MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Liberibacter crescens BT-1 chromosome

Total Repeats: 18844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019907	AAT	2	6	23	28	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805347
2	NC_019907	GTC	2	6	67	72	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805347
3	NC_019907	TAT	3	9	220	228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805347
4	NC_019907	TGG	2	6	284	289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431805347
5	NC_019907	CTG	2	6	292	297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805347
6	NC_019907	CGT	2	6	453	458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805347
7	NC_019907	TGA	2	6	563	568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805347
8	NC_019907	AGA	2	6	569	574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805347
9	NC_019907	GAA	2	6	594	599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805347
10	NC_019907	AAG	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805347
11	NC_019907	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805347
12	NC_019907	TAC	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805347
13	NC_019907	CAG	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805347
14	NC_019907	AAG	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805347
15	NC_019907	AGA	2	6	894	899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805347
16	NC_019907	TTA	2	6	936	941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805347
17	NC_019907	TTC	2	6	950	955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805347
18	NC_019907	TCA	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805347
19	NC_019907	TGA	2	6	1034	1039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805347
20	NC_019907	TAT	2	6	1109	1114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805347
21	NC_019907	ATA	2	6	1117	1122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805347
22	NC_019907	AGC	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805347
23	NC_019907	AAC	2	6	1303	1308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805347
24	NC_019907	ATG	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805348
25	NC_019907	CTA	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805348
26	NC_019907	CAG	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805348
27	NC_019907	AAG	2	6	1703	1708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
28	NC_019907	AAG	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
29	NC_019907	CTT	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805348
30	NC_019907	AGA	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
31	NC_019907	GTT	2	6	1828	1833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805348
32	NC_019907	GAA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
33	NC_019907	ATA	2	6	1919	1924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805348
34	NC_019907	CTG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805348
35	NC_019907	TAA	2	6	2079	2084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805348
36	NC_019907	AAC	2	6	2112	2117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805348
37	NC_019907	TAT	2	6	2133	2138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805348
38	NC_019907	AGA	2	6	2214	2219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
39	NC_019907	TCA	2	6	2250	2255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805348
40	NC_019907	ATT	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805348
41	NC_019907	GCA	2	6	2515	2520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805348
42	NC_019907	TAG	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805348
43	NC_019907	GAT	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805348
44	NC_019907	CTT	2	6	2843	2848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805348
45	NC_019907	AAC	2	6	2981	2986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805348
46	NC_019907	ATC	2	6	2997	3002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805348
47	NC_019907	GAA	2	6	3055	3060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
48	NC_019907	ATT	2	6	3086	3091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805348
49	NC_019907	CTG	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805348
50	NC_019907	TAT	2	6	3231	3236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805348
51	NC_019907	AGA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
52	NC_019907	ACA	2	6	3339	3344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805349
53	NC_019907	CTA	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805349
54	NC_019907	TCT	2	6	3391	3396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805349
55	NC_019907	GTG	3	9	3491	3499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431805349
56	NC_019907	TAT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805349
57	NC_019907	ATA	2	6	3752	3757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805349
58	NC_019907	TAA	2	6	3804	3809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805349
59	NC_019907	AAT	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805349
60	NC_019907	TAT	2	6	3956	3961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805350
61	NC_019907	AGG	2	6	3980	3985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431805350
62	NC_019907	ACT	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805350
63	NC_019907	AGC	2	6	4028	4033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805350
64	NC_019907	TCT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805350
65	NC_019907	ATT	2	6	4197	4202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805350
66	NC_019907	GAA	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805350
67	NC_019907	TTA	2	6	4317	4322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805350
68	NC_019907	TCC	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431805350
69	NC_019907	AGC	2	6	4367	4372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805350
70	NC_019907	CAA	2	6	4530	4535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805350
71	NC_019907	GTT	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805350
72	NC_019907	AAT	2	6	4554	4559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805350
73	NC_019907	CTT	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805350
74	NC_019907	GCT	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805350
75	NC_019907	TGC	2	6	4787	4792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805351
76	NC_019907	ATA	2	6	4822	4827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805351
77	NC_019907	ATC	2	6	4880	4885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805351
78	NC_019907	AAT	2	6	4893	4898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805351
79	NC_019907	GAA	3	9	4917	4925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805351
80	NC_019907	TCG	2	6	4949	4954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805351
81	NC_019907	AGA	2	6	4994	4999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805351
82	NC_019907	AAT	2	6	5009	5014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805351
83	NC_019907	ACG	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805351
84	NC_019907	TGC	2	6	5036	5041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805351
85	NC_019907	TTA	2	6	5071	5076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805351
86	NC_019907	TTG	2	6	5116	5121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805351
87	NC_019907	AGA	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805351
88	NC_019907	ATT	2	6	5220	5225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805351
89	NC_019907	TTG	2	6	5371	5376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805351
90	NC_019907	TTC	2	6	5453	5458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805351
91	NC_019907	AAT	2	6	5486	5491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805351
92	NC_019907	GTG	2	6	5554	5559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431805351
93	NC_019907	TAT	2	6	5574	5579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805351
94	NC_019907	AGA	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805351
95	NC_019907	TTA	2	6	5613	5618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805351
96	NC_019907	ATT	2	6	5712	5717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805352
97	NC_019907	AGT	2	6	5718	5723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805352
98	NC_019907	AGC	2	6	5868	5873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805352
99	NC_019907	TAA	2	6	5994	5999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805352
100	NC_019907	CAT	2	6	6086	6091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805352
101	NC_019907	ATA	2	6	6100	6105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805352
102	NC_019907	AAT	2	6	6117	6122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805352
103	NC_019907	TTC	2	6	6138	6143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805352
104	NC_019907	TCC	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431805352
105	NC_019907	TTA	2	6	6224	6229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805352
106	NC_019907	GTT	2	6	6247	6252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805352
107	NC_019907	AAG	2	6	6270	6275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805352
108	NC_019907	ATC	2	6	6309	6314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805352
109	NC_019907	TGT	2	6	6393	6398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805352
110	NC_019907	GGA	2	6	6421	6426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431805352
111	NC_019907	TAA	2	6	6431	6436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805352
112	NC_019907	TAT	2	6	6483	6488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805352
113	NC_019907	TAA	2	6	6578	6583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805352
114	NC_019907	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805352
115	NC_019907	GTT	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805352
116	NC_019907	TTA	2	6	6762	6767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805353
117	NC_019907	TAA	2	6	6771	6776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805353
118	NC_019907	AGC	2	6	6808	6813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805353
119	NC_019907	ATT	2	6	6905	6910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805353
120	NC_019907	CTG	2	6	6942	6947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805353
121	NC_019907	AGA	2	6	6979	6984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805353
122	NC_019907	AAG	2	6	6991	6996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805353
123	NC_019907	ATA	2	6	7025	7030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805353
124	NC_019907	TAT	2	6	7056	7061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805353
125	NC_019907	GTT	2	6	7104	7109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805353
126	NC_019907	TAT	2	6	7153	7158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805353
127	NC_019907	TAA	2	6	7178	7183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805353
128	NC_019907	ATA	2	6	7233	7238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805353
129	NC_019907	AAT	2	6	7295	7300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805354
130	NC_019907	CTA	2	6	7492	7497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805354
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132	NC_019907	ATT	2	6	7557	7562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805354
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