MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019942	AATGC	2	10	2188	2197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019942	TGGCT	2	10	15048	15057	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019942	GACCC	2	10	15317	15326	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_019942	ATTTT	2	10	50513	50522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019942	AATGC	2	10	162053	162062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019942	AATGC	2	10	179574	179583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019942	TTCCT	2	10	206538	206547	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019942	TTTTA	2	10	230586	230595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019942	TTTTA	2	10	233458	233467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019942	ATTCT	2	10	260217	260226	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019942	CCTTG	2	10	267851	267860	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_019942	TAGCT	2	10	267990	267999	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019942	TCGCC	2	10	284258	284267	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_019942	CACCT	2	10	310925	310934	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_019942	ACATA	2	10	311353	311362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019942	GAATA	2	10	311486	311495	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019942	AAAGG	2	10	348161	348170	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019942	AAAAT	2	10	352665	352674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019942	AAAAT	2	10	380993	381002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019942	ACTTT	2	10	394729	394738	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019942	GGGAT	2	10	394750	394759	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019942	TAATT	2	10	434241	434250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019942	ATTGT	2	10	439926	439935	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019942	ATGCC	2	10	448183	448192	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_019942	TTATT	2	10	450381	450390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019942	ATTAA	2	10	509089	509098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019942	CTTTG	2	10	519015	519024	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019942	TTCCC	2	10	569941	569950	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_019942	CAAGA	2	10	599184	599193	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019942	GAAAA	2	10	604094	604103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019942	ATTCG	2	10	604154	604163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019942	TAACC	2	10	626805	626814	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019942	AGTAT	2	10	690030	690039	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019942	TCGAA	2	10	704981	704990	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019942	TCGGA	2	10	704993	705002	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019942	TTTCT	2	10	709330	709339	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019942	CTATT	2	10	710558	710567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019942	TAAAT	2	10	726399	726408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019942	AATTA	2	10	728721	728730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019942	CGAAG	2	10	728928	728937	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019942	GGTGA	2	10	785401	785410	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019942	CATCC	2	10	787673	787682	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_019942	GTCCT	2	10	788781	788790	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_019942	TTTTG	2	10	814677	814686	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019942	ACGGG	2	10	818563	818572	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019942	TAATT	2	10	818637	818646	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019942	GATTT	2	10	879765	879774	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019942	AAAAT	2	10	923624	923633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019942	ACACC	2	10	1010368	1010377	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_019942	GGCTA	2	10	1011239	1011248	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019942	AAAAT	2	10	1013587	1013596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019942	TTTTA	2	10	1034463	1034472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019942	GTAGT	2	10	1076682	1076691	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019942	ATTTT	2	10	1081813	1081822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019942	AAAAT	2	10	1086689	1086698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019942	TATAT	2	10	1103704	1103713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019942	ATTTT	2	10	1176309	1176318	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019942	TAGGG	2	10	1201363	1201372	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019942	TAAAA	2	10	1219680	1219689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019942	TCCAG	2	10	1256140	1256149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_019942	CATCC	2	10	1263230	1263239	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_019942	TAATA	2	10	1299538	1299547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019942	ATTTT	2	10	1363664	1363673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019942	TTAAT	2	10	1366071	1366080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019942	AATCA	2	10	1373748	1373757	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_019942	GATGC	2	10	1377554	1377563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019942	ATTGA	2	10	1382863	1382872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019942	TGCGA	2	10	1394822	1394831	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019942	GGGGT	2	10	1407687	1407696	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019942	CCTCA	2	10	1415602	1415611	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.