MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070017 complete genome

Total Repeats: 77543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019952	CGT	2	6	289	294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633013
2	NC_019952	CAC	2	6	320	325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633013
3	NC_019952	GTC	2	6	339	344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633013
4	NC_019952	GAC	2	6	372	377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
5	NC_019952	CAG	2	6	383	388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
6	NC_019952	TCG	2	6	460	465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633013
7	NC_019952	AGC	2	6	492	497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
8	NC_019952	GCC	2	6	553	558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633013
9	NC_019952	CCG	2	6	597	602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633013
10	NC_019952	CGA	2	6	617	622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
11	NC_019952	GCC	2	6	632	637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633013
12	NC_019952	ACG	2	6	682	687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
13	NC_019952	TGA	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633013
14	NC_019952	CGC	3	9	854	862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633013
15	NC_019952	GTT	2	6	974	979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633013
16	NC_019952	CGA	2	6	1103	1108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
17	NC_019952	TTC	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433633013
18	NC_019952	CAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633013
19	NC_019952	AGC	2	6	1219	1224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
20	NC_019952	ACC	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633013
21	NC_019952	CGA	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
22	NC_019952	CAG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
23	NC_019952	GCG	2	6	1530	1535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633013
24	NC_019952	CCG	2	6	1552	1557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633013
25	NC_019952	CAC	2	6	1784	1789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633013
26	NC_019952	GTT	2	6	2478	2483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633014
27	NC_019952	CCG	2	6	2534	2539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633014
28	NC_019952	TTG	2	6	2596	2601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633014
29	NC_019952	CGA	2	6	2699	2704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633014
30	NC_019952	TTG	2	6	2755	2760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633014
31	NC_019952	ATT	2	6	2769	2774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433633014
32	NC_019952	CGC	2	6	2802	2807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633014
33	NC_019952	GAC	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633014
34	NC_019952	GGT	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633014
35	NC_019952	CGT	2	6	2927	2932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633014
36	NC_019952	GCC	2	6	2983	2988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633014
37	NC_019952	CGG	2	6	3000	3005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633014
38	NC_019952	GCA	2	6	3086	3091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633014
39	NC_019952	CTT	2	6	3100	3105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433633014
40	NC_019952	CCA	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633014
41	NC_019952	GAT	2	6	3280	3285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633014
42	NC_019952	TTG	3	9	3308	3316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633014
43	NC_019952	CGG	2	6	3497	3502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633014
44	NC_019952	TTG	2	6	3654	3659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633015
45	NC_019952	CGA	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633015
46	NC_019952	GTG	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633015
47	NC_019952	ACG	2	6	3798	3803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633015
48	NC_019952	CAA	2	6	3847	3852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633015
49	NC_019952	ATC	2	6	3868	3873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633015
50	NC_019952	TGT	2	6	3915	3920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633015
51	NC_019952	CGG	2	6	3965	3970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633015
52	NC_019952	GAT	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633015
53	NC_019952	TGG	2	6	4161	4166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633015
54	NC_019952	GAA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433633015
55	NC_019952	AGC	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633015
56	NC_019952	GGC	2	6	4336	4341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633015
57	NC_019952	GGC	2	6	4345	4350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633015
58	NC_019952	GAC	2	6	4403	4408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633015
59	NC_019952	GGC	2	6	4492	4497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633015
60	NC_019952	TGG	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633015
61	NC_019952	GTT	2	6	4534	4539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633015
62	NC_019952	CGA	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633015
63	NC_019952	CGG	2	6	4593	4598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633015
64	NC_019952	CCG	2	6	4605	4610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633015
65	NC_019952	CCG	2	6	4650	4655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633015
66	NC_019952	GGT	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633015
67	NC_019952	TGC	2	6	4824	4829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633016
68	NC_019952	CGA	2	6	4903	4908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633016
69	NC_019952	GGT	2	6	5037	5042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633016
70	NC_019952	CCA	2	6	5046	5051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633016
71	NC_019952	ACG	2	6	5084	5089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633016
72	NC_019952	CGC	2	6	5169	5174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633016
73	NC_019952	CGG	2	6	5219	5224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633016
74	NC_019952	AAG	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433633017
75	NC_019952	GGT	2	6	5675	5680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
76	NC_019952	CGA	2	6	5693	5698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
77	NC_019952	TGC	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633017
78	NC_019952	CGA	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
79	NC_019952	GTG	2	6	5823	5828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
80	NC_019952	CGG	2	6	5846	5851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633017
81	NC_019952	TGG	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
82	NC_019952	GGT	2	6	5909	5914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
83	NC_019952	AAG	2	6	6024	6029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433633017
84	NC_019952	CAA	2	6	6131	6136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633017
85	NC_019952	CGA	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
86	NC_019952	GTC	2	6	6183	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633017
87	NC_019952	TGG	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
88	NC_019952	AGC	2	6	6348	6353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
89	NC_019952	GGC	2	6	6468	6473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633017
90	NC_019952	GGT	2	6	6509	6514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
91	NC_019952	GCG	2	6	6812	6817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633017
92	NC_019952	ATC	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633017
93	NC_019952	ATC	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633017
94	NC_019952	ACG	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
95	NC_019952	TGT	2	6	7159	7164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633017
96	NC_019952	GTT	3	9	7169	7177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633017
97	NC_019952	CCG	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633017
98	NC_019952	CTG	2	6	7299	7304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633017
99	NC_019952	GAA	2	6	7325	7330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433633017
100	NC_019952	CAA	2	6	7334	7339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633017
101	NC_019952	ACC	2	6	7401	7406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633017
102	NC_019952	GAC	2	6	7446	7451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
103	NC_019952	GCC	4	12	7452	7463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633017
104	NC_019952	GTT	2	6	7469	7474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633017
105	NC_019952	GCC	2	6	7611	7616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633018
106	NC_019952	GAC	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
107	NC_019952	CAG	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
108	NC_019952	TCG	2	6	7700	7705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
109	NC_019952	ACC	2	6	7844	7849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633018
110	NC_019952	TGG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633018
111	NC_019952	CGG	2	6	7964	7969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633018
112	NC_019952	CGA	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
113	NC_019952	ACG	2	6	8060	8065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
114	NC_019952	CTG	2	6	8110	8115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
115	NC_019952	GGC	2	6	8128	8133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633018
116	NC_019952	CGC	2	6	8162	8167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633018
117	NC_019952	ACG	2	6	8216	8221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
118	NC_019952	CGA	2	6	8223	8228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
119	NC_019952	CCG	2	6	8282	8287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633018
120	NC_019952	TCG	2	6	8294	8299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
121	NC_019952	GTT	2	6	8359	8364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633018
122	NC_019952	AGA	2	6	8370	8375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433633018
123	NC_019952	TCA	2	6	8441	8446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633018
124	NC_019952	GGT	2	6	8568	8573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633018
125	NC_019952	TCG	2	6	8636	8641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
126	NC_019952	ACC	2	6	8693	8698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633018
127	NC_019952	GCG	2	6	8715	8720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633018
128	NC_019952	CAC	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633018
129	NC_019952	GCT	2	6	8862	8867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
130	NC_019952	CGA	2	6	8874	8879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
131	NC_019952	GCG	2	6	8913	8918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633018
132	NC_019952	CAT	2	6	8943	8948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633018
133	NC_019952	CGA	2	6	8949	8954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
134	NC_019952	CGA	2	6	9033	9038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
135	NC_019952	CGA	2	6	9066	9071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
136	NC_019952	ATC	2	6	9085	9090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633018
137	NC_019952	CGA	2	6	9111	9116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
138	NC_019952	CGT	2	6	9138	9143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
139	NC_019952	CGG	2	6	9210	9215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633018
140	NC_019952	GAC	2	6	9247	9252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
141	NC_019952	TCG	2	6	9254	9259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
142	NC_019952	CTT	2	6	9264	9269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433633018
143	NC_019952	TTC	2	6	9298	9303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433633018
144	NC_019952	ACC	2	6	9304	9309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633018
145	NC_019952	GCA	2	6	9372	9377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
146	NC_019952	ACG	2	6	9560	9565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
147	NC_019952	CGA	3	9	9594	9602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
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149	NC_019952	CGA	2	6	9714	9719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
150	NC_019952	GCT	2	6	9723	9728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
151	NC_019952	CGT	2	6	9738	9743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
152	NC_019952	CTG	2	6	9760	9765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
153	NC_019952	CGG	2	6	9828	9833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633018
154	NC_019952	CCG	2	6	9861	9866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633018
155	NC_019952	CGA	3	9	9897	9905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
156	NC_019952	CGG	2	6	9930	9935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633018
157	NC_019952	TGA	2	6	10001	10006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633018
158	NC_019952	GAA	2	6	10051	10056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433633018
159	NC_019952	CGA	2	6	10062	10067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
160	NC_019952	CGC	2	6	10333	10338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633019
161	NC_019952	TGC	2	6	10349	10354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633019
162	NC_019952	GCC	3	9	10385	10393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633019
163	NC_019952	CCG	4	12	10429	10440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633019
164	NC_019952	GCC	2	6	10494	10499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633019
165	NC_019952	CCG	2	6	10558	10563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633019
166	NC_019952	GCC	2	6	10677	10682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633019
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169	NC_019952	TTC	2	6	10842	10847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433633019
170	NC_019952	GAT	2	6	10853	10858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633019
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183	NC_019952	GGT	2	6	12297	12302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633021
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205	NC_019952	CCG	2	6	14533	14538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633025
206	NC_019952	ACC	2	6	14621	14626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633025
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209	NC_019952	CCG	2	6	14688	14693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633025
210	NC_019952	GGC	2	6	14707	14712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633025
211	NC_019952	TGG	2	6	14739	14744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633025
212	NC_019952	CAT	2	6	14896	14901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633025
213	NC_019952	TGC	2	6	14937	14942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633025
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218	NC_019952	ACT	2	6	15162	15167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633025
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220	NC_019952	ACC	2	6	15306	15311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633026
221	NC_019952	GCC	2	6	15326	15331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633026
222	NC_019952	GCA	2	6	15425	15430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633026
223	NC_019952	CAG	2	6	15529	15534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633026
224	NC_019952	AGC	2	6	15659	15664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633026
225	NC_019952	GCA	2	6	15682	15687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633026
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229	NC_019952	CGG	2	6	15936	15941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633027
230	NC_019952	GAC	2	6	15951	15956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633027
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234	NC_019952	CCA	2	6	16370	16375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633027
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239	NC_019952	GCC	2	6	16698	16703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633027
240	NC_019952	ACG	2	6	16729	16734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633027
241	NC_019952	ACC	2	6	16756	16761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633027
242	NC_019952	TGC	2	6	16787	16792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633027
243	NC_019952	GTC	2	6	16806	16811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633027
244	NC_019952	GAC	2	6	16867	16872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633027
245	NC_019952	AGC	2	6	16873	16878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633027
246	NC_019952	GGC	2	6	16918	16923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633027
247	NC_019952	CCG	2	6	16961	16966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633027
248	NC_019952	ACG	2	6	17011	17016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633027
249	NC_019952	CGG	2	6	17027	17032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633027
250	NC_019952	CTG	2	6	17237	17242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633027
251	NC_019952	ATG	2	6	17329	17334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633027
252	NC_019952	GAT	2	6	17358	17363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633027
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254	NC_019952	CGG	2	6	17510	17515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633027
255	NC_019952	CGA	2	6	17546	17551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633027
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492	NC_019952	CCG	2	6	31943	31948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633041
493	NC_019952	GGC	2	6	31995	32000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633041
494	NC_019952	GCT	2	6	32061	32066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633041
495	NC_019952	GCC	2	6	32081	32086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633041
496	NC_019952	GGC	2	6	32151	32156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633042
497	NC_019952	TCG	2	6	32211	32216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633042
498	NC_019952	TGC	3	9	32220	32228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633042
499	NC_019952	CTC	2	6	32415	32420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433633043
500	NC_019952	CAC	2	6	32430	32435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633043

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