MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanoregula formicicum SMSP

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019943	ACAATA	2	12	45322	45333	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019943	CCTGCC	2	12	87946	87957	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019943	TTTCAC	2	12	119948	119959	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019943	GGGGAG	2	12	122803	122814	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019943	GGGCAG	2	12	273478	273489	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019943	GAACGG	2	12	279225	279236	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019943	GATTTA	2	12	447735	447746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019943	GGGCAG	2	12	480046	480057	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_019943	GAAAAA	2	12	480255	480266	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019943	TTGGCA	2	12	544719	544730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019943	TATTCA	2	12	551912	551923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019943	GGTTTA	2	12	570915	570926	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019943	TCAGGG	2	12	580107	580118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019943	GGATCA	2	12	612347	612358	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019943	ATCCTT	2	12	657143	657154	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019943	GGGAGA	2	12	674430	674441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019943	CCCGTC	2	12	701208	701219	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_019943	ACGGAA	2	12	702506	702517	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019943	CGTTCT	2	12	724881	724892	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019943	ATTCTC	2	12	727589	727600	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019943	CCGGTC	2	12	728190	728201	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019943	TCGTGA	2	12	745153	745164	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019943	TTTCAC	2	12	762170	762181	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019943	ATTGTG	2	12	793031	793042	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019943	TTTTAA	2	12	807044	807055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019943	CGTTAC	2	12	811746	811757	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019943	AATCAT	2	12	814907	814918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019943	AATTTT	2	12	842381	842392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019943	TCATAT	2	12	867272	867283	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019943	CCCCCT	2	12	903474	903485	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
31	NC_019943	TGGGGG	2	12	903518	903529	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019943	CCGGGA	2	12	907560	907571	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019943	CTGCCC	2	12	984582	984593	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019943	CCTGCC	2	12	984865	984876	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_019943	CGGCCT	2	12	1025105	1025116	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019943	GTCCTC	2	12	1048147	1048158	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019943	GCCCCC	2	12	1118895	1118906	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
38	NC_019943	TGGTGA	2	12	1128822	1128833	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019943	TATAGA	2	12	1140288	1140299	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019943	GGGGAG	2	12	1147425	1147436	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019943	TAAAAA	2	12	1150770	1150781	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019943	GCCCCC	2	12	1154820	1154831	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
43	NC_019943	TCACTA	2	12	1158956	1158967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019943	TAATTC	2	12	1179556	1179567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019943	GAAAAA	2	12	1197444	1197455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019943	TTTTTC	2	12	1227157	1227168	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019943	TCAAAT	2	12	1234617	1234628	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019943	CCCCTT	2	12	1244027	1244038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_019943	CAGTGC	2	12	1244050	1244061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019943	ATTAAA	2	12	1355371	1355382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019943	ATGGGA	2	12	1361351	1361362	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019943	GGTCAT	2	12	1367357	1367368	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019943	CTATAT	2	12	1402638	1402649	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019943	CCCGTA	2	12	1412827	1412838	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019943	TGAAGA	2	12	1486488	1486499	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019943	GCCCTC	2	12	1518245	1518256	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_019943	AAATAT	2	12	1532779	1532790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019943	CCTGAG	2	12	1548445	1548456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019943	GAACGG	2	12	1554208	1554219	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019943	ATTTTC	2	12	1589477	1589488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019943	TTTTGA	2	12	1599034	1599045	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019943	GCGATC	2	12	1599275	1599286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019943	TTCCCG	2	12	1706254	1706265	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019943	ACAAAA	2	12	1741172	1741183	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019943	AGTAAA	2	12	1765581	1765592	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019943	CGGGAG	2	12	1765953	1765964	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019943	GGGACA	2	12	1798889	1798900	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019943	AAATAG	2	12	1823078	1823089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019943	AAACGA	2	12	1823134	1823145	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019943	GTCCCC	2	12	1872457	1872468	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019943	TCAGGA	2	12	1902838	1902849	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019943	AGACAG	2	12	1903561	1903572	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019943	GAGGGG	2	12	1942298	1942309	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019943	TTCCTG	2	12	1961097	1961108	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019943	TACTCA	2	12	1961331	1961342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019943	ACTCAA	2	12	1978195	1978206	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019943	CAACAG	2	12	1991126	1991137	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019943	CGATTG	2	12	2007487	2007498	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019943	CTCCCC	2	12	2070510	2070521	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_019943	TTTACC	2	12	2112852	2112863	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019943	ACCGCA	2	12	2189147	2189158	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019943	TCCTGA	2	12	2189557	2189568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019943	TGGGGA	2	12	2255103	2255114	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019943	CAGGAC	2	12	2327154	2327165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019943	TTTCAT	2	12	2328924	2328935	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019943	TTGCCG	2	12	2373388	2373399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019943	CGGAAC	2	12	2374282	2374293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019943	GGGAAC	2	12	2407174	2407185	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019943	TATAAT	2	12	2436533	2436544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019943	ATAAAC	2	12	2439331	2439342	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019943	CGATCA	2	12	2440164	2440175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019943	GGATAA	2	12	2455274	2455285	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019943	GGGGGT	2	12	2485242	2485253	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019943	GACAAC	2	12	2490780	2490791	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019943	TGCCGC	2	12	2519742	2519753	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019943	TGAGAA	2	12	2658117	2658128	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019943	AAGATC	2	12	2670964	2670975	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019943	CGGTGC	2	12	2678457	2678468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019943	TGCCCG	2	12	2696086	2696097	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019943	GCCCCC	2	12	2709545	2709556	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
101	NC_019943	GGTGCA	2	12	2772557	2772568	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019943	TGGATC	2	12	2814663	2814674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.