MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 chromosome

Total Repeats: 76593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019936	CGA	2	6	43	48	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925210
2	NC_019936	GAC	2	6	62	67	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925210
3	NC_019936	TGG	2	6	74	79	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925210
4	NC_019936	CAG	2	6	544	549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019936	GTT	2	6	586	591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019936	GCC	2	6	623	628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_019936	GCA	2	6	678	683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925211
8	NC_019936	GAG	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925211
9	NC_019936	CTG	2	6	835	840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925211
10	NC_019936	TCG	2	6	910	915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925211
11	NC_019936	CTG	3	9	929	937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925211
12	NC_019936	GCA	2	6	985	990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925211
13	NC_019936	AGC	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925211
14	NC_019936	TCG	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925211
15	NC_019936	GGC	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925211
16	NC_019936	CTG	2	6	1270	1275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925211
17	NC_019936	AAG	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925211
18	NC_019936	GGT	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925211
19	NC_019936	GCT	2	6	1398	1403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925211
20	NC_019936	CGA	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925211
21	NC_019936	TTC	2	6	1420	1425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925211
22	NC_019936	AAG	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925211
23	NC_019936	TTC	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925211
24	NC_019936	CAG	2	6	1489	1494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925211
25	NC_019936	GCC	2	6	1590	1595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925211
26	NC_019936	TGA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925211
27	NC_019936	TTC	2	6	1672	1677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925211
28	NC_019936	TAC	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925211
29	NC_019936	CTG	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925211
30	NC_019936	CAC	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925211
31	NC_019936	TGC	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925211
32	NC_019936	CGT	2	6	2199	2204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925212
33	NC_019936	TTG	2	6	2246	2251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431925212
34	NC_019936	CAG	2	6	2260	2265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925212
35	NC_019936	TGG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925212
36	NC_019936	GCC	2	6	2326	2331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925212
37	NC_019936	GAT	2	6	2419	2424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925212
38	NC_019936	AGA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925212
39	NC_019936	GAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925212
40	NC_019936	GCA	2	6	2564	2569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925212
41	NC_019936	GCA	2	6	2583	2588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925212
42	NC_019936	TGC	2	6	2639	2644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925212
43	NC_019936	TCA	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925212
44	NC_019936	GCA	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925212
45	NC_019936	TGG	2	6	2852	2857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925212
46	NC_019936	TGC	2	6	2930	2935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925212
47	NC_019936	CAA	2	6	3027	3032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925212
48	NC_019936	GAA	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925212
49	NC_019936	GAA	2	6	3055	3060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925212
50	NC_019936	CTG	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925212
51	NC_019936	CAG	2	6	3177	3182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925212
52	NC_019936	ACG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925212
53	NC_019936	CGT	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925212
54	NC_019936	CTG	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019936	GTC	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925213
56	NC_019936	GCA	2	6	3417	3422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925213
57	NC_019936	GCG	2	6	3531	3536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925213
58	NC_019936	GCC	2	6	3575	3580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925213
59	NC_019936	CTG	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925213
60	NC_019936	CGA	2	6	3820	3825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925213
61	NC_019936	CGG	2	6	3839	3844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925213
62	NC_019936	CTG	2	6	3893	3898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925213
63	NC_019936	CTA	2	6	3922	3927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925213
64	NC_019936	CAG	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925213
65	NC_019936	TGG	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925213
66	NC_019936	AAG	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925213
67	NC_019936	TCG	2	6	4393	4398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925214
68	NC_019936	CGA	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925214
69	NC_019936	CAC	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925214
70	NC_019936	GTC	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925214
71	NC_019936	TCA	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925214
72	NC_019936	TGC	2	6	4661	4666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925214
73	NC_019936	GGT	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925214
74	NC_019936	CAG	2	6	4886	4891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925214
75	NC_019936	GTT	2	6	5010	5015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431925214
76	NC_019936	CGA	2	6	5106	5111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925214
77	NC_019936	CAA	2	6	5178	5183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925214
78	NC_019936	AAG	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925214
79	NC_019936	CCA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925214
80	NC_019936	TGA	2	6	5304	5309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925214
81	NC_019936	CCG	2	6	5408	5413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925214
82	NC_019936	GGT	2	6	5478	5483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925214
83	NC_019936	GAT	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925214
84	NC_019936	GAT	2	6	5748	5753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925214
85	NC_019936	TCC	2	6	5755	5760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925214
86	NC_019936	ACA	2	6	5816	5821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925214
87	NC_019936	CAT	4	12	5844	5855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925214
88	NC_019936	CTG	3	9	5893	5901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925214
89	NC_019936	TTC	3	9	5905	5913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925214
90	NC_019936	GCC	2	6	5961	5966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925214
91	NC_019936	GGA	2	6	6024	6029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925214
92	NC_019936	TGA	2	6	6137	6142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925214
93	NC_019936	CTT	2	6	6408	6413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925214
94	NC_019936	GCA	2	6	6416	6421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925214
95	NC_019936	AAG	2	6	6505	6510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925214
96	NC_019936	TGA	2	6	6545	6550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925214
97	NC_019936	CGC	2	6	6562	6567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925214
98	NC_019936	GCG	2	6	6645	6650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925214
99	NC_019936	CAG	2	6	6804	6809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019936	TCA	2	6	6955	6960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019936	CCA	2	6	6982	6987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019936	TCG	2	6	7076	7081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925215
103	NC_019936	CTG	2	6	7123	7128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925215
104	NC_019936	CGA	2	6	7176	7181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925215
105	NC_019936	CGT	2	6	7193	7198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925215
106	NC_019936	CGG	2	6	7215	7220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925215
107	NC_019936	GCT	2	6	7284	7289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925215
108	NC_019936	CGG	2	6	7296	7301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925215
109	NC_019936	ACG	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925215
110	NC_019936	GTC	2	6	7654	7659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925215
111	NC_019936	GGT	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925215
112	NC_019936	GCG	2	6	7684	7689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925215
113	NC_019936	CGC	2	6	7695	7700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925215
114	NC_019936	CGC	2	6	7725	7730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925215
115	NC_019936	CGG	2	6	7740	7745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925215
116	NC_019936	CAT	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925215
117	NC_019936	CGA	2	6	7896	7901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925215
118	NC_019936	CGG	2	6	7929	7934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925215
119	NC_019936	TGG	2	6	8085	8090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925215
120	NC_019936	TCG	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925215
121	NC_019936	GCT	2	6	8148	8153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925215
122	NC_019936	GAG	2	6	8164	8169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925215
123	NC_019936	TGC	2	6	8186	8191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925215
124	NC_019936	ACC	2	6	8242	8247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925215
125	NC_019936	ACG	2	6	8303	8308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925215
126	NC_019936	CTG	2	6	8353	8358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925215
127	NC_019936	ATC	2	6	8410	8415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925215
128	NC_019936	CGC	2	6	8454	8459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925215
129	NC_019936	AGC	2	6	8594	8599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019936	GCT	2	6	8606	8611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019936	GCA	2	6	8653	8658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925216
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133	NC_019936	CTG	2	6	8708	8713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925216
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156	NC_019936	GCA	2	6	10491	10496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925217
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248	NC_019936	CGG	2	6	16783	16788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_019936	CTC	2	6	16840	16845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925225
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255	NC_019936	CAG	2	6	17170	17175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925225
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257	NC_019936	TCG	2	6	17311	17316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925225
258	NC_019936	TCG	2	6	17402	17407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925225
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491	NC_019936	CGA	2	6	31617	31622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_019936	TGG	2	6	31898	31903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925241
498	NC_019936	TGA	2	6	31928	31933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925241
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500	NC_019936	GCC	2	6	32051	32056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925241

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