MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 complete genome

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019954	GATAAA	2	12	28583	28594	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019954	ACATGA	2	12	36925	36936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019954	TTATGG	2	12	37082	37093	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019954	AATTCT	2	12	54177	54188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019954	TTAAAT	2	12	59746	59757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019954	TATAAA	2	12	103746	103757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019954	CAAAAG	2	12	106479	106490	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019954	TAAAGG	2	12	147233	147244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019954	AAATTT	2	12	150529	150540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019954	GGTATT	2	12	160102	160113	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019954	TGAAAC	2	12	238682	238693	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019954	AAGCGA	2	12	252614	252625	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019954	TTTTAT	2	12	267281	267292	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019954	AATGAA	2	12	270222	270233	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019954	TCATAA	2	12	270907	270918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019954	ACAGTA	2	12	284528	284539	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019954	AAAAAG	2	12	294673	294684	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019954	TTAGCC	2	12	300036	300047	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019954	AAAACC	2	12	338070	338081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019954	TAATCT	2	12	374160	374171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019954	TTATGA	2	12	375953	375964	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019954	ATGTAT	2	12	380608	380619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019954	CTGTAA	2	12	380695	380706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019954	CAAAAT	2	12	468499	468510	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019954	TTTATA	2	12	504698	504709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019954	ATATTT	2	12	516900	516911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019954	TTTAAA	2	12	518353	518364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019954	CATCAA	2	12	570234	570245	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019954	TGATGT	2	12	579985	579996	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019954	AAGGAA	2	12	626504	626515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019954	ACCATT	2	12	651022	651033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019954	TAACAA	2	12	662102	662113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019954	CATTAG	2	12	703157	703168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019954	TTGACA	2	12	743456	743467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019954	CTAAAA	2	12	748294	748305	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019954	CTCAAA	2	12	778306	778317	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019954	ATAAAA	2	12	783996	784007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019954	ATTGTT	2	12	833956	833967	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019954	ATTTAT	2	12	888054	888065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019954	TAACTA	2	12	913179	913190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019954	AAAATA	2	12	927431	927442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019954	AAAAGC	2	12	940487	940498	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019954	ATATTT	2	12	944673	944684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019954	GATTTG	2	12	952061	952072	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019954	CTTTTT	2	12	967196	967207	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019954	TTAGAA	2	12	977742	977753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019954	AAAATC	2	12	992114	992125	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019954	CAAGCT	2	12	996967	996978	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019954	ATAAAT	2	12	997190	997201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019954	ATTTTC	2	12	1021464	1021475	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019954	TAAAGC	2	12	1021714	1021725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019954	TTTATA	2	12	1045183	1045194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019954	TATGCA	2	12	1070014	1070025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019954	ACCGAA	2	12	1092289	1092300	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019954	TATAAT	2	12	1174637	1174648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019954	AATATT	2	12	1214465	1214476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019954	AAGCGA	2	12	1220166	1220177	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019954	TAAATG	2	12	1243026	1243037	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019954	TTAAAT	2	12	1330952	1330963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019954	TAAAAT	2	12	1378277	1378288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019954	TAAAAC	2	12	1407048	1407059	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019954	TGATTT	2	12	1426297	1426308	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019954	TTTATA	2	12	1429068	1429079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019954	CTGCTA	2	12	1434360	1434371	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019954	CAATTG	2	12	1439094	1439105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019954	ATTTAT	2	12	1444375	1444386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019954	CTTATC	2	12	1463592	1463603	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019954	ATTTAA	2	12	1534112	1534123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019954	AATTGA	2	12	1582565	1582576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019954	ATAATT	2	12	1582992	1583003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019954	AGTATA	2	12	1618576	1618587	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019954	TTATAT	2	12	1667210	1667221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019954	ATAACA	2	12	1671373	1671384	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019954	TTTTGC	2	12	1684064	1684075	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019954	TAAAAA	2	12	1748218	1748229	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019954	TCAATT	2	12	1793730	1793741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019954	TTATTT	2	12	1804006	1804017	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019954	AATTTC	2	12	1874677	1874688	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019954	AATTTA	2	12	1946544	1946555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019954	TGAGCT	2	12	1956549	1956560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019954	TAAAAA	2	12	1957639	1957650	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019954	TAGAAT	2	12	1975009	1975020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019954	TACCCC	2	12	1997295	1997306	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_019954	ATTTAC	2	12	2093115	2093126	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_019954	CAATTA	2	12	2101484	2101495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019954	GCCTAT	2	12	2109032	2109043	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019954	AATAAA	2	12	2113078	2113089	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019954	TCAAGT	2	12	2191503	2191514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019954	TAAAAT	2	12	2194959	2194970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019954	TTATTT	2	12	2217716	2217727	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019954	GCTATG	2	12	2225962	2225973	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019954	TTTTTA	2	12	2239083	2239094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019954	ATTTTT	2	12	2246423	2246434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019954	GAATAT	2	12	2250920	2250931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019954	ATAAAA	2	12	2254684	2254695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019954	TTAATC	2	12	2269350	2269361	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_019954	AAAAAT	2	12	2276183	2276194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019954	ATATTT	2	12	2276896	2276907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019954	TAAAAT	2	12	2300450	2300461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019954	ATATTT	2	12	2305888	2305899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019954	TTTCAA	2	12	2331754	2331765	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019954	TAAAAT	2	12	2337822	2337833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019954	CGCCTC	2	12	2349497	2349508	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_019954	AATATA	2	12	2400907	2400918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019954	TAGATA	2	12	2403436	2403447	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019954	TTAAGT	2	12	2407549	2407560	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019954	TAAAAT	2	12	2412965	2412976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019954	CTTTCA	2	12	2469106	2469117	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019954	TTTAAT	2	12	2483419	2483430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019954	TAAATT	2	12	2487311	2487322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019954	TTAAGT	2	12	2487634	2487645	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019954	TAAAAA	2	12	2495392	2495403	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019954	TAAAAA	2	12	2497456	2497467	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019954	TTTTTA	2	12	2525022	2525033	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019954	TATTTT	2	12	2567656	2567667	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019954	TGTAAG	2	12	2577250	2577261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019954	TACTTC	2	12	2577391	2577402	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019954	ATTTTT	2	12	2585607	2585618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019954	GAAAAA	2	12	2606865	2606876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019954	TTAATT	2	12	2632420	2632431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019954	TGTATT	2	12	2656581	2656592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019954	TATTTA	2	12	2670522	2670533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019954	TTTTAA	2	12	2689476	2689487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019954	GTTGCG	2	12	2690788	2690799	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019954	TAAATA	2	12	2708872	2708883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.