MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019950	CGTCGG	2	12	68544	68555	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019950	TCGGCC	2	12	71698	71709	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019950	CAACGG	2	12	80037	80048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019950	TCACCT	2	12	84230	84241	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019950	TCGGTC	2	12	154713	154724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019950	CGCAGA	2	12	189198	189209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019950	TCGGCG	2	12	189714	189725	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019950	ACAGCC	2	12	224103	224114	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019950	GCACGA	2	12	294819	294830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019950	AGATTC	2	12	336022	336033	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019950	GGGCCG	2	12	348649	348660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019950	GGTCGC	2	12	351459	351470	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019950	GTGACC	2	12	397390	397401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019950	TGGTCG	2	12	462752	462763	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019950	TGCGGG	2	12	481457	481468	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019950	TCCCGG	2	12	481954	481965	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019950	CCGATA	2	12	482817	482828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019950	ATAGTC	2	12	549307	549318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019950	GCCCGC	2	12	569026	569037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_019950	ACCAGT	2	12	597368	597379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019950	AGGCCG	2	12	703059	703070	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019950	TCCCCG	2	12	703212	703223	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_019950	CGCCGT	2	12	721517	721528	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019950	CGCGGG	2	12	835509	835520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019950	CCGGCG	2	12	858537	858548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019950	ACCGGG	2	12	866785	866796	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019950	GCGGCC	2	12	902341	902352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019950	ACAGCA	2	12	903714	903725	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019950	CTGGGT	2	12	918611	918622	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019950	CAGTCG	2	12	926350	926361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019950	TCGGGT	2	12	961657	961668	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019950	CATCGT	2	12	964852	964863	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019950	GTCGAT	2	12	986802	986813	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019950	GAGCGG	2	12	1017746	1017757	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019950	CAACGG	2	12	1024345	1024356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019950	GATCGA	2	12	1024398	1024409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019950	GACTGC	2	12	1028801	1028812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019950	CGCCGG	2	12	1047665	1047676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019950	TGTGAT	2	12	1061047	1061058	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019950	CAATGC	2	12	1126304	1126315	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019950	TTGGTG	2	12	1154441	1154452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019950	TTCCGT	2	12	1165135	1165146	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019950	TAGCCA	2	12	1192150	1192161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019950	AGTTAC	2	12	1218042	1218053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019950	CGCGGT	2	12	1273386	1273397	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019950	CTTCGG	2	12	1273448	1273459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019950	AGGCCA	2	12	1337256	1337267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019950	TCGACA	2	12	1364856	1364867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019950	CCGAGT	2	12	1420366	1420377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019950	TTGGTG	2	12	1468793	1468804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019950	CCGGCC	2	12	1469158	1469169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019950	CACGCG	2	12	1527182	1527193	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019950	ATATTC	2	12	1562204	1562215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019950	AGCCCG	2	12	1581911	1581922	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019950	GCCCCT	2	12	1635734	1635745	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_019950	GGTTGA	2	12	1744593	1744604	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019950	CTGGGC	2	12	1751746	1751757	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019950	CGAGTG	2	12	1790719	1790730	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019950	GGCGCC	2	12	1837094	1837105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019950	TCCCAC	2	12	1852963	1852974	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019950	CCGCGG	2	12	1902348	1902359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019950	TAGCGG	2	12	1929452	1929463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019950	TTTGCG	2	12	1929625	1929636	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019950	TCGGCT	2	12	1930408	1930419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019950	ACCGCA	2	12	1931388	1931399	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019950	CGCCGA	2	12	1990264	1990275	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019950	CCGATG	2	12	1992835	1992846	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019950	CTGCGG	2	12	1993154	1993165	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019950	GCTGCC	2	12	1993531	1993542	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019950	GGTGAT	2	12	2054425	2054436	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019950	TTCGGC	2	12	2068366	2068377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019950	AGTCGC	2	12	2073757	2073768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019950	AGAGGG	2	12	2086634	2086645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019950	GCTGGG	2	12	2155736	2155747	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019950	CGCGAG	2	12	2188362	2188373	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019950	GGCGAA	2	12	2215103	2215114	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019950	CGGTTG	2	12	2247273	2247284	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_019950	CGGCTC	2	12	2278215	2278226	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019950	GTTGGT	2	12	2359599	2359610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019950	CCCGAC	2	12	2360534	2360545	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_019950	TGACAC	2	12	2374089	2374100	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019950	ATAGAA	2	12	2395987	2395998	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019950	GATTCG	2	12	2426209	2426220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019950	CTCAAC	2	12	2438515	2438526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019950	CCGCTG	2	12	2459104	2459115	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019950	CGACCA	2	12	2482893	2482904	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019950	GCGTCG	2	12	2521444	2521455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019950	CACGAC	2	12	2539615	2539626	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019950	CTGGAC	2	12	2638020	2638031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019950	GCAACC	2	12	2665216	2665227	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019950	CACGTG	2	12	2747417	2747428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019950	GAGGTC	2	12	2751029	2751040	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019950	GGGGCC	2	12	2753688	2753699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019950	CTCGCC	2	12	2755412	2755423	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_019950	CCGGCA	2	12	2767824	2767835	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019950	CGCCAC	2	12	2825978	2825989	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_019950	TCAAAC	2	12	2827731	2827742	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019950	ATGCCG	2	12	2832914	2832925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019950	GCACCC	2	12	2861992	2862003	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019950	CACCGC	2	12	2905018	2905029	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_019950	CGACGG	2	12	2908361	2908372	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019950	GCCCGA	2	12	2915456	2915467	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019950	GTATTG	2	12	2953892	2953903	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019950	CCGTTG	2	12	2963837	2963848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019950	GGCGCC	2	12	2983664	2983675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019950	CATATT	2	12	3040665	3040676	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019950	CCGGCA	2	12	3104709	3104720	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019950	CGGGTA	2	12	3128656	3128667	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019950	CGAACC	2	12	3138644	3138655	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019950	TCGCCT	2	12	3147438	3147449	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019950	CATCAC	2	12	3207947	3207958	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019950	CCCCGC	2	12	3266235	3266246	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
113	NC_019950	TCGCCG	2	12	3312298	3312309	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019950	TCGCCG	2	12	3312355	3312366	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019950	TCGCCG	2	12	3312412	3312423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019950	CGCCAC	2	12	3328440	3328451	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_019950	AGGCCG	2	12	3337108	3337119	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019950	CGTAGG	2	12	3407757	3407768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_019950	GGGGTG	2	12	3440204	3440215	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019950	CGATGC	2	12	3451360	3451371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019950	TGTACA	2	12	3466410	3466421	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_019950	ACCAAC	2	12	3471759	3471770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019950	CCGTTG	2	12	3494992	3495003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019950	CTGTCA	2	12	3527649	3527660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019950	TCCGCT	2	12	3575711	3575722	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019950	GCCTCC	2	12	3668904	3668915	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_019950	GACCCG	2	12	3730140	3730151	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019950	TGCCGC	2	12	3769365	3769376	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019950	CGTTGC	2	12	3769488	3769499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019950	CGCCAC	2	12	3769614	3769625	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_019950	GCGCAG	2	12	3811536	3811547	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019950	TGTACA	2	12	3830877	3830888	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_019950	CACGTT	2	12	3906353	3906364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019950	TCCTCT	2	12	3911631	3911642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019950	TCGGAG	2	12	3935936	3935947	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_019950	CCGCTC	2	12	3939965	3939976	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_019950	CGTTGG	2	12	3952605	3952616	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_019950	CGGCCG	2	12	3956828	3956839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019950	CGAACA	2	12	4037745	4037756	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019950	GGCGAG	2	12	4128558	4128569	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_019950	TGGCGG	2	12	4219491	4219502	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_019950	CTCATC	2	12	4285574	4285585	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019950	CATCGC	2	12	4342006	4342017	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019950	GGGTTG	2	12	4344570	4344581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019950	CACCCC	2	12	4373895	4373906	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
146	NC_019950	CCTCCG	2	12	4373909	4373920	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_019950	GTCGTG	2	12	4375407	4375418	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.