MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 complete genome

Total Repeats: 1030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019954	GCTGAT	2	12	6549	6560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	555077098
2	NC_019954	GCTTTG	2	12	10343	10354	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	438000919
3	NC_019954	TTTTAG	2	12	14802	14813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	438000925
4	NC_019954	CAGGGA	2	12	15268	15279	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	438000926
5	NC_019954	CAGGAA	2	12	16073	16084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	438000926
6	NC_019954	GATAAA	2	12	28583	28594	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019954	TACCTA	2	12	29173	29184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077107
8	NC_019954	TTTTAG	2	12	35138	35149	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	438000948
9	NC_019954	TATTGA	2	12	36898	36909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438000948
10	NC_019954	ACATGA	2	12	36925	36936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019954	TTATGG	2	12	37082	37093	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019954	GGCTCA	2	12	40049	40060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	438000951
13	NC_019954	ACAGTA	2	12	40426	40437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	438000951
14	NC_019954	GGTATT	2	12	42591	42602	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	438000953
15	NC_019954	GCAGAT	2	12	48934	48945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	438000959
16	NC_019954	AATTCT	2	12	54177	54188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019954	TAATGC	2	12	57736	57747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	438000967
18	NC_019954	TTAAAT	2	12	59746	59757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019954	CATAAA	2	12	61289	61300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	555077118
20	NC_019954	ATGCTG	2	12	65697	65708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	438000977
21	NC_019954	TTTGAC	2	12	68402	68413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	438000979
22	NC_019954	TAAAAA	2	12	69681	69692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	438000982
23	NC_019954	TTGGCA	2	12	70062	70073	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	438000982
24	NC_019954	AAATAG	2	12	73656	73667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438000984
25	NC_019954	GCAGGG	2	12	76432	76443	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	555077120
26	NC_019954	GGGGAT	2	12	76873	76884	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	555077120
27	NC_019954	TATCCA	2	12	81041	81052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077122
28	NC_019954	TTTAGA	2	12	84882	84893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438000993
29	NC_019954	AAAAGC	2	12	89135	89146	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	438000999
30	NC_019954	ATGGGA	2	12	90516	90527	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001000
31	NC_019954	TGGGGT	2	12	91802	91813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077125
32	NC_019954	AGAGGA	2	12	95794	95805	50 %	0 %	50 %	0 %	555077128
33	NC_019954	AAGAAA	4	24	95835	95858	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	555077128
34	NC_019954	ATCCGG	2	12	99063	99074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	438001011
35	NC_019954	TATAAA	2	12	103746	103757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019954	CAAAAG	2	12	106479	106490	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019954	AAATGC	2	12	108070	108081	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	438001023
38	NC_019954	AAATAT	2	12	110710	110721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438001028
39	NC_019954	TCAGGT	2	12	114970	114981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	555077134
40	NC_019954	AAATAA	2	12	115455	115466	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	555077134
41	NC_019954	AGGAAG	2	12	116777	116788	50 %	0 %	50 %	0 %	555077134
42	NC_019954	CCATAC	2	12	118501	118512	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	438001036
43	NC_019954	AAAGCT	2	12	121958	121969	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	438001039
44	NC_019954	CCGATG	2	12	122636	122647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	555077136
45	NC_019954	GAAAAA	2	12	125423	125434	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	438001043
46	NC_019954	AAAATG	2	12	130173	130184	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	555077142
47	NC_019954	GTTTAT	2	12	133850	133861	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	438001049
48	NC_019954	GACAAA	2	12	145618	145629	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	555077147
49	NC_019954	CCTTCT	2	12	146524	146535	0 %	50 %	0 %	50 %	555077149
50	NC_019954	TTGCTA	2	12	147038	147049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	555077149
51	NC_019954	TAAAGG	2	12	147233	147244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019954	AAATTT	2	12	150529	150540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019954	TTCCGG	2	12	153467	153478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438001068
54	NC_019954	GTAGAT	2	12	156971	156982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438001071
55	NC_019954	GGTATT	2	12	160102	160113	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019954	GGTTGC	2	12	162970	162981	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	438001079
57	NC_019954	CTACGC	2	12	166594	166605	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	438001083
58	NC_019954	TCTTAA	2	12	175721	175732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	438001091
59	NC_019954	GTAGAG	2	12	175752	175763	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001091
60	NC_019954	AGGCGG	2	12	180490	180501	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	438001096
61	NC_019954	GACGAA	2	12	180725	180736	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	438001096
62	NC_019954	GGGAAG	2	12	191016	191027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	438001105
63	NC_019954	GGATGA	2	12	191278	191289	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001105
64	NC_019954	AAATGC	2	12	196971	196982	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	438001111
65	NC_019954	TACTGC	2	12	198441	198452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	438001112
66	NC_019954	AAAGGT	2	12	200317	200328	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	438001115
67	NC_019954	TATATG	2	12	204847	204858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438001117
68	NC_019954	AGACTC	2	12	205317	205328	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	438001117
69	NC_019954	GCAGGA	2	12	210557	210568	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	438001122
70	NC_019954	TGCGGC	2	12	213058	213069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	438001123
71	NC_019954	GAAACA	2	12	217866	217877	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	438001131
72	NC_019954	AAAAGG	2	12	218377	218388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438001133
73	NC_019954	AAAGCT	2	12	218519	218530	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	438001133
74	NC_019954	TATGTT	2	12	225495	225506	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	555077172
75	NC_019954	TTGAAG	2	12	225737	225748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438001147
76	NC_019954	AAAAGA	2	12	227307	227318	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	555077174
77	NC_019954	CAAAAA	2	12	230304	230315	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	555077175
78	NC_019954	TTATAC	2	12	231718	231729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	555077176
79	NC_019954	TGCTCA	2	12	235357	235368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	438001161
80	NC_019954	TGAAAC	2	12	238682	238693	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019954	AGAAAA	2	12	245616	245627	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	555077179
82	NC_019954	AAGCGA	2	12	252614	252625	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019954	GCAACA	2	12	257941	257952	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	438001175
84	NC_019954	GCCCGG	2	12	258084	258095	0 %	0 %	50 %	50 %	438001175
85	NC_019954	GAATAT	2	12	260229	260240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	438001177
86	NC_019954	TTTCAT	2	12	261162	261173	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	438001178
87	NC_019954	GTAGAG	2	12	262648	262659	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001179
88	NC_019954	AGAAAA	2	12	262850	262861	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	438001179
89	NC_019954	GTAAAA	2	12	264994	265005	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438001182
90	NC_019954	TTTTAT	2	12	267281	267292	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019954	ATGGTG	2	12	269772	269783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	555077183
92	NC_019954	TCATGA	2	12	269990	270001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	555077183
93	NC_019954	AATGAA	2	12	270222	270233	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019954	TCATAA	2	12	270907	270918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019954	ACAGTA	2	12	284528	284539	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019954	AAAAAG	2	12	294673	294684	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019954	AAAACT	2	12	297680	297691	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	438001222
98	NC_019954	TGCTTT	2	12	298053	298064	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	438001222
99	NC_019954	TTAGCC	2	12	300036	300047	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019954	CCAAGC	2	12	301255	301266	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	438001225
101	NC_019954	TGAAAT	2	12	302050	302061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	438001225
102	NC_019954	TAAAGG	2	12	304244	304255	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	555077192
103	NC_019954	ATATTA	2	12	305583	305594	50 %	50 %	0 %	0 %	555077193
104	NC_019954	AAAGAA	2	12	306411	306422	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	555077193
105	NC_019954	ATATGT	2	12	307547	307558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438001229
106	NC_019954	GAAATA	2	12	308742	308753	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438001229
107	NC_019954	TTATGA	2	12	310794	310805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438001231
108	NC_019954	GAATGG	2	12	311168	311179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001231
109	NC_019954	CCGGAA	2	12	312568	312579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077194
110	NC_019954	TTATGA	2	12	314098	314109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	555077195
111	NC_019954	GATTAT	2	12	318083	318094	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438001239
112	NC_019954	GTCCAT	2	12	321676	321687	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	438001241
113	NC_019954	ACTTTG	2	12	323472	323483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	438001242
114	NC_019954	CGGAGG	2	12	331212	331223	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	438001249
115	NC_019954	GAAGAT	2	12	334987	334998	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	438001253
116	NC_019954	TAAAAA	2	12	337672	337683	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	438001257
117	NC_019954	AAAACC	2	12	338070	338081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019954	AGGATG	3	18	339109	339126	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001258
119	NC_019954	GTAAAA	2	12	342394	342405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438001259
120	NC_019954	TAGAAA	2	12	342881	342892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438001259
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124	NC_019954	TAATAT	2	12	356003	356014	50 %	50 %	0 %	0 %	438001274
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131	NC_019954	TTATGA	2	12	375953	375964	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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207	NC_019954	TGATCA	2	12	583134	583145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	438001513
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216	NC_019954	TGCCGG	2	12	603780	603791	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	438001535
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219	NC_019954	AAATAG	2	12	609353	609364	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438001542
220	NC_019954	GTTGCA	2	12	610641	610652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	438001544
221	NC_019954	AGGTAT	2	12	610999	611010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438001545
222	NC_019954	CAAATG	2	12	616171	616182	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	555077281
223	NC_019954	TGACGG	2	12	621382	621393	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	555077282
224	NC_019954	TTATGC	2	12	623956	623967	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	438001558
225	NC_019954	TACCGT	2	12	625940	625951	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	438001559
226	NC_019954	AAGGAA	2	12	626504	626515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
227	NC_019954	CAAAAG	2	12	627202	627213	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	555077283
228	NC_019954	CATTTC	2	12	630864	630875	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	555077284
229	NC_019954	AAGGAA	2	12	631250	631261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077284
230	NC_019954	GTCCTC	2	12	636342	636353	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	438001568
231	NC_019954	ACAAGA	2	12	639422	639433	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	555077287
232	NC_019954	AAAAGA	2	12	646226	646237	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	438001575
233	NC_019954	GATATA	2	12	649867	649878	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	438001580
234	NC_019954	ACCATT	2	12	651022	651033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_019954	ACACCA	2	12	656706	656717	50 %	0 %	0 %	50 %	438001586
236	NC_019954	TAACAA	2	12	662102	662113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
237	NC_019954	AGTTAA	2	12	666425	666436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	555077293
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347	NC_019954	GTTAGG	2	12	947368	947379	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	438001897
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349	NC_019954	CTACTG	2	12	951777	951788	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	555077374
350	NC_019954	GATTTG	2	12	952061	952072	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
351	NC_019954	AAATAA	2	12	952758	952769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	555077375
352	NC_019954	AAAAGC	2	12	953283	953294	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	555077375
353	NC_019954	TAAAGA	2	12	954536	954547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438001909
354	NC_019954	TATCAT	2	12	961480	961491	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	438001917
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356	NC_019954	CCATAT	2	12	965128	965139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	438001921
357	NC_019954	CTTTTT	2	12	967196	967207	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
358	NC_019954	TAAATA	2	12	969313	969324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438001927
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360	NC_019954	GTTTTT	2	12	973753	973764	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	555077383
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362	NC_019954	TTAGAA	2	12	977742	977753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
363	NC_019954	TCAGAA	2	12	988483	988494	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	555077386
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366	NC_019954	GATGCA	2	12	992867	992878	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	438001960
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370	NC_019954	ATAAAT	2	12	997190	997201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
371	NC_019954	TTGAAA	2	12	1001923	1001934	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	555077392
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380	NC_019954	ATGGTT	2	12	1034181	1034192	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	438002013
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382	NC_019954	TTTATA	2	12	1045183	1045194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_019954	ATGATA	2	12	1045490	1045501	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	438002026
384	NC_019954	TATTAA	2	12	1048000	1048011	50 %	50 %	0 %	0 %	438002028
385	NC_019954	TAAATA	2	12	1053540	1053551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438002035
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391	NC_019954	TATGCA	2	12	1070014	1070025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
392	NC_019954	TTTGTT	2	12	1073244	1073255	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	438002056
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399	NC_019954	GATAAA	3	18	1090336	1090353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	555077431
400	NC_019954	ACCGAA	2	12	1092289	1092300	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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403	NC_019954	GGGATT	2	12	1095607	1095618	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	438002095
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420	NC_019954	GCCGCA	2	12	1156166	1156177	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	555077458
421	NC_019954	CAAATC	2	12	1159535	1159546	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	555077459
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423	NC_019954	TATAAT	2	12	1174637	1174648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_019954	TGATTC	2	12	1175459	1175470	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	438002191
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432	NC_019954	TGCAGC	2	12	1189995	1190006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	438002203
433	NC_019954	AGCTGA	2	12	1192959	1192970	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	438002206
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443	NC_019954	AATATT	2	12	1214465	1214476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_019954	TAAAAA	2	12	1214917	1214928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	555077483
445	NC_019954	AAGCGA	2	12	1220166	1220177	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
446	NC_019954	AGTAGC	2	12	1223706	1223717	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	438002234
447	NC_019954	ATGGTG	2	12	1225254	1225265	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	438002236
448	NC_019954	ATTAAT	2	12	1226009	1226020	50 %	50 %	0 %	0 %	555077486
449	NC_019954	TTGATG	2	12	1229898	1229909	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	438002242
450	NC_019954	TGAAAA	2	12	1231741	1231752	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	555077488
451	NC_019954	ACATTG	2	12	1235650	1235661	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	555077490
452	NC_019954	TTTATT	2	12	1236744	1236755	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	555077491
453	NC_019954	CGGTGC	2	12	1239463	1239474	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	555077494
454	NC_019954	TAAATG	2	12	1243026	1243037	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
455	NC_019954	GAAAAA	2	12	1244483	1244494	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	438002260
456	NC_019954	AGGGGC	2	12	1245285	1245296	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	438002261
457	NC_019954	ATTGAT	2	12	1245388	1245399	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438002261
458	NC_019954	TAAAAT	2	12	1246587	1246598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077495
459	NC_019954	TATTGC	2	12	1249925	1249936	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	438002268
460	NC_019954	TATTAA	2	12	1252865	1252876	50 %	50 %	0 %	0 %	555077498
461	NC_019954	GAACAA	2	12	1254002	1254013	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	438002275
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498	NC_019954	TTCTAT	2	12	1330739	1330750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	555077529
499	NC_019954	TTAAAT	2	12	1330952	1330963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_019954	GAAAAT	6	36	1331265	1331300	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438002368

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