MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 83271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019950	CAA	2	6	155	160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019950	CGT	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625089
3	NC_019950	CAC	2	6	247	252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625089
4	NC_019950	GTC	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625089
5	NC_019950	GAC	2	6	299	304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
6	NC_019950	CAG	2	6	310	315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
7	NC_019950	TCG	2	6	387	392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625089
8	NC_019950	AGC	2	6	419	424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
9	NC_019950	GCC	2	6	480	485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
10	NC_019950	CCG	2	6	524	529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
11	NC_019950	CGA	2	6	544	549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
12	NC_019950	GCC	2	6	559	564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
13	NC_019950	ACG	2	6	609	614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
14	NC_019950	TGA	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625089
15	NC_019950	CGC	3	9	781	789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
16	NC_019950	GTT	2	6	901	906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625089
17	NC_019950	CGA	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
18	NC_019950	TTC	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625089
19	NC_019950	CAA	2	6	1108	1113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625089
20	NC_019950	AGC	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
21	NC_019950	ACC	2	6	1213	1218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625089
22	NC_019950	CGA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
23	NC_019950	CAG	2	6	1306	1311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
24	NC_019950	GCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625089
25	NC_019950	CCG	2	6	1479	1484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
26	NC_019950	CAC	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625089
27	NC_019950	TCT	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019950	GAG	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019950	CGG	2	6	1825	1830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625090
30	NC_019950	GGT	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625090
31	NC_019950	GGC	2	6	1982	1987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625090
32	NC_019950	GTG	2	6	2207	2212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019950	CAC	2	6	2227	2232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019950	GGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
35	NC_019950	GCG	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
36	NC_019950	CGC	2	6	2406	2411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625091
37	NC_019950	CTG	2	6	2460	2465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625091
38	NC_019950	ACC	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625091
39	NC_019950	CGG	2	6	2580	2585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
40	NC_019950	GCG	2	6	2662	2667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
41	NC_019950	TTG	2	6	2835	2840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625091
42	NC_019950	CAA	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625091
43	NC_019950	CGC	2	6	2885	2890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625091
44	NC_019950	CGA	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625091
45	NC_019950	CAA	2	6	2973	2978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625091
46	NC_019950	GGC	2	6	3020	3025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
47	NC_019950	CGC	3	9	3049	3057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019950	CCG	2	6	3066	3071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_019950	GCC	2	6	3093	3098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_019950	ACG	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019950	AGC	3	9	3205	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625092
52	NC_019950	CCA	2	6	3219	3224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625092
53	NC_019950	CGG	2	6	3398	3403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625092
54	NC_019950	TCG	2	6	3556	3561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019950	ACC	2	6	3603	3608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_019950	TCG	2	6	3621	3626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019950	ATG	2	6	3644	3649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019950	GTT	3	9	3680	3688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019950	CGT	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019950	GTT	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625093
61	NC_019950	CCG	2	6	3997	4002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625093
62	NC_019950	TTG	2	6	4059	4064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625093
63	NC_019950	CGA	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625093
64	NC_019950	TTG	2	6	4218	4223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625093
65	NC_019950	ATT	2	6	4232	4237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433625093
66	NC_019950	CGC	2	6	4265	4270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625093
67	NC_019950	GAC	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625093
68	NC_019950	GGT	2	6	4331	4336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625093
69	NC_019950	CGT	2	6	4390	4395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625093
70	NC_019950	GCC	2	6	4446	4451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625093
71	NC_019950	CGG	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625093
72	NC_019950	GCA	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625093
73	NC_019950	CTT	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625093
74	NC_019950	CCA	2	6	4624	4629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625093
75	NC_019950	TGA	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625093
76	NC_019950	CGG	2	6	4960	4965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625093
77	NC_019950	GTG	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
78	NC_019950	ACG	2	6	5262	5267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
79	NC_019950	CGC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625094
80	NC_019950	CAA	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625094
81	NC_019950	TGT	2	6	5379	5384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625094
82	NC_019950	CGG	2	6	5429	5434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
83	NC_019950	GAT	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625094
84	NC_019950	TGG	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
85	NC_019950	GAA	2	6	5671	5676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625094
86	NC_019950	AGC	2	6	5785	5790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
87	NC_019950	CGG	2	6	5799	5804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
88	NC_019950	GGC	2	6	5809	5814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
89	NC_019950	GAC	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
90	NC_019950	GGC	2	6	5956	5961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
91	NC_019950	TGG	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
92	NC_019950	GTT	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625094
93	NC_019950	CGA	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
94	NC_019950	CGG	2	6	6057	6062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
95	NC_019950	CCG	2	6	6069	6074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625094
96	NC_019950	CCG	2	6	6114	6119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625094
97	NC_019950	GGT	2	6	6178	6183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
98	NC_019950	TGC	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625095
99	NC_019950	CGA	2	6	6367	6372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625095
100	NC_019950	GGT	2	6	6501	6506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625095
101	NC_019950	CCA	2	6	6510	6515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625095
102	NC_019950	ACG	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625095
103	NC_019950	CGC	2	6	6633	6638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625095
104	NC_019950	CGG	2	6	6683	6688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625095
105	NC_019950	GAA	2	6	6847	6852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019950	AGA	2	6	6897	6902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019950	GTG	2	6	6930	6935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019950	GCG	2	6	6947	6952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019950	GAG	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019950	AAG	2	6	7011	7016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625096
111	NC_019950	GGT	2	6	7139	7144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
112	NC_019950	CGA	2	6	7157	7162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
113	NC_019950	TGC	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625096
114	NC_019950	CGA	2	6	7229	7234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
115	NC_019950	GTG	2	6	7287	7292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
116	NC_019950	CGG	2	6	7310	7315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625096
117	NC_019950	TGG	2	6	7346	7351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
118	NC_019950	GGT	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
119	NC_019950	AAG	2	6	7488	7493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625096
120	NC_019950	CAA	2	6	7595	7600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625096
121	NC_019950	CGA	2	6	7622	7627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
122	NC_019950	GTC	2	6	7647	7652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625096
123	NC_019950	TGG	2	6	7765	7770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
124	NC_019950	AGC	2	6	7812	7817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
125	NC_019950	GGC	2	6	7932	7937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625096
126	NC_019950	GGT	2	6	7973	7978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
127	NC_019950	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625096
128	NC_019950	GCG	2	6	8276	8281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625096
129	NC_019950	ATC	2	6	8448	8453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625096
130	NC_019950	ATC	2	6	8508	8513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625096
131	NC_019950	ACG	2	6	8536	8541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
132	NC_019950	TGT	2	6	8623	8628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625096
133	NC_019950	GTT	3	9	8633	8641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625096
134	NC_019950	CCG	2	6	8691	8696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625096
135	NC_019950	CTG	2	6	8763	8768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625096
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241	NC_019950	CGG	2	6	14098	14103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_019950	ACG	2	6	14367	14372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625100
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248	NC_019950	CAG	2	6	14926	14931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625101
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254	NC_019950	CGG	2	6	15405	15410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_019950	CAA	2	6	15438	15443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625102
256	NC_019950	AAC	2	6	15589	15594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625102
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258	NC_019950	GAC	2	6	15735	15740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_019950	GGC	2	6	29351	29356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625114
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500	NC_019950	CGC	2	6	29522	29527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625114

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