MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 plasmid pPSEST02

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019938	TTGG	2	8	57	64	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019938	GGCA	2	8	70	77	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019938	CCAG	2	8	448	455	25 %	0 %	25 %	50 %	431925194
4	NC_019938	CCAG	2	8	488	495	25 %	0 %	25 %	50 %	431925194
5	NC_019938	ATCG	3	12	916	927	25 %	25 %	25 %	25 %	431925195
6	NC_019938	GCCG	2	8	940	947	0 %	0 %	50 %	50 %	431925195
7	NC_019938	CCGG	2	8	1059	1066	0 %	0 %	50 %	50 %	431925195
8	NC_019938	GCAA	2	8	2219	2226	50 %	0 %	25 %	25 %	431925197
9	NC_019938	CTGC	2	8	2498	2505	0 %	25 %	25 %	50 %	431925198
10	NC_019938	GCTG	2	8	2584	2591	0 %	25 %	50 %	25 %	431925198
11	NC_019938	GAGC	2	8	2697	2704	25 %	0 %	50 %	25 %	431925198
12	NC_019938	TCGC	2	8	3192	3199	0 %	25 %	25 %	50 %	431925198
13	NC_019938	GACG	2	8	3570	3577	25 %	0 %	50 %	25 %	431925198
14	NC_019938	TCCG	2	8	3581	3588	0 %	25 %	25 %	50 %	431925198
15	NC_019938	CCGC	2	8	5196	5203	0 %	0 %	25 %	75 %	431925201
16	NC_019938	GCAG	2	8	5523	5530	25 %	0 %	50 %	25 %	431925202
17	NC_019938	GACA	2	8	6189	6196	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019938	AGCC	2	8	7265	7272	25 %	0 %	25 %	50 %	431925205
19	NC_019938	CCAT	2	8	7839	7846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019938	CCCT	2	8	7901	7908	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_019938	TGAG	2	8	8315	8322	25 %	25 %	50 %	0 %	431925206
22	NC_019938	AGGC	2	8	8465	8472	25 %	0 %	50 %	25 %	431925206
23	NC_019938	GCCG	2	8	8734	8741	0 %	0 %	50 %	50 %	431925206
24	NC_019938	ACGC	2	8	8835	8842	25 %	0 %	25 %	50 %	431925207
25	NC_019938	GAAG	2	8	9166	9173	50 %	0 %	50 %	0 %	431925207
26	NC_019938	TCTG	2	8	9476	9483	0 %	50 %	25 %	25 %	431925208
27	NC_019938	GAGC	2	8	9835	9842	25 %	0 %	50 %	25 %	431925208

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.