MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma cynos C142 complete genome

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019949	TTCAGA	2	12	23922	23933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019949	CTGGAG	2	12	47879	47890	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019949	AAGTGT	2	12	48185	48196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019949	AAGAAA	2	12	88097	88108	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019949	AAAAAT	2	12	97538	97549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019949	TTTTTC	2	12	98905	98916	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019949	GTTTTA	2	12	113917	113928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019949	GTTTTA	2	12	119624	119635	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019949	GTTTTA	2	12	121180	121191	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019949	ATTTTC	2	12	122854	122865	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019949	TTTATT	2	12	127712	127723	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019949	TGATTT	2	12	130107	130118	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019949	TAGTTT	2	12	140057	140068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019949	TAAATA	2	12	146961	146972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019949	TAAATA	2	12	147093	147104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019949	ATTAAG	2	12	152746	152757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019949	TTACAT	2	12	155196	155207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019949	GGAACA	2	12	191289	191300	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019949	CTGGAG	2	12	210190	210201	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019949	AAGTGT	2	12	210496	210507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019949	ATTTTT	2	12	249272	249283	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019949	GAATAA	2	12	250700	250711	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019949	CTTTAT	2	12	250929	250940	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019949	TATTTA	2	12	262132	262143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019949	TTAAAA	2	12	262170	262181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019949	ATTAAT	2	12	264836	264847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019949	ATTTTT	2	12	311954	311965	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019949	AAAAAT	2	12	313867	313878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019949	TAAAAA	2	12	313902	313913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019949	TTGAAA	2	12	336922	336933	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019949	GAATTA	2	12	337091	337102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019949	TTTTTA	2	12	337105	337116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019949	ATTTTT	2	12	347432	347443	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019949	TTTAAA	2	12	367080	367091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019949	CTTTTT	2	12	402560	402571	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019949	AGAAAA	2	12	418357	418368	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019949	ATTTAA	2	12	422729	422740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019949	TAATAT	2	12	426359	426370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019949	AAAAAT	2	12	444092	444103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019949	TGAAAT	2	12	449293	449304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019949	CTTTTT	2	12	461741	461752	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019949	ATTTTT	2	12	471042	471053	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019949	CTTTTT	2	12	488681	488692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019949	AAATAA	2	12	532948	532959	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019949	TAAAAA	2	12	545319	545330	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019949	ATATTT	2	12	549477	549488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019949	ATTAAT	2	12	551145	551156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019949	ATAAAA	2	12	556790	556801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019949	TATTTA	2	12	599924	599935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019949	TTAAAA	2	12	604241	604252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019949	ATTAAT	2	12	620595	620606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019949	TATAAC	2	12	624349	624360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019949	ATTTTT	2	12	624513	624524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019949	TAAACT	2	12	633081	633092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019949	AAAATA	2	12	642115	642126	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019949	TAAAAA	2	12	650222	650233	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019949	ATTTTT	2	12	704919	704930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019949	TCTTTT	2	12	710099	710110	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019949	TAAAAA	2	12	719915	719926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019949	TAAATA	2	12	741403	741414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019949	TAAAAA	2	12	746343	746354	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019949	TAAATA	2	12	751177	751188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019949	TTTTAT	2	12	755730	755741	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019949	TAAATA	2	12	760989	761000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019949	TTTTAT	2	12	791740	791751	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019949	TTGCTT	2	12	807261	807272	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019949	TTTTTA	2	12	824046	824057	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019949	TGTATT	2	12	831386	831397	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019949	ATTTTT	2	12	845209	845220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019949	ATTTAT	2	12	845350	845361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019949	TTAAAT	2	12	852658	852669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019949	TAAACA	2	12	882821	882832	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019949	ATAAAA	2	12	922494	922505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019949	CTTTTT	3	18	968161	968178	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019949	TTTATA	2	12	972263	972274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.