MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 43536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019955	TAT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019955	ACT	2	6	66	71	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019955	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019955	TCT	2	6	110	115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019955	GTT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019955	GCA	2	6	408	413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656323
7	NC_019955	TCT	2	6	414	419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656323
8	NC_019955	TCT	2	6	480	485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656323
9	NC_019955	TGC	2	6	596	601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656323
10	NC_019955	CAC	2	6	769	774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656323
11	NC_019955	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656323
12	NC_019955	CTT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019955	ATT	2	6	909	914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656324
14	NC_019955	GTC	2	6	952	957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
15	NC_019955	TGC	2	6	989	994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
16	NC_019955	GCT	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
17	NC_019955	GAC	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
18	NC_019955	GGT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656324
19	NC_019955	TTG	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656324
20	NC_019955	CCA	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
21	NC_019955	TCA	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656324
22	NC_019955	CAG	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
23	NC_019955	GAT	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656324
24	NC_019955	GCA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
25	NC_019955	GAC	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
26	NC_019955	CTT	2	6	1656	1661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656324
27	NC_019955	GAT	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656324
28	NC_019955	TCT	2	6	1736	1741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656324
29	NC_019955	CCA	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
30	NC_019955	TGC	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
31	NC_019955	GCT	2	6	1853	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
32	NC_019955	GCT	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
33	NC_019955	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656324
34	NC_019955	ACC	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
35	NC_019955	GCC	2	6	2360	2365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_019955	GAA	2	6	2493	2498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
37	NC_019955	AAG	4	12	2500	2511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
38	NC_019955	TCT	2	6	2540	2545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656325
39	NC_019955	GTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
40	NC_019955	TCT	2	6	2579	2584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656325
41	NC_019955	AGT	2	6	2611	2616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
42	NC_019955	GTA	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
43	NC_019955	GAA	2	6	2664	2669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
44	NC_019955	CAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656325
45	NC_019955	GTC	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
46	NC_019955	CAC	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
47	NC_019955	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
48	NC_019955	CTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
49	NC_019955	TTG	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
50	NC_019955	AGC	2	6	3228	3233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656325
51	NC_019955	AGT	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
52	NC_019955	TGC	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
53	NC_019955	ACC	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
54	NC_019955	GTT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
55	NC_019955	GTT	2	6	3453	3458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
56	NC_019955	GCT	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
57	NC_019955	CAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656325
58	NC_019955	TGA	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
59	NC_019955	TGA	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
60	NC_019955	CAG	2	6	3728	3733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656325
61	NC_019955	CCA	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
62	NC_019955	TCA	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656325
63	NC_019955	TGC	2	6	3887	3892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
64	NC_019955	TTG	2	6	3945	3950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
65	NC_019955	TGG	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019955	AAC	2	6	4280	4285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656326
67	NC_019955	TTC	2	6	4322	4327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656326
68	NC_019955	CAA	2	6	4335	4340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656326
69	NC_019955	ATG	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656326
70	NC_019955	ATT	2	6	4606	4611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656327
71	NC_019955	ACG	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656327
72	NC_019955	AGT	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019955	AAG	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019955	GAA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019955	CAA	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019955	CGA	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656328
77	NC_019955	CTT	2	6	5108	5113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
78	NC_019955	ACC	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656328
79	NC_019955	CTT	2	6	5169	5174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
80	NC_019955	TCA	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
81	NC_019955	GCT	3	9	5282	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
82	NC_019955	CCA	2	6	5293	5298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656328
83	NC_019955	ATC	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
84	NC_019955	CTG	2	6	5355	5360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
85	NC_019955	TTC	2	6	5383	5388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
86	NC_019955	GTC	2	6	5535	5540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
87	NC_019955	TCG	2	6	5557	5562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
88	NC_019955	GAT	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656328
89	NC_019955	ATC	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
90	NC_019955	CAC	3	9	5777	5785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656329
91	NC_019955	AGT	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656329
92	NC_019955	TCA	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656329
93	NC_019955	GAT	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656329
94	NC_019955	GCA	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656329
95	NC_019955	CCA	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656329
96	NC_019955	TAA	2	6	6162	6167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656329
97	NC_019955	GAA	2	6	6203	6208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656329
98	NC_019955	GCA	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656329
99	NC_019955	CAT	2	6	6759	6764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656330
100	NC_019955	GTA	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656330
101	NC_019955	ATA	2	6	7253	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656330
102	NC_019955	TAC	2	6	7285	7290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019955	TAA	2	6	7345	7350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019955	ATA	2	6	7368	7373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019955	AGG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019955	ATA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019955	AAT	2	6	7562	7567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656331
108	NC_019955	TCG	2	6	7597	7602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656331
109	NC_019955	GCA	2	6	7712	7717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656332
110	NC_019955	AAG	2	6	7723	7728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656332
111	NC_019955	CGG	2	6	7963	7968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656332
112	NC_019955	GAC	2	6	8037	8042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656332
113	NC_019955	GCG	2	6	8142	8147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656332
114	NC_019955	AGC	2	6	8171	8176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656332
115	NC_019955	GGT	2	6	8199	8204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656332
116	NC_019955	AAC	2	6	8259	8264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656332
117	NC_019955	GTG	2	6	8277	8282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656332
118	NC_019955	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656332
119	NC_019955	CTA	2	6	8357	8362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656332
120	NC_019955	CAA	2	6	8408	8413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656332
121	NC_019955	AAG	2	6	8425	8430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656332
122	NC_019955	TTC	2	6	8433	8438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656332
123	NC_019955	TTG	2	6	8454	8459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656332
124	NC_019955	ATC	2	6	8475	8480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656332
125	NC_019955	GCC	2	6	8570	8575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656332
126	NC_019955	TGA	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656332
127	NC_019955	GCC	2	6	8737	8742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656332
128	NC_019955	CTG	2	6	8781	8786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656332
129	NC_019955	ACA	2	6	8815	8820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656332
130	NC_019955	TAC	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656332
131	NC_019955	CTG	2	6	8865	8870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656332
132	NC_019955	CGT	2	6	8877	8882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656332
133	NC_019955	TGG	2	6	8972	8977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656332
134	NC_019955	AGC	2	6	9019	9024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656332
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136	NC_019955	ACA	2	6	9194	9199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656333
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138	NC_019955	ATC	2	6	9411	9416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656333
139	NC_019955	TAC	2	6	9609	9614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656333
140	NC_019955	ATC	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656333
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143	NC_019955	CAA	2	6	9908	9913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656333
144	NC_019955	TGA	2	6	9932	9937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656333
145	NC_019955	TGC	2	6	9959	9964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656333
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147	NC_019955	AAC	2	6	10035	10040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656333
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151	NC_019955	TCA	2	6	10279	10284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656334
152	NC_019955	CAG	2	6	10287	10292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656334
153	NC_019955	CAG	2	6	10327	10332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656334
154	NC_019955	TGA	2	6	10457	10462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656334
155	NC_019955	TAA	2	6	10520	10525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656334
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160	NC_019955	GAC	2	6	11169	11174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656334
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163	NC_019955	GAC	2	6	11446	11451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656335
164	NC_019955	CAC	2	6	11464	11469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656335
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243	NC_019955	CAT	2	6	16630	16635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656339
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250	NC_019955	TTA	2	6	16938	16943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_019955	GAA	3	9	16967	16975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_019955	TCA	2	6	16985	16990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_019955	TGG	2	6	17045	17050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_019955	GTC	2	6	17091	17096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656340
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256	NC_019955	CTT	2	6	17126	17131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656340
257	NC_019955	TGT	2	6	17203	17208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656340
258	NC_019955	GTA	2	6	17316	17321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656340
259	NC_019955	GGC	2	6	17358	17363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656340
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261	NC_019955	TGA	2	6	17552	17557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656340
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290	NC_019955	TCT	2	6	19637	19642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
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