MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Liberibacter crescens BT-1 chromosome

Total Repeats: 1245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019907	GAAAA	2	10	36	45	80 %	0 %	20 %	0 %	431805347
2	NC_019907	AATAA	2	10	1095	1104	80 %	20 %	0 %	0 %	431805347
3	NC_019907	TATCC	2	10	2903	2912	20 %	40 %	0 %	40 %	431805348
4	NC_019907	ATTTT	2	10	6406	6415	20 %	80 %	0 %	0 %	431805352
5	NC_019907	GATTT	2	10	6727	6736	20 %	60 %	20 %	0 %	431805352
6	NC_019907	TTAAA	2	10	7254	7263	60 %	40 %	0 %	0 %	431805353
7	NC_019907	AGAAA	2	10	8210	8219	80 %	0 %	20 %	0 %	431805354
8	NC_019907	AATTT	2	10	8686	8695	40 %	60 %	0 %	0 %	431805354
9	NC_019907	ATTTG	2	10	9009	9018	20 %	60 %	20 %	0 %	431805354
10	NC_019907	CCAAT	2	10	9210	9219	40 %	20 %	0 %	40 %	431805354
11	NC_019907	CATCC	2	10	9643	9652	20 %	20 %	0 %	60 %	431805354
12	NC_019907	AATGT	2	10	10586	10595	40 %	40 %	20 %	0 %	431805355
13	NC_019907	AAAAT	2	10	10945	10954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019907	CAGAA	2	10	11943	11952	60 %	0 %	20 %	20 %	431805356
15	NC_019907	GAAAT	2	10	12478	12487	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019907	TTTTA	2	10	13320	13329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019907	AAAAT	2	10	13437	13446	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019907	TTTTC	2	10	14125	14134	0 %	80 %	0 %	20 %	431805358
19	NC_019907	AAGCT	2	10	14831	14840	40 %	20 %	20 %	20 %	431805358
20	NC_019907	CAGAT	2	10	15993	16002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019907	ATTAT	2	10	17556	17565	40 %	60 %	0 %	0 %	431805361
22	NC_019907	TCAGG	2	10	18983	18992	20 %	20 %	40 %	20 %	431805363
23	NC_019907	AATCT	2	10	20528	20537	40 %	40 %	0 %	20 %	431805365
24	NC_019907	CTTTT	2	10	20610	20619	0 %	80 %	0 %	20 %	431805365
25	NC_019907	TAAAA	2	10	20807	20816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019907	TTTGC	2	10	23067	23076	0 %	60 %	20 %	20 %	431805367
27	NC_019907	TAATT	2	10	24458	24467	40 %	60 %	0 %	0 %	431805367
28	NC_019907	TATGA	2	10	25389	25398	40 %	40 %	20 %	0 %	431805367
29	NC_019907	AAATA	2	10	25621	25630	80 %	20 %	0 %	0 %	431805367
30	NC_019907	AATAT	2	10	27673	27682	60 %	40 %	0 %	0 %	431805367
31	NC_019907	GTTGT	2	10	31035	31044	0 %	60 %	40 %	0 %	431805368
32	NC_019907	ATTTA	2	10	31244	31253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019907	GAAGA	2	10	32020	32029	60 %	0 %	40 %	0 %	431805369
34	NC_019907	TAAAA	2	10	32483	32492	80 %	20 %	0 %	0 %	431805369
35	NC_019907	TAACT	2	10	33055	33064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019907	GTCGT	2	10	34238	34247	0 %	40 %	40 %	20 %	431805370
37	NC_019907	TATTT	2	10	34368	34377	20 %	80 %	0 %	0 %	431805370
38	NC_019907	ATCTT	2	10	35117	35126	20 %	60 %	0 %	20 %	431805371
39	NC_019907	ATACT	2	10	36651	36660	40 %	40 %	0 %	20 %	431805372
40	NC_019907	GTTTT	2	10	36726	36735	0 %	80 %	20 %	0 %	431805372
41	NC_019907	GTTTT	2	10	39569	39578	0 %	80 %	20 %	0 %	431805374
42	NC_019907	TAAAA	2	10	39711	39720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019907	AGATG	2	10	40332	40341	40 %	20 %	40 %	0 %	431805375
44	NC_019907	ATAGA	2	10	40383	40392	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019907	ACAAT	2	10	42842	42851	60 %	20 %	0 %	20 %	431805377
46	NC_019907	AAGGT	2	10	44744	44753	40 %	20 %	40 %	0 %	431805377
47	NC_019907	AAGGT	2	10	45676	45685	40 %	20 %	40 %	0 %	431805379
48	NC_019907	AGAGT	2	10	45915	45924	40 %	20 %	40 %	0 %	431805379
49	NC_019907	AGTTA	2	10	46742	46751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019907	TTTTG	2	10	54336	54345	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019907	GATGG	2	10	56624	56633	20 %	20 %	60 %	0 %	431805390
52	NC_019907	GGTTT	2	10	57611	57620	0 %	60 %	40 %	0 %	431805392
53	NC_019907	TGGTG	2	10	57635	57644	0 %	40 %	60 %	0 %	431805392
54	NC_019907	ATTTT	2	10	58128	58137	20 %	80 %	0 %	0 %	431805392
55	NC_019907	GTTAT	2	10	58460	58469	20 %	60 %	20 %	0 %	431805393
56	NC_019907	TTAAT	2	10	59372	59381	40 %	60 %	0 %	0 %	431805393
57	NC_019907	TGTTT	2	10	59632	59641	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019907	ATAGG	2	10	59652	59661	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019907	GTTGA	2	10	62181	62190	20 %	40 %	40 %	0 %	431805395
60	NC_019907	TTAAA	2	10	63521	63530	60 %	40 %	0 %	0 %	431805396
61	NC_019907	ATTGT	2	10	63787	63796	20 %	60 %	20 %	0 %	431805397
62	NC_019907	TATGG	2	10	64197	64206	20 %	40 %	40 %	0 %	431805397
63	NC_019907	ATGCT	2	10	65036	65045	20 %	40 %	20 %	20 %	431805398
64	NC_019907	ATTTC	2	10	66706	66715	20 %	60 %	0 %	20 %	431805400
65	NC_019907	TGTAC	2	10	68263	68272	20 %	40 %	20 %	20 %	431805401
66	NC_019907	ATTTT	2	10	68554	68563	20 %	80 %	0 %	0 %	431805401
67	NC_019907	GTAAA	2	10	68849	68858	60 %	20 %	20 %	0 %	431805402
68	NC_019907	ATTAA	2	10	69074	69083	60 %	40 %	0 %	0 %	431805402
69	NC_019907	TTTTG	2	10	69560	69569	0 %	80 %	20 %	0 %	431805403
70	NC_019907	TTTGT	2	10	69916	69925	0 %	80 %	20 %	0 %	431805403
71	NC_019907	GAAAA	2	10	70029	70038	80 %	0 %	20 %	0 %	431805403
72	NC_019907	TGTAT	2	10	70128	70137	20 %	60 %	20 %	0 %	431805403
73	NC_019907	GATTT	2	10	71166	71175	20 %	60 %	20 %	0 %	431805404
74	NC_019907	ATATT	2	10	72213	72222	40 %	60 %	0 %	0 %	431805404
75	NC_019907	TTAAT	2	10	72755	72764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019907	ATTAT	2	10	73380	73389	40 %	60 %	0 %	0 %	431805406
77	NC_019907	ATTAA	2	10	75085	75094	60 %	40 %	0 %	0 %	431805408
78	NC_019907	AGCTT	2	10	76765	76774	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019907	AATGA	2	10	77862	77871	60 %	20 %	20 %	0 %	431805410
80	NC_019907	ATATG	2	10	78944	78953	40 %	40 %	20 %	0 %	431805411
81	NC_019907	TCCAT	2	10	80913	80922	20 %	40 %	0 %	40 %	431805413
82	NC_019907	CATAT	2	10	81236	81245	40 %	40 %	0 %	20 %	431805413
83	NC_019907	CTTGA	2	10	81265	81274	20 %	40 %	20 %	20 %	431805413
84	NC_019907	TTACC	2	10	83362	83371	20 %	40 %	0 %	40 %	431805416
85	NC_019907	AAAGG	2	10	84838	84847	60 %	0 %	40 %	0 %	431805417
86	NC_019907	CCAAT	2	10	87577	87586	40 %	20 %	0 %	40 %	431805419
87	NC_019907	ATCTT	2	10	89718	89727	20 %	60 %	0 %	20 %	431805420
88	NC_019907	TAATC	2	10	90195	90204	40 %	40 %	0 %	20 %	431805420
89	NC_019907	GGAAG	2	10	91125	91134	40 %	0 %	60 %	0 %	431805421
90	NC_019907	TCTCA	2	10	91607	91616	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_019907	GAGTC	2	10	92663	92672	20 %	20 %	40 %	20 %	431805422
92	NC_019907	TGCAA	2	10	93721	93730	40 %	20 %	20 %	20 %	431805422
93	NC_019907	AGCCT	2	10	94176	94185	20 %	20 %	20 %	40 %	431805422
94	NC_019907	CAGAA	2	10	95748	95757	60 %	0 %	20 %	20 %	431805426
95	NC_019907	CAATA	2	10	96311	96320	60 %	20 %	0 %	20 %	431805426
96	NC_019907	TTTTA	2	10	96905	96914	20 %	80 %	0 %	0 %	431805426
97	NC_019907	ATTTT	2	10	97445	97454	20 %	80 %	0 %	0 %	431805427
98	NC_019907	TTTGA	2	10	97804	97813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019907	TATGC	2	10	98750	98759	20 %	40 %	20 %	20 %	431805428
100	NC_019907	TTCTG	2	10	101842	101851	0 %	60 %	20 %	20 %	431805430
101	NC_019907	TTGAT	2	10	101931	101940	20 %	60 %	20 %	0 %	431805430
102	NC_019907	TTTGT	2	10	102275	102284	0 %	80 %	20 %	0 %	431805431
103	NC_019907	TTCTA	2	10	103151	103160	20 %	60 %	0 %	20 %	431805432
104	NC_019907	GAAGA	2	10	103910	103919	60 %	0 %	40 %	0 %	431805433
105	NC_019907	ATGTT	2	10	105435	105444	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019907	CATTT	2	10	111256	111265	20 %	60 %	0 %	20 %	431805441
107	NC_019907	AATTA	2	10	111817	111826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019907	TAAAA	2	10	113136	113145	80 %	20 %	0 %	0 %	431805443
109	NC_019907	GTAAT	2	10	113305	113314	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019907	GTAAT	2	10	115027	115036	40 %	40 %	20 %	0 %	431805446
111	NC_019907	TTTTA	2	10	115460	115469	20 %	80 %	0 %	0 %	431805446
112	NC_019907	ATCTT	2	10	115804	115813	20 %	60 %	0 %	20 %	431805446
113	NC_019907	AGTTC	2	10	116178	116187	20 %	40 %	20 %	20 %	431805446
114	NC_019907	GGAAA	2	10	116291	116300	60 %	0 %	40 %	0 %	431805446
115	NC_019907	AGATA	2	10	116887	116896	60 %	20 %	20 %	0 %	431805447
116	NC_019907	TAAAT	2	10	118171	118180	60 %	40 %	0 %	0 %	431805448
117	NC_019907	CATTG	2	10	118285	118294	20 %	40 %	20 %	20 %	431805448
118	NC_019907	TTTTC	3	15	119231	119245	0 %	80 %	0 %	20 %	431805448
119	NC_019907	TGTCC	2	10	120192	120201	0 %	40 %	20 %	40 %	431805448
120	NC_019907	TCTTT	2	10	121038	121047	0 %	80 %	0 %	20 %	431805448
121	NC_019907	TTATA	2	10	121377	121386	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019907	ATTTT	2	10	121429	121438	20 %	80 %	0 %	0 %	431805449
123	NC_019907	CTTTG	2	10	122182	122191	0 %	60 %	20 %	20 %	431805449
124	NC_019907	TAACG	2	10	126615	126624	40 %	20 %	20 %	20 %	431805454
125	NC_019907	CATGC	2	10	127555	127564	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_019907	TCTTA	2	10	129363	129372	20 %	60 %	0 %	20 %	431805457
127	NC_019907	TTATT	2	10	130152	130161	20 %	80 %	0 %	0 %	431805458
128	NC_019907	TAGAT	2	10	135205	135214	40 %	40 %	20 %	0 %	431805461
129	NC_019907	ATTTA	2	10	136089	136098	40 %	60 %	0 %	0 %	431805463
130	NC_019907	CAATG	2	10	137813	137822	40 %	20 %	20 %	20 %	431805464
131	NC_019907	AAGTA	2	10	138091	138100	60 %	20 %	20 %	0 %	431805464
132	NC_019907	GATTA	2	10	141750	141759	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019907	GGAAA	2	10	144287	144296	60 %	0 %	40 %	0 %	431805467
134	NC_019907	ATTGG	2	10	145093	145102	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019907	ATTTT	2	10	146599	146608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019907	AAATT	2	10	146741	146750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019907	AGATA	2	10	148828	148837	60 %	20 %	20 %	0 %	431805469
138	NC_019907	TGATC	2	10	151388	151397	20 %	40 %	20 %	20 %	431805471
139	NC_019907	CATGA	2	10	155133	155142	40 %	20 %	20 %	20 %	431805474
140	NC_019907	CACGG	2	10	155179	155188	20 %	0 %	40 %	40 %	431805474
141	NC_019907	CTATT	2	10	155426	155435	20 %	60 %	0 %	20 %	431805474
142	NC_019907	GATCG	2	10	156827	156836	20 %	20 %	40 %	20 %	431805475
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147	NC_019907	TTATT	2	10	163873	163882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019907	TTATT	2	10	165314	165323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019907	AAATG	2	10	167554	167563	60 %	20 %	20 %	0 %	431805482
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