MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 chromosome

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019936	CAGCGG	2	12	452	463	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019936	TGCTCA	2	12	19990	20001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019936	CTCGCC	2	12	40928	40939	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_019936	TACCCA	2	12	49179	49190	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019936	TGCCCA	2	12	49191	49202	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019936	TGCCCG	2	12	49203	49214	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019936	CACCGA	2	12	89436	89447	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019936	TTCCCG	2	12	89517	89528	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019936	CGTTTC	2	12	180698	180709	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019936	GCCCGC	2	12	207325	207336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_019936	TATTGT	2	12	400785	400796	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019936	ATTCGC	2	12	590963	590974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019936	AAGCCT	2	12	651329	651340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019936	TATCTG	2	12	664042	664053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019936	TGGCGA	2	12	674014	674025	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019936	GCTGCG	2	12	817776	817787	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019936	GCTGCC	2	12	818292	818303	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019936	AATGAT	2	12	916402	916413	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019936	AGGGCG	2	12	931356	931367	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019936	AGAAGT	2	12	998349	998360	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019936	TCTTGT	2	12	1082412	1082423	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019936	TGAAAT	2	12	1132129	1132140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019936	CCTACG	2	12	1148578	1148589	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019936	AGAACA	2	12	1163658	1163669	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019936	TGCCCT	2	12	1186530	1186541	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019936	CAAGCC	2	12	1187496	1187507	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019936	GAACGC	2	12	1232396	1232407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019936	GACCCG	2	12	1245728	1245739	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019936	ATTTGC	2	12	1259583	1259594	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019936	CGGAGG	2	12	1515719	1515730	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019936	CCGCAC	2	12	1519151	1519162	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_019936	TCTTGT	2	12	1540628	1540639	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019936	CACTTC	2	12	1684473	1684484	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019936	GGTTGA	2	12	1688424	1688435	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019936	GGCGCG	2	12	1950165	1950176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019936	AAACCG	2	12	1961416	1961427	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019936	TCGGCT	2	12	1981087	1981098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019936	CCGCTG	2	12	2024485	2024496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019936	AGGCCG	2	12	2076815	2076826	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019936	CAAGCA	2	12	2084256	2084267	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019936	AAGCGT	2	12	2084305	2084316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019936	CGCGAA	2	12	2110424	2110435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019936	ATTTCG	2	12	2119693	2119704	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019936	TGAAAT	2	12	2125846	2125857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019936	TCCAAG	2	12	2127167	2127178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019936	AGCGGG	2	12	2134851	2134862	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019936	CGTTGG	2	12	2240406	2240417	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019936	CGGCTT	2	12	2349850	2349861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019936	CGGCTT	2	12	2356282	2356293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019936	GCTGGG	2	12	2372137	2372148	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019936	CCATAT	2	12	2378964	2378975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019936	GCAGAG	2	12	2426879	2426890	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019936	AGATGA	2	12	2447085	2447096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019936	GGCCGC	2	12	2477003	2477014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019936	GCACAA	2	12	2633942	2633953	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019936	AGAACA	2	12	2644932	2644943	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019936	CGCTGG	2	12	2692714	2692725	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019936	CATCTG	2	12	2835438	2835449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019936	GCCGGC	2	12	2841303	2841314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019936	CGTGCC	2	12	2844101	2844112	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019936	CAGCTG	2	12	2845105	2845116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019936	ATAACT	2	12	2850101	2850112	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019936	CTTGGA	2	12	2872843	2872854	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019936	ATTTCA	2	12	2874165	2874176	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019936	CATCGG	2	12	2895080	2895091	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019936	CAACGT	2	12	2896751	2896762	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019936	AAAACA	2	12	2968529	2968540	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019936	CCAGCC	2	12	2989489	2989500	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_019936	TCGCCT	2	12	3034201	3034212	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019936	CAAATA	2	12	3137827	3137838	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019936	CGAAAA	2	12	3176149	3176160	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019936	GCTCGG	2	12	3213914	3213925	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019936	CGAGCA	2	12	3328194	3328205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019936	GGCGCA	2	12	3373992	3374003	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019936	CTCACA	2	12	3414739	3414750	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019936	AACGGC	2	12	3467521	3467532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019936	CTGCGC	2	12	3625235	3625246	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019936	TCGCCC	2	12	3711120	3711131	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019936	ATTTCA	2	12	3791753	3791764	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019936	CGGCAA	2	12	3921806	3921817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019936	AGGCAG	2	12	3962961	3962972	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019936	TAAAAA	2	12	3966713	3966724	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019936	GTCGAA	2	12	3986432	3986443	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019936	GGGGTG	2	12	4044251	4044262	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019936	GAAGAC	2	12	4084339	4084350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019936	CACATA	2	12	4085742	4085753	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019936	TCCTTT	2	12	4086394	4086405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019936	TCCTGA	2	12	4145882	4145893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019936	ACAAGC	2	12	4156142	4156153	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019936	CAAGGC	2	12	4208668	4208679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019936	TCTCCC	2	12	4295669	4295680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_019936	GCCGAA	2	12	4296745	4296756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019936	AGTTGA	2	12	4342524	4342535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019936	GCGTGC	2	12	4346920	4346931	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019936	CGCCCG	2	12	4371761	4371772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_019936	GGGGGA	2	12	4397916	4397927	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019936	CGAACC	2	12	4414620	4414631	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019936	AGGACA	2	12	4433758	4433769	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019936	CCTTTT	2	12	4549112	4549123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019936	AGAAAA	2	12	4553525	4553536	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.