MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 76644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019950	CGT	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625089
2	NC_019950	CAC	2	6	247	252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625089
3	NC_019950	GTC	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625089
4	NC_019950	GAC	2	6	299	304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
5	NC_019950	CAG	2	6	310	315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
6	NC_019950	TCG	2	6	387	392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625089
7	NC_019950	AGC	2	6	419	424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
8	NC_019950	GCC	2	6	480	485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
9	NC_019950	CCG	2	6	524	529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
10	NC_019950	CGA	2	6	544	549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
11	NC_019950	GCC	2	6	559	564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
12	NC_019950	ACG	2	6	609	614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
13	NC_019950	TGA	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625089
14	NC_019950	CGC	3	9	781	789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
15	NC_019950	GTT	2	6	901	906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625089
16	NC_019950	CGA	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
17	NC_019950	TTC	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625089
18	NC_019950	CAA	2	6	1108	1113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625089
19	NC_019950	AGC	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
20	NC_019950	ACC	2	6	1213	1218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625089
21	NC_019950	CGA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
22	NC_019950	CAG	2	6	1306	1311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625089
23	NC_019950	GCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625089
24	NC_019950	CCG	2	6	1479	1484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625089
25	NC_019950	CAC	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625089
26	NC_019950	CGG	2	6	1825	1830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625090
27	NC_019950	GGT	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625090
28	NC_019950	GGC	2	6	1982	1987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625090
29	NC_019950	GGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
30	NC_019950	GCG	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
31	NC_019950	CGC	2	6	2406	2411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625091
32	NC_019950	CTG	2	6	2460	2465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625091
33	NC_019950	ACC	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625091
34	NC_019950	CGG	2	6	2580	2585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
35	NC_019950	GCG	2	6	2662	2667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
36	NC_019950	TTG	2	6	2835	2840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625091
37	NC_019950	CAA	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625091
38	NC_019950	CGC	2	6	2885	2890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625091
39	NC_019950	CGA	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625091
40	NC_019950	CAA	2	6	2973	2978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625091
41	NC_019950	GGC	2	6	3020	3025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625091
42	NC_019950	AGC	3	9	3205	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625092
43	NC_019950	CCA	2	6	3219	3224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625092
44	NC_019950	CGG	2	6	3398	3403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625092
45	NC_019950	GTT	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625093
46	NC_019950	CCG	2	6	3997	4002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625093
47	NC_019950	TTG	2	6	4059	4064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625093
48	NC_019950	CGA	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625093
49	NC_019950	TTG	2	6	4218	4223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625093
50	NC_019950	ATT	2	6	4232	4237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433625093
51	NC_019950	CGC	2	6	4265	4270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625093
52	NC_019950	GAC	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625093
53	NC_019950	GGT	2	6	4331	4336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625093
54	NC_019950	CGT	2	6	4390	4395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625093
55	NC_019950	GCC	2	6	4446	4451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625093
56	NC_019950	CGG	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625093
57	NC_019950	GCA	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625093
58	NC_019950	CTT	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625093
59	NC_019950	CCA	2	6	4624	4629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625093
60	NC_019950	TGA	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625093
61	NC_019950	CGG	2	6	4960	4965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625093
62	NC_019950	GTG	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
63	NC_019950	ACG	2	6	5262	5267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
64	NC_019950	CGC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625094
65	NC_019950	CAA	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625094
66	NC_019950	TGT	2	6	5379	5384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625094
67	NC_019950	CGG	2	6	5429	5434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
68	NC_019950	GAT	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625094
69	NC_019950	TGG	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
70	NC_019950	GAA	2	6	5671	5676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625094
71	NC_019950	AGC	2	6	5785	5790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
72	NC_019950	CGG	2	6	5799	5804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
73	NC_019950	GGC	2	6	5809	5814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
74	NC_019950	GAC	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
75	NC_019950	GGC	2	6	5956	5961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
76	NC_019950	TGG	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
77	NC_019950	GTT	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625094
78	NC_019950	CGA	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625094
79	NC_019950	CGG	2	6	6057	6062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625094
80	NC_019950	CCG	2	6	6069	6074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625094
81	NC_019950	CCG	2	6	6114	6119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625094
82	NC_019950	GGT	2	6	6178	6183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625094
83	NC_019950	TGC	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625095
84	NC_019950	CGA	2	6	6367	6372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625095
85	NC_019950	GGT	2	6	6501	6506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625095
86	NC_019950	CCA	2	6	6510	6515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625095
87	NC_019950	ACG	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625095
88	NC_019950	CGC	2	6	6633	6638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625095
89	NC_019950	CGG	2	6	6683	6688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625095
90	NC_019950	AAG	2	6	7011	7016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625096
91	NC_019950	GGT	2	6	7139	7144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
92	NC_019950	CGA	2	6	7157	7162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
93	NC_019950	TGC	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625096
94	NC_019950	CGA	2	6	7229	7234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
95	NC_019950	GTG	2	6	7287	7292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
96	NC_019950	CGG	2	6	7310	7315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625096
97	NC_019950	TGG	2	6	7346	7351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
98	NC_019950	GGT	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
99	NC_019950	AAG	2	6	7488	7493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625096
100	NC_019950	CAA	2	6	7595	7600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625096
101	NC_019950	CGA	2	6	7622	7627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
102	NC_019950	GTC	2	6	7647	7652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625096
103	NC_019950	TGG	2	6	7765	7770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
104	NC_019950	AGC	2	6	7812	7817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
105	NC_019950	GGC	2	6	7932	7937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625096
106	NC_019950	GGT	2	6	7973	7978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625096
107	NC_019950	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625096
108	NC_019950	GCG	2	6	8276	8281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625096
109	NC_019950	ATC	2	6	8448	8453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625096
110	NC_019950	ATC	2	6	8508	8513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625096
111	NC_019950	ACG	2	6	8536	8541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
112	NC_019950	TGT	2	6	8623	8628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625096
113	NC_019950	GTT	3	9	8633	8641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625096
114	NC_019950	CCG	2	6	8691	8696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625096
115	NC_019950	CTG	2	6	8763	8768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625096
116	NC_019950	GAA	2	6	8789	8794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625096
117	NC_019950	CAA	2	6	8798	8803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625096
118	NC_019950	ACC	2	6	8865	8870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625096
119	NC_019950	GAC	2	6	8910	8915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625096
120	NC_019950	GCC	4	12	8916	8927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625096
121	NC_019950	GTT	2	6	8933	8938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625096
122	NC_019950	GCC	2	6	9075	9080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625097
123	NC_019950	GAC	2	6	9082	9087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625097
124	NC_019950	CAG	2	6	9118	9123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625097
125	NC_019950	TCG	2	6	9164	9169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625097
126	NC_019950	ACC	2	6	9308	9313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625097
127	NC_019950	TGG	2	6	9383	9388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625097
128	NC_019950	CGG	2	6	9428	9433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625097
129	NC_019950	CGA	2	6	9492	9497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625097
130	NC_019950	ACG	2	6	9524	9529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625097
131	NC_019950	CTG	2	6	9574	9579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625097
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133	NC_019950	CGC	2	6	9626	9631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625097
134	NC_019950	ACG	2	6	9680	9685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625097
135	NC_019950	CGA	2	6	9687	9692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625097
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250	NC_019950	TGA	3	9	17715	17723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625105
251	NC_019950	CCA	2	6	17781	17786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625105
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253	NC_019950	TCG	2	6	17930	17935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625105
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499	NC_019950	CGG	2	6	32543	32548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625117
500	NC_019950	CAA	2	6	32571	32576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625117

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