MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 complete genome

Total Repeats: 1631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019954	AAAAC	2	10	425	434	80 %	0 %	0 %	20 %	555077095
2	NC_019954	TCGCT	2	10	602	611	0 %	40 %	20 %	40 %	555077095
3	NC_019954	TAAAA	2	10	2862	2871	80 %	20 %	0 %	0 %	438000912
4	NC_019954	ATTTT	2	10	2936	2945	20 %	80 %	0 %	0 %	438000912
5	NC_019954	ATAAA	2	10	4748	4757	80 %	20 %	0 %	0 %	555077097
6	NC_019954	AAAAT	2	10	5089	5098	80 %	20 %	0 %	0 %	555077098
7	NC_019954	AAGGG	2	10	6008	6017	40 %	0 %	60 %	0 %	555077098
8	NC_019954	CAAAA	2	10	10636	10645	80 %	0 %	0 %	20 %	438000919
9	NC_019954	AACAC	2	10	11807	11816	60 %	0 %	0 %	40 %	555077100
10	NC_019954	TTTTA	2	10	13606	13615	20 %	80 %	0 %	0 %	438000924
11	NC_019954	CATTA	2	10	14635	14644	40 %	40 %	0 %	20 %	438000925
12	NC_019954	TGCAC	2	10	15841	15850	20 %	20 %	20 %	40 %	438000926
13	NC_019954	AAGAC	2	10	16482	16491	60 %	0 %	20 %	20 %	438000926
14	NC_019954	AGGCA	2	10	17245	17254	40 %	0 %	40 %	20 %	438000927
15	NC_019954	GACAA	2	10	18559	18568	60 %	0 %	20 %	20 %	438000928
16	NC_019954	ATCCC	2	10	18797	18806	20 %	20 %	0 %	60 %	438000928
17	NC_019954	GCCAA	2	10	19756	19765	40 %	0 %	20 %	40 %	438000929
18	NC_019954	CGATT	2	10	20483	20492	20 %	40 %	20 %	20 %	438000929
19	NC_019954	ATTAC	2	10	23029	23038	40 %	40 %	0 %	20 %	555077102
20	NC_019954	ATTTT	2	10	28314	28323	20 %	80 %	0 %	0 %	438000937
21	NC_019954	AAATC	2	10	31993	32002	60 %	20 %	0 %	20 %	438000943
22	NC_019954	ATAAG	2	10	37337	37346	60 %	20 %	20 %	0 %	438000949
23	NC_019954	CAAGT	2	10	39629	39638	40 %	20 %	20 %	20 %	438000951
24	NC_019954	AATAC	2	10	41165	41174	60 %	20 %	0 %	20 %	438000952
25	NC_019954	ATATA	2	10	41781	41790	60 %	40 %	0 %	0 %	438000952
26	NC_019954	TGATA	2	10	42257	42266	40 %	40 %	20 %	0 %	438000953
27	NC_019954	GGCAA	2	10	45545	45554	40 %	0 %	40 %	20 %	555077111
28	NC_019954	TGTTT	2	10	48543	48552	0 %	80 %	20 %	0 %	438000959
29	NC_019954	AAAGA	2	10	54053	54062	80 %	0 %	20 %	0 %	438000963
30	NC_019954	ATATC	2	10	59988	59997	40 %	40 %	0 %	20 %	555077117
31	NC_019954	CATGA	2	10	61224	61233	40 %	20 %	20 %	20 %	555077118
32	NC_019954	TAAAT	2	10	61247	61256	60 %	40 %	0 %	0 %	555077118
33	NC_019954	AGAAA	2	10	62203	62212	80 %	0 %	20 %	0 %	555077118
34	NC_019954	CAAGT	2	10	64077	64086	40 %	20 %	20 %	20 %	438000974
35	NC_019954	GAAAT	2	10	67398	67407	60 %	20 %	20 %	0 %	438000979
36	NC_019954	GCTTA	2	10	70957	70966	20 %	40 %	20 %	20 %	438000983
37	NC_019954	GTATT	2	10	71013	71022	20 %	60 %	20 %	0 %	438000983
38	NC_019954	AATTG	2	10	74125	74134	40 %	40 %	20 %	0 %	438000984
39	NC_019954	AATAT	2	10	75764	75773	60 %	40 %	0 %	0 %	555077119
40	NC_019954	AAGAA	2	10	77481	77490	80 %	0 %	20 %	0 %	555077120
41	NC_019954	GTTTG	2	10	81115	81124	0 %	60 %	40 %	0 %	555077122
42	NC_019954	ACCGT	2	10	81715	81724	20 %	20 %	20 %	40 %	555077122
43	NC_019954	ATATG	2	10	83093	83102	40 %	40 %	20 %	0 %	438000992
44	NC_019954	ATTTT	2	10	85495	85504	20 %	80 %	0 %	0 %	555077123
45	NC_019954	TATAA	2	10	86571	86580	60 %	40 %	0 %	0 %	438000996
46	NC_019954	ATATG	2	10	87067	87076	40 %	40 %	20 %	0 %	438000996
47	NC_019954	TTTTA	2	10	90603	90612	20 %	80 %	0 %	0 %	438001000
48	NC_019954	TGCTG	2	10	92157	92166	0 %	40 %	40 %	20 %	555077125
49	NC_019954	ATGAA	2	10	92636	92645	60 %	20 %	20 %	0 %	555077125
50	NC_019954	CCTTA	2	10	97337	97346	20 %	40 %	0 %	40 %	438001009
51	NC_019954	ATAGA	2	10	99823	99832	60 %	20 %	20 %	0 %	438001012
52	NC_019954	AAAAT	2	10	101317	101326	80 %	20 %	0 %	0 %	438001013
53	NC_019954	AATAC	2	10	102190	102199	60 %	20 %	0 %	20 %	438001014
54	NC_019954	GTCAG	2	10	103376	103385	20 %	20 %	40 %	20 %	438001016
55	NC_019954	CGGAC	2	10	105589	105598	20 %	0 %	40 %	40 %	438001019
56	NC_019954	AAACT	2	10	106538	106547	60 %	20 %	0 %	20 %	555077130
57	NC_019954	CGAAA	2	10	106663	106672	60 %	0 %	20 %	20 %	555077130
58	NC_019954	TTGGT	2	10	107978	107987	0 %	60 %	40 %	0 %	438001023
59	NC_019954	ACAGA	2	10	115880	115889	60 %	0 %	20 %	20 %	555077134
60	NC_019954	ATTTC	2	10	117972	117981	20 %	60 %	0 %	20 %	438001036
61	NC_019954	TCAGG	2	10	118282	118291	20 %	20 %	40 %	20 %	438001036
62	NC_019954	GTCAA	2	10	118473	118482	40 %	20 %	20 %	20 %	438001036
63	NC_019954	TGCTT	2	10	119039	119048	0 %	60 %	20 %	20 %	555077135
64	NC_019954	CTTCA	2	10	120051	120060	20 %	40 %	0 %	40 %	555077135
65	NC_019954	ATTTG	2	10	122088	122097	20 %	60 %	20 %	0 %	438001039
66	NC_019954	GTGAT	2	10	122729	122738	20 %	40 %	40 %	0 %	555077136
67	NC_019954	GAAAG	2	10	124588	124597	60 %	0 %	40 %	0 %	438001043
68	NC_019954	TAAAA	2	10	125647	125656	80 %	20 %	0 %	0 %	438001043
69	NC_019954	AGGAG	2	10	126113	126122	40 %	0 %	60 %	0 %	555077137
70	NC_019954	TTATT	2	10	129004	129013	20 %	80 %	0 %	0 %	555077140
71	NC_019954	TGATT	2	10	129055	129064	20 %	60 %	20 %	0 %	555077140
72	NC_019954	TTATA	2	10	129423	129432	40 %	60 %	0 %	0 %	555077141
73	NC_019954	AGTTT	2	10	130481	130490	20 %	60 %	20 %	0 %	555077142
74	NC_019954	GGGAG	2	10	134101	134110	20 %	0 %	80 %	0 %	438001049
75	NC_019954	ATGAA	2	10	134681	134690	60 %	20 %	20 %	0 %	438001050
76	NC_019954	CATAT	2	10	135453	135462	40 %	40 %	0 %	20 %	438001050
77	NC_019954	TATAA	2	10	135757	135766	60 %	40 %	0 %	0 %	438001050
78	NC_019954	ATTAT	2	10	139352	139361	40 %	60 %	0 %	0 %	438001054
79	NC_019954	CAAAT	2	10	140683	140692	60 %	20 %	0 %	20 %	438001057
80	NC_019954	ACGAA	2	10	142220	142229	60 %	0 %	20 %	20 %	555077145
81	NC_019954	AATTT	2	10	143471	143480	40 %	60 %	0 %	0 %	555077146
82	NC_019954	AGGGA	2	10	143567	143576	40 %	0 %	60 %	0 %	555077146
83	NC_019954	GAGGT	2	10	144501	144510	20 %	20 %	60 %	0 %	555077147
84	NC_019954	AAGGC	2	10	144882	144891	40 %	0 %	40 %	20 %	555077147
85	NC_019954	GCTGT	2	10	145326	145335	0 %	40 %	40 %	20 %	555077147
86	NC_019954	GTTTG	2	10	147140	147149	0 %	60 %	40 %	0 %	555077149
87	NC_019954	ATCCA	2	10	152160	152169	40 %	20 %	0 %	40 %	438001066
88	NC_019954	TTATT	2	10	152720	152729	20 %	80 %	0 %	0 %	555077150
89	NC_019954	TGACA	2	10	154304	154313	40 %	20 %	20 %	20 %	438001068
90	NC_019954	CAATA	2	10	155417	155426	60 %	20 %	0 %	20 %	438001069
91	NC_019954	ACTAA	2	10	157094	157103	60 %	20 %	0 %	20 %	438001071
92	NC_019954	AACGG	2	10	157528	157537	40 %	0 %	40 %	20 %	438001073
93	NC_019954	AAATA	2	10	158566	158575	80 %	20 %	0 %	0 %	438001074
94	NC_019954	GCCGT	2	10	164463	164472	0 %	20 %	40 %	40 %	438001081
95	NC_019954	TGCCA	2	10	164704	164713	20 %	20 %	20 %	40 %	438001081
96	NC_019954	TCCAA	2	10	164920	164929	40 %	20 %	0 %	40 %	438001081
97	NC_019954	TAGGG	2	10	166247	166256	20 %	20 %	60 %	0 %	438001083
98	NC_019954	CGCTT	2	10	166829	166838	0 %	40 %	20 %	40 %	438001083
99	NC_019954	ACGGT	2	10	167941	167950	20 %	20 %	40 %	20 %	438001083
100	NC_019954	ATGCC	2	10	170220	170229	20 %	20 %	20 %	40 %	555077156
101	NC_019954	CATAA	2	10	170289	170298	60 %	20 %	0 %	20 %	555077156
102	NC_019954	GGTTT	2	10	170559	170568	0 %	60 %	40 %	0 %	555077157
103	NC_019954	TGCGG	2	10	171008	171017	0 %	20 %	60 %	20 %	438001088
104	NC_019954	GATAA	2	10	172062	172071	60 %	20 %	20 %	0 %	438001089
105	NC_019954	AGGGA	2	10	172618	172627	40 %	0 %	60 %	0 %	438001089
106	NC_019954	ATAAC	2	10	173329	173338	60 %	20 %	0 %	20 %	438001089
107	NC_019954	TAGAG	2	10	174237	174246	40 %	20 %	40 %	0 %	438001090
108	NC_019954	AGAAA	2	10	176609	176618	80 %	0 %	20 %	0 %	555077158
109	NC_019954	TAGTA	2	10	178004	178013	40 %	40 %	20 %	0 %	555077160
110	NC_019954	TTATT	2	10	179008	179017	20 %	80 %	0 %	0 %	555077161
111	NC_019954	TTAAG	2	10	180111	180120	40 %	40 %	20 %	0 %	438001096
112	NC_019954	TAATA	2	10	180685	180694	60 %	40 %	0 %	0 %	438001096
113	NC_019954	TTTAT	2	10	183909	183918	20 %	80 %	0 %	0 %	438001099
114	NC_019954	AAGGG	2	10	185001	185010	40 %	0 %	60 %	0 %	438001102
115	NC_019954	CAAGG	2	10	187711	187720	40 %	0 %	40 %	20 %	555077164
116	NC_019954	AAAGC	2	10	187992	188001	60 %	0 %	20 %	20 %	555077164
117	NC_019954	ATCAT	2	10	191109	191118	40 %	40 %	0 %	20 %	438001105
118	NC_019954	GATTT	2	10	195657	195666	20 %	60 %	20 %	0 %	438001108
119	NC_019954	TTGGT	2	10	196879	196888	0 %	60 %	40 %	0 %	438001111
120	NC_019954	TTCCT	2	10	203645	203654	0 %	60 %	0 %	40 %	438001117
121	NC_019954	GATAA	2	10	207375	207384	60 %	20 %	20 %	0 %	555077168
122	NC_019954	ACACG	2	10	208134	208143	40 %	0 %	20 %	40 %	555077168
123	NC_019954	AAAAG	2	10	208405	208414	80 %	0 %	20 %	0 %	555077168
124	NC_019954	GCAGG	2	10	209816	209825	20 %	0 %	60 %	20 %	438001120
125	NC_019954	GCACG	2	10	214961	214970	20 %	0 %	40 %	40 %	438001126
126	NC_019954	AGCTG	2	10	215338	215347	20 %	20 %	40 %	20 %	438001126
127	NC_019954	TGGCA	2	10	216223	216232	20 %	20 %	40 %	20 %	438001128
128	NC_019954	ATGCT	2	10	217116	217125	20 %	40 %	20 %	20 %	438001130
129	NC_019954	CAGGG	2	10	217165	217174	20 %	0 %	60 %	20 %	438001130
130	NC_019954	ATTGA	2	10	227594	227603	40 %	40 %	20 %	0 %	438001152
131	NC_019954	TCGGT	2	10	228344	228353	0 %	40 %	40 %	20 %	438001152
132	NC_019954	AACTG	2	10	230477	230486	40 %	20 %	20 %	20 %	555077175
133	NC_019954	TACTT	2	10	230748	230757	20 %	60 %	0 %	20 %	438001156
134	NC_019954	TATGG	2	10	235343	235352	20 %	40 %	40 %	0 %	438001161
135	NC_019954	TCGGC	2	10	248205	248214	0 %	20 %	40 %	40 %	438001169
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249	NC_019954	TTCAC	2	10	443532	443541	20 %	40 %	0 %	40 %	438001362
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253	NC_019954	AGCAT	2	10	449496	449505	40 %	20 %	20 %	20 %	555077227
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258	NC_019954	GGGAA	2	10	457253	457262	40 %	0 %	60 %	0 %	438001375
259	NC_019954	TCTAG	2	10	457342	457351	20 %	40 %	20 %	20 %	438001375
260	NC_019954	TATTT	2	10	465942	465951	20 %	80 %	0 %	0 %	438001385
261	NC_019954	CAAAT	2	10	468813	468822	60 %	20 %	0 %	20 %	555077237
262	NC_019954	CAAAA	2	10	468941	468950	80 %	0 %	0 %	20 %	555077237
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