MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanoregula formicicum SMSP

Total Repeats: 6557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019943	TCCC	2	8	10	17	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_019943	AAGC	2	8	574	581	50 %	0 %	25 %	25 %	432329453
3	NC_019943	GGAT	2	8	870	877	25 %	25 %	50 %	0 %	432329453
4	NC_019943	GCAC	2	8	1989	1996	25 %	0 %	25 %	50 %	432329454
5	NC_019943	GCTC	2	8	2245	2252	0 %	25 %	25 %	50 %	432329455
6	NC_019943	CGGG	2	8	2390	2397	0 %	0 %	75 %	25 %	432329455
7	NC_019943	TCGA	2	8	2596	2603	25 %	25 %	25 %	25 %	432329456
8	NC_019943	ATCC	2	8	2706	2713	25 %	25 %	0 %	50 %	432329456
9	NC_019943	TACT	2	8	3438	3445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019943	CGCC	2	8	3878	3885	0 %	0 %	25 %	75 %	432329459
11	NC_019943	GAAC	2	8	4120	4127	50 %	0 %	25 %	25 %	432329460
12	NC_019943	AGGC	2	8	4146	4153	25 %	0 %	50 %	25 %	432329460
13	NC_019943	TCGC	2	8	4169	4176	0 %	25 %	25 %	50 %	432329460
14	NC_019943	GGCC	2	8	4294	4301	0 %	0 %	50 %	50 %	432329460
15	NC_019943	CACG	2	8	4336	4343	25 %	0 %	25 %	50 %	432329460
16	NC_019943	CCGG	2	8	4840	4847	0 %	0 %	50 %	50 %	432329460
17	NC_019943	GGGC	2	8	5560	5567	0 %	0 %	75 %	25 %	432329461
18	NC_019943	GGAG	2	8	6570	6577	25 %	0 %	75 %	0 %	432329463
19	NC_019943	CCGG	2	8	6689	6696	0 %	0 %	50 %	50 %	432329463
20	NC_019943	GTGG	2	8	6852	6859	0 %	25 %	75 %	0 %	432329463
21	NC_019943	GCCG	2	8	6915	6922	0 %	0 %	50 %	50 %	432329463
22	NC_019943	CGGC	2	8	8314	8321	0 %	0 %	50 %	50 %	432329465
23	NC_019943	CAAG	2	8	9469	9476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019943	TTTC	2	8	9535	9542	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019943	GCCC	2	8	10478	10485	0 %	0 %	25 %	75 %	432329467
26	NC_019943	TGTT	2	8	10519	10526	0 %	75 %	25 %	0 %	432329467
27	NC_019943	CCCG	2	8	10719	10726	0 %	0 %	25 %	75 %	432329467
28	NC_019943	ATTT	2	8	10954	10961	25 %	75 %	0 %	0 %	432329467
29	NC_019943	CGAT	2	8	11326	11333	25 %	25 %	25 %	25 %	432329468
30	NC_019943	TTCA	2	8	11430	11437	25 %	50 %	0 %	25 %	432329468
31	NC_019943	ATCC	2	8	11660	11667	25 %	25 %	0 %	50 %	432329468
32	NC_019943	AAGC	2	8	11927	11934	50 %	0 %	25 %	25 %	432329468
33	NC_019943	AGGG	2	8	12156	12163	25 %	0 %	75 %	0 %	432329468
34	NC_019943	GCCT	2	8	12547	12554	0 %	25 %	25 %	50 %	432329469
35	NC_019943	TCTT	2	8	12740	12747	0 %	75 %	0 %	25 %	432329469
36	NC_019943	CTTC	2	8	13070	13077	0 %	50 %	0 %	50 %	432329469
37	NC_019943	AGGG	2	8	13183	13190	25 %	0 %	75 %	0 %	432329469
38	NC_019943	CAGG	2	8	13264	13271	25 %	0 %	50 %	25 %	432329469
39	NC_019943	GGCA	2	8	13553	13560	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019943	GGCC	2	8	13853	13860	0 %	0 %	50 %	50 %	432329470
41	NC_019943	CGGC	2	8	13971	13978	0 %	0 %	50 %	50 %	432329470
42	NC_019943	CTTT	2	8	14492	14499	0 %	75 %	0 %	25 %	432329470
43	NC_019943	ATCC	2	8	14709	14716	25 %	25 %	0 %	50 %	432329470
44	NC_019943	TGCC	2	8	15037	15044	0 %	25 %	25 %	50 %	432329471
45	NC_019943	GGAT	2	8	15045	15052	25 %	25 %	50 %	0 %	432329471
46	NC_019943	CCCA	2	8	15197	15204	25 %	0 %	0 %	75 %	432329471
47	NC_019943	TCTT	2	8	15477	15484	0 %	75 %	0 %	25 %	432329472
48	NC_019943	CGGT	2	8	15816	15823	0 %	25 %	50 %	25 %	432329472
49	NC_019943	CGTT	2	8	16892	16899	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019943	CGGC	2	8	17104	17111	0 %	0 %	50 %	50 %	432329474
51	NC_019943	TACG	2	8	17652	17659	25 %	25 %	25 %	25 %	432329475
52	NC_019943	ATAC	2	8	17664	17671	50 %	25 %	0 %	25 %	432329475
53	NC_019943	ACCG	2	8	17898	17905	25 %	0 %	25 %	50 %	432329475
54	NC_019943	TTCA	2	8	18165	18172	25 %	50 %	0 %	25 %	432329475
55	NC_019943	GCCG	2	8	18843	18850	0 %	0 %	50 %	50 %	432329476
56	NC_019943	CGGC	2	8	19603	19610	0 %	0 %	50 %	50 %	432329476
57	NC_019943	CGGC	2	8	19923	19930	0 %	0 %	50 %	50 %	432329477
58	NC_019943	GAAG	2	8	20136	20143	50 %	0 %	50 %	0 %	432329477
59	NC_019943	GGGC	2	8	20361	20368	0 %	0 %	75 %	25 %	432329478
60	NC_019943	CCCG	2	8	20473	20480	0 %	0 %	25 %	75 %	432329478
61	NC_019943	GACC	2	8	20718	20725	25 %	0 %	25 %	50 %	432329478
62	NC_019943	CCCT	2	8	20753	20760	0 %	25 %	0 %	75 %	432329478
63	NC_019943	CGGT	2	8	21565	21572	0 %	25 %	50 %	25 %	432329479
64	NC_019943	ACAG	2	8	21753	21760	50 %	0 %	25 %	25 %	432329479
65	NC_019943	ACGA	2	8	22095	22102	50 %	0 %	25 %	25 %	432329479
66	NC_019943	CAGA	2	8	22302	22309	50 %	0 %	25 %	25 %	432329479
67	NC_019943	GACA	2	8	22965	22972	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019943	AAGA	2	8	23759	23766	75 %	0 %	25 %	0 %	432329480
69	NC_019943	TGCC	2	8	23906	23913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019943	CCGT	2	8	24478	24485	0 %	25 %	25 %	50 %	432329481
71	NC_019943	ACGC	2	8	25120	25127	25 %	0 %	25 %	50 %	432329481
72	NC_019943	GCCC	2	8	25146	25153	0 %	0 %	25 %	75 %	432329481
73	NC_019943	CATT	2	8	25317	25324	25 %	50 %	0 %	25 %	432329481
74	NC_019943	CCGG	2	8	25730	25737	0 %	0 %	50 %	50 %	432329482
75	NC_019943	CTGT	2	8	26847	26854	0 %	50 %	25 %	25 %	432329483
76	NC_019943	TCGT	2	8	27872	27879	0 %	50 %	25 %	25 %	432329483
77	NC_019943	TCGG	2	8	28283	28290	0 %	25 %	50 %	25 %	432329483
78	NC_019943	CGAG	2	8	28350	28357	25 %	0 %	50 %	25 %	432329483
79	NC_019943	TTCC	2	8	28791	28798	0 %	50 %	0 %	50 %	432329483
80	NC_019943	GATC	2	8	29178	29185	25 %	25 %	25 %	25 %	432329483
81	NC_019943	ATCC	2	8	29459	29466	25 %	25 %	0 %	50 %	432329483
82	NC_019943	TTGT	2	8	29550	29557	0 %	75 %	25 %	0 %	432329483
83	NC_019943	AGGG	2	8	29813	29820	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019943	TCAC	2	8	30060	30067	25 %	25 %	0 %	50 %	432329484
85	NC_019943	TACT	2	8	30491	30498	25 %	50 %	0 %	25 %	432329484
86	NC_019943	TGAC	2	8	30575	30582	25 %	25 %	25 %	25 %	432329484
87	NC_019943	AGGA	2	8	30989	30996	50 %	0 %	50 %	0 %	432329485
88	NC_019943	ATGG	2	8	31417	31424	25 %	25 %	50 %	0 %	432329485
89	NC_019943	CCGG	2	8	32443	32450	0 %	0 %	50 %	50 %	432329487
90	NC_019943	CGGG	2	8	32542	32549	0 %	0 %	75 %	25 %	432329488
91	NC_019943	TGTT	2	8	32611	32618	0 %	75 %	25 %	0 %	432329488
92	NC_019943	GGGA	2	8	32793	32800	25 %	0 %	75 %	0 %	432329488
93	NC_019943	GACC	2	8	33361	33368	25 %	0 %	25 %	50 %	432329489
94	NC_019943	CTTT	2	8	33986	33993	0 %	75 %	0 %	25 %	432329490
95	NC_019943	CCTG	2	8	34614	34621	0 %	25 %	25 %	50 %	432329491
96	NC_019943	TGGA	2	8	35334	35341	25 %	25 %	50 %	0 %	432329492
97	NC_019943	TTGG	2	8	36864	36871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019943	CTGC	2	8	37110	37117	0 %	25 %	25 %	50 %	432329493
99	NC_019943	CTGC	2	8	37260	37267	0 %	25 %	25 %	50 %	432329493
100	NC_019943	GAGT	2	8	37398	37405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019943	ATCC	2	8	37514	37521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019943	ATCC	2	8	37613	37620	25 %	25 %	0 %	50 %	432329494
103	NC_019943	AATG	2	8	38478	38485	50 %	25 %	25 %	0 %	432329495
104	NC_019943	CTTC	2	8	38525	38532	0 %	50 %	0 %	50 %	432329495
105	NC_019943	CGGC	2	8	38866	38873	0 %	0 %	50 %	50 %	432329495
106	NC_019943	GCAG	2	8	38998	39005	25 %	0 %	50 %	25 %	432329495
107	NC_019943	CCAT	2	8	39737	39744	25 %	25 %	0 %	50 %	432329496
108	NC_019943	ATGG	2	8	39999	40006	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019943	CTGG	2	8	40067	40074	0 %	25 %	50 %	25 %	432329497
110	NC_019943	GCCG	2	8	40732	40739	0 %	0 %	50 %	50 %	432329497
111	NC_019943	TGCA	2	8	40752	40759	25 %	25 %	25 %	25 %	432329497
112	NC_019943	TGCA	2	8	40974	40981	25 %	25 %	25 %	25 %	432329497
113	NC_019943	CGAC	2	8	40999	41006	25 %	0 %	25 %	50 %	432329497
114	NC_019943	GTCA	2	8	41249	41256	25 %	25 %	25 %	25 %	432329497
115	NC_019943	GCAG	2	8	41519	41526	25 %	0 %	50 %	25 %	432329498
116	NC_019943	TGTT	2	8	41629	41636	0 %	75 %	25 %	0 %	432329498
117	NC_019943	GAAG	2	8	42921	42928	50 %	0 %	50 %	0 %	432329501
118	NC_019943	GAAA	2	8	43411	43418	75 %	0 %	25 %	0 %	432329502
119	NC_019943	AAAC	2	8	43682	43689	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019943	AAAC	2	8	43697	43704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019943	ATCT	2	8	44436	44443	25 %	50 %	0 %	25 %	432329503
122	NC_019943	AATT	2	8	44898	44905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019943	ATTT	2	8	44923	44930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019943	TAAA	2	8	44950	44957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019943	ACCA	2	8	45001	45008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019943	CTAT	2	8	45009	45016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019943	AGAA	2	8	45642	45649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019943	CAGA	2	8	45890	45897	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019943	CCCT	2	8	46194	46201	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_019943	CAAA	2	8	46548	46555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019943	GATC	2	8	46732	46739	25 %	25 %	25 %	25 %	432329505
132	NC_019943	CCGG	2	8	46769	46776	0 %	0 %	50 %	50 %	432329505
133	NC_019943	TGCC	2	8	47267	47274	0 %	25 %	25 %	50 %	432329506
134	NC_019943	AGGC	2	8	48136	48143	25 %	0 %	50 %	25 %	432329507
135	NC_019943	GTCG	2	8	48276	48283	0 %	25 %	50 %	25 %	432329507
136	NC_019943	ACGA	2	8	48295	48302	50 %	0 %	25 %	25 %	432329507
137	NC_019943	TCGC	2	8	48698	48705	0 %	25 %	25 %	50 %	432329507
138	NC_019943	CTCG	2	8	48787	48794	0 %	25 %	25 %	50 %	432329508
139	NC_019943	TGCC	2	8	48879	48886	0 %	25 %	25 %	50 %	432329508
140	NC_019943	CCTT	2	8	48941	48948	0 %	50 %	0 %	50 %	432329508
141	NC_019943	CTCG	2	8	49018	49025	0 %	25 %	25 %	50 %	432329508
142	NC_019943	TCGA	2	8	49271	49278	25 %	25 %	25 %	25 %	432329508
143	NC_019943	GGGA	2	8	49586	49593	25 %	0 %	75 %	0 %	432329508
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