MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019942	ATATTT	2	12	27071	27082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019942	GAAAGG	2	12	44901	44912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019942	TATTCC	2	12	145761	145772	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019942	ATGCCC	2	12	174108	174119	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019942	ATGCCC	2	12	191630	191641	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019942	AAATAT	2	12	335748	335759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019942	CCCCGG	2	12	348995	349006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019942	TTTAAA	2	12	430691	430702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019942	AAATAA	2	12	453217	453228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019942	AAAATT	2	12	453299	453310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019942	TTGGTT	2	12	611649	611660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019942	AAAAAT	2	12	663646	663657	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019942	TTAAAA	2	12	693463	693474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019942	CCCAGT	2	12	693724	693735	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019942	TAAAGT	2	12	693749	693760	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019942	TTAGAG	2	12	700196	700207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019942	ATATTT	2	12	880910	880921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019942	TATTTT	2	12	901291	901302	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019942	CCTTGC	2	12	913399	913410	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019942	CCCATT	2	12	983841	983852	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019942	ATATTT	2	12	1049818	1049829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019942	AAATTT	2	12	1052137	1052148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019942	AATAGA	2	12	1086215	1086226	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019942	AAATAA	2	12	1102903	1102914	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019942	AAAATT	2	12	1102985	1102996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019942	TAATTT	2	12	1104730	1104741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019942	TCCCGG	2	12	1201414	1201425	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019942	TAAAAA	2	12	1231305	1231316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019942	TAAAAA	2	12	1237978	1237989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019942	GGGGTA	2	12	1246931	1246942	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019942	ATAAAA	2	12	1258779	1258790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019942	TTAAAT	2	12	1294414	1294425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019942	AAATAG	2	12	1377631	1377642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.