MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 85102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019951	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629071
2	NC_019951	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629071
3	NC_019951	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
4	NC_019951	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
5	NC_019951	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629071
6	NC_019951	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
7	NC_019951	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
8	NC_019951	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
9	NC_019951	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
10	NC_019951	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
11	NC_019951	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433629071
12	NC_019951	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
13	NC_019951	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629071
14	NC_019951	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
15	NC_019951	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433629071
16	NC_019951	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629071
17	NC_019951	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
18	NC_019951	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629071
19	NC_019951	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
20	NC_019951	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629071
21	NC_019951	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629071
22	NC_019951	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629071
23	NC_019951	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629071
24	NC_019951	TCT	2	6	1532	1537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019951	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019951	TCA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019951	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019951	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019951	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019951	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019951	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019951	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019951	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629072
34	NC_019951	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629072
35	NC_019951	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629072
36	NC_019951	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629072
37	NC_019951	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629072
38	NC_019951	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433629072
39	NC_019951	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629072
40	NC_019951	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629072
41	NC_019951	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629072
42	NC_019951	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629072
43	NC_019951	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629072
44	NC_019951	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629072
45	NC_019951	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629072
46	NC_019951	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433629072
47	NC_019951	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629072
48	NC_019951	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433629072
49	NC_019951	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629072
50	NC_019951	GTG	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
51	NC_019951	ACG	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629073
52	NC_019951	CGC	2	6	3541	3546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629073
53	NC_019951	CAA	2	6	3556	3561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629073
54	NC_019951	TGT	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629073
55	NC_019951	CGG	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
56	NC_019951	GAT	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433629073
57	NC_019951	TGG	2	6	3870	3875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
58	NC_019951	GAA	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629073
59	NC_019951	GGC	2	6	4045	4050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
60	NC_019951	GGC	2	6	4054	4059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
61	NC_019951	CGA	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629073
62	NC_019951	GGC	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
63	NC_019951	TGG	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
64	NC_019951	GTT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629073
65	NC_019951	CGA	2	6	4252	4257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629073
66	NC_019951	CGG	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629073
67	NC_019951	CCG	2	6	4314	4319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629073
68	NC_019951	CCG	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629073
69	NC_019951	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629073
70	NC_019951	TGC	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629074
71	NC_019951	CGA	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629074
72	NC_019951	GGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629074
73	NC_019951	CCA	2	6	4755	4760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629074
74	NC_019951	ACG	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629074
75	NC_019951	CGC	2	6	4878	4883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629074
76	NC_019951	CGG	2	6	4928	4933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629074
77	NC_019951	GAA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019951	AGA	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019951	GTG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019951	GAG	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019951	AAG	2	6	5256	5261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629075
82	NC_019951	GGT	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
83	NC_019951	CGA	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
84	NC_019951	CGA	2	6	5474	5479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
85	NC_019951	GTG	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
86	NC_019951	CGG	2	6	5555	5560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629075
87	NC_019951	TGG	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
88	NC_019951	GGT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
89	NC_019951	AAG	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629075
90	NC_019951	CAA	2	6	5840	5845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629075
91	NC_019951	CGA	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
92	NC_019951	GTC	2	6	5892	5897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629075
93	NC_019951	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
94	NC_019951	AGC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
95	NC_019951	GGC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629075
96	NC_019951	GGT	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629075
97	NC_019951	GAC	2	6	6282	6287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
98	NC_019951	GCG	2	6	6521	6526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629075
99	NC_019951	ATC	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433629075
100	NC_019951	ATC	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433629075
101	NC_019951	ACG	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
102	NC_019951	TGT	2	6	6868	6873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629075
103	NC_019951	GTT	3	9	6878	6886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629075
104	NC_019951	CCG	2	6	6936	6941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629075
105	NC_019951	CTG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629075
106	NC_019951	GAA	2	6	7034	7039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629075
107	NC_019951	CAA	2	6	7043	7048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433629075
108	NC_019951	ACC	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629075
109	NC_019951	GAC	2	6	7155	7160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629075
110	NC_019951	GCC	4	12	7161	7172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629075
111	NC_019951	GTT	2	6	7178	7183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629075
112	NC_019951	ACG	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629076
113	NC_019951	GCC	2	6	7320	7325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629076
114	NC_019951	GAC	2	6	7327	7332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629076
115	NC_019951	CAG	2	6	7363	7368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629076
116	NC_019951	TCG	2	6	7409	7414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629076
117	NC_019951	ACC	2	6	7553	7558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629076
118	NC_019951	TGG	2	6	7628	7633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433629076
119	NC_019951	CGG	2	6	7673	7678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629076
120	NC_019951	CGA	2	6	7737	7742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629076
121	NC_019951	ACG	2	6	7769	7774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629076
122	NC_019951	CTG	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629076
123	NC_019951	GGC	2	6	7837	7842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629076
124	NC_019951	CGC	2	6	7871	7876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629076
125	NC_019951	ACG	2	6	7925	7930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629076
126	NC_019951	CGA	2	6	7932	7937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433629076
127	NC_019951	GGA	2	6	7938	7943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433629076
128	NC_019951	CCG	2	6	7991	7996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433629076
129	NC_019951	TCG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433629076
130	NC_019951	GTT	2	6	8068	8073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433629076
131	NC_019951	AGA	2	6	8079	8084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433629076
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499	NC_019951	ACC	2	6	29501	29506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433629100
500	NC_019951	GCG	2	6	29692	29697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433629101

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