MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 complete genome

Total Repeats: 905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019954	GCTGAT	2	12	6549	6560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	555077098
2	NC_019954	GCTTTG	2	12	10343	10354	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	438000919
3	NC_019954	TTTTAG	2	12	14802	14813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	438000925
4	NC_019954	CAGGGA	2	12	15268	15279	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	438000926
5	NC_019954	CAGGAA	2	12	16073	16084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	438000926
6	NC_019954	TACCTA	2	12	29173	29184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077107
7	NC_019954	TTTTAG	2	12	35138	35149	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	438000948
8	NC_019954	TATTGA	2	12	36898	36909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438000948
9	NC_019954	GGCTCA	2	12	40049	40060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	438000951
10	NC_019954	ACAGTA	2	12	40426	40437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	438000951
11	NC_019954	GGTATT	2	12	42591	42602	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	438000953
12	NC_019954	GCAGAT	2	12	48934	48945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	438000959
13	NC_019954	TAATGC	2	12	57736	57747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	438000967
14	NC_019954	CATAAA	2	12	61289	61300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	555077118
15	NC_019954	ATGCTG	2	12	65697	65708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	438000977
16	NC_019954	TTTGAC	2	12	68402	68413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	438000979
17	NC_019954	TAAAAA	2	12	69681	69692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	438000982
18	NC_019954	TTGGCA	2	12	70062	70073	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	438000982
19	NC_019954	AAATAG	2	12	73656	73667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438000984
20	NC_019954	GCAGGG	2	12	76432	76443	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	555077120
21	NC_019954	GGGGAT	2	12	76873	76884	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	555077120
22	NC_019954	TATCCA	2	12	81041	81052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077122
23	NC_019954	TTTAGA	2	12	84882	84893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438000993
24	NC_019954	AAAAGC	2	12	89135	89146	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	438000999
25	NC_019954	ATGGGA	2	12	90516	90527	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001000
26	NC_019954	TGGGGT	2	12	91802	91813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077125
27	NC_019954	AGAGGA	2	12	95794	95805	50 %	0 %	50 %	0 %	555077128
28	NC_019954	AAGAAA	4	24	95835	95858	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	555077128
29	NC_019954	ATCCGG	2	12	99063	99074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	438001011
30	NC_019954	AAATGC	2	12	108070	108081	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	438001023
31	NC_019954	AAATAT	2	12	110710	110721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438001028
32	NC_019954	TCAGGT	2	12	114970	114981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	555077134
33	NC_019954	AAATAA	2	12	115455	115466	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	555077134
34	NC_019954	AGGAAG	2	12	116777	116788	50 %	0 %	50 %	0 %	555077134
35	NC_019954	CCATAC	2	12	118501	118512	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	438001036
36	NC_019954	AAAGCT	2	12	121958	121969	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	438001039
37	NC_019954	CCGATG	2	12	122636	122647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	555077136
38	NC_019954	GAAAAA	2	12	125423	125434	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	438001043
39	NC_019954	AAAATG	2	12	130173	130184	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	555077142
40	NC_019954	GTTTAT	2	12	133850	133861	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	438001049
41	NC_019954	GACAAA	2	12	145618	145629	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	555077147
42	NC_019954	CCTTCT	2	12	146524	146535	0 %	50 %	0 %	50 %	555077149
43	NC_019954	TTGCTA	2	12	147038	147049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	555077149
44	NC_019954	TTCCGG	2	12	153467	153478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438001068
45	NC_019954	GTAGAT	2	12	156971	156982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438001071
46	NC_019954	GGTTGC	2	12	162970	162981	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	438001079
47	NC_019954	CTACGC	2	12	166594	166605	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	438001083
48	NC_019954	TCTTAA	2	12	175721	175732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	438001091
49	NC_019954	GTAGAG	2	12	175752	175763	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001091
50	NC_019954	AGGCGG	2	12	180490	180501	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	438001096
51	NC_019954	GACGAA	2	12	180725	180736	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	438001096
52	NC_019954	GGGAAG	2	12	191016	191027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	438001105
53	NC_019954	GGATGA	2	12	191278	191289	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001105
54	NC_019954	AAATGC	2	12	196971	196982	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	438001111
55	NC_019954	TACTGC	2	12	198441	198452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	438001112
56	NC_019954	AAAGGT	2	12	200317	200328	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	438001115
57	NC_019954	TATATG	2	12	204847	204858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438001117
58	NC_019954	AGACTC	2	12	205317	205328	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	438001117
59	NC_019954	GCAGGA	2	12	210557	210568	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	438001122
60	NC_019954	TGCGGC	2	12	213058	213069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	438001123
61	NC_019954	GAAACA	2	12	217866	217877	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	438001131
62	NC_019954	AAAAGG	2	12	218377	218388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438001133
63	NC_019954	AAAGCT	2	12	218519	218530	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	438001133
64	NC_019954	TATGTT	2	12	225495	225506	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	555077172
65	NC_019954	TTGAAG	2	12	225737	225748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438001147
66	NC_019954	AAAAGA	2	12	227307	227318	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	555077174
67	NC_019954	CAAAAA	2	12	230304	230315	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	555077175
68	NC_019954	TTATAC	2	12	231718	231729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	555077176
69	NC_019954	TGCTCA	2	12	235357	235368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	438001161
70	NC_019954	AGAAAA	2	12	245616	245627	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	555077179
71	NC_019954	GCAACA	2	12	257941	257952	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	438001175
72	NC_019954	GCCCGG	2	12	258084	258095	0 %	0 %	50 %	50 %	438001175
73	NC_019954	GAATAT	2	12	260229	260240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	438001177
74	NC_019954	TTTCAT	2	12	261162	261173	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	438001178
75	NC_019954	GTAGAG	2	12	262648	262659	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001179
76	NC_019954	AGAAAA	2	12	262850	262861	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	438001179
77	NC_019954	GTAAAA	2	12	264994	265005	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438001182
78	NC_019954	ATGGTG	2	12	269772	269783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	555077183
79	NC_019954	TCATGA	2	12	269990	270001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	555077183
80	NC_019954	AAAACT	2	12	297680	297691	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	438001222
81	NC_019954	TGCTTT	2	12	298053	298064	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	438001222
82	NC_019954	CCAAGC	2	12	301255	301266	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	438001225
83	NC_019954	TGAAAT	2	12	302050	302061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	438001225
84	NC_019954	TAAAGG	2	12	304244	304255	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	555077192
85	NC_019954	ATATTA	2	12	305583	305594	50 %	50 %	0 %	0 %	555077193
86	NC_019954	AAAGAA	2	12	306411	306422	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	555077193
87	NC_019954	ATATGT	2	12	307547	307558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438001229
88	NC_019954	GAAATA	2	12	308742	308753	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438001229
89	NC_019954	TTATGA	2	12	310794	310805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438001231
90	NC_019954	GAATGG	2	12	311168	311179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001231
91	NC_019954	CCGGAA	2	12	312568	312579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077194
92	NC_019954	TTATGA	2	12	314098	314109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	555077195
93	NC_019954	GATTAT	2	12	318083	318094	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	438001239
94	NC_019954	GTCCAT	2	12	321676	321687	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	438001241
95	NC_019954	ACTTTG	2	12	323472	323483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	438001242
96	NC_019954	CGGAGG	2	12	331212	331223	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	438001249
97	NC_019954	GAAGAT	2	12	334987	334998	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	438001253
98	NC_019954	TAAAAA	2	12	337672	337683	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	438001257
99	NC_019954	AGGATG	3	18	339109	339126	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	438001258
100	NC_019954	GTAAAA	2	12	342394	342405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438001259
101	NC_019954	TAGAAA	2	12	342881	342892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438001259
102	NC_019954	AAATCC	2	12	345195	345206	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	555077201
103	NC_019954	AAAAAC	2	12	346746	346757	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	555077202
104	NC_019954	GATTCA	2	12	349588	349599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	438001269
105	NC_019954	TAATAT	2	12	356003	356014	50 %	50 %	0 %	0 %	438001274
106	NC_019954	AGCTAA	2	12	361306	361317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	555077204
107	NC_019954	TAAAAA	2	12	367805	367816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	555077207
108	NC_019954	TAAAAG	2	12	368996	369007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	438001286
109	NC_019954	GATGTT	2	12	371277	371288	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	438001288
110	NC_019954	GAAATG	2	12	372463	372474	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	438001290
111	NC_019954	CGGAGC	2	12	377933	377944	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	438001298
112	NC_019954	GGAAAG	2	12	379087	379098	50 %	0 %	50 %	0 %	438001299
113	NC_019954	TGGCGG	2	12	379877	379888	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	438001299
114	NC_019954	ACTGTT	2	12	384968	384979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	438001304
115	NC_019954	AGGAAA	2	12	387068	387079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438001306
116	NC_019954	ATTCAT	2	12	388416	388427	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	438001307
117	NC_019954	AGAAAG	2	12	390770	390781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077209
118	NC_019954	GTCCTC	2	12	392321	392332	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	438001312
119	NC_019954	TGGATA	2	12	406235	406246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438001322
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218	NC_019954	GTTATT	2	12	706547	706558	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	438001633
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220	NC_019954	TTGACT	2	12	709904	709915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	438001637
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222	NC_019954	TGGCCA	2	12	711287	711298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	438001638
223	NC_019954	CCATCA	2	12	712183	712194	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	555077308
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228	NC_019954	CAAAGA	2	12	727836	727847	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	555077316
229	NC_019954	AATATT	2	12	733724	733735	50 %	50 %	0 %	0 %	438001661
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231	NC_019954	TGGCTA	2	12	739053	739064	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	555077318
232	NC_019954	CTATTG	2	12	746835	746846	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	438001670
233	NC_019954	TCAATT	2	12	749343	749354	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	555077321
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332	NC_019954	TATTAA	2	12	1048000	1048011	50 %	50 %	0 %	0 %	438002028
333	NC_019954	TAAATA	2	12	1053540	1053551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438002035
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336	NC_019954	ATATCA	2	12	1063395	1063406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	555077418
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338	NC_019954	ATGAGT	2	12	1069046	1069057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438002051
339	NC_019954	TTTGTT	2	12	1073244	1073255	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	438002056
340	NC_019954	TATTTT	2	12	1073694	1073705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	438002056
341	NC_019954	GAAAGA	2	12	1075117	1075128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077423
342	NC_019954	TGGATG	2	12	1079539	1079550	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	555077426
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