MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 3610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019951	CCTGG	2	10	1238963	1238972	0 %	20 %	40 %	40 %	433630164
1002	NC_019951	CAGCG	2	10	1240424	1240433	20 %	0 %	40 %	40 %	433630165
1003	NC_019951	CGCAC	2	10	1240434	1240443	20 %	0 %	20 %	60 %	433630165
1004	NC_019951	CATCA	2	10	1240946	1240955	40 %	20 %	0 %	40 %	433630165
1005	NC_019951	GCGCA	2	10	1241104	1241113	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1006	NC_019951	TTTGA	2	10	1241529	1241538	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019951	TGCTG	2	10	1241837	1241846	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_019951	GGGTC	2	10	1243877	1243886	0 %	20 %	60 %	20 %	433630167
1009	NC_019951	TGGCC	2	10	1244243	1244252	0 %	20 %	40 %	40 %	433630167
1010	NC_019951	CGCTG	2	10	1245195	1245204	0 %	20 %	40 %	40 %	433630168
1011	NC_019951	GACCG	2	10	1245486	1245495	20 %	0 %	40 %	40 %	433630168
1012	NC_019951	CGGTG	2	10	1247756	1247765	0 %	20 %	60 %	20 %	433630171
1013	NC_019951	TGCCG	2	10	1249503	1249512	0 %	20 %	40 %	40 %	433630173
1014	NC_019951	GTTGG	2	10	1250353	1250362	0 %	40 %	60 %	0 %	433630174
1015	NC_019951	CGGCG	2	10	1254163	1254172	0 %	0 %	60 %	40 %	433630177
1016	NC_019951	ACTGC	2	10	1254727	1254736	20 %	20 %	20 %	40 %	433630177
1017	NC_019951	TGGTT	2	10	1256840	1256849	0 %	60 %	40 %	0 %	433630179
1018	NC_019951	GCCTC	2	10	1256942	1256951	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1019	NC_019951	CGCTG	2	10	1257662	1257671	0 %	20 %	40 %	40 %	433630180
1020	NC_019951	ATGGG	2	10	1258723	1258732	20 %	20 %	60 %	0 %	433630181
1021	NC_019951	GCGCG	2	10	1260106	1260115	0 %	0 %	60 %	40 %	433630182
1022	NC_019951	CATCG	2	10	1260822	1260831	20 %	20 %	20 %	40 %	433630183
1023	NC_019951	CGATG	2	10	1262168	1262177	20 %	20 %	40 %	20 %	433630184
1024	NC_019951	GGATC	2	10	1262695	1262704	20 %	20 %	40 %	20 %	433630185
1025	NC_019951	ACTGC	2	10	1264888	1264897	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1026	NC_019951	CCGCG	2	10	1269637	1269646	0 %	0 %	40 %	60 %	433630192
1027	NC_019951	ACCCA	2	10	1270811	1270820	40 %	0 %	0 %	60 %	433630193
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1030	NC_019951	GCTCG	2	10	1275897	1275906	0 %	20 %	40 %	40 %	433630197
1031	NC_019951	GGCTG	2	10	1275956	1275965	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_019951	TGCTG	2	10	1276110	1276119	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1033	NC_019951	CCGAG	2	10	1278093	1278102	20 %	0 %	40 %	40 %	433630199
1034	NC_019951	CCGGC	2	10	1280060	1280069	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1035	NC_019951	CGGTG	2	10	1280174	1280183	0 %	20 %	60 %	20 %	433630201
1036	NC_019951	CCCCA	2	10	1282236	1282245	20 %	0 %	0 %	80 %	433630203
1037	NC_019951	GATGA	2	10	1282810	1282819	40 %	20 %	40 %	0 %	433630203
1038	NC_019951	CGCCC	2	10	1283641	1283650	0 %	0 %	20 %	80 %	433630204
1039	NC_019951	CGCGT	2	10	1286792	1286801	0 %	20 %	40 %	40 %	433630208
1040	NC_019951	CGGTC	2	10	1287069	1287078	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1041	NC_019951	TCGGC	2	10	1288918	1288927	0 %	20 %	40 %	40 %	433630209
1042	NC_019951	GCTGC	2	10	1289381	1289390	0 %	20 %	40 %	40 %	433630209
1043	NC_019951	TTCGG	2	10	1292664	1292673	0 %	40 %	40 %	20 %	433630213
1044	NC_019951	GAGCT	2	10	1293459	1293468	20 %	20 %	40 %	20 %	433630214
1045	NC_019951	CGCTG	2	10	1293909	1293918	0 %	20 %	40 %	40 %	433630214
1046	NC_019951	CGCCT	2	10	1293960	1293969	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1047	NC_019951	CGAAC	2	10	1294095	1294104	40 %	0 %	20 %	40 %	433630215
1048	NC_019951	GCCCG	2	10	1296875	1296884	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1049	NC_019951	GGTCG	2	10	1297847	1297856	0 %	20 %	60 %	20 %	433630221
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1063	NC_019951	CGCGG	2	10	1316472	1316481	0 %	0 %	60 %	40 %	433630235
1064	NC_019951	CCGAT	2	10	1316592	1316601	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1065	NC_019951	GCGCG	2	10	1316673	1316682	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1066	NC_019951	GCCAA	2	10	1319675	1319684	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1067	NC_019951	GGGTT	2	10	1321236	1321245	0 %	40 %	60 %	0 %	433630239
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1071	NC_019951	CAGCC	2	10	1323954	1323963	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1072	NC_019951	GCCGG	2	10	1325219	1325228	0 %	0 %	60 %	40 %	433630243
1073	NC_019951	CGGGC	2	10	1326953	1326962	0 %	0 %	60 %	40 %	433630245
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1087	NC_019951	GGCGC	2	10	1341650	1341659	0 %	0 %	60 %	40 %	433630260
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1092	NC_019951	CGGCG	2	10	1343262	1343271	0 %	0 %	60 %	40 %	433630263
1093	NC_019951	GTGCG	2	10	1344072	1344081	0 %	20 %	60 %	20 %	433630263
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1096	NC_019951	CTCAG	2	10	1348539	1348548	20 %	20 %	20 %	40 %	433630264
1097	NC_019951	TGCGC	2	10	1348698	1348707	0 %	20 %	40 %	40 %	433630265
1098	NC_019951	GCGCG	2	10	1349040	1349049	0 %	0 %	60 %	40 %	433630265
1099	NC_019951	CCGCG	2	10	1349950	1349959	0 %	0 %	40 %	60 %	433630266
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1105	NC_019951	CGGGT	2	10	1354011	1354020	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1106	NC_019951	GGCCG	2	10	1355995	1356004	0 %	0 %	60 %	40 %	433630271
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1108	NC_019951	TCGCC	2	10	1356537	1356546	0 %	20 %	20 %	60 %	433630271
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1246	NC_019951	CGGTG	2	10	1535207	1535216	0 %	20 %	60 %	20 %	433630418
1247	NC_019951	GGCCG	2	10	1535687	1535696	0 %	0 %	60 %	40 %	433630418
1248	NC_019951	TTTGC	2	10	1535730	1535739	0 %	60 %	20 %	20 %	433630418
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1499	NC_019951	CGCGT	2	10	1862142	1862151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1500	NC_019951	CGCGC	2	10	1867775	1867784	0 %	0 %	40 %	60 %	433630687

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