MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Echinicola vietnamensis DSM 17526 chromosome

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019904	AATATT	2	12	63288	63299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019904	CAATGC	2	12	64796	64807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019904	TCTTTT	2	12	88956	88967	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019904	CTTTTT	2	12	119811	119822	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019904	ATAAAA	2	12	197684	197695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019904	ATTGAA	2	12	244562	244573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019904	CAAAAT	2	12	285703	285714	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019904	TTAATA	2	12	305961	305972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019904	TCAAGT	2	12	349241	349252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019904	CTTTTT	2	12	383628	383639	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019904	GTTTTT	2	12	403039	403050	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019904	GTTTTT	2	12	456429	456440	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019904	TTTTTA	2	12	457948	457959	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019904	CCTCAC	2	12	471948	471959	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019904	CCATGG	2	12	479548	479559	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019904	TATTCA	2	12	489014	489025	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019904	CTTTGT	2	12	492307	492318	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019904	ATAGTT	2	12	509599	509610	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019904	CTTTTT	2	12	512478	512489	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019904	AATTCA	2	12	543076	543087	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019904	GGAAAT	2	12	639134	639145	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019904	GCCAAC	2	12	640954	640965	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019904	TCATTT	2	12	656406	656417	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019904	TTTATT	2	12	681273	681284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019904	ATTCAC	2	12	724152	724163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019904	TTTATG	2	12	744463	744474	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019904	TTAAAA	2	12	760917	760928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019904	TGGGTT	2	12	791695	791706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019904	AAATTC	2	12	794493	794504	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019904	AACCTT	2	12	832018	832029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019904	TTACCC	2	12	875041	875052	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019904	CCACAT	2	12	895479	895490	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019904	ATTTAT	2	12	900543	900554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019904	TTTTAC	2	12	905482	905493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019904	ATAAAA	2	12	915410	915421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019904	ACGTGT	2	12	919787	919798	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019904	CATCAA	2	12	931679	931690	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019904	AATGTT	2	12	935369	935380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019904	AAAAGA	2	12	938146	938157	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019904	TTTATC	2	12	1037177	1037188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019904	ATTCAC	2	12	1043099	1043110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019904	ATGGTT	2	12	1137226	1137237	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019904	AAAACA	2	12	1151259	1151270	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019904	GAAAAA	2	12	1165527	1165538	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019904	AAAAGC	2	12	1169892	1169903	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019904	AATTTT	2	12	1194119	1194130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019904	ATGGAC	2	12	1211499	1211510	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019904	AAACGA	2	12	1231522	1231533	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019904	GGGAAG	2	12	1345534	1345545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019904	AGGAAG	2	12	1489925	1489936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019904	TACTTT	2	12	1512582	1512593	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019904	TCAAAA	2	12	1602062	1602073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019904	AGGAAA	2	12	1656993	1657004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019904	CGGTTT	2	12	1704790	1704801	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019904	TGATTG	2	12	1739326	1739337	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019904	CAAAAA	2	12	1740041	1740052	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019904	CATTTA	2	12	1760340	1760351	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019904	TGATTT	2	12	1766878	1766889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019904	TGAAAA	2	12	1832100	1832111	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019904	ATCCTG	2	12	1842770	1842781	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019904	AAATGG	2	12	1842902	1842913	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019904	AAAGAA	2	12	1866869	1866880	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019904	AGAACA	2	12	1870248	1870259	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019904	TTCAAA	2	12	1927265	1927276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019904	AACCAA	2	12	1965803	1965814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019904	CGGTTT	2	12	2027116	2027127	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019904	TTTAAT	2	12	2106821	2106832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019904	GCATTG	2	12	2109287	2109298	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019904	AAATTA	2	12	2160556	2160567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019904	CTTTTT	2	12	2160611	2160622	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019904	AATTAA	2	12	2160631	2160642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019904	GAAGGC	2	12	2331985	2331996	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019904	ATTCAC	2	12	2370012	2370023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019904	GATTTG	2	12	2392279	2392290	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019904	TTTTTG	2	12	2408984	2408995	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019904	AAATTA	2	12	2409422	2409433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019904	AAATAT	2	12	2525876	2525887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019904	CTTGAA	2	12	2577463	2577474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019904	GATTAA	2	12	2594265	2594276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019904	TACCAT	2	12	2654378	2654389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019904	AAAAGA	2	12	2701812	2701823	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019904	TAAATC	2	12	2718724	2718735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019904	ATTTTA	2	12	2774528	2774539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019904	ATTCCT	2	12	2806492	2806503	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019904	ATTAAA	2	12	2831910	2831921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019904	AAAACA	2	12	2837864	2837875	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019904	TGTTTT	2	12	2853940	2853951	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019904	TTTGCT	2	12	2875013	2875024	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019904	CGGTGT	2	12	2946684	2946695	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_019904	TTGGTT	2	12	2952697	2952708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019904	ATTCTA	2	12	2979079	2979090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019904	ATAAAA	2	12	3001513	3001524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019904	TAAACT	2	12	3009431	3009442	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019904	TTGGCC	2	12	3030560	3030571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019904	TTAAGG	2	12	3074878	3074889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019904	TCCGCT	2	12	3075861	3075872	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019904	TAATGA	2	12	3102407	3102418	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019904	TTAGAT	2	12	3125484	3125495	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019904	GATTTT	2	12	3222371	3222382	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019904	GTTTTA	2	12	3270573	3270584	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019904	TTAAAC	2	12	3346934	3346945	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019904	ATGATT	2	12	3393676	3393687	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019904	TGGAGA	2	12	3420074	3420085	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019904	CTTTTT	2	12	3448074	3448085	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019904	ACCGTC	2	12	3449618	3449629	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019904	TAAATA	2	12	3466864	3466875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019904	AGTTAA	2	12	3479721	3479732	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019904	GGTGAA	2	12	3513435	3513446	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019904	ATAGGG	2	12	3513490	3513501	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019904	AATTTT	2	12	3539565	3539576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019904	CTGAAA	2	12	3578042	3578053	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019904	TATATT	2	12	3586787	3586798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019904	TAGGGG	2	12	3650587	3650598	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019904	AAAGAA	2	12	3689714	3689725	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019904	CCAGCA	2	12	3701289	3701300	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019904	GTTTTA	2	12	3715990	3716001	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019904	ATGATT	2	12	3765653	3765664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019904	TTTTCA	2	12	3798677	3798688	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_019904	TCGCAT	2	12	3808020	3808031	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019904	ATTGCA	2	12	3824044	3824055	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019904	TGTAAC	2	12	3833251	3833262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_019904	AAATAA	2	12	3841162	3841173	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019904	TCTTTC	2	12	3846524	3846535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019904	TTTTTA	2	12	3846714	3846725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019904	TAAAAA	2	12	3849052	3849063	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019904	GAATTC	2	12	3862256	3862267	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_019904	TGCACA	2	12	3888623	3888634	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019904	GTGAAT	2	12	3909937	3909948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_019904	CCATAG	2	12	3951093	3951104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019904	ATGGAG	2	12	3951600	3951611	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019904	CATGAG	2	12	3976534	3976545	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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156	NC_019904	TATAAT	2	12	4552714	4552725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.