MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 11434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019950	CGAC	2	8	531	538	25 %	0 %	25 %	50 %	433625089
2	NC_019950	CGTT	2	8	747	754	0 %	50 %	25 %	25 %	433625089
3	NC_019950	CCCG	2	8	809	816	0 %	0 %	25 %	75 %	433625089
4	NC_019950	GGCA	2	8	880	887	25 %	0 %	50 %	25 %	433625089
5	NC_019950	CCCA	2	8	1138	1145	25 %	0 %	0 %	75 %	433625089
6	NC_019950	AAGG	2	8	1849	1856	50 %	0 %	50 %	0 %	433625090
7	NC_019950	CAGG	2	8	1947	1954	25 %	0 %	50 %	25 %	433625090
8	NC_019950	TGCG	2	8	2021	2028	0 %	25 %	50 %	25 %	433625090
9	NC_019950	TGGG	2	8	2505	2512	0 %	25 %	75 %	0 %	433625091
10	NC_019950	GCGG	2	8	2630	2637	0 %	0 %	75 %	25 %	433625091
11	NC_019950	GCCC	2	8	3148	3155	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_019950	CCGA	2	8	3480	3487	25 %	0 %	25 %	50 %	433625092
13	NC_019950	GTGG	2	8	3887	3894	0 %	25 %	75 %	0 %	433625093
14	NC_019950	GCCA	2	8	3905	3912	25 %	0 %	25 %	50 %	433625093
15	NC_019950	TCAG	2	8	4249	4256	25 %	25 %	25 %	25 %	433625093
16	NC_019950	CGTT	2	8	4475	4482	0 %	50 %	25 %	25 %	433625093
17	NC_019950	ACCG	2	8	4601	4608	25 %	0 %	25 %	50 %	433625093
18	NC_019950	ACGG	2	8	4827	4834	25 %	0 %	50 %	25 %	433625093
19	NC_019950	CGTC	2	8	5041	5048	0 %	25 %	25 %	50 %	433625094
20	NC_019950	GGTA	2	8	5221	5228	25 %	25 %	50 %	0 %	433625094
21	NC_019950	GGTT	2	8	5403	5410	0 %	50 %	50 %	0 %	433625094
22	NC_019950	CCGC	2	8	5631	5638	0 %	0 %	25 %	75 %	433625094
23	NC_019950	CCAC	2	8	7255	7262	25 %	0 %	0 %	75 %	433625096
24	NC_019950	ACCG	2	8	7274	7281	25 %	0 %	25 %	50 %	433625096
25	NC_019950	CAAG	2	8	7469	7476	50 %	0 %	25 %	25 %	433625096
26	NC_019950	CGCC	2	8	7565	7572	0 %	0 %	25 %	75 %	433625096
27	NC_019950	CGGC	2	8	8380	8387	0 %	0 %	50 %	50 %	433625096
28	NC_019950	ATCG	2	8	8472	8479	25 %	25 %	25 %	25 %	433625096
29	NC_019950	GACA	2	8	9060	9067	50 %	0 %	25 %	25 %	433625097
30	NC_019950	CGGT	2	8	9280	9287	0 %	25 %	50 %	25 %	433625097
31	NC_019950	CGAG	2	8	10212	10219	25 %	0 %	50 %	25 %	433625097
32	NC_019950	CCAC	2	8	10742	10749	25 %	0 %	0 %	75 %	433625097
33	NC_019950	CGAC	2	8	11111	11118	25 %	0 %	25 %	50 %	433625097
34	NC_019950	GGTT	2	8	11339	11346	0 %	50 %	50 %	0 %	433625097
35	NC_019950	CCCG	2	8	11835	11842	0 %	0 %	25 %	75 %	433625098
36	NC_019950	GCAC	2	8	13311	13318	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019950	GAGC	2	8	13795	13802	25 %	0 %	50 %	25 %	433625099
38	NC_019950	CTCA	2	8	14006	14013	25 %	25 %	0 %	50 %	433625099
39	NC_019950	GCCC	2	8	14156	14163	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_019950	AACC	2	8	15041	15048	50 %	0 %	0 %	50 %	433625101
41	NC_019950	CCCG	2	8	15150	15157	0 %	0 %	25 %	75 %	433625101
42	NC_019950	ATTC	2	8	15394	15401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019950	ACCC	2	8	15801	15808	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_019950	TGAT	2	8	15838	15845	25 %	50 %	25 %	0 %	433625103
45	NC_019950	TGCT	2	8	15885	15892	0 %	50 %	25 %	25 %	433625103
46	NC_019950	GCCC	2	8	16372	16379	0 %	0 %	25 %	75 %	433625103
47	NC_019950	GGGC	2	8	17153	17160	0 %	0 %	75 %	25 %	433625104
48	NC_019950	CTGA	2	8	17608	17615	25 %	25 %	25 %	25 %	433625105
49	NC_019950	TGGC	2	8	17751	17758	0 %	25 %	50 %	25 %	433625105
50	NC_019950	GCTT	2	8	17810	17817	0 %	50 %	25 %	25 %	433625105
51	NC_019950	CAGT	2	8	17838	17845	25 %	25 %	25 %	25 %	433625105
52	NC_019950	CGGT	2	8	18209	18216	0 %	25 %	50 %	25 %	433625105
53	NC_019950	GCCG	2	8	18268	18275	0 %	0 %	50 %	50 %	433625105
54	NC_019950	CGGG	2	8	19503	19510	0 %	0 %	75 %	25 %	433625106
55	NC_019950	CTGG	2	8	19611	19618	0 %	25 %	50 %	25 %	433625106
56	NC_019950	GTGC	2	8	20111	20118	0 %	25 %	50 %	25 %	433625106
57	NC_019950	GCCG	2	8	20129	20136	0 %	0 %	50 %	50 %	433625106
58	NC_019950	CCGC	2	8	20494	20501	0 %	0 %	25 %	75 %	433625107
59	NC_019950	GCCG	2	8	21958	21965	0 %	0 %	50 %	50 %	433625108
60	NC_019950	CCAG	2	8	22446	22453	25 %	0 %	25 %	50 %	433625108
61	NC_019950	CACC	2	8	22629	22636	25 %	0 %	0 %	75 %	433625108
62	NC_019950	CGGG	2	8	23585	23592	0 %	0 %	75 %	25 %	433625109
63	NC_019950	GCCG	2	8	23676	23683	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
64	NC_019950	GCTG	2	8	24056	24063	0 %	25 %	50 %	25 %	433625109
65	NC_019950	CGGC	2	8	24076	24083	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
66	NC_019950	GCCG	2	8	24747	24754	0 %	0 %	50 %	50 %	433625109
67	NC_019950	CCCA	2	8	24759	24766	25 %	0 %	0 %	75 %	433625109
68	NC_019950	GCTG	2	8	25898	25905	0 %	25 %	50 %	25 %	433625111
69	NC_019950	CGGC	2	8	25946	25953	0 %	0 %	50 %	50 %	433625111
70	NC_019950	GCCG	2	8	26046	26053	0 %	0 %	50 %	50 %	433625111
71	NC_019950	CGGG	2	8	26121	26128	0 %	0 %	75 %	25 %	433625111
72	NC_019950	TCAA	2	8	27199	27206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019950	GAGC	2	8	27227	27234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019950	GGCC	2	8	27241	27248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019950	GCTC	2	8	28190	28197	0 %	25 %	25 %	50 %	433625112
76	NC_019950	CCAA	2	8	28407	28414	50 %	0 %	0 %	50 %	433625112
77	NC_019950	CAGC	2	8	28473	28480	25 %	0 %	25 %	50 %	433625112
78	NC_019950	CGGC	2	8	29293	29300	0 %	0 %	50 %	50 %	433625114
79	NC_019950	CCGG	2	8	29779	29786	0 %	0 %	50 %	50 %	433625114
80	NC_019950	GCTC	2	8	30335	30342	0 %	25 %	25 %	50 %	433625115
81	NC_019950	TGCG	2	8	30411	30418	0 %	25 %	50 %	25 %	433625115
82	NC_019950	TGCG	2	8	30474	30481	0 %	25 %	50 %	25 %	433625115
83	NC_019950	CCGG	2	8	30739	30746	0 %	0 %	50 %	50 %	433625115
84	NC_019950	CGTC	2	8	31070	31077	0 %	25 %	25 %	50 %	433625116
85	NC_019950	CACG	2	8	31430	31437	25 %	0 %	25 %	50 %	433625117
86	NC_019950	ACCG	2	8	31511	31518	25 %	0 %	25 %	50 %	433625117
87	NC_019950	CCGG	2	8	31830	31837	0 %	0 %	50 %	50 %	433625117
88	NC_019950	GTCG	2	8	32006	32013	0 %	25 %	50 %	25 %	433625117
89	NC_019950	CCCG	2	8	32628	32635	0 %	0 %	25 %	75 %	433625117
90	NC_019950	CGTG	2	8	32735	32742	0 %	25 %	50 %	25 %	433625117
91	NC_019950	ACCA	2	8	32813	32820	50 %	0 %	0 %	50 %	433625117
92	NC_019950	CGAG	2	8	33144	33151	25 %	0 %	50 %	25 %	433625118
93	NC_019950	CGAC	2	8	33441	33448	25 %	0 %	25 %	50 %	433625119
94	NC_019950	GCCG	2	8	34168	34175	0 %	0 %	50 %	50 %	433625121
95	NC_019950	CCGA	2	8	35157	35164	25 %	0 %	25 %	50 %	433625122
96	NC_019950	GCTA	2	8	35544	35551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019950	GGCC	2	8	36292	36299	0 %	0 %	50 %	50 %	433625124
98	NC_019950	ATCG	2	8	36785	36792	25 %	25 %	25 %	25 %	433625124
99	NC_019950	GATC	2	8	37123	37130	25 %	25 %	25 %	25 %	433625124
100	NC_019950	CCAC	2	8	37944	37951	25 %	0 %	0 %	75 %	433625124
101	NC_019950	ACCG	2	8	38338	38345	25 %	0 %	25 %	50 %	433625125
102	NC_019950	CTGG	2	8	38682	38689	0 %	25 %	50 %	25 %	433625126
103	NC_019950	GCAT	2	8	39077	39084	25 %	25 %	25 %	25 %	433625127
104	NC_019950	GCTG	2	8	39591	39598	0 %	25 %	50 %	25 %	433625127
105	NC_019950	AACG	2	8	40346	40353	50 %	0 %	25 %	25 %	433625127
106	NC_019950	CCGA	2	8	40407	40414	25 %	0 %	25 %	50 %	433625127
107	NC_019950	CCAC	2	8	40563	40570	25 %	0 %	0 %	75 %	433625127
108	NC_019950	CAGC	2	8	40903	40910	25 %	0 %	25 %	50 %	433625128
109	NC_019950	GCCG	2	8	41398	41405	0 %	0 %	50 %	50 %	433625128
110	NC_019950	GGCC	2	8	41930	41937	0 %	0 %	50 %	50 %	433625129
111	NC_019950	CGAT	2	8	42380	42387	25 %	25 %	25 %	25 %	433625129
112	NC_019950	GCCG	2	8	42680	42687	0 %	0 %	50 %	50 %	433625129
113	NC_019950	CACC	2	8	42705	42712	25 %	0 %	0 %	75 %	433625129
114	NC_019950	ACCG	2	8	42928	42935	25 %	0 %	25 %	50 %	433625129
115	NC_019950	GCGT	2	8	42954	42961	0 %	25 %	50 %	25 %	433625129
116	NC_019950	CCAC	2	8	43683	43690	25 %	0 %	0 %	75 %	433625130
117	NC_019950	CGAT	2	8	43692	43699	25 %	25 %	25 %	25 %	433625130
118	NC_019950	GGCC	2	8	44388	44395	0 %	0 %	50 %	50 %	433625132
119	NC_019950	CCCG	2	8	44979	44986	0 %	0 %	25 %	75 %	433625132
120	NC_019950	CGGG	2	8	45008	45015	0 %	0 %	75 %	25 %	433625132
121	NC_019950	CGAC	2	8	45647	45654	25 %	0 %	25 %	50 %	433625133
122	NC_019950	GAGC	2	8	46027	46034	25 %	0 %	50 %	25 %	433625133
123	NC_019950	GGGC	2	8	47186	47193	0 %	0 %	75 %	25 %	433625133
124	NC_019950	CGGC	2	8	47281	47288	0 %	0 %	50 %	50 %	433625133
125	NC_019950	GCCG	2	8	48244	48251	0 %	0 %	50 %	50 %	433625133
126	NC_019950	TTGC	2	8	48408	48415	0 %	50 %	25 %	25 %	433625134
127	NC_019950	CCGC	2	8	48556	48563	0 %	0 %	25 %	75 %	433625134
128	NC_019950	CCGC	2	8	48589	48596	0 %	0 %	25 %	75 %	433625134
129	NC_019950	GGTC	2	8	48697	48704	0 %	25 %	50 %	25 %	433625134
130	NC_019950	CTAC	2	8	49021	49028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019950	CGGG	2	8	49248	49255	0 %	0 %	75 %	25 %	433625135
132	NC_019950	GCAG	2	8	49321	49328	25 %	0 %	50 %	25 %	433625135
133	NC_019950	GTGC	2	8	50221	50228	0 %	25 %	50 %	25 %	433625136
134	NC_019950	GCCG	2	8	50505	50512	0 %	0 %	50 %	50 %	433625136
135	NC_019950	CAGC	2	8	51690	51697	25 %	0 %	25 %	50 %	433625137
136	NC_019950	CGGG	2	8	51879	51886	0 %	0 %	75 %	25 %	433625138
137	NC_019950	GCCG	2	8	51979	51986	0 %	0 %	50 %	50 %	433625138
138	NC_019950	GGTG	2	8	52302	52309	0 %	25 %	75 %	0 %	433625138
139	NC_019950	CTCA	2	8	52918	52925	25 %	25 %	0 %	50 %	433625138
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141	NC_019950	GGTA	2	8	53923	53930	25 %	25 %	50 %	0 %	433625140
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