MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070017 complete genome

Total Repeats: 3591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019952	TCATC	2	10	1195	1204	20 %	40 %	0 %	40 %	433633013
2	NC_019952	CGTTT	2	10	2384	2393	0 %	60 %	20 %	20 %	433633014
3	NC_019952	CGGTT	2	10	3533	3542	0 %	40 %	40 %	20 %	433633014
4	NC_019952	GTCGG	2	10	4881	4890	0 %	20 %	60 %	20 %	433633016
5	NC_019952	GCAGC	2	10	7665	7674	20 %	0 %	40 %	40 %	433633018
6	NC_019952	CGGTG	2	10	9573	9582	0 %	20 %	60 %	20 %	433633018
7	NC_019952	CAGAC	2	10	10091	10100	40 %	0 %	20 %	40 %	433633018
8	NC_019952	CGCAA	2	10	10615	10624	40 %	0 %	20 %	40 %	433633019
9	NC_019952	CGGCG	2	10	10741	10750	0 %	0 %	60 %	40 %	433633019
10	NC_019952	ACCCG	2	10	11571	11580	20 %	0 %	20 %	60 %	433633020
11	NC_019952	CGACC	2	10	13964	13973	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_019952	GGCGT	2	10	14446	14455	0 %	20 %	60 %	20 %	433633025
13	NC_019952	GGGCC	2	10	14729	14738	0 %	0 %	60 %	40 %	433633025
14	NC_019952	GCGTT	2	10	15474	15483	0 %	40 %	40 %	20 %	433633026
15	NC_019952	CCAGC	2	10	16014	16023	20 %	0 %	20 %	60 %	433633027
16	NC_019952	ACCGA	2	10	16777	16786	40 %	0 %	20 %	40 %	433633027
17	NC_019952	ATCGG	2	10	17169	17178	20 %	20 %	40 %	20 %	433633027
18	NC_019952	CGGCC	2	10	18178	18187	0 %	0 %	40 %	60 %	433633028
19	NC_019952	TTAGC	2	10	19329	19338	20 %	40 %	20 %	20 %	433633029
20	NC_019952	GGTCC	2	10	19401	19410	0 %	20 %	40 %	40 %	433633029
21	NC_019952	GTCGT	2	10	21920	21929	0 %	40 %	40 %	20 %	433633030
22	NC_019952	ATCAC	2	10	24193	24202	40 %	20 %	0 %	40 %	433633033
23	NC_019952	GCCGG	2	10	24880	24889	0 %	0 %	60 %	40 %	433633033
24	NC_019952	CGAGC	2	10	27242	27251	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_019952	GGCAA	2	10	29575	29584	40 %	0 %	40 %	20 %	433633038
26	NC_019952	CGATC	2	10	30401	30410	20 %	20 %	20 %	40 %	433633039
27	NC_019952	CGACG	2	10	32588	32597	20 %	0 %	40 %	40 %	433633043
28	NC_019952	GCGTC	2	10	32643	32652	0 %	20 %	40 %	40 %	433633043
29	NC_019952	GACAC	2	10	32740	32749	40 %	0 %	20 %	40 %	433633043
30	NC_019952	TCCTG	2	10	37609	37618	0 %	40 %	20 %	40 %	433633048
31	NC_019952	GGCTC	2	10	37700	37709	0 %	20 %	40 %	40 %	433633048
32	NC_019952	GGCGC	2	10	38245	38254	0 %	0 %	60 %	40 %	433633048
33	NC_019952	TGGCC	2	10	38393	38402	0 %	20 %	40 %	40 %	433633048
34	NC_019952	CGGCG	2	10	38925	38934	0 %	0 %	60 %	40 %	433633048
35	NC_019952	GTCCA	2	10	39639	39648	20 %	20 %	20 %	40 %	433633049
36	NC_019952	GCCAA	2	10	41773	41782	40 %	0 %	20 %	40 %	433633051
37	NC_019952	GCGTC	2	10	42188	42197	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_019952	GCACA	2	10	42572	42581	40 %	0 %	20 %	40 %	433633052
39	NC_019952	GGTAC	2	10	45106	45115	20 %	20 %	40 %	20 %	433633054
40	NC_019952	TCGAA	2	10	45338	45347	40 %	20 %	20 %	20 %	433633054
41	NC_019952	GCACC	2	10	46268	46277	20 %	0 %	20 %	60 %	433633054
42	NC_019952	CGGTG	2	10	47307	47316	0 %	20 %	60 %	20 %	433633055
43	NC_019952	TCATG	2	10	47453	47462	20 %	40 %	20 %	20 %	433633055
44	NC_019952	ATCGG	2	10	47600	47609	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019952	GCAGC	2	10	48847	48856	20 %	0 %	40 %	40 %	433633057
46	NC_019952	CCCGA	2	10	48930	48939	20 %	0 %	20 %	60 %	433633057
47	NC_019952	CAGCG	2	10	50055	50064	20 %	0 %	40 %	40 %	433633058
48	NC_019952	CTCCC	2	10	56495	56504	0 %	20 %	0 %	80 %	433633064
49	NC_019952	CGGCG	2	10	56944	56953	0 %	0 %	60 %	40 %	433633064
50	NC_019952	CGACC	2	10	58476	58485	20 %	0 %	20 %	60 %	433633066
51	NC_019952	CTTCG	2	10	59163	59172	0 %	40 %	20 %	40 %	433633067
52	NC_019952	CGGTG	2	10	60219	60228	0 %	20 %	60 %	20 %	433633070
53	NC_019952	TCAGG	2	10	62705	62714	20 %	20 %	40 %	20 %	433633071
54	NC_019952	TGCCG	2	10	65736	65745	0 %	20 %	40 %	40 %	433633075
55	NC_019952	CGGCG	2	10	66247	66256	0 %	0 %	60 %	40 %	433633076
56	NC_019952	GGCGA	2	10	66668	66677	20 %	0 %	60 %	20 %	433633076
57	NC_019952	CCACG	2	10	69001	69010	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_019952	CGGCC	2	10	69513	69522	0 %	0 %	40 %	60 %	433633079
59	NC_019952	TGCCA	2	10	69837	69846	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_019952	GGTGT	2	10	70665	70674	0 %	40 %	60 %	0 %	433633081
61	NC_019952	ATCGG	2	10	71302	71311	20 %	20 %	40 %	20 %	433633081
62	NC_019952	CCGCG	2	10	71839	71848	0 %	0 %	40 %	60 %	433633081
63	NC_019952	GGCAA	2	10	72190	72199	40 %	0 %	40 %	20 %	433633081
64	NC_019952	CGACC	2	10	72479	72488	20 %	0 %	20 %	60 %	433633081
65	NC_019952	GGTCG	2	10	72993	73002	0 %	20 %	60 %	20 %	433633081
66	NC_019952	TGCCT	2	10	73734	73743	0 %	40 %	20 %	40 %	433633083
67	NC_019952	GTCCA	2	10	74605	74614	20 %	20 %	20 %	40 %	433633084
68	NC_019952	GACCT	2	10	77230	77239	20 %	20 %	20 %	40 %	433633086
69	NC_019952	GCCAA	2	10	77543	77552	40 %	0 %	20 %	40 %	433633086
70	NC_019952	TCTGT	2	10	78861	78870	0 %	60 %	20 %	20 %	433633087
71	NC_019952	TCGCA	2	10	79189	79198	20 %	20 %	20 %	40 %	433633087
72	NC_019952	CGCCA	2	10	82470	82479	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_019952	CGGGC	2	10	82541	82550	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_019952	GAGCA	2	10	84377	84386	40 %	0 %	40 %	20 %	433633091
75	NC_019952	CCGGG	2	10	84477	84486	0 %	0 %	60 %	40 %	433633091
76	NC_019952	CGACG	2	10	84553	84562	20 %	0 %	40 %	40 %	433633091
77	NC_019952	CACCG	2	10	86102	86111	20 %	0 %	20 %	60 %	433633093
78	NC_019952	TGGTC	2	10	88237	88246	0 %	40 %	40 %	20 %	433633095
79	NC_019952	GCTGG	2	10	88874	88883	0 %	20 %	60 %	20 %	433633096
80	NC_019952	TGCGG	2	10	91240	91249	0 %	20 %	60 %	20 %	433633099
81	NC_019952	AACCG	2	10	92004	92013	40 %	0 %	20 %	40 %	433633101
82	NC_019952	TCGCC	2	10	92141	92150	0 %	20 %	20 %	60 %	433633101
83	NC_019952	GGGTC	2	10	92648	92657	0 %	20 %	60 %	20 %	433633102
84	NC_019952	GGGCC	2	10	93114	93123	0 %	0 %	60 %	40 %	433633102
85	NC_019952	ACCGC	2	10	94165	94174	20 %	0 %	20 %	60 %	433633102
86	NC_019952	GGCCG	2	10	94433	94442	0 %	0 %	60 %	40 %	433633103
87	NC_019952	GCACC	2	10	95085	95094	20 %	0 %	20 %	60 %	433633103
88	NC_019952	TCGGG	2	10	96108	96117	0 %	20 %	60 %	20 %	433633105
89	NC_019952	AGATC	2	10	97628	97637	40 %	20 %	20 %	20 %	433633106
90	NC_019952	CGGCG	2	10	101209	101218	0 %	0 %	60 %	40 %	433633109
91	NC_019952	CTGAC	2	10	101251	101260	20 %	20 %	20 %	40 %	433633109
92	NC_019952	CGGCG	2	10	101335	101344	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_019952	GCGGT	2	10	102284	102293	0 %	20 %	60 %	20 %	433633111
94	NC_019952	GGTGA	2	10	102502	102511	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019952	GCGCC	2	10	105116	105125	0 %	0 %	40 %	60 %	433633113
96	NC_019952	CGAGC	2	10	105491	105500	20 %	0 %	40 %	40 %	433633113
97	NC_019952	GGTGG	2	10	105800	105809	0 %	20 %	80 %	0 %	433633114
98	NC_019952	CTGGC	2	10	107556	107565	0 %	20 %	40 %	40 %	433633115
99	NC_019952	GCACC	2	10	108637	108646	20 %	0 %	20 %	60 %	433633115
100	NC_019952	GAGAA	2	10	108758	108767	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019952	ATCGC	2	10	111514	111523	20 %	20 %	20 %	40 %	433633118
102	NC_019952	CGGTC	2	10	113123	113132	0 %	20 %	40 %	40 %	433633120
103	NC_019952	GGCTG	2	10	116828	116837	0 %	20 %	60 %	20 %	433633120
104	NC_019952	CCGCG	2	10	120796	120805	0 %	0 %	40 %	60 %	433633121
105	NC_019952	CCCCG	2	10	122999	123008	0 %	0 %	20 %	80 %	433633122
106	NC_019952	TCGTG	2	10	124748	124757	0 %	40 %	40 %	20 %	433633123
107	NC_019952	CAGCG	2	10	124991	125000	20 %	0 %	40 %	40 %	433633123
108	NC_019952	ACGGC	2	10	125803	125812	20 %	0 %	40 %	40 %	433633123
109	NC_019952	CCGGA	2	10	126285	126294	20 %	0 %	40 %	40 %	433633124
110	NC_019952	GGCCG	2	10	128646	128655	0 %	0 %	60 %	40 %	433633125
111	NC_019952	TGCGC	2	10	128758	128767	0 %	20 %	40 %	40 %	433633125
112	NC_019952	GCGAG	2	10	129269	129278	20 %	0 %	60 %	20 %	433633125
113	NC_019952	GGGGT	2	10	130278	130287	0 %	20 %	80 %	0 %	433633125
114	NC_019952	CCCAC	2	10	130840	130849	20 %	0 %	0 %	80 %	433633125
115	NC_019952	CGCAG	2	10	131094	131103	20 %	0 %	40 %	40 %	433633125
116	NC_019952	CCGGC	2	10	131350	131359	0 %	0 %	40 %	60 %	433633125
117	NC_019952	GCTGC	2	10	131588	131597	0 %	20 %	40 %	40 %	433633125
118	NC_019952	TGCGG	2	10	131760	131769	0 %	20 %	60 %	20 %	433633125
119	NC_019952	ATCGC	2	10	133236	133245	20 %	20 %	20 %	40 %	433633127
120	NC_019952	ATCGG	2	10	133284	133293	20 %	20 %	40 %	20 %	433633127
121	NC_019952	CGGGC	2	10	133760	133769	0 %	0 %	60 %	40 %	433633127
122	NC_019952	GCGAT	2	10	135565	135574	20 %	20 %	40 %	20 %	433633129
123	NC_019952	GTTCG	2	10	135786	135795	0 %	40 %	40 %	20 %	433633129
124	NC_019952	CCTGG	2	10	136178	136187	0 %	20 %	40 %	40 %	433633129
125	NC_019952	CGACC	2	10	136868	136877	20 %	0 %	20 %	60 %	433633129
126	NC_019952	GAGAT	2	10	139888	139897	40 %	20 %	40 %	0 %	433633133
127	NC_019952	GGGCT	2	10	140076	140085	0 %	20 %	60 %	20 %	433633133
128	NC_019952	CGGCG	2	10	142043	142052	0 %	0 %	60 %	40 %	433633135
129	NC_019952	TGCGG	2	10	142676	142685	0 %	20 %	60 %	20 %	433633136
130	NC_019952	GTTGC	2	10	143929	143938	0 %	40 %	40 %	20 %	433633137
131	NC_019952	ACGCC	2	10	144650	144659	20 %	0 %	20 %	60 %	433633137
132	NC_019952	AACCG	2	10	146107	146116	40 %	0 %	20 %	40 %	433633138
133	NC_019952	CCGCC	2	10	146694	146703	0 %	0 %	20 %	80 %	433633138
134	NC_019952	CCGCC	2	10	147337	147346	0 %	0 %	20 %	80 %	433633139
135	NC_019952	ATCGG	2	10	150817	150826	20 %	20 %	40 %	20 %	433633143
136	NC_019952	ATTGG	2	10	153651	153660	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019952	AGCGA	2	10	155554	155563	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019952	TCGTC	2	10	155901	155910	0 %	40 %	20 %	40 %	433633146
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140	NC_019952	ATTCT	2	10	157209	157218	20 %	60 %	0 %	20 %	433633147
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146	NC_019952	CGGCG	2	10	162449	162458	0 %	0 %	60 %	40 %	433633152
147	NC_019952	GTCGC	2	10	162922	162931	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_019952	GCCGG	2	10	163221	163230	0 %	0 %	60 %	40 %	433633153
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150	NC_019952	CTGGG	2	10	165559	165568	0 %	20 %	60 %	20 %	433633155
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177	NC_019952	GGCCG	2	10	197756	197765	0 %	0 %	60 %	40 %	433633183
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197	NC_019952	CCGTG	2	10	223398	223407	0 %	20 %	40 %	40 %	433633207
198	NC_019952	GGTGC	2	10	223522	223531	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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234	NC_019952	GCCCG	2	10	277065	277074	0 %	0 %	40 %	60 %	433633249
235	NC_019952	GCAGT	2	10	277443	277452	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
236	NC_019952	GATCC	2	10	279885	279894	20 %	20 %	20 %	40 %	433633251
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238	NC_019952	CAGCG	2	10	284229	284238	20 %	0 %	40 %	40 %	433633255
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240	NC_019952	GCGCA	2	10	285610	285619	20 %	0 %	40 %	40 %	433633255
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243	NC_019952	GGTGC	2	10	293430	293439	0 %	20 %	60 %	20 %	433633262
244	NC_019952	GCAGC	2	10	300186	300195	20 %	0 %	40 %	40 %	433633267
245	NC_019952	CGGCC	2	10	303200	303209	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
246	NC_019952	TGCGC	2	10	303247	303256	0 %	20 %	40 %	40 %	433633270
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248	NC_019952	TCGAC	2	10	306405	306414	20 %	20 %	20 %	40 %	433633271
249	NC_019952	GGGCC	2	10	309424	309433	0 %	0 %	60 %	40 %	433633275
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251	NC_019952	TGCGG	2	10	310095	310104	0 %	20 %	60 %	20 %	433633275
252	NC_019952	CGGGC	2	10	310526	310535	0 %	0 %	60 %	40 %	433633275
253	NC_019952	CACTG	2	10	310995	311004	20 %	20 %	20 %	40 %	433633276
254	NC_019952	TGCCA	2	10	311961	311970	20 %	20 %	20 %	40 %	433633278
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256	NC_019952	CAGAT	2	10	315232	315241	40 %	20 %	20 %	20 %	433633280
257	NC_019952	AGCGG	2	10	315456	315465	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
258	NC_019952	CGGAC	2	10	315570	315579	20 %	0 %	40 %	40 %	433633281
259	NC_019952	CGCAG	2	10	315778	315787	20 %	0 %	40 %	40 %	433633281
260	NC_019952	GGCCG	2	10	316093	316102	0 %	0 %	60 %	40 %	433633282
261	NC_019952	GCCCG	2	10	316591	316600	0 %	0 %	40 %	60 %	433633282
262	NC_019952	TCGGC	2	10	317619	317628	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
263	NC_019952	CCTGG	2	10	318167	318176	0 %	20 %	40 %	40 %	433633284
264	NC_019952	GGCCG	2	10	321284	321293	0 %	0 %	60 %	40 %	433633285
265	NC_019952	TGCGC	2	10	321781	321790	0 %	20 %	40 %	40 %	433633285
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