MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfitobacterium dichloroeliminans LMG P-21439 chromosome

Total Repeats: 2517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019903	GTTGT	2	10	2283	2292	0 %	60 %	40 %	0 %	431792072
2	NC_019903	GCTTA	2	10	2643	2652	20 %	40 %	20 %	20 %	431792072
3	NC_019903	ACGGG	2	10	2941	2950	20 %	0 %	60 %	20 %	431792072
4	NC_019903	AGAAA	2	10	3507	3516	80 %	0 %	20 %	0 %	431792073
5	NC_019903	TAAAT	2	10	4036	4045	60 %	40 %	0 %	0 %	431792073
6	NC_019903	GAAAA	2	10	4481	4490	80 %	0 %	20 %	0 %	431792074
7	NC_019903	TTTCT	2	10	4518	4527	0 %	80 %	0 %	20 %	431792074
8	NC_019903	AATAT	2	10	9272	9281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019903	GCTGG	2	10	9559	9568	0 %	20 %	60 %	20 %	431792077
10	NC_019903	GAGCG	2	10	12439	12448	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019903	CAAAA	2	10	14267	14276	80 %	0 %	0 %	20 %	431792082
12	NC_019903	TCTAC	2	10	14959	14968	20 %	40 %	0 %	40 %	431792082
13	NC_019903	AAGGT	2	10	16094	16103	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019903	GCTCT	2	10	16983	16992	0 %	40 %	20 %	40 %	431792084
15	NC_019903	GAAAA	2	10	17473	17482	80 %	0 %	20 %	0 %	431792084
16	NC_019903	TGGTT	2	10	17537	17546	0 %	60 %	40 %	0 %	431792084
17	NC_019903	GTGGA	2	10	21386	21395	20 %	20 %	60 %	0 %	431792088
18	NC_019903	GCAGA	2	10	21880	21889	40 %	0 %	40 %	20 %	431792088
19	NC_019903	AAGAT	2	10	23777	23786	60 %	20 %	20 %	0 %	431792089
20	NC_019903	CGTTC	2	10	24918	24927	0 %	40 %	20 %	40 %	431792090
21	NC_019903	AGGAA	2	10	26746	26755	60 %	0 %	40 %	0 %	431792092
22	NC_019903	CCCAA	2	10	26787	26796	40 %	0 %	0 %	60 %	431792092
23	NC_019903	TGGAC	2	10	30970	30979	20 %	20 %	40 %	20 %	431792095
24	NC_019903	AAACT	2	10	31147	31156	60 %	20 %	0 %	20 %	431792096
25	NC_019903	AAAGG	2	10	31634	31643	60 %	0 %	40 %	0 %	431792097
26	NC_019903	ATATT	2	10	32926	32935	40 %	60 %	0 %	0 %	431792099
27	NC_019903	CTTAG	2	10	39162	39171	20 %	40 %	20 %	20 %	431792104
28	NC_019903	CTGGT	2	10	40850	40859	0 %	40 %	40 %	20 %	431792105
29	NC_019903	ATTAC	2	10	41364	41373	40 %	40 %	0 %	20 %	431792106
30	NC_019903	TGAAG	2	10	41900	41909	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019903	AAAAT	2	10	43660	43669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019903	GGTTG	2	10	44616	44625	0 %	40 %	60 %	0 %	431792108
33	NC_019903	TGATT	2	10	45473	45482	20 %	60 %	20 %	0 %	431792108
34	NC_019903	TAAGG	2	10	47018	47027	40 %	20 %	40 %	0 %	431792110
35	NC_019903	CCAAT	2	10	48263	48272	40 %	20 %	0 %	40 %	431792111
36	NC_019903	GCCAA	2	10	48957	48966	40 %	0 %	20 %	40 %	431792112
37	NC_019903	GCTGG	2	10	51868	51877	0 %	20 %	60 %	20 %	431792114
38	NC_019903	AAGGT	2	10	52064	52073	40 %	20 %	40 %	0 %	431792114
39	NC_019903	GAGTG	2	10	53266	53275	20 %	20 %	60 %	0 %	431792115
40	NC_019903	ATGTT	2	10	54594	54603	20 %	60 %	20 %	0 %	431792116
41	NC_019903	AATAT	2	10	56133	56142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019903	TGAAA	2	10	60124	60133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019903	AGCCA	2	10	60981	60990	40 %	0 %	20 %	40 %	431792124
44	NC_019903	TCGAG	2	10	61681	61690	20 %	20 %	40 %	20 %	431792124
45	NC_019903	AGGAT	2	10	62461	62470	40 %	20 %	40 %	0 %	431792125
46	NC_019903	TGGGT	2	10	62471	62480	0 %	40 %	60 %	0 %	431792125
47	NC_019903	AAAGT	2	10	62690	62699	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019903	TTTGC	2	10	63472	63481	0 %	60 %	20 %	20 %	431792128
49	NC_019903	AGCTG	2	10	64280	64289	20 %	20 %	40 %	20 %	431792128
50	NC_019903	GCGGA	2	10	64767	64776	20 %	0 %	60 %	20 %	431792128
51	NC_019903	GTCGG	2	10	66286	66295	0 %	20 %	60 %	20 %	431792128
52	NC_019903	AAGAA	2	10	67395	67404	80 %	0 %	20 %	0 %	431792129
53	NC_019903	CTGAG	2	10	67962	67971	20 %	20 %	40 %	20 %	431792129
54	NC_019903	GAAGT	2	10	69548	69557	40 %	20 %	40 %	0 %	431792131
55	NC_019903	ATCAA	2	10	70056	70065	60 %	20 %	0 %	20 %	431792131
56	NC_019903	TGGGG	2	10	71780	71789	0 %	20 %	80 %	0 %	431792135
57	NC_019903	GATTT	2	10	71812	71821	20 %	60 %	20 %	0 %	431792135
58	NC_019903	AAGGG	2	10	72553	72562	40 %	0 %	60 %	0 %	431792136
59	NC_019903	GCCCC	2	10	73296	73305	0 %	0 %	20 %	80 %	431792138
60	NC_019903	GATGG	2	10	75258	75267	20 %	20 %	60 %	0 %	431792139
61	NC_019903	GAAGA	2	10	76052	76061	60 %	0 %	40 %	0 %	431792140
62	NC_019903	GAAAA	2	10	77867	77876	80 %	0 %	20 %	0 %	431792141
63	NC_019903	CCGGA	2	10	78615	78624	20 %	0 %	40 %	40 %	431792141
64	NC_019903	AGAAA	2	10	79333	79342	80 %	0 %	20 %	0 %	431792141
65	NC_019903	GGATC	2	10	83405	83414	20 %	20 %	40 %	20 %	431792146
66	NC_019903	CCAAG	2	10	83768	83777	40 %	0 %	20 %	40 %	431792146
67	NC_019903	CTAGG	2	10	83837	83846	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019903	AGTAG	2	10	86070	86079	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019903	GGGAA	2	10	87009	87018	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019903	TGATA	2	10	87288	87297	40 %	40 %	20 %	0 %	431792151
71	NC_019903	ACCTA	2	10	87335	87344	40 %	20 %	0 %	40 %	431792151
72	NC_019903	CCATT	2	10	90014	90023	20 %	40 %	0 %	40 %	431792153
73	NC_019903	CCGGT	2	10	90299	90308	0 %	20 %	40 %	40 %	431792154
74	NC_019903	ATTTT	2	10	91968	91977	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019903	TCGTG	2	10	92593	92602	0 %	40 %	40 %	20 %	431792156
76	NC_019903	CCTAA	2	10	95851	95860	40 %	20 %	0 %	40 %	431792159
77	NC_019903	AGTAA	2	10	96338	96347	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019903	TCGTG	2	10	97871	97880	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019903	GAAGC	2	10	98057	98066	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019903	GGGAG	2	10	99412	99421	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019903	CCGTA	2	10	100684	100693	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_019903	AGAGG	2	10	100910	100919	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019903	TTGAA	2	10	100939	100948	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019903	GACAG	2	10	101106	101115	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_019903	CGGAT	2	10	101789	101798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019903	TTTGA	2	10	104897	104906	20 %	60 %	20 %	0 %	431792163
87	NC_019903	TCAGC	2	10	107184	107193	20 %	20 %	20 %	40 %	431792165
88	NC_019903	GAGAT	2	10	107331	107340	40 %	20 %	40 %	0 %	431792165
89	NC_019903	ATTTA	2	10	108620	108629	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019903	ATTTC	2	10	108733	108742	20 %	60 %	0 %	20 %	431792166
91	NC_019903	TGGTC	2	10	108928	108937	0 %	40 %	40 %	20 %	431792166
92	NC_019903	TCCTC	2	10	109231	109240	0 %	40 %	0 %	60 %	431792166
93	NC_019903	CTTTT	2	10	110521	110530	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019903	AAAAG	2	10	114883	114892	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019903	TGGTT	2	10	115318	115327	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019903	TTCGT	2	10	118168	118177	0 %	60 %	20 %	20 %	431792171
97	NC_019903	ATTTG	2	10	118817	118826	20 %	60 %	20 %	0 %	431792171
98	NC_019903	AATCA	2	10	119355	119364	60 %	20 %	0 %	20 %	431792172
99	NC_019903	GCTCG	2	10	126813	126822	0 %	20 %	40 %	40 %	431792176
100	NC_019903	AGGAT	2	10	127426	127435	40 %	20 %	40 %	0 %	431792176
101	NC_019903	TTTGT	2	10	129246	129255	0 %	80 %	20 %	0 %	431792177
102	NC_019903	CTTGA	2	10	130151	130160	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019903	GAATC	2	10	131225	131234	40 %	20 %	20 %	20 %	431792179
104	NC_019903	AGATT	2	10	132260	132269	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019903	CTTAC	2	10	132421	132430	20 %	40 %	0 %	40 %	431792181
106	NC_019903	TTTCT	2	10	132732	132741	0 %	80 %	0 %	20 %	431792181
107	NC_019903	GAAAA	2	10	133390	133399	80 %	0 %	20 %	0 %	431792182
108	NC_019903	AGTGC	2	10	135432	135441	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019903	TCAAT	2	10	137543	137552	40 %	40 %	0 %	20 %	431792186
110	NC_019903	TTTCA	2	10	140844	140853	20 %	60 %	0 %	20 %	431792188
111	NC_019903	TTCCT	2	10	141057	141066	0 %	60 %	0 %	40 %	431792189
112	NC_019903	TTTAG	2	10	142160	142169	20 %	60 %	20 %	0 %	431792189
113	NC_019903	CCTTC	2	10	142300	142309	0 %	40 %	0 %	60 %	431792189
114	NC_019903	TTGCT	2	10	145400	145409	0 %	60 %	20 %	20 %	431792192
115	NC_019903	CCATG	2	10	146048	146057	20 %	20 %	20 %	40 %	431792193
116	NC_019903	CAAAG	2	10	147018	147027	60 %	0 %	20 %	20 %	431792196
117	NC_019903	TCTGA	2	10	148519	148528	20 %	40 %	20 %	20 %	431792197
118	NC_019903	ATGAT	2	10	149626	149635	40 %	40 %	20 %	0 %	431792198
119	NC_019903	AAATC	2	10	151569	151578	60 %	20 %	0 %	20 %	431792200
120	NC_019903	CGATA	2	10	152710	152719	40 %	20 %	20 %	20 %	431792201
121	NC_019903	AAAGG	2	10	154488	154497	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019903	GCATA	2	10	158156	158165	40 %	20 %	20 %	20 %	431792204
123	NC_019903	GTTAA	2	10	158822	158831	40 %	40 %	20 %	0 %	431792205
124	NC_019903	CGATT	2	10	158888	158897	20 %	40 %	20 %	20 %	431792205
125	NC_019903	TGGCT	2	10	160595	160604	0 %	40 %	40 %	20 %	431792206
126	NC_019903	CTTCC	2	10	162837	162846	0 %	40 %	0 %	60 %	431792208
127	NC_019903	CATGG	2	10	163292	163301	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019903	ACGAT	2	10	163941	163950	40 %	20 %	20 %	20 %	431792209
129	NC_019903	GGGCA	2	10	164968	164977	20 %	0 %	60 %	20 %	431792210
130	NC_019903	TGCCA	2	10	166161	166170	20 %	20 %	20 %	40 %	431792212
131	NC_019903	ATTGA	2	10	166218	166227	40 %	40 %	20 %	0 %	431792212
132	NC_019903	AAAGA	2	10	166571	166580	80 %	0 %	20 %	0 %	431792214
133	NC_019903	ATGCC	2	10	168215	168224	20 %	20 %	20 %	40 %	431792217
134	NC_019903	GGGAT	2	10	171832	171841	20 %	20 %	60 %	0 %	431792220
135	NC_019903	GGGAA	2	10	172342	172351	40 %	0 %	60 %	0 %	431792220
136	NC_019903	ATTTT	2	10	174715	174724	20 %	80 %	0 %	0 %	431792223
137	NC_019903	AAGGA	2	10	177297	177306	60 %	0 %	40 %	0 %	431792227
138	NC_019903	TTTTC	2	10	177751	177760	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_019903	CCGTA	2	10	231572	231581	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
182	NC_019903	AGAGG	2	10	231798	231807	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_019903	TGTCA	2	10	318938	318947	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_019903	CTAAC	2	10	339246	339255	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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404	NC_019903	CAAGC	2	10	536772	536781	40 %	0 %	20 %	40 %	431792547
405	NC_019903	AAGGC	2	10	541342	541351	40 %	0 %	40 %	20 %	431792552
406	NC_019903	ATCTG	2	10	543321	543330	20 %	40 %	20 %	20 %	431792553
407	NC_019903	AAGCC	2	10	545365	545374	40 %	0 %	20 %	40 %	431792554
408	NC_019903	TTTTG	2	10	546746	546755	0 %	80 %	20 %	0 %	431792555
409	NC_019903	TATAG	2	10	547365	547374	40 %	40 %	20 %	0 %	431792555
410	NC_019903	CCGTC	2	10	554613	554622	0 %	20 %	20 %	60 %	431792560
411	NC_019903	ATGCC	2	10	556189	556198	20 %	20 %	20 %	40 %	431792562
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416	NC_019903	GTTGA	2	10	561572	561581	20 %	40 %	40 %	0 %	431792566
417	NC_019903	AAATT	2	10	562553	562562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_019903	TGGGA	2	10	565626	565635	20 %	20 %	60 %	0 %	431792570
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421	NC_019903	CCCAA	2	10	570334	570343	40 %	0 %	0 %	60 %	431792575
422	NC_019903	AATTG	2	10	573249	573258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_019903	TAAGA	2	10	585062	585071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
431	NC_019903	AAGGG	2	10	586231	586240	40 %	0 %	60 %	0 %	431792589
432	NC_019903	ATACC	2	10	587126	587135	40 %	20 %	0 %	40 %	431792589
433	NC_019903	AACAC	2	10	587669	587678	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
434	NC_019903	TCTCA	2	10	588047	588056	20 %	40 %	0 %	40 %	431792590
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437	NC_019903	TGCTT	2	10	589174	589183	0 %	60 %	20 %	20 %	431792590
438	NC_019903	GCAGA	2	10	594928	594937	40 %	0 %	40 %	20 %	431792596
439	NC_019903	CTATA	2	10	599247	599256	40 %	40 %	0 %	20 %	431792601
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442	NC_019903	CAAGT	2	10	600952	600961	40 %	20 %	20 %	20 %	431792602
443	NC_019903	AGAAA	2	10	601194	601203	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
444	NC_019903	GTTGA	2	10	601913	601922	20 %	40 %	40 %	0 %	431792603
445	NC_019903	AAATT	2	10	602894	602903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_019903	GAAAA	2	10	602969	602978	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
447	NC_019903	CTTTG	2	10	606159	606168	0 %	60 %	20 %	20 %	431792606
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451	NC_019903	CTCAC	2	10	614545	614554	20 %	20 %	0 %	60 %	431792613
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454	NC_019903	GGGCA	2	10	616531	616540	20 %	0 %	60 %	20 %	431792614
455	NC_019903	AAAAG	2	10	620179	620188	80 %	0 %	20 %	0 %	431792617
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