MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 complete genome

Total Repeats: 445

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019954	TATAA	2	10	61	70	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019954	ATATA	2	10	14091	14100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019954	ATTCT	2	10	16680	16689	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019954	TAGCA	2	10	16734	16743	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019954	CTTAA	2	10	18947	18956	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019954	TTTTC	2	10	19240	19249	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019954	GCAAA	2	10	20830	20839	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019954	AAACA	2	10	37243	37252	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019954	TAATT	2	10	52630	52639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019954	ATTTA	2	10	54230	54239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019954	AATAC	2	10	55875	55884	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019954	ATGTG	2	10	69161	69170	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019954	CATCA	2	10	69181	69190	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_019954	GGATG	2	10	87459	87468	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019954	GTGAG	2	10	91344	91353	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019954	ATATT	2	10	93979	93988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019954	ATTTT	2	10	99423	99432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019954	CAAAA	2	10	105000	105009	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019954	ACTAT	2	10	107327	107336	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019954	TAATT	2	10	107421	107430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019954	AGAAA	2	10	108993	109002	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019954	TTTAT	2	10	129834	129843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019954	TTAAA	2	10	144218	144227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019954	ATTAA	2	10	144235	144244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019954	ATTTG	2	10	148601	148610	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019954	ATATT	2	10	148737	148746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019954	TAACT	2	10	148811	148820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019954	TAATA	2	10	161685	161694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019954	CAGGG	2	10	162504	162513	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019954	AAGGC	2	10	163412	163421	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019954	AGATG	2	10	163544	163553	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019954	TATAT	3	15	168897	168911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019954	GAATA	2	10	168922	168931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019954	TGATA	2	10	175250	175259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019954	TGTTT	2	10	182412	182421	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019954	ATTTT	2	10	182609	182618	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019954	ATATA	2	10	189789	189798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019954	ACGAA	2	10	193281	193290	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019954	GAATA	2	10	193327	193336	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019954	TAATT	2	10	196322	196331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019954	AGAAA	2	10	197894	197903	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019954	AACCA	2	10	213995	214004	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_019954	TTTGA	2	10	215686	215695	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019954	ATTTT	2	10	236941	236950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019954	ACGAC	2	10	237414	237423	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_019954	CAAGC	2	10	238508	238517	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_019954	TGATA	2	10	242138	242147	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019954	TTTCT	2	10	246148	246157	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_019954	TCGTG	2	10	251268	251277	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019954	GGGAG	2	10	252481	252490	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019954	ATCCC	2	10	254771	254780	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_019954	TCCTT	2	10	260340	260349	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_019954	AACTT	2	10	260379	260388	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019954	AATAG	2	10	268243	268252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019954	ATACC	2	10	270994	271003	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_019954	ATACG	2	10	271275	271284	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_019954	ATATT	2	10	272609	272618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019954	GCCTT	2	10	273166	273175	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_019954	AATAC	2	10	277844	277853	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019954	ATTAC	2	10	280998	281007	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019954	GAAAA	2	10	281055	281064	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019954	GTTAA	2	10	282822	282831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019954	AGTAT	2	10	294700	294709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019954	ATGCG	2	10	294756	294765	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_019954	AATAA	2	10	343141	343150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019954	ATTTT	2	10	345435	345444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019954	ATTTA	3	15	349269	349283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019954	TGGGG	2	10	350419	350428	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019954	ATTAT	2	10	357076	357085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019954	TTACA	2	10	364212	364221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019954	TAAAA	2	10	370442	370451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019954	TAGTA	2	10	371406	371415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019954	ACTTT	2	10	383043	383052	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019954	CATTA	2	10	384079	384088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019954	TAATT	2	10	386364	386373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019954	TATAA	2	10	390576	390585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019954	CAAAA	2	10	398267	398276	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019954	CAGAA	2	10	399141	399150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019954	ATATT	2	10	411644	411653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019954	ATTTA	2	10	418878	418887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019954	CATTT	2	10	431949	431958	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019954	TGTTA	2	10	432149	432158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019954	AACAA	2	10	447296	447305	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019954	ATTTT	2	10	447691	447700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019954	ATTTA	2	10	485395	485404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019954	TATTT	2	10	495118	495127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019954	AAAAG	2	10	506327	506336	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019954	AAGAA	2	10	507198	507207	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019954	TCCCT	2	10	516821	516830	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_019954	ATGAT	2	10	517792	517801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019954	TTAAA	2	10	522456	522465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019954	TTTAA	2	10	534754	534763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019954	TTTGC	2	10	536424	536433	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019954	TTAAA	2	10	536832	536841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019954	AGTTA	2	10	570246	570255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019954	TAATT	2	10	579880	579889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019954	TACTA	2	10	582839	582848	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019954	AAAAT	2	10	584095	584104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019954	GAAAA	2	10	584329	584338	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019954	ACTAT	2	10	585195	585204	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019954	TGCAA	2	10	608354	608363	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019954	ATACA	2	10	608626	608635	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019954	TTTTA	2	10	610216	610225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019954	AAATA	2	10	611176	611185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019954	ATAAC	2	10	623162	623171	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_019954	TAAAA	2	10	626428	626437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019954	TAATT	2	10	627762	627771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019954	TAAAA	2	10	637140	637149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019954	TTTGC	2	10	640439	640448	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019954	TTTTA	2	10	640938	640947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019954	TGATA	2	10	642821	642830	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019954	TAAAA	2	10	643585	643594	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019954	TGATA	2	10	646720	646729	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019954	TACAT	2	10	648401	648410	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019954	TATAC	2	10	650350	650359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019954	TATAA	2	10	651128	651137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019954	AATAT	2	10	657914	657923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019954	TTAAA	2	10	664937	664946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019954	TGGAA	2	10	668414	668423	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019954	CTTTG	2	10	675582	675591	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019954	AAATG	2	10	687918	687927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019954	CTAAT	2	10	688153	688162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019954	AGTTA	2	10	697963	697972	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019954	GAAAT	2	10	699647	699656	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019954	AAATT	2	10	701388	701397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019954	AATAA	2	10	702849	702858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019954	ATAAA	2	10	709573	709582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019954	ATCTC	2	10	712993	713002	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_019954	GATTC	2	10	722950	722959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019954	TTTGT	2	10	723635	723644	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019954	CTTAT	2	10	724724	724733	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019954	AAGCA	2	10	728516	728525	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019954	CTTAT	2	10	731974	731983	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_019954	ATTAA	2	10	743312	743321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019954	TAATA	2	10	746978	746987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019954	ATGCA	2	10	759608	759617	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019954	ATGGA	2	10	763813	763822	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019954	TGAGG	2	10	765902	765911	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019954	ACAAG	2	10	774631	774640	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019954	TAAAG	2	10	774910	774919	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019954	ATTTT	2	10	789875	789884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019954	ATATT	2	10	791046	791055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019954	ATTAA	2	10	811012	811021	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019954	TGATG	2	10	822595	822604	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019954	AACAA	2	10	828295	828304	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019954	TTGCA	2	10	842794	842803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019954	TAAAA	2	10	851573	851582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019954	TTAAA	2	10	891364	891373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_019954	GCAAA	2	10	2687743	2687752	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
429	NC_019954	TGATA	2	10	2688568	2688577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
430	NC_019954	CTTCG	2	10	2689586	2689595	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
431	NC_019954	TGCTT	2	10	2689609	2689618	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
432	NC_019954	AGTTT	2	10	2692615	2692624	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
433	NC_019954	TATAA	2	10	2697197	2697206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_019954	TTTAA	2	10	2697424	2697433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_019954	TATGG	2	10	2708244	2708253	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
436	NC_019954	TCGAC	2	10	2708263	2708272	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
437	NC_019954	TTATA	2	10	2708792	2708801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_019954	AAGAT	2	10	2711914	2711923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
439	NC_019954	TCCCC	2	10	2728436	2728445	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
440	NC_019954	TTAAT	2	10	2729127	2729136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_019954	ACTTT	2	10	2732091	2732100	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
442	NC_019954	ATATT	2	10	2734705	2734714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_019954	CTTTC	2	10	2741769	2741778	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
444	NC_019954	CATGT	2	10	2748842	2748851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
445	NC_019954	TATAA	2	10	2761004	2761013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.