MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070017 complete genome

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019952	CGTCGG	2	12	66991	67002	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019952	CTGACC	2	12	121931	121942	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019952	TCGGTC	2	12	150601	150612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019952	CGCAGA	2	12	185007	185018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019952	TCGGCG	2	12	185523	185534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019952	ACAGCC	2	12	219801	219812	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019952	CCCGAC	2	12	231835	231846	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019952	AGATTC	2	12	331592	331603	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_019952	CCACAG	2	12	336904	336915	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019952	GGGCCG	2	12	338206	338217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019952	GGTCGC	2	12	341041	341052	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019952	GTTGGC	2	12	428261	428272	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019952	CCGTTG	2	12	484058	484069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019952	GGGGTT	2	12	484109	484120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019952	CCGATA	2	12	484454	484465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019952	GCCCGG	2	12	486515	486526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019952	ATAGTC	2	12	550781	550792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019952	GCCGGT	2	12	554817	554828	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019952	ACCAGT	2	12	599172	599183	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019952	AGGCCG	2	12	730266	730277	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019952	CTTGGC	2	12	794622	794633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019952	CGCGGG	2	12	867497	867508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019952	CCGGCG	2	12	905102	905113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019952	ACCGGG	2	12	911823	911834	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019952	GCGGCC	2	12	947418	947429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019952	ACAGCA	2	12	948805	948816	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019952	GATATC	2	12	963507	963518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019952	CAGTCG	2	12	981007	981018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019952	TCGGGT	2	12	1015758	1015769	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019952	GTCGAT	2	12	1041420	1041431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019952	GAGCGG	2	12	1074119	1074130	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019952	GATCGA	2	12	1075507	1075518	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019952	CGCCGG	2	12	1098823	1098834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019952	CAATGC	2	12	1177558	1177569	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019952	TTCCGT	2	12	1214366	1214377	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019952	TCATCG	2	12	1217823	1217834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019952	GGGTGT	2	12	1233880	1233891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019952	TAGCCA	2	12	1252641	1252652	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019952	AGTTAC	2	12	1275816	1275827	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019952	CCGACG	2	12	1297910	1297921	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019952	ACCGCC	2	12	1472209	1472220	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_019952	TTCGGC	2	12	1477111	1477122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019952	GGCCAG	2	12	1477677	1477688	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019952	CCGAGT	2	12	1482470	1482481	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019952	TCGGGG	2	12	1507804	1507815	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019952	CGGCCA	2	12	1552450	1552461	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019952	CACGCG	2	12	1587463	1587474	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019952	ATATTC	2	12	1623591	1623602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019952	CGGTGC	2	12	1698684	1698695	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019952	TGCTTG	2	12	1786311	1786322	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019952	ATCGCG	2	12	1787618	1787629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019952	GGCGCC	2	12	1790338	1790349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019952	TGCTTG	2	12	1794251	1794262	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019952	CTGGGC	2	12	1814096	1814107	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019952	CGAGTG	2	12	1851764	1851775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019952	GGCGCC	2	12	1899673	1899684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019952	TCCCAC	2	12	1915370	1915381	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019952	TGGTCA	2	12	1959128	1959139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019952	TCTAAG	2	12	1990445	1990456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019952	TCGTCA	2	12	2033838	2033849	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019952	CTCTTT	2	12	2057836	2057847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019952	GGTGAT	2	12	2121498	2121509	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019952	AGTCGC	2	12	2140594	2140605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019952	AGAGGG	2	12	2153573	2153584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019952	GCTGGG	2	12	2222505	2222516	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019952	CGCGAG	2	12	2256811	2256822	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019952	GCCTCA	2	12	2281259	2281270	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019952	GCGGTG	2	12	2307440	2307451	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019952	CGGTTG	2	12	2309805	2309816	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019952	GGTTCG	2	12	2338695	2338706	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019952	CGGCTC	2	12	2339222	2339233	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019952	TTCGAT	2	12	2352063	2352074	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019952	GGTTTC	2	12	2381407	2381418	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019952	CGATTT	2	12	2381824	2381835	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019952	TCCCAT	2	12	2385967	2385978	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019952	ACGCCG	2	12	2386239	2386250	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019952	GGTCCC	2	12	2386666	2386677	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019952	GTCGGG	2	12	2387434	2387445	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019952	CGATCG	2	12	2387577	2387588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019952	CACCGC	2	12	2388001	2388012	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_019952	CAGCCC	2	12	2390233	2390244	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019952	ACGCCG	2	12	2392308	2392319	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019952	CCCCCG	2	12	2392497	2392508	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
84	NC_019952	GGTCCC	2	12	2392736	2392747	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019952	CGATCG	2	12	2393644	2393655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019952	GGCCGC	2	12	2402761	2402772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019952	TGACGG	2	12	2440218	2440229	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019952	ATAGAA	2	12	2462857	2462868	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019952	GATTCG	2	12	2493329	2493340	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_019952	CTCAAC	2	12	2505635	2505646	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019952	CCGCTG	2	12	2525129	2525140	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019952	GCCGGC	2	12	2539434	2539445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019952	GCGTCG	2	12	2584721	2584732	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019952	CACGAC	2	12	2602996	2603007	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019952	GACGTG	2	12	2683424	2683435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019952	GCGACC	2	12	2683522	2683533	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019952	GACCTG	2	12	2707396	2707407	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019952	GCAACC	2	12	2736042	2736053	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019952	GCGCTG	2	12	2736560	2736571	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019952	CACGTG	2	12	2821372	2821383	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019952	GAGGTC	2	12	2824984	2824995	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019952	CCGGCA	2	12	2837888	2837899	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019952	CGCCAC	2	12	2899148	2899159	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_019952	GCCACG	2	12	2899243	2899254	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019952	TCAAAC	2	12	2900901	2900912	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019952	CACCCA	2	12	2928913	2928924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_019952	GCCCGA	2	12	2980708	2980719	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019952	GTATTG	2	12	3019085	3019096	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019952	CCGTTG	2	12	3029030	3029041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019952	GGCGCC	2	12	3048733	3048744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019952	CCGACA	2	12	3072215	3072226	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019952	CATATT	2	12	3106405	3106416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019952	GATGCC	2	12	3166644	3166655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019952	GCCGGC	2	12	3167184	3167195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019952	CCGGCA	2	12	3170876	3170887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019952	CGGGTA	2	12	3196617	3196628	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_019952	GCGCCC	2	12	3210919	3210930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_019952	TTCACA	2	12	3214009	3214020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019952	GTCGGC	2	12	3229446	3229457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019952	GGCCGG	2	12	3266631	3266642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019952	CTCGCC	2	12	3267075	3267086	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_019952	GATCCA	2	12	3293091	3293102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019952	CCCCGC	2	12	3339898	3339909	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
124	NC_019952	GAGCGC	2	12	3380013	3380024	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019952	TCGCCG	2	12	3386027	3386038	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019952	TCGCCG	2	12	3386084	3386095	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019952	CGCCAC	2	12	3402100	3402111	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_019952	AGGCCG	2	12	3407799	3407810	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019952	GCACCG	2	12	3446442	3446453	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019952	ATGCGC	2	12	3455036	3455047	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019952	CGTAGG	2	12	3481033	3481044	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_019952	CGATGC	2	12	3513985	3513996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019952	TGTACA	2	12	3529239	3529250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_019952	CCGTTG	2	12	3556532	3556543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019952	AAGATC	2	12	3568014	3568025	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_019952	GCTCCT	2	12	3593023	3593034	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019952	TCCGCT	2	12	3656745	3656756	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019952	GCCTCC	2	12	3752481	3752492	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_019952	CCGGTG	2	12	3849983	3849994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019952	ACGAGC	2	12	3852607	3852618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019952	TTCCGT	2	12	3863754	3863765	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019952	ATTTTG	2	12	3864578	3864589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019952	CCCCGG	2	12	3878131	3878142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_019952	TGTACA	2	12	3901858	3901869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_019952	CGTGGA	2	12	3931285	3931296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_019952	TTGGCC	2	12	3931632	3931643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019952	CACGTT	2	12	3977646	3977657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019952	TCCTCT	2	12	3982926	3982937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019952	TCGGAG	2	12	4010317	4010328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_019952	CCGCTC	2	12	4014346	4014357	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_019952	CGTTGG	2	12	4026979	4026990	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_019952	CATTAT	2	12	4038797	4038808	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_019952	CGAACA	2	12	4130748	4130759	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019952	GGTTAC	2	12	4267284	4267295	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_019952	TGGCGG	2	12	4315090	4315101	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_019952	CTCATC	2	12	4380760	4380771	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_019952	TGCCGG	2	12	4426095	4426106	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_019952	CATCGC	2	12	4435080	4435091	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
159	NC_019952	GGGTTG	2	12	4437644	4437655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.