MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Echinicola vietnamensis DSM 17526 chromosome

Total Repeats: 4274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019904	GCCTG	2	10	1974	1983	0 %	20 %	40 %	40 %	431795412
2	NC_019904	TCATT	2	10	4437	4446	20 %	60 %	0 %	20 %	431795415
3	NC_019904	ATTTA	2	10	6343	6352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019904	ACATT	2	10	7150	7159	40 %	40 %	0 %	20 %	431795419
5	NC_019904	AGGAT	2	10	7628	7637	40 %	20 %	40 %	0 %	431795420
6	NC_019904	ATCCC	2	10	8722	8731	20 %	20 %	0 %	60 %	431795421
7	NC_019904	TTGAT	2	10	9139	9148	20 %	60 %	20 %	0 %	431795422
8	NC_019904	CTTAC	2	10	10007	10016	20 %	40 %	0 %	40 %	431795423
9	NC_019904	AAATC	2	10	11874	11883	60 %	20 %	0 %	20 %	431795424
10	NC_019904	TAAGT	2	10	12010	12019	40 %	40 %	20 %	0 %	431795424
11	NC_019904	ACCAC	2	10	13466	13475	40 %	0 %	0 %	60 %	431795424
12	NC_019904	GTTTG	2	10	13632	13641	0 %	60 %	40 %	0 %	431795424
13	NC_019904	TAAAT	2	10	14467	14476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019904	CAAAA	2	10	18693	18702	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019904	TCTAT	2	10	20760	20769	20 %	60 %	0 %	20 %	431795432
16	NC_019904	CTTGG	2	10	21826	21835	0 %	40 %	40 %	20 %	431795433
17	NC_019904	TTTAC	2	10	24356	24365	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019904	TTCAT	2	10	24937	24946	20 %	60 %	0 %	20 %	431795435
19	NC_019904	TGGAT	2	10	26877	26886	20 %	40 %	40 %	0 %	431795437
20	NC_019904	CCAGC	2	10	27807	27816	20 %	0 %	20 %	60 %	431795438
21	NC_019904	GGCAC	2	10	28645	28654	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_019904	AGACT	2	10	28879	28888	40 %	20 %	20 %	20 %	431795439
23	NC_019904	AGTTC	2	10	31620	31629	20 %	40 %	20 %	20 %	431795441
24	NC_019904	GATCT	2	10	34740	34749	20 %	40 %	20 %	20 %	431795444
25	NC_019904	TCCCT	2	10	37018	37027	0 %	40 %	0 %	60 %	431795447
26	NC_019904	ATTCA	2	10	37589	37598	40 %	40 %	0 %	20 %	431795448
27	NC_019904	CGAAT	2	10	38283	38292	40 %	20 %	20 %	20 %	431795450
28	NC_019904	ACTGC	2	10	38313	38322	20 %	20 %	20 %	40 %	431795450
29	NC_019904	AAATG	2	10	40756	40765	60 %	20 %	20 %	0 %	431795452
30	NC_019904	ATGCA	2	10	42351	42360	40 %	20 %	20 %	20 %	431795453
31	NC_019904	CCCTT	2	10	42409	42418	0 %	40 %	0 %	60 %	431795453
32	NC_019904	TTGTT	2	10	42675	42684	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019904	TCTTT	2	10	42903	42912	0 %	80 %	0 %	20 %	431795454
34	NC_019904	AACTA	2	10	44401	44410	60 %	20 %	0 %	20 %	431795455
35	NC_019904	TTACG	2	10	47655	47664	20 %	40 %	20 %	20 %	431795460
36	NC_019904	CTGAC	2	10	47840	47849	20 %	20 %	20 %	40 %	431795460
37	NC_019904	AAATC	2	10	49727	49736	60 %	20 %	0 %	20 %	431795462
38	NC_019904	CTCAT	2	10	51277	51286	20 %	40 %	0 %	40 %	431795463
39	NC_019904	TAAAT	2	10	53490	53499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019904	AAAAG	2	10	55737	55746	80 %	0 %	20 %	0 %	431795467
41	NC_019904	TACCT	2	10	57522	57531	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_019904	AGGAT	2	10	60596	60605	40 %	20 %	40 %	0 %	431795469
43	NC_019904	CTTCT	2	10	61704	61713	0 %	60 %	0 %	40 %	431795470
44	NC_019904	GCAGT	2	10	64189	64198	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019904	TTCAG	2	10	65005	65014	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019904	CTTCG	2	10	65722	65731	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_019904	TCGGT	2	10	66146	66155	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019904	CAATT	2	10	70193	70202	40 %	40 %	0 %	20 %	431795472
49	NC_019904	TACCC	2	10	70593	70602	20 %	20 %	0 %	60 %	431795473
50	NC_019904	CAAAA	2	10	71067	71076	80 %	0 %	0 %	20 %	431795474
51	NC_019904	AAACA	2	10	71648	71657	80 %	0 %	0 %	20 %	431795474
52	NC_019904	TTCTT	2	10	71692	71701	0 %	80 %	0 %	20 %	431795475
53	NC_019904	TCCTC	2	10	71876	71885	0 %	40 %	0 %	60 %	431795475
54	NC_019904	GCAGG	2	10	73601	73610	20 %	0 %	60 %	20 %	431795476
55	NC_019904	GCCAC	2	10	74678	74687	20 %	0 %	20 %	60 %	431795476
56	NC_019904	AAGAA	2	10	75013	75022	80 %	0 %	20 %	0 %	431795477
57	NC_019904	TAAAA	2	10	76911	76920	80 %	20 %	0 %	0 %	431795478
58	NC_019904	TTGGC	2	10	81583	81592	0 %	40 %	40 %	20 %	431795483
59	NC_019904	GAAAT	2	10	81851	81860	60 %	20 %	20 %	0 %	431795483
60	NC_019904	AGCCC	2	10	83004	83013	20 %	0 %	20 %	60 %	431795485
61	NC_019904	ATTTC	2	10	83765	83774	20 %	60 %	0 %	20 %	431795485
62	NC_019904	ACAAT	2	10	84020	84029	60 %	20 %	0 %	20 %	431795486
63	NC_019904	CAGCC	2	10	84770	84779	20 %	0 %	20 %	60 %	431795487
64	NC_019904	GAAAG	2	10	89659	89668	60 %	0 %	40 %	0 %	431795493
65	NC_019904	AAGCC	2	10	92066	92075	40 %	0 %	20 %	40 %	431795495
66	NC_019904	GGAAA	2	10	92834	92843	60 %	0 %	40 %	0 %	431795496
67	NC_019904	TTTTC	2	10	95436	95445	0 %	80 %	0 %	20 %	431795499
68	NC_019904	TCGCT	2	10	96598	96607	0 %	40 %	20 %	40 %	431795500
69	NC_019904	CTTTG	2	10	96920	96929	0 %	60 %	20 %	20 %	431795500
70	NC_019904	ATTTT	2	10	97467	97476	20 %	80 %	0 %	0 %	431795501
71	NC_019904	TGGCT	2	10	98233	98242	0 %	40 %	40 %	20 %	431795502
72	NC_019904	TTTGC	2	10	98938	98947	0 %	60 %	20 %	20 %	431795502
73	NC_019904	AACCC	2	10	100666	100675	40 %	0 %	0 %	60 %	431795505
74	NC_019904	CTTTG	2	10	100900	100909	0 %	60 %	20 %	20 %	431795505
75	NC_019904	CTTTT	2	10	103623	103632	0 %	80 %	0 %	20 %	431795511
76	NC_019904	TCCGG	2	10	104578	104587	0 %	20 %	40 %	40 %	431795512
77	NC_019904	CGCTA	2	10	105189	105198	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_019904	AATGA	2	10	107217	107226	60 %	20 %	20 %	0 %	431795515
79	NC_019904	TTCAA	2	10	109684	109693	40 %	40 %	0 %	20 %	431795517
80	NC_019904	CAAAC	2	10	110104	110113	60 %	0 %	0 %	40 %	431795518
81	NC_019904	GACCG	2	10	112516	112525	20 %	0 %	40 %	40 %	431795518
82	NC_019904	GAAAT	2	10	114503	114512	60 %	20 %	20 %	0 %	431795520
83	NC_019904	CACCG	2	10	114814	114823	20 %	0 %	20 %	60 %	431795520
84	NC_019904	CATAC	2	10	116790	116799	40 %	20 %	0 %	40 %	431795521
85	NC_019904	TTTTC	2	10	117647	117656	0 %	80 %	0 %	20 %	431795521
86	NC_019904	AATGT	2	10	118191	118200	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019904	GCTCA	2	10	118493	118502	20 %	20 %	20 %	40 %	431795522
88	NC_019904	CCTTT	2	10	118637	118646	0 %	60 %	0 %	40 %	431795522
89	NC_019904	CTCTC	2	10	118839	118848	0 %	40 %	0 %	60 %	431795522
90	NC_019904	GTCAT	2	10	119994	120003	20 %	40 %	20 %	20 %	431795523
91	NC_019904	GCTTT	2	10	121970	121979	0 %	60 %	20 %	20 %	431795524
92	NC_019904	AAAGG	2	10	122462	122471	60 %	0 %	40 %	0 %	431795525
93	NC_019904	CTGGT	2	10	122758	122767	0 %	40 %	40 %	20 %	431795525
94	NC_019904	CAAAT	2	10	123819	123828	60 %	20 %	0 %	20 %	431795526
95	NC_019904	ATCAA	2	10	124243	124252	60 %	20 %	0 %	20 %	431795526
96	NC_019904	CTACC	2	10	124666	124675	20 %	20 %	0 %	60 %	431795527
97	NC_019904	TATCC	2	10	124942	124951	20 %	40 %	0 %	40 %	431795527
98	NC_019904	GAATT	2	10	124979	124988	40 %	40 %	20 %	0 %	431795527
99	NC_019904	GAAAG	2	10	125870	125879	60 %	0 %	40 %	0 %	431795528
100	NC_019904	AAAAT	2	10	127489	127498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019904	CTTCA	2	10	127781	127790	20 %	40 %	0 %	40 %	431795532
102	NC_019904	TGTCA	2	10	128090	128099	20 %	40 %	20 %	20 %	431795532
103	NC_019904	CCCAC	2	10	129791	129800	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
104	NC_019904	TCATT	2	10	129894	129903	20 %	60 %	0 %	20 %	431795534
105	NC_019904	TAAAG	2	10	132166	132175	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019904	GGAAA	2	10	133539	133548	60 %	0 %	40 %	0 %	431795536
107	NC_019904	GGAAA	2	10	133641	133650	60 %	0 %	40 %	0 %	431795536
108	NC_019904	CAATA	2	10	136786	136795	60 %	20 %	0 %	20 %	431795540
109	NC_019904	CTTTA	2	10	137699	137708	20 %	60 %	0 %	20 %	431795541
110	NC_019904	ATCAA	2	10	139926	139935	60 %	20 %	0 %	20 %	431795542
111	NC_019904	ACTTG	2	10	142918	142927	20 %	40 %	20 %	20 %	431795546
112	NC_019904	CCTGG	2	10	145265	145274	0 %	20 %	40 %	40 %	431795548
113	NC_019904	TTAAA	2	10	148617	148626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019904	CTTTT	2	10	153624	153633	0 %	80 %	0 %	20 %	431795555
115	NC_019904	ACTCC	2	10	156544	156553	20 %	20 %	0 %	60 %	431795557
116	NC_019904	ATCAA	2	10	158896	158905	60 %	20 %	0 %	20 %	431795559
117	NC_019904	TTGCC	2	10	159786	159795	0 %	40 %	20 %	40 %	431795560
118	NC_019904	AGGCG	2	10	162511	162520	20 %	0 %	60 %	20 %	431795562
119	NC_019904	TAACT	2	10	162693	162702	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019904	CCTTT	2	10	164431	164440	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_019904	CATTT	2	10	164557	164566	20 %	60 %	0 %	20 %	431795564
122	NC_019904	AAAGG	2	10	165972	165981	60 %	0 %	40 %	0 %	431795565
123	NC_019904	CCCTG	2	10	171793	171802	0 %	20 %	20 %	60 %	431795570
124	NC_019904	AAGTT	2	10	173145	173154	40 %	40 %	20 %	0 %	431795571
125	NC_019904	CTTTT	2	10	175519	175528	0 %	80 %	0 %	20 %	431795573
126	NC_019904	TTGAT	2	10	177710	177719	20 %	60 %	20 %	0 %	431795573
127	NC_019904	TTCCA	2	10	179593	179602	20 %	40 %	0 %	40 %	431795574
128	NC_019904	AACTG	2	10	182638	182647	40 %	20 %	20 %	20 %	431795577
129	NC_019904	AGCCA	2	10	183285	183294	40 %	0 %	20 %	40 %	431795577
130	NC_019904	CACAT	2	10	184233	184242	40 %	20 %	0 %	40 %	431795577
131	NC_019904	TACCG	2	10	188255	188264	20 %	20 %	20 %	40 %	431795578
132	NC_019904	TTTGA	2	10	192142	192151	20 %	60 %	20 %	0 %	431795579
133	NC_019904	TCTAT	2	10	193508	193517	20 %	60 %	0 %	20 %	431795579
134	NC_019904	TGATG	2	10	194119	194128	20 %	40 %	40 %	0 %	431795580
135	NC_019904	TTCCT	2	10	194580	194589	0 %	60 %	0 %	40 %	431795580
136	NC_019904	TTCTT	2	10	195087	195096	0 %	80 %	0 %	20 %	431795580
137	NC_019904	TTTCA	2	10	197321	197330	20 %	60 %	0 %	20 %	431795582
138	NC_019904	AAAAC	2	10	198451	198460	80 %	0 %	0 %	20 %	431795584
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140	NC_019904	GATAT	2	10	200071	200080	40 %	40 %	20 %	0 %	431795585
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142	NC_019904	TTTTA	2	10	205198	205207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019904	AAATC	2	10	207238	207247	60 %	20 %	0 %	20 %	431795593
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147	NC_019904	TTTCC	2	10	217335	217344	0 %	60 %	0 %	40 %	431795602
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151	NC_019904	TCACT	2	10	225688	225697	20 %	40 %	0 %	40 %	431795608
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199	NC_019904	GTCCT	2	10	296634	296643	0 %	40 %	20 %	40 %	431795681
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236	NC_019904	CGCAC	2	10	347240	347249	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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248	NC_019904	TGACC	2	10	369849	369858	20 %	20 %	20 %	40 %	431795744
249	NC_019904	GCCCT	2	10	369920	369929	0 %	20 %	20 %	60 %	431795744
250	NC_019904	ATTTC	2	10	369938	369947	20 %	60 %	0 %	20 %	431795744
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252	NC_019904	GGATA	2	10	371366	371375	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
253	NC_019904	CGTTT	2	10	375356	375365	0 %	60 %	20 %	20 %	431795748
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255	NC_019904	CGTCC	2	10	377297	377306	0 %	20 %	20 %	60 %	431795748
256	NC_019904	CCTAT	2	10	379644	379653	20 %	40 %	0 %	40 %	431795748
257	NC_019904	ATCGA	2	10	382934	382943	40 %	20 %	20 %	20 %	431795751
258	NC_019904	CCCTT	2	10	384565	384574	0 %	40 %	0 %	60 %	431795752
259	NC_019904	AGATC	2	10	388600	388609	40 %	20 %	20 %	20 %	431795757
260	NC_019904	TGGCA	2	10	388960	388969	20 %	20 %	40 %	20 %	431795757
261	NC_019904	GGCTA	2	10	389415	389424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
262	NC_019904	ATGGA	2	10	390016	390025	40 %	20 %	40 %	0 %	431795758
263	NC_019904	TGCAG	2	10	390285	390294	20 %	20 %	40 %	20 %	431795759
264	NC_019904	CTGAC	2	10	392084	392093	20 %	20 %	20 %	40 %	431795760
265	NC_019904	GAATG	2	10	393213	393222	40 %	20 %	40 %	0 %	431795761
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267	NC_019904	TGCCA	2	10	393431	393440	20 %	20 %	20 %	40 %	431795761
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399	NC_019904	AAAAC	2	10	552657	552666	80 %	0 %	0 %	20 %	431795886
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