MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 complete genome

Total Repeats: 37369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019954	GTT	2	6	142	147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019954	TAT	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019954	TTA	2	6	172	177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019954	TTC	2	6	182	187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019954	GAG	2	6	196	201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019954	GCA	2	6	236	241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077095
7	NC_019954	CAA	2	6	304	309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	555077095
8	NC_019954	TAA	2	6	397	402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077095
9	NC_019954	TGT	2	6	440	445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	555077095
10	NC_019954	TGA	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077095
11	NC_019954	AGA	2	6	536	541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077095
12	NC_019954	CAT	2	6	550	555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077095
13	NC_019954	TGG	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077095
14	NC_019954	GCA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077095
15	NC_019954	CAG	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077095
16	NC_019954	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077095
17	NC_019954	TGA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077095
18	NC_019954	TTC	2	6	853	858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	555077095
19	NC_019954	ATG	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077095
20	NC_019954	GCC	2	6	1046	1051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	555077095
21	NC_019954	ATG	2	6	1092	1097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077095
22	NC_019954	ATG	2	6	1117	1122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077095
23	NC_019954	TCA	2	6	1200	1205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077095
24	NC_019954	TTC	2	6	1258	1263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	555077095
25	NC_019954	GAA	2	6	1305	1310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077095
26	NC_019954	GAA	2	6	1338	1343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077095
27	NC_019954	GAA	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077095
28	NC_019954	TAA	2	6	1569	1574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077095
29	NC_019954	CAT	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019954	TTA	2	6	1710	1715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019954	TAC	5	15	1745	1759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019954	ATG	2	6	1943	1948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000912
33	NC_019954	TTC	2	6	2208	2213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	438000912
34	NC_019954	GAT	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000912
35	NC_019954	GAT	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000912
36	NC_019954	TAA	2	6	2549	2554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438000912
37	NC_019954	GAC	2	6	2616	2621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000912
38	NC_019954	AAT	2	6	2695	2700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438000912
39	NC_019954	GCA	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000912
40	NC_019954	TAT	2	6	2901	2906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438000912
41	NC_019954	CGG	2	6	3056	3061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	438000913
42	NC_019954	GCT	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438000913
43	NC_019954	GGA	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	555077096
44	NC_019954	TGC	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077096
45	NC_019954	ATC	2	6	3807	3812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077096
46	NC_019954	ATT	2	6	3824	3829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	555077096
47	NC_019954	GAT	2	6	3991	3996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077096
48	NC_019954	GAT	2	6	4135	4140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077096
49	NC_019954	ATC	2	6	4193	4198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077096
50	NC_019954	GGA	2	6	4236	4241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	555077096
51	NC_019954	CTG	2	6	4321	4326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077097
52	NC_019954	TGG	2	6	4397	4402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077097
53	NC_019954	ACA	2	6	4445	4450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	555077097
54	NC_019954	AGA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077097
55	NC_019954	GAT	2	6	4627	4632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077097
56	NC_019954	ATG	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077097
57	NC_019954	AAG	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077097
58	NC_019954	TGA	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077097
59	NC_019954	AGT	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000916
60	NC_019954	GAA	2	6	4887	4892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438000916
61	NC_019954	CAG	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000916
62	NC_019954	AAG	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438000916
63	NC_019954	ATT	2	6	4973	4978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438000916
64	NC_019954	ATG	2	6	5083	5088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
65	NC_019954	CAT	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077098
66	NC_019954	TGA	2	6	5210	5215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
67	NC_019954	GAT	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
68	NC_019954	TGC	2	6	5356	5361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077098
69	NC_019954	CGG	2	6	5366	5371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	555077098
70	NC_019954	TCT	2	6	5485	5490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	555077098
71	NC_019954	GAA	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077098
72	NC_019954	TGA	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
73	NC_019954	GGT	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077098
74	NC_019954	TGC	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077098
75	NC_019954	GAT	2	6	5805	5810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
76	NC_019954	ATA	2	6	5875	5880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077098
77	NC_019954	TTG	2	6	6106	6111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	555077098
78	NC_019954	GTA	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
79	NC_019954	AGC	2	6	6194	6199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077098
80	NC_019954	TGG	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077098
81	NC_019954	GAA	2	6	6456	6461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077098
82	NC_019954	GAG	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	555077098
83	NC_019954	GCC	2	6	6653	6658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	555077098
84	NC_019954	TGA	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
85	NC_019954	CAG	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077098
86	NC_019954	GGC	2	6	6791	6796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	555077098
87	NC_019954	AGC	2	6	6799	6804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077098
88	NC_019954	AGA	2	6	6857	6862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077098
89	NC_019954	GCT	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077098
90	NC_019954	GGC	2	6	6919	6924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	555077098
91	NC_019954	AGG	2	6	6970	6975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	555077098
92	NC_019954	GAA	3	9	7024	7032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438000918
93	NC_019954	ATT	2	6	7052	7057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438000918
94	NC_019954	CCA	2	6	7274	7279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	438000918
95	NC_019954	CTG	2	6	7285	7290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438000918
96	NC_019954	ATG	2	6	7430	7435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
97	NC_019954	TGC	2	6	7457	7462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438000918
98	NC_019954	TTC	2	6	7494	7499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	438000918
99	NC_019954	CCG	2	6	7531	7536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	438000918
100	NC_019954	ATG	2	6	7570	7575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
101	NC_019954	AGA	2	6	7599	7604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438000918
102	NC_019954	TTA	2	6	7616	7621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438000918
103	NC_019954	AAT	2	6	7647	7652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438000918
104	NC_019954	ACA	2	6	7684	7689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	438000918
105	NC_019954	TGT	2	6	7701	7706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	438000918
106	NC_019954	TGG	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	438000918
107	NC_019954	ATA	2	6	7997	8002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438000918
108	NC_019954	GAT	2	6	8028	8033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
109	NC_019954	TTA	2	6	8034	8039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438000918
110	NC_019954	AAG	2	6	8070	8075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438000918
111	NC_019954	TGA	2	6	8301	8306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
112	NC_019954	ACT	2	6	8336	8341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	438000918
113	NC_019954	ATG	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
114	NC_019954	AGA	2	6	8469	8474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438000918
115	NC_019954	GAG	2	6	8564	8569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	438000918
116	NC_019954	GAA	2	6	8599	8604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438000918
117	NC_019954	TCA	2	6	8637	8642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	438000918
118	NC_019954	TGT	2	6	8643	8648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	438000918
119	NC_019954	CTG	2	6	8743	8748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438000918
120	NC_019954	GAT	2	6	8778	8783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
121	NC_019954	TGA	2	6	8799	8804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
122	NC_019954	GCT	2	6	8853	8858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438000918
123	NC_019954	ACG	2	6	8877	8882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000918
124	NC_019954	GAT	3	9	8911	8919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
125	NC_019954	GAG	2	6	8953	8958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	438000918
126	NC_019954	ATG	2	6	9005	9010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
127	NC_019954	GTG	2	6	9073	9078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	438000918
128	NC_019954	ATG	2	6	9104	9109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
129	NC_019954	TAA	2	6	9191	9196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438000918
130	NC_019954	GTT	2	6	9241	9246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	438000918
131	NC_019954	ATG	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
132	NC_019954	AGC	2	6	9586	9591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000919
133	NC_019954	TCA	2	6	9667	9672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	438000919
134	NC_019954	ATG	2	6	9776	9781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000919
135	NC_019954	GAT	2	6	9800	9805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000919
136	NC_019954	GGC	2	6	9867	9872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	438000919
137	NC_019954	CTG	2	6	9980	9985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438000919
138	NC_019954	GCA	3	9	10044	10052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000919
139	NC_019954	CAA	2	6	10378	10383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	438000919
140	NC_019954	TTC	2	6	10509	10514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	438000919
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142	NC_019954	TAA	2	6	10582	10587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438000919
143	NC_019954	CAG	2	6	10588	10593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000919
144	NC_019954	TAA	2	6	10681	10686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438000919
145	NC_019954	TAA	2	6	10758	10763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438000919
146	NC_019954	TCC	2	6	10783	10788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	438000919
147	NC_019954	ATA	2	6	10949	10954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019954	CTG	3	9	11148	11156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077099
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152	NC_019954	ATA	2	6	11615	11620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077099
153	NC_019954	GGT	2	6	11704	11709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077100
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157	NC_019954	AGA	2	6	11830	11835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077100
158	NC_019954	CTG	2	6	11919	11924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077100
159	NC_019954	TAG	2	6	11955	11960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077100
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163	NC_019954	GCT	2	6	12357	12362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438000922
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165	NC_019954	GGT	2	6	12442	12447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_019954	TAT	2	6	12798	12803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438000923
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188	NC_019954	GAA	2	6	14041	14046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438000924
189	NC_019954	AGG	2	6	14137	14142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_019954	AGT	2	6	18444	18449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000928
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248	NC_019954	AGT	2	6	19032	19037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_019954	ATT	2	6	19100	19105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_019954	AGG	2	6	19331	19336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_019954	TAT	3	9	19337	19345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438000929
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253	NC_019954	ATT	2	6	19447	19452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438000929
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255	NC_019954	GCA	2	6	19713	19718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000929
256	NC_019954	GCA	2	6	19729	19734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000929
257	NC_019954	ACT	2	6	19851	19856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	438000929
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298	NC_019954	ATA	2	6	22926	22931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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371	NC_019954	TAA	2	6	27200	27205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077104
372	NC_019954	ATA	2	6	27283	27288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
373	NC_019954	CAA	2	6	27545	27550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	555077105
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377	NC_019954	AGG	2	6	27925	27930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	438000937
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