %	75 %	25 %	433644145
137	NC_019957	GCGG	2	8	48376	48383	0 %	0 %	75 %	25 %	433644145
138	NC_019957	CAGC	2	8	48507	48514	25 %	0 %	25 %	50 %	433644145
139	NC_019957	AGGG	2	8	49727	49734	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019957	GCTG	2	8	50371	50378	0 %	25 %	50 %	25 %	433644148
141	NC_019957	TCGA	2	8	50577	50584	25 %	25 %	25 %	25 %	433644148
142	NC_019957	CCAG	2	8	51517	51524	25 %	0 %	25 %	50 %	433644148
143	NC_019957	CCGA	2	8	53704	53711	25 %	0 %	25 %	50 %	433644149
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