MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 5991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019955	TAT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019955	ACT	2	6	66	71	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019955	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019955	TCT	2	6	110	115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019955	GTT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019955	CTT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019955	GCC	2	6	2360	2365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019955	TGG	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019955	AGT	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019955	AAG	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019955	GAA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019955	CAA	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019955	TAC	2	6	7285	7290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019955	TAA	2	6	7345	7350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019955	ATA	2	6	7368	7373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019955	AGG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019955	ATA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019955	GCT	2	6	13813	13818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019955	TGG	2	6	13830	13835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019955	CAC	2	6	13845	13850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019955	CTA	2	6	13877	13882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019955	AAG	2	6	14107	14112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019955	CCG	2	6	14683	14688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019955	TTG	2	6	14707	14712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019955	TGA	2	6	14796	14801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019955	AGA	2	6	14846	14851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019955	TTA	2	6	16938	16943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019955	GAA	3	9	16967	16975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019955	TCA	2	6	16985	16990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019955	TGG	2	6	17045	17050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019955	AAC	2	6	19165	19170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019955	CAA	2	6	19214	19219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019955	AAT	2	6	19266	19271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019955	CAA	2	6	19298	19303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019955	CTG	2	6	22562	22567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019955	CAA	2	6	22616	22621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019955	TGA	2	6	22663	22668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019955	ATC	2	6	22769	22774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019955	AAT	2	6	22813	22818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019955	TAC	2	6	22865	22870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019955	AAC	2	6	24268	24273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019955	AGC	2	6	26677	26682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019955	CTT	2	6	26711	26716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019955	TCA	2	6	26739	26744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019955	TAA	2	6	26783	26788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019955	GCC	2	6	26809	26814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019955	TCG	2	6	30297	30302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019955	ATT	2	6	31180	31185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019955	TCG	2	6	31190	31195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019955	TGC	2	6	33186	33191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019955	TGA	2	6	33474	33479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019955	GGC	2	6	33651	33656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019955	GCG	2	6	33725	33730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019955	ATG	2	6	33802	33807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019955	CGA	2	6	33900	33905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019955	GAT	2	6	33925	33930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019955	GCA	2	6	33974	33979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019955	GAA	2	6	34033	34038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019955	ATT	2	6	34097	34102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019955	AGA	2	6	34116	34121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019955	CAG	2	6	34142	34147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019955	GGT	2	6	34207	34212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019955	GGC	2	6	34353	34358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019955	GAA	2	6	34596	34601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019955	TGC	2	6	34672	34677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019955	GTC	2	6	34684	34689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019955	GGA	2	6	34798	34803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019955	GAC	2	6	34811	34816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019955	TCA	2	6	34823	34828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019955	GGC	2	6	34878	34883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019955	CGT	2	6	34917	34922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019955	CCT	2	6	35159	35164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_019955	GAT	2	6	35170	35175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019955	AGA	3	9	35224	35232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019955	CGG	2	6	35294	35299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019955	TTC	2	6	35410	35415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019955	GAA	2	6	35421	35426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019955	CCA	2	6	35510	35515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019955	GAA	2	6	35617	35622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019955	ACA	2	6	35657	35662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019955	TTG	2	6	35668	35673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019955	CAT	2	6	35766	35771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019955	TCA	2	6	35805	35810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019955	GTA	2	6	35892	35897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019955	GTA	2	6	35920	35925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019955	AGG	2	6	36005	36010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019955	GCG	2	6	36077	36082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019955	CGA	2	6	36141	36146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019955	GAC	2	6	36170	36175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019955	TCC	2	6	36239	36244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_019955	TAC	2	6	36254	36259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019955	GGA	2	6	36548	36553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019955	TAC	2	6	36671	36676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019955	AAC	2	6	36802	36807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019955	TAC	2	6	36834	36839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019955	AGC	2	6	36891	36896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019955	CAT	2	6	36897	36902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019955	AGT	2	6	36964	36969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019955	CCT	2	6	37108	37113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019955	CTT	2	6	37223	37228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019955	ACG	2	6	37340	37345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019955	GGT	2	6	37440	37445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019955	TTA	2	6	37597	37602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019955	CGG	2	6	37723	37728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019955	ATG	2	6	37799	37804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019955	TAC	2	6	37897	37902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019955	ACC	2	6	37994	37999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_019955	TGG	2	6	38054	38059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019955	TCC	2	6	38080	38085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_019955	GGA	2	6	38097	38102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019955	GGT	2	6	38217	38222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019955	CGG	2	6	38304	38309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019955	TCA	2	6	38332	38337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019955	CGT	2	6	38412	38417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019955	GCT	2	6	38466	38471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019955	ACG	2	6	38647	38652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019955	ACA	2	6	38726	38731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019955	GAA	2	6	38942	38947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019955	GAA	2	6	40053	40058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019955	AGC	2	6	42077	42082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019955	CTT	2	6	42118	42123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019955	ACC	2	6	46975	46980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_019955	CTA	2	6	47020	47025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019955	AAC	2	6	49771	49776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019955	AAT	2	6	49803	49808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019955	TTG	2	6	49830	49835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019955	ACA	2	6	49842	49847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019955	TAT	2	6	49970	49975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019955	CCG	2	6	49982	49987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019955	GGA	2	6	50080	50085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019955	TGG	2	6	50104	50109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019955	TGG	2	6	50378	50383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019955	AGA	2	6	50643	50648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019955	CAG	2	6	50656	50661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019955	ACC	2	6	50714	50719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_019955	ACT	2	6	51543	51548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019955	TAT	2	6	51570	51575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019955	GAG	2	6	51702	51707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019955	TGT	2	6	51721	51726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019955	TGT	2	6	51893	51898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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