MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Liberibacter crescens BT-1 chromosome

Total Repeats: 329

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019907	AAAAT	2	10	10945	10954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019907	GAAAT	2	10	12478	12487	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019907	TTTTA	2	10	13320	13329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019907	AAAAT	2	10	13437	13446	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019907	CAGAT	2	10	15993	16002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019907	TAAAA	2	10	20807	20816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019907	ATTTA	2	10	31244	31253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019907	TAACT	2	10	33055	33064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019907	TAAAA	2	10	39711	39720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019907	ATAGA	2	10	40383	40392	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019907	AGTTA	2	10	46742	46751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019907	TTTTG	2	10	54336	54345	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019907	TGTTT	2	10	59632	59641	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019907	ATAGG	2	10	59652	59661	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019907	TTAAT	2	10	72755	72764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019907	AGCTT	2	10	76765	76774	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019907	TCTCA	2	10	91607	91616	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_019907	TTTGA	2	10	97804	97813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019907	ATGTT	2	10	105435	105444	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019907	AATTA	2	10	111817	111826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019907	GTAAT	2	10	113305	113314	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019907	TTATA	2	10	121377	121386	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019907	CATGC	2	10	127555	127564	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019907	GATTA	2	10	141750	141759	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019907	ATTGG	2	10	145093	145102	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019907	ATTTT	2	10	146599	146608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019907	AAATT	2	10	146741	146750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019907	TTTTC	2	10	160213	160222	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019907	TTATT	2	10	163873	163882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019907	TTATT	2	10	165314	165323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019907	TAATA	2	10	173290	173299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019907	AGTAA	2	10	173344	173353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019907	TATAA	2	10	174728	174737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019907	ATTAA	2	10	178237	178246	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019907	TAAAA	2	10	186987	186996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019907	ATTTA	2	10	190671	190680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019907	GTTAT	2	10	190948	190957	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019907	AGGAA	2	10	192553	192562	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019907	TTTTC	2	10	194315	194324	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019907	TTGTT	2	10	202401	202410	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019907	ATTAA	2	10	207787	207796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019907	TATTT	2	10	208629	208638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019907	ATTTT	2	10	218060	218069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019907	AGGTG	2	10	227119	227128	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019907	GTTAC	2	10	236119	236128	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019907	TTTAA	2	10	242298	242307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019907	TAATA	2	10	248005	248014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019907	GTAAA	2	10	248118	248127	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019907	ATTGA	2	10	250212	250221	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019907	TGAAA	2	10	253498	253507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019907	TATGT	2	10	253845	253854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019907	ATCTT	2	10	256744	256753	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019907	ATTTA	2	10	256837	256846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019907	GTTTT	2	10	260485	260494	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019907	AATTT	2	10	281461	281470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019907	TAATT	2	10	292308	292317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019907	GGTAT	2	10	297871	297880	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019907	ATATA	2	10	320161	320170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019907	TTATT	2	10	321119	321128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019907	TTGAA	2	10	326083	326092	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019907	TCGTG	2	10	327101	327110	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019907	TGGGC	2	10	327244	327253	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_019907	AGGCG	2	10	329566	329575	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019907	TAAGA	2	10	333486	333495	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019907	ATTGT	2	10	339054	339063	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019907	TTAAT	2	10	340694	340703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019907	ATTCC	2	10	340784	340793	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_019907	TTTTA	2	10	345475	345484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019907	CAGAA	2	10	353045	353054	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019907	ATTGA	2	10	353194	353203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019907	TAGTT	2	10	355973	355982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019907	TAAAA	2	10	378904	378913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019907	ATTTT	2	10	381933	381942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019907	GATTA	2	10	385995	386004	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019907	ATCTA	2	10	386449	386458	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019907	TGCTT	2	10	386918	386927	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019907	TAATA	2	10	387116	387125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019907	TATTT	2	10	387563	387572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019907	TAATT	2	10	394715	394724	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019907	TGAAT	2	10	398009	398018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019907	TAGAT	2	10	406117	406126	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019907	AATTT	2	10	406158	406167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019907	ATATT	2	10	413672	413681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019907	TTTTA	2	10	414609	414618	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019907	TTTAA	2	10	423258	423267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019907	ATTTT	2	10	430254	430263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019907	ATAAG	2	10	437334	437343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019907	CATCA	2	10	439766	439775	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_019907	TTTTA	2	10	445196	445205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019907	CCTTG	2	10	451350	451359	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_019907	GTATA	2	10	467326	467335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019907	TTAAA	2	10	470122	470131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019907	AGAAA	2	10	470595	470604	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019907	ATATT	2	10	473909	473918	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019907	TAAAG	2	10	483538	483547	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019907	ATTTT	2	10	487468	487477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019907	AATTA	2	10	489491	489500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019907	AGAAT	2	10	494010	494019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019907	AACAA	2	10	508721	508730	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019907	TCTTG	2	10	508759	508768	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019907	ATATA	2	10	510440	510449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019907	TTGTT	2	10	519965	519974	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019907	GATAG	2	10	523740	523749	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019907	GTTTC	2	10	527634	527643	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019907	AGAAA	2	10	531981	531990	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019907	TTGAA	2	10	540265	540274	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019907	GAAAA	2	10	540289	540298	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019907	AATAC	2	10	545372	545381	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019907	TACCT	2	10	546223	546232	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_019907	TTTGT	2	10	546438	546447	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019907	GTTTT	2	10	546507	546516	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019907	ATTAA	2	10	568609	568618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019907	CTTTT	2	10	570472	570481	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019907	TTCTT	2	10	577302	577311	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019907	TATAA	2	10	577321	577330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019907	TTATG	2	10	579610	579619	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019907	TAAAA	2	10	583479	583488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019907	TAAAA	2	10	586881	586890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019907	TAAAA	2	10	587831	587840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019907	TAAAA	2	10	588808	588817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019907	TAAAA	2	10	588918	588927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019907	CAAAT	2	10	588997	589006	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019907	TTTTA	2	10	591177	591186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019907	TAAAA	2	10	597573	597582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019907	TTATT	2	10	599354	599363	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019907	TTTTA	2	10	599379	599388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019907	TTTTA	2	10	600317	600326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019907	ATTTA	2	10	601437	601446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019907	AGTAT	2	10	605402	605411	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019907	TTTTC	2	10	611160	611169	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019907	TGGAA	2	10	625045	625054	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019907	GCACT	2	10	635703	635712	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_019907	ATTTT	2	10	637699	637708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019907	CTTAA	2	10	645229	645238	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019907	ATTTT	2	10	651953	651962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019907	TATGA	2	10	652082	652091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019907	TAGTA	2	10	652577	652586	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019907	TATAA	2	10	675353	675362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019907	ATTTT	2	10	682662	682671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019907	TTATT	2	10	685558	685567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019907	CAAAC	2	10	688187	688196	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_019907	GAAAA	2	10	692594	692603	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019907	CTGGA	2	10	693660	693669	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019907	ATAAA	2	10	695598	695607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019907	ACAAA	2	10	699177	699186	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019907	AGGAA	2	10	704625	704634	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019907	TAAAA	2	10	705839	705848	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019907	TATAA	2	10	711937	711946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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325	NC_019907	TTTTA	2	10	1493474	1493483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_019907	TTAAT	2	10	1503172	1503181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.