MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019951	CAACGG	2	12	90470	90481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019951	TGTCTT	2	12	153132	153143	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019951	CTCGGT	2	12	164369	164380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019951	CGCAGA	2	12	198534	198545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019951	TCGGCG	2	12	199050	199061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019951	ACAGCC	2	12	233439	233450	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019951	GCTGAT	2	12	250356	250367	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019951	CGCCGG	2	12	357171	357182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019951	CCGATA	2	12	490876	490887	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019951	GCCCGG	2	12	492934	492945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019951	ACCAGT	2	12	603622	603633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019951	AGGCCG	2	12	718845	718856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019951	CGACGG	2	12	718900	718911	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019951	AGTTCG	2	12	719313	719324	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019951	CGGGCG	2	12	848871	848882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019951	GCCGCG	2	12	849302	849313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019951	CCGGCG	2	12	876174	876185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019951	ACCGGG	2	12	882895	882906	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019951	TTCCGA	2	12	889648	889659	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019951	GCGGCC	2	12	922064	922075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019951	ACAGCA	2	12	923447	923458	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019951	CGCCAC	2	12	941826	941837	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_019951	GCGCCG	2	12	941933	941944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019951	ATGGCG	2	12	942116	942127	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019951	ACGCCC	2	12	942777	942788	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019951	CAGTCG	2	12	945639	945650	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019951	GATGGC	2	12	964238	964249	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019951	TCGGGT	2	12	985988	985999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019951	CATCGT	2	12	989182	989193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019951	GTCGAT	2	12	1011598	1011609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019951	GCACCG	2	12	1028273	1028284	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019951	GAGCGG	2	12	1048358	1048369	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019951	CAGTTC	2	12	1057361	1057372	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019951	CCAAGC	2	12	1059761	1059772	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019951	CAACGG	2	12	1066061	1066072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019951	GATCGA	2	12	1066112	1066123	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019951	CCAGGG	2	12	1134072	1134083	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019951	CAATGC	2	12	1168108	1168119	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019951	TTCCGT	2	12	1204694	1204705	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019951	CGATGG	2	12	1207302	1207313	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019951	TCATCG	2	12	1209614	1209625	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019951	CGGCTG	2	12	1214107	1214118	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019951	TTGATC	2	12	1230220	1230231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019951	CATCGC	2	12	1231641	1231652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019951	ACCGCC	2	12	1251620	1251631	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019951	ACGCCG	2	12	1253315	1253326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019951	TAGCCA	2	12	1257096	1257107	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019951	AGTTAC	2	12	1277656	1277667	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019951	CGTGGT	2	12	1287426	1287437	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019951	TGCCGG	2	12	1320353	1320364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019951	TCAGTG	2	12	1428129	1428140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019951	CCGAGT	2	12	1485584	1485595	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019951	TCGGGG	2	12	1510757	1510768	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019951	GCCGGT	2	12	1564198	1564209	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019951	ATATTC	2	12	1635840	1635851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019951	ATCGTG	2	12	1679721	1679732	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019951	CGCCGG	2	12	1706256	1706267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019951	CCACCG	2	12	1707107	1707118	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019951	CGCCGG	2	12	1707555	1707566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019951	CACCGG	2	12	1707870	1707881	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019951	CGGCCC	2	12	1710284	1710295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_019951	CGCCGG	2	12	1713133	1713144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019951	GCCTTG	2	12	1862247	1862258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019951	CGAGTG	2	12	1863313	1863324	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019951	GGCGCC	2	12	1909563	1909574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019951	TCCCAC	2	12	1925432	1925443	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019951	CCGCGG	2	12	1973350	1973361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019951	TAGCGG	2	12	2000469	2000480	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019951	ACCGCA	2	12	2002438	2002449	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019951	GCCGTG	2	12	2082592	2082603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019951	GGTGAT	2	12	2127476	2127487	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019951	AGTCGC	2	12	2146551	2146562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019951	AGAGGG	2	12	2159428	2159439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019951	GCTGGG	2	12	2252862	2252873	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019951	CGCGAG	2	12	2288235	2288246	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019951	GCCTTG	2	12	2292414	2292425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019951	TATCCT	2	12	2315398	2315409	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019951	GCGGTG	2	12	2341275	2341286	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019951	CGGTTG	2	12	2343651	2343662	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019951	GCCGTG	2	12	2372579	2372590	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019951	CCCGAC	2	12	2458314	2458325	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019951	TGACGG	2	12	2466169	2466180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019951	CTGGGC	2	12	2479226	2479237	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019951	ATAGAA	2	12	2484801	2484812	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019951	GTGTTG	2	12	2486511	2486522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019951	CTCAAC	2	12	2527773	2527784	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019951	CCGCTG	2	12	2548362	2548373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019951	GCGTCG	2	12	2609517	2609528	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019951	CACGAC	2	12	2627699	2627710	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019951	CACTGC	2	12	2695044	2695055	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019951	CTGGAC	2	12	2720145	2720156	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019951	AAGCCC	2	12	2720164	2720175	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019951	CACCGC	2	12	2727529	2727540	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_019951	ATGACG	2	12	2738519	2738530	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019951	GCCGGG	2	12	2748958	2748969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019951	GCAACC	2	12	2750707	2750718	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019951	CCCGCA	2	12	2755768	2755779	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019951	AGCTGT	2	12	2805793	2805804	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019951	ACGGCG	2	12	2827796	2827807	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019951	CACGTG	2	12	2838624	2838635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019951	GAGGTC	2	12	2842236	2842247	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019951	CACCGC	2	12	2845261	2845272	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019951	CCGGCA	2	12	2856735	2856746	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019951	CGGCGC	2	12	2891892	2891903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019951	CGCCAC	2	12	2914907	2914918	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_019951	GCACCC	2	12	2946268	2946279	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_019951	ACCGCT	2	12	2987064	2987075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019951	GCCCGA	2	12	3010017	3010028	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019951	GTATTG	2	12	3048391	3048402	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019951	CCGTTG	2	12	3060711	3060722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019951	GGCGCC	2	12	3080518	3080529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019951	TCAAAG	2	12	3087847	3087858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019951	CCGACA	2	12	3104229	3104240	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019951	CACCCG	2	12	3130442	3130453	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_019951	CGGGTA	2	12	3224489	3224500	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019951	CGAACC	2	12	3239045	3239056	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019951	CGCCGG	2	12	3268603	3268614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019951	GCCTCG	2	12	3269271	3269282	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019951	GTCCTC	2	12	3269435	3269446	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019951	TCGCCG	2	12	3416911	3416922	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019951	CGCCAC	2	12	3432939	3432950	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_019951	GGCCGG	2	12	3438639	3438650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019951	CGTAGG	2	12	3505241	3505252	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019951	CGATGC	2	12	3538104	3538115	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019951	TGTACA	2	12	3553421	3553432	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019951	ACCAAC	2	12	3558770	3558781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019951	GCCCAC	2	12	3567165	3567176	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_019951	CCGTTG	2	12	3582315	3582326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019951	AAGATC	2	12	3594394	3594405	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_019951	ATCGTC	2	12	3597306	3597317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019951	GCCGTG	2	12	3599081	3599092	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019951	GCTCCT	2	12	3624477	3624488	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019951	TCCGCT	2	12	3692329	3692340	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019951	GCCTCC	2	12	3778265	3778276	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_019951	TGCCGC	2	12	3881271	3881282	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019951	CGTTGC	2	12	3881394	3881405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019951	CGCCAC	2	12	3881520	3881531	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_019951	AATGCA	2	12	3885605	3885616	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_019951	TGTACA	2	12	3917866	3917877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_019951	ACCGCG	2	12	3959919	3959930	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_019951	TCGTGG	2	12	3970660	3970671	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_019951	CACCGG	2	12	3985267	3985278	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019951	GCTGCG	2	12	3986470	3986481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019951	CGGGAT	2	12	3988564	3988575	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_019951	CACGTT	2	12	3995477	3995488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019951	TCCTCT	2	12	4000755	4000766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019951	TCGGAG	2	12	4025012	4025023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_019951	CGTTGG	2	12	4041661	4041672	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_019951	CGCCGG	2	12	4048541	4048552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019951	CGCCAA	2	12	4049083	4049094	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019951	CGATCC	2	12	4051196	4051207	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
152	NC_019951	CGCCAA	2	12	4052559	4052570	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
153	NC_019951	CGGCAA	2	12	4053478	4053489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019951	CAACGG	2	12	4055613	4055624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_019951	GCCGGC	2	12	4055722	4055733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_019951	CGCCGG	2	12	4061842	4061853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_019951	CGAACA	2	12	4129572	4129583	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_019951	GGCGAG	2	12	4228067	4228078	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_019951	TGGCGG	2	12	4315462	4315473	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_019951	GCCGCG	2	12	4359368	4359379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_019951	CTCATC	2	12	4381231	4381242	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_019951	CAGCGA	2	12	4439801	4439812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.