MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 6229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019908	AGTT	2	8	436	443	25 %	50 %	25 %	0 %	431806728
2	NC_019908	GAAA	2	8	891	898	75 %	0 %	25 %	0 %	431806728
3	NC_019908	GTGA	2	8	2305	2312	25 %	25 %	50 %	0 %	431806729
4	NC_019908	AAAG	2	8	2475	2482	75 %	0 %	25 %	0 %	431806729
5	NC_019908	AAAG	3	12	2564	2575	75 %	0 %	25 %	0 %	431806730
6	NC_019908	AACA	2	8	2864	2871	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
7	NC_019908	TAAC	2	8	2959	2966	50 %	25 %	0 %	25 %	431806731
8	NC_019908	AAAC	2	8	3144	3151	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
9	NC_019908	AAAG	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	431806731
10	NC_019908	AAGA	2	8	3492	3499	75 %	0 %	25 %	0 %	431806731
11	NC_019908	TTAA	2	8	3990	3997	50 %	50 %	0 %	0 %	431806731
12	NC_019908	ACAA	2	8	4017	4024	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
13	NC_019908	CAAT	2	8	4052	4059	50 %	25 %	0 %	25 %	431806731
14	NC_019908	GAAA	2	8	4089	4096	75 %	0 %	25 %	0 %	431806731
15	NC_019908	ACAG	2	8	4500	4507	50 %	0 %	25 %	25 %	431806731
16	NC_019908	ACAA	2	8	4567	4574	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
17	NC_019908	AATA	2	8	4695	4702	75 %	25 %	0 %	0 %	431806731
18	NC_019908	TACT	2	8	5176	5183	25 %	50 %	0 %	25 %	431806732
19	NC_019908	TAAT	2	8	5218	5225	50 %	50 %	0 %	0 %	431806732
20	NC_019908	AAAT	2	8	5609	5616	75 %	25 %	0 %	0 %	431806732
21	NC_019908	TAAA	2	8	5653	5660	75 %	25 %	0 %	0 %	431806732
22	NC_019908	TGAG	2	8	6816	6823	25 %	25 %	50 %	0 %	431806734
23	NC_019908	AATG	2	8	6931	6938	50 %	25 %	25 %	0 %	431806734
24	NC_019908	AAGA	2	8	7529	7536	75 %	0 %	25 %	0 %	431806735
25	NC_019908	ATGC	2	8	7898	7905	25 %	25 %	25 %	25 %	431806735
26	NC_019908	AAAT	2	8	7937	7944	75 %	25 %	0 %	0 %	431806735
27	NC_019908	TTTA	2	8	8736	8743	25 %	75 %	0 %	0 %	431806736
28	NC_019908	GTAT	2	8	11669	11676	25 %	50 %	25 %	0 %	431806737
29	NC_019908	CAGC	2	8	11890	11897	25 %	0 %	25 %	50 %	431806737
30	NC_019908	CATA	2	8	12325	12332	50 %	25 %	0 %	25 %	431806738
31	NC_019908	TACA	2	8	13032	13039	50 %	25 %	0 %	25 %	431806738
32	NC_019908	GGAG	2	8	13280	13287	25 %	0 %	75 %	0 %	431806738
33	NC_019908	ATTA	2	8	15365	15372	50 %	50 %	0 %	0 %	431806740
34	NC_019908	TACC	2	8	15413	15420	25 %	25 %	0 %	50 %	431806740
35	NC_019908	TTTG	2	8	15578	15585	0 %	75 %	25 %	0 %	431806740
36	NC_019908	ATAC	2	8	15767	15774	50 %	25 %	0 %	25 %	431806740
37	NC_019908	AAGA	2	8	16359	16366	75 %	0 %	25 %	0 %	431806741
38	NC_019908	AGAA	2	8	18057	18064	75 %	0 %	25 %	0 %	431806742
39	NC_019908	GTAT	2	8	18117	18124	25 %	50 %	25 %	0 %	431806742
40	NC_019908	CTTC	2	8	18686	18693	0 %	50 %	0 %	50 %	431806742
41	NC_019908	ACAG	2	8	19353	19360	50 %	0 %	25 %	25 %	431806742
42	NC_019908	CTTC	2	8	19550	19557	0 %	50 %	0 %	50 %	431806742
43	NC_019908	AATG	2	8	19778	19785	50 %	25 %	25 %	0 %	431806742
44	NC_019908	ATGA	2	8	19823	19830	50 %	25 %	25 %	0 %	431806742
45	NC_019908	AAAC	2	8	21233	21240	75 %	0 %	0 %	25 %	431806746
46	NC_019908	TGCT	2	8	21450	21457	0 %	50 %	25 %	25 %	431806746
47	NC_019908	AATG	2	8	21463	21470	50 %	25 %	25 %	0 %	431806746
48	NC_019908	ACAG	2	8	21641	21648	50 %	0 %	25 %	25 %	431806746
49	NC_019908	ATTT	2	8	21977	21984	25 %	75 %	0 %	0 %	431806747
50	NC_019908	TGTT	2	8	22007	22014	0 %	75 %	25 %	0 %	431806747
51	NC_019908	AACA	2	8	22455	22462	75 %	0 %	0 %	25 %	431806747
52	NC_019908	ATTT	2	8	22971	22978	25 %	75 %	0 %	0 %	431806747
53	NC_019908	ATTA	2	8	23301	23308	50 %	50 %	0 %	0 %	431806748
54	NC_019908	GAAA	2	8	23712	23719	75 %	0 %	25 %	0 %	431806749
55	NC_019908	ATTT	2	8	23724	23731	25 %	75 %	0 %	0 %	431806749
56	NC_019908	GTAT	2	8	23899	23906	25 %	50 %	25 %	0 %	431806749
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58	NC_019908	CTTC	2	8	24483	24490	0 %	50 %	0 %	50 %	431806749
59	NC_019908	ACAA	2	8	24639	24646	75 %	0 %	0 %	25 %	431806749
60	NC_019908	TAAT	3	12	24673	24684	50 %	50 %	0 %	0 %	431806749
61	NC_019908	AATC	2	8	24927	24934	50 %	25 %	0 %	25 %	431806750
62	NC_019908	CATG	2	8	25077	25084	25 %	25 %	25 %	25 %	431806750
63	NC_019908	TTAT	2	8	25587	25594	25 %	75 %	0 %	0 %	431806751
64	NC_019908	AAAT	2	8	25631	25638	75 %	25 %	0 %	0 %	431806751
65	NC_019908	CAAT	2	8	25716	25723	50 %	25 %	0 %	25 %	431806751
66	NC_019908	TTTA	2	8	26081	26088	25 %	75 %	0 %	0 %	431806751
67	NC_019908	ATTT	2	8	26108	26115	25 %	75 %	0 %	0 %	431806751
68	NC_019908	TAAT	2	8	26341	26348	50 %	50 %	0 %	0 %	431806751
69	NC_019908	TTTG	2	8	26913	26920	0 %	75 %	25 %	0 %	431806752
70	NC_019908	ATTT	2	8	27113	27120	25 %	75 %	0 %	0 %	431806752
71	NC_019908	TAAT	2	8	27167	27174	50 %	50 %	0 %	0 %	431806752
72	NC_019908	AAAC	2	8	27683	27690	75 %	0 %	0 %	25 %	431806753
73	NC_019908	CATA	2	8	27979	27986	50 %	25 %	0 %	25 %	431806753
74	NC_019908	TGAT	2	8	28176	28183	25 %	50 %	25 %	0 %	431806753
75	NC_019908	GCCT	2	8	28311	28318	0 %	25 %	25 %	50 %	431806753
76	NC_019908	CTTC	2	8	28476	28483	0 %	50 %	0 %	50 %	431806753
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79	NC_019908	AATA	2	8	29192	29199	75 %	25 %	0 %	0 %	431806754
80	NC_019908	ATCT	2	8	29223	29230	25 %	50 %	0 %	25 %	431806754
81	NC_019908	TAAA	2	8	30549	30556	75 %	25 %	0 %	0 %	431806757
82	NC_019908	TAAT	2	8	30802	30809	50 %	50 %	0 %	0 %	431806758
83	NC_019908	AATA	2	8	31165	31172	75 %	25 %	0 %	0 %	431806758
84	NC_019908	GCAA	2	8	32783	32790	50 %	0 %	25 %	25 %	431806760
85	NC_019908	ATCT	2	8	33227	33234	25 %	50 %	0 %	25 %	431806760
86	NC_019908	TAGA	2	8	33385	33392	50 %	25 %	25 %	0 %	431806760
87	NC_019908	CATA	2	8	33628	33635	50 %	25 %	0 %	25 %	431806760
88	NC_019908	TCAT	2	8	33702	33709	25 %	50 %	0 %	25 %	431806760
89	NC_019908	CTTA	2	8	35123	35130	25 %	50 %	0 %	25 %	431806761
90	NC_019908	TAAA	2	8	36744	36751	75 %	25 %	0 %	0 %	431806763
91	NC_019908	TAAA	2	8	37188	37195	75 %	25 %	0 %	0 %	431806763
92	NC_019908	AAGA	2	8	37367	37374	75 %	0 %	25 %	0 %	431806763
93	NC_019908	TACT	2	8	37977	37984	25 %	50 %	0 %	25 %	431806763
94	NC_019908	GGTT	2	8	38240	38247	0 %	50 %	50 %	0 %	431806763
95	NC_019908	TCAC	2	8	38439	38446	25 %	25 %	0 %	50 %	431806763
96	NC_019908	TACT	2	8	38713	38720	25 %	50 %	0 %	25 %	431806763
97	NC_019908	AGAT	2	8	38734	38741	50 %	25 %	25 %	0 %	431806763
98	NC_019908	CTTG	2	8	39085	39092	0 %	50 %	25 %	25 %	431806763
99	NC_019908	GTAA	2	8	39128	39135	50 %	25 %	25 %	0 %	431806763
100	NC_019908	AGTG	2	8	40230	40237	25 %	25 %	50 %	0 %	431806765
101	NC_019908	ATTT	2	8	40803	40810	25 %	75 %	0 %	0 %	431806766
102	NC_019908	AAAT	2	8	40896	40903	75 %	25 %	0 %	0 %	431806766
103	NC_019908	TTTA	2	8	40947	40954	25 %	75 %	0 %	0 %	431806766
104	NC_019908	ATTT	2	8	41003	41010	25 %	75 %	0 %	0 %	431806766
105	NC_019908	ATTT	2	8	41036	41043	25 %	75 %	0 %	0 %	431806766
106	NC_019908	TATT	2	8	41201	41208	25 %	75 %	0 %	0 %	431806766
107	NC_019908	GCAA	2	8	41227	41234	50 %	0 %	25 %	25 %	431806766
108	NC_019908	GAAA	2	8	41900	41907	75 %	0 %	25 %	0 %	431806767
109	NC_019908	ATTT	2	8	41989	41996	25 %	75 %	0 %	0 %	431806767
110	NC_019908	TAAG	2	8	42130	42137	50 %	25 %	25 %	0 %	431806767
111	NC_019908	TAAT	2	8	42874	42881	50 %	50 %	0 %	0 %	431806767
112	NC_019908	AAAC	2	8	43245	43252	75 %	0 %	0 %	25 %	431806767
113	NC_019908	ATTT	2	8	43284	43291	25 %	75 %	0 %	0 %	431806767
114	NC_019908	ATTG	2	8	43559	43566	25 %	50 %	25 %	0 %	431806767
115	NC_019908	TAGA	2	8	43792	43799	50 %	25 %	25 %	0 %	431806767
116	NC_019908	TTAA	2	8	44352	44359	50 %	50 %	0 %	0 %	431806767
117	NC_019908	AAAT	2	8	44440	44447	75 %	25 %	0 %	0 %	431806767
118	NC_019908	AGAA	2	8	45427	45434	75 %	0 %	25 %	0 %	431806768
119	NC_019908	TAAT	2	8	45636	45643	50 %	50 %	0 %	0 %	431806768
120	NC_019908	TAAA	2	8	45789	45796	75 %	25 %	0 %	0 %	431806768
121	NC_019908	AAAT	2	8	45861	45868	75 %	25 %	0 %	0 %	431806768
122	NC_019908	ATTA	2	8	46196	46203	50 %	50 %	0 %	0 %	431806769
123	NC_019908	ATCA	2	8	46880	46887	50 %	25 %	0 %	25 %	431806770
124	NC_019908	TTGA	2	8	47240	47247	25 %	50 %	25 %	0 %	431806770
125	NC_019908	GATA	2	8	48043	48050	50 %	25 %	25 %	0 %	431806771
126	NC_019908	TATT	2	8	48310	48317	25 %	75 %	0 %	0 %	431806771
127	NC_019908	GAAA	2	8	48679	48686	75 %	0 %	25 %	0 %	431806771
128	NC_019908	ATAG	2	8	48839	48846	50 %	25 %	25 %	0 %	431806771
129	NC_019908	CTTT	2	8	49259	49266	0 %	75 %	0 %	25 %	431806771
130	NC_019908	ATTT	2	8	49440	49447	25 %	75 %	0 %	0 %	431806771
131	NC_019908	AGGC	2	8	49577	49584	25 %	0 %	50 %	25 %	431806771
132	NC_019908	AGTA	2	8	49774	49781	50 %	25 %	25 %	0 %	431806771
133	NC_019908	AGAA	2	8	49850	49857	75 %	0 %	25 %	0 %	431806771
134	NC_019908	GAAT	2	8	50028	50035	50 %	25 %	25 %	0 %	431806771
135	NC_019908	GATA	2	8	50140	50147	50 %	25 %	25 %	0 %	431806771
136	NC_019908	TAAT	2	8	50359	50366	50 %	50 %	0 %	0 %	431806771
137	NC_019908	TAAA	2	8	50489	50496	75 %	25 %	0 %	0 %	431806772
138	NC_019908	TTTG	2	8	52132	52139	0 %	75 %	25 %	0 %	431806773
139	NC_019908	AGTA	2	8	52662	52669	50 %	25 %	25 %	0 %	431806774
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