MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070017 complete genome

Total Repeats: 1370

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019952	CCGA	2	8	2017	2024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019952	GCAC	2	8	11900	11907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019952	TGCG	2	8	12710	12717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019952	GCCC	2	8	12745	12752	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_019952	ATTC	2	8	13983	13990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019952	ACCC	2	8	14390	14397	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_019952	GAGC	2	8	25816	25823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019952	GGCC	2	8	25830	25837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019952	AGCT	2	8	33995	34002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019952	CTAC	2	8	47468	47475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019952	CTGG	2	8	52965	52972	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019952	GCCG	2	8	53819	53826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019952	CGGA	2	8	69022	69029	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019952	ACGC	2	8	69948	69955	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019952	CGAC	2	8	69966	69973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019952	CGGT	2	8	80877	80884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019952	CGGT	2	8	81062	81069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019952	CTTC	2	8	87509	87516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019952	CTGG	2	8	89187	89194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019952	CGCT	2	8	99640	99647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019952	CCTG	2	8	99687	99694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019952	GCGA	2	8	99731	99738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019952	GCGG	2	8	101288	101295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019952	AGCG	2	8	126097	126104	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019952	ATCC	2	8	127423	127430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019952	GGCG	2	8	132573	132580	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019952	GCTC	2	8	133061	133068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019952	CGCC	2	8	134167	134174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_019952	CGGG	2	8	135160	135167	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019952	TTCT	2	8	141077	141084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019952	ACGC	2	8	141149	141156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019952	AGCA	2	8	142321	142328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019952	GGCC	2	8	142366	142373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019952	GCCG	2	8	145127	145134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019952	GCCA	2	8	149615	149622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019952	CAGC	2	8	149656	149663	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019952	ATAC	2	8	149849	149856	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019952	CAGC	2	8	150528	150535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019952	GCCG	2	8	153639	153646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019952	CCGG	2	8	156952	156959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019952	GGCT	2	8	159144	159151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019952	CGCA	2	8	159170	159177	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019952	TCGT	2	8	162861	162868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019952	CCGG	2	8	162869	162876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019952	CCCG	2	8	163082	163089	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_019952	ACTT	2	8	172564	172571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019952	GGCC	2	8	185536	185543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019952	ACCG	2	8	186350	186357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019952	GCCA	2	8	186394	186401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019952	TTGA	2	8	188097	188104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019952	CTGG	2	8	198084	198091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019952	CTGT	2	8	213580	213587	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019952	CGGT	2	8	220004	220011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019952	GATG	2	8	220751	220758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019952	AACC	2	8	231916	231923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019952	AACT	2	8	231957	231964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019952	GGAA	2	8	232132	232139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019952	ACGT	2	8	232884	232891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019952	ACAT	2	8	232951	232958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019952	TGGA	2	8	232965	232972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019952	GTGC	2	8	242664	242671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019952	GAAC	2	8	250343	250350	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019952	CGCA	2	8	254961	254968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019952	GACG	2	8	257371	257378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019952	GCGG	2	8	274346	274353	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019952	CGGC	2	8	275721	275728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019952	TGGG	2	8	282435	282442	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019952	ACTT	2	8	293162	293169	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019952	TCGT	2	8	294789	294796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019952	AACT	2	8	296829	296836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019952	AACC	2	8	296837	296844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019952	ATGC	2	8	297827	297834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019952	AGGC	2	8	297850	297857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019952	GACG	2	8	303145	303152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019952	TTGC	2	8	310784	310791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019952	TCGG	2	8	311283	311290	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019952	CGCC	2	8	322471	322478	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_019952	CCGG	2	8	327453	327460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019952	GCGG	2	8	334521	334528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019952	GTCT	2	8	335987	335994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019952	TAAA	2	8	336301	336308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019952	TTAT	2	8	336357	336364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019952	GAAT	2	8	336760	336767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019952	CTAC	2	8	336955	336962	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019952	ATCA	2	8	338149	338156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019952	CATT	2	8	338157	338164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019952	AGGT	2	8	372756	372763	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019952	AATC	2	8	372771	372778	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019952	GGCC	2	8	383162	383169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019952	AGGA	2	8	384195	384202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019952	TGCC	2	8	384579	384586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019952	TGAC	2	8	392950	392957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019952	GTCA	2	8	392961	392968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019952	CAGC	2	8	394223	394230	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019952	CCTG	2	8	399686	399693	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019952	ACCA	2	8	399731	399738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019952	CGAG	2	8	408849	408856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019952	CCGG	2	8	413183	413190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019952	GTGC	2	8	413240	413247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019952	ATCG	2	8	415049	415056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019952	GCCA	2	8	415140	415147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019952	GTCC	2	8	415166	415173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019952	GAGC	2	8	419576	419583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019952	GGCC	2	8	428350	428357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019952	GCCG	2	8	428424	428431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019952	CGAC	2	8	428580	428587	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019952	CATC	2	8	428631	428638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019952	GCTG	2	8	428906	428913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019952	ACGG	2	8	428973	428980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019952	TCGC	2	8	429699	429706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019952	CTGC	2	8	444301	444308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019952	GCTG	2	8	444345	444352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019952	CACG	2	8	461324	461331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019952	CAAT	2	8	469827	469834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019952	TCGG	2	8	469855	469862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019952	CCGT	2	8	470254	470261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019952	TTCA	2	8	470341	470348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019952	GGAT	2	8	479542	479549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019952	ACCA	2	8	484210	484217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019952	TGGG	2	8	485258	485265	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019952	GAGC	2	8	486936	486943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019952	GAGC	2	8	497256	497263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019952	AGAA	2	8	497368	497375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019952	GCGG	2	8	509744	509751	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019952	ACCG	2	8	511624	511631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019952	CGGG	2	8	511661	511668	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019952	GAGG	2	8	513617	513624	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019952	GCGT	2	8	513703	513710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019952	ACGG	2	8	516953	516960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019952	CTGA	2	8	522550	522557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019952	GCAA	2	8	525186	525193	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019952	GCTG	2	8	528059	528066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019952	CCGT	2	8	536300	536307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019952	CGGC	2	8	541630	541637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019952	CGGC	2	8	546373	546380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019952	GACG	2	8	546383	546390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019952	AATC	2	8	553072	553079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019952	GTCT	2	8	553694	553701	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019952	CGGC	2	8	567402	567409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019952	CGGC	2	8	568338	568345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_019952	AGCA	2	8	572642	572649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019952	TGGC	2	8	573131	573138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019952	CGAC	2	8	573312	573319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019952	GTGG	2	8	575590	575597	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019952	CGCC	2	8	585476	585483	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_019952	GTTT	2	8	594503	594510	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019952	GCCG	2	8	599523	599530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_019952	TGCC	2	8	604522	604529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019952	TGGC	2	8	604588	604595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019952	GCTA	2	8	604769	604776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019952	GCGT	2	8	612646	612653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_019952	ATGT	2	8	614631	614638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_019952	GGTG	2	8	626064	626071	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019952	TGCC	2	8	627963	627970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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165	NC_019952	GCGG	2	8	629621	629628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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167	NC_019952	TGCC	2	8	655687	655694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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260	NC_019952	TTGT	2	8	962702	962709	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
261	NC_019952	GGCT	2	8	963404	963411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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275	NC_019952	CACT	2	8	983063	983070	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
276	NC_019952	AAAT	2	8	984433	984440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_019952	CCGG	2	8	991514	991521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
282	NC_019952	CCCG	2	8	996314	996321	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
283	NC_019952	TCAA	2	8	996455	996462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
284	NC_019952	AGCA	2	8	997409	997416	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
285	NC_019952	GCTG	2	8	1002215	1002222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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288	NC_019952	CGCA	2	8	1008839	1008846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
289	NC_019952	GTCA	2	8	1010512	1010519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
290	NC_019952	TGGA	2	8	1015921	1015928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
291	NC_019952	GAGG	2	8	1015947	1015954	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_019952	CGGC	2	8	1018816	1018823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
295	NC_019952	GTAC	2	8	1018926	1018933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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487	NC_019952	AGGA	2	8	1730214	1730221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
488	NC_019952	ATCT	2	8	1730795	1730802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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491	NC_019952	CCGA	2	8	1745051	1745058	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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497	NC_019952	GCAC	2	8	1766940	1766947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_019952	GCCG	2	8	1772497	1772504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
499	NC_019952	ATGG	2	8	1776038	1776045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
500	NC_019952	CGGT	2	8	1786199	1786206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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