MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Liberibacter crescens BT-1 chromosome

Total Repeats: 578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019907	GCTATT	2	12	81	92	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431805347
2	NC_019907	TTAGAT	2	12	804	815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	431805347
3	NC_019907	TTAAAA	2	12	3118	3129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805348
4	NC_019907	CTTTAT	2	12	3194	3205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	431805348
5	NC_019907	TTGATC	2	12	4057	4068	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431805350
6	NC_019907	TTCTAT	2	12	5940	5951	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	431805352
7	NC_019907	CATATG	2	12	12084	12095	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	431805356
8	NC_019907	TTTAGC	2	12	13581	13592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431805358
9	NC_019907	GCTTTT	2	12	13948	13959	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	431805358
10	NC_019907	TTAAAG	2	12	14030	14041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431805358
11	NC_019907	TAGAAT	2	12	19070	19081	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431805363
12	NC_019907	GTAAAG	2	12	19994	20005	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	431805365
13	NC_019907	AAAAAT	2	12	20153	20164	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	431805365
14	NC_019907	TAGTAA	2	12	26477	26488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431805367
15	NC_019907	AGTTAC	2	12	26906	26917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	431805367
16	NC_019907	GATTTT	2	12	28887	28898	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	431805367
17	NC_019907	AAGGAA	2	12	29110	29121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805367
18	NC_019907	GTTTAT	2	12	38348	38359	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	431805373
19	NC_019907	AGGAAA	2	12	38434	38445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805373
20	NC_019907	TGAGCG	2	12	40846	40857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	431805376
21	NC_019907	TTGATG	2	12	41568	41579	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	431805376
22	NC_019907	ACATTA	2	12	42376	42387	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	431805377
23	NC_019907	TCGTGG	2	12	44004	44015	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	431805377
24	NC_019907	ATAGTA	2	12	45221	45232	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431805378
25	NC_019907	ATGAAG	2	12	46222	46233	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	431805379
26	NC_019907	ACTGAA	2	12	47246	47257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	431805382
27	NC_019907	ATGTTG	2	12	55291	55302	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	431805388
28	NC_019907	ATATTT	2	12	57965	57976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805392
29	NC_019907	AGTTTC	2	12	60202	60213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431805394
30	NC_019907	ATTCTT	2	12	60513	60524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	431805394
31	NC_019907	CCTTTA	2	12	61802	61813	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	431805394
32	NC_019907	AGAGGC	3	18	71239	71256	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	431805404
33	NC_019907	TTTTTG	2	12	73716	73727	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	431805407
34	NC_019907	CAACCA	2	12	79874	79885	50 %	0 %	0 %	50 %	431805412
35	NC_019907	CTCCTG	2	12	82297	82308	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	431805415
36	NC_019907	TGAAAT	2	12	85425	85436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431805417
37	NC_019907	AAGAGC	2	12	86593	86604	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	431805419
38	NC_019907	ATTCCT	2	12	90133	90144	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	431805420
39	NC_019907	GATAAA	2	12	90906	90917	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431805421
40	NC_019907	GGGTAT	2	12	93013	93024	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	431805422
41	NC_019907	GGGATT	2	12	103536	103547	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	431805433
42	NC_019907	TAATGA	2	12	104521	104532	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431805434
43	NC_019907	TGTTTT	2	12	104744	104755	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	431805435
44	NC_019907	TGGGAT	2	12	107218	107229	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	431805437
45	NC_019907	GCTTTT	2	12	109639	109650	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	431805440
46	NC_019907	AGGAAT	2	12	110064	110075	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	431805440
47	NC_019907	GATAAA	2	12	112704	112715	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431805442
48	NC_019907	GATAAA	2	12	114428	114439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431805445
49	NC_019907	CCATTC	2	12	118145	118156	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	431805448
50	NC_019907	GATTAA	2	12	126047	126058	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431805454
51	NC_019907	AACATT	2	12	127141	127152	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	431805455
52	NC_019907	TGAAAA	2	12	128675	128686	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431805457
53	NC_019907	AGGTTG	2	12	131402	131413	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	431805459
54	NC_019907	AATTTT	2	12	140790	140801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805466
55	NC_019907	CTCAAA	2	12	148275	148286	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	431805469
56	NC_019907	TAGAAG	2	12	148785	148796	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	431805469
57	NC_019907	AATCAA	2	12	149024	149035	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	431805469
58	NC_019907	TTTTGA	2	12	151261	151272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	431805471
59	NC_019907	AATATG	2	12	152962	152973	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431805471
60	NC_019907	CAATTC	2	12	153076	153087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805471
61	NC_019907	TGCTCA	2	12	154000	154011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	431805472
62	NC_019907	GCTTTC	2	12	156221	156232	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	431805474
63	NC_019907	TTGCGA	2	12	156635	156646	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	431805475
64	NC_019907	AGCTAT	2	12	157006	157017	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	431805475
65	NC_019907	CTATTG	2	12	157704	157715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431805475
66	NC_019907	CTGTTG	2	12	157953	157964	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	431805475
67	NC_019907	TATTCT	2	12	158089	158100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	431805475
68	NC_019907	ATTTCA	2	12	162950	162961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431805478
69	NC_019907	TTTTAG	2	12	164036	164047	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	431805479
70	NC_019907	TATCAT	2	12	164225	164236	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431805479
71	NC_019907	TTTTAG	2	12	165477	165488	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	431805481
72	NC_019907	TATCAT	2	12	165666	165677	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431805481
73	NC_019907	TGTCCT	2	12	168388	168399	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	431805483
74	NC_019907	TTTAAA	2	12	168685	168696	50 %	50 %	0 %	0 %	431805483
75	NC_019907	GATATT	2	12	176908	176919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	431805490
76	NC_019907	AGAAGT	2	12	180620	180631	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	431805492
77	NC_019907	TCATTC	2	12	181467	181478	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	431805494
78	NC_019907	ACGAGT	2	12	183719	183730	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	431805496
79	NC_019907	AATTAA	2	12	184184	184195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805497
80	NC_019907	ATTTTT	2	12	185888	185899	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	431805498
81	NC_019907	TTGGAA	2	12	187992	188003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805502
82	NC_019907	TTCAAT	2	12	191162	191173	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431805505
83	NC_019907	TTCGAA	2	12	192446	192457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	431805506
84	NC_019907	ATCTTA	2	12	195969	195980	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431805509
85	NC_019907	AAGTGC	2	12	201523	201534	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	431805515
86	NC_019907	ATTACC	2	12	204312	204323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805517
87	NC_019907	ATATTC	2	12	212843	212854	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431805523
88	NC_019907	AGTTTC	2	12	214244	214255	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431805523
89	NC_019907	TTCTTG	2	12	216469	216480	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	431805524
90	NC_019907	CAAAAA	2	12	216837	216848	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	431805524
91	NC_019907	CATTTC	2	12	225358	225369	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	431805532
92	NC_019907	TTCATC	2	12	226748	226759	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	431805533
93	NC_019907	GCAAAA	2	12	234942	234953	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	431805543
94	NC_019907	CTTTTG	2	12	238241	238252	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	431805549
95	NC_019907	CTATGT	2	12	243506	243517	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431805556
96	NC_019907	GCATAA	2	12	243661	243672	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	431805556
97	NC_019907	TTGCTA	2	12	247494	247505	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431805560
98	NC_019907	TTAATA	2	12	249690	249701	50 %	50 %	0 %	0 %	431805562
99	NC_019907	TTTTGT	2	12	250673	250684	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	431805563
100	NC_019907	GATTTC	2	12	251786	251797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431805564
101	NC_019907	TACTGG	2	12	252042	252053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	431805564
102	NC_019907	AAATTT	2	12	253132	253143	50 %	50 %	0 %	0 %	431805565
103	NC_019907	AAAAGA	2	12	254104	254115	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	431805566
104	NC_019907	TTCATA	2	12	254912	254923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431805567
105	NC_019907	ATTCCT	2	12	256025	256036	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	431805568
106	NC_019907	CAGAAA	2	12	258712	258723	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	431805571
107	NC_019907	GATTTA	2	12	263680	263691	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	431805576
108	NC_019907	TAATGA	2	12	263709	263720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	431805576
109	NC_019907	AAAGCA	2	12	266167	266178	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	431805579
110	NC_019907	TCAGAA	2	12	266792	266803	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	431805580
111	NC_019907	CAGGGT	2	12	267611	267622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	431805580
112	NC_019907	GATATG	2	12	268312	268323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805581
113	NC_019907	TTGCTG	2	12	268676	268687	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	431805582
114	NC_019907	GCTCCA	2	12	270071	270082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	431805584
115	NC_019907	GCTTCT	2	12	273948	273959	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	431805587
116	NC_019907	TCCAAC	2	12	274169	274180	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	431805587
117	NC_019907	AAAATC	2	12	283101	283112	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	431805594
118	NC_019907	GCAAAA	2	12	283351	283362	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	431805594
119	NC_019907	ATTTTT	2	12	283550	283561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	431805595
120	NC_019907	GAAAAA	2	12	284032	284043	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	431805596
121	NC_019907	TCAATC	2	12	284244	284255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805596
122	NC_019907	GTGAAG	2	12	290041	290052	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	431805602
123	NC_019907	GTTTTG	2	12	293374	293385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805605
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460	NC_019907	CAGAAA	2	12	1166267	1166278	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	431806415
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464	NC_019907	AAAACC	2	12	1173975	1173986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806422
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