MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 2449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019902	TTGGC	2	10	856	865	0 %	40 %	40 %	20 %	430759340
2	NC_019902	CGCAT	2	10	1664	1673	20 %	20 %	20 %	40 %	430759340
3	NC_019902	GCCAG	2	10	4932	4941	20 %	0 %	40 %	40 %	430759342
4	NC_019902	CGCGG	2	10	14031	14040	0 %	0 %	60 %	40 %	430759355
5	NC_019902	GGGGC	2	10	16505	16514	0 %	0 %	80 %	20 %	430759358
6	NC_019902	CCAGT	2	10	18641	18650	20 %	20 %	20 %	40 %	430759363
7	NC_019902	GCCCG	2	10	19083	19092	0 %	0 %	40 %	60 %	430759364
8	NC_019902	GCGCC	2	10	22600	22609	0 %	0 %	40 %	60 %	430759370
9	NC_019902	GTCGC	2	10	23077	23086	0 %	20 %	40 %	40 %	430759371
10	NC_019902	GCGAG	2	10	24703	24712	20 %	0 %	60 %	20 %	430759374
11	NC_019902	GCGCA	2	10	26607	26616	20 %	0 %	40 %	40 %	430759378
12	NC_019902	CCCGA	2	10	34470	34479	20 %	0 %	20 %	60 %	430759385
13	NC_019902	GAGGT	2	10	36112	36121	20 %	20 %	60 %	0 %	430759386
14	NC_019902	ATCGC	2	10	37362	37371	20 %	20 %	20 %	40 %	430759388
15	NC_019902	TTGCA	2	10	37523	37532	20 %	40 %	20 %	20 %	430759388
16	NC_019902	CCGAG	2	10	39243	39252	20 %	0 %	40 %	40 %	430759389
17	NC_019902	CGAGC	2	10	41840	41849	20 %	0 %	40 %	40 %	430759393
18	NC_019902	TGGCC	2	10	42442	42451	0 %	20 %	40 %	40 %	430759394
19	NC_019902	TCCAG	2	10	43792	43801	20 %	20 %	20 %	40 %	430759394
20	NC_019902	CGCGA	2	10	44646	44655	20 %	0 %	40 %	40 %	430759395
21	NC_019902	GCCGA	2	10	45159	45168	20 %	0 %	40 %	40 %	430759395
22	NC_019902	TGCGC	2	10	46164	46173	0 %	20 %	40 %	40 %	430759397
23	NC_019902	ACCGG	2	10	47586	47595	20 %	0 %	40 %	40 %	430759399
24	NC_019902	ATCGC	2	10	48926	48935	20 %	20 %	20 %	40 %	430759400
25	NC_019902	CCGGT	2	10	49082	49091	0 %	20 %	40 %	40 %	430759400
26	NC_019902	CGGGG	2	10	50459	50468	0 %	0 %	80 %	20 %	430759401
27	NC_019902	GGGCC	2	10	54417	54426	0 %	0 %	60 %	40 %	430759404
28	NC_019902	CCCGG	2	10	58435	58444	0 %	0 %	40 %	60 %	430759410
29	NC_019902	GGTCG	2	10	58527	58536	0 %	20 %	60 %	20 %	430759410
30	NC_019902	CATCG	2	10	58586	58595	20 %	20 %	20 %	40 %	430759410
31	NC_019902	CGCGT	2	10	62201	62210	0 %	20 %	40 %	40 %	430759412
32	NC_019902	CGGTG	2	10	66422	66431	0 %	20 %	60 %	20 %	430759418
33	NC_019902	CGCGC	2	10	69178	69187	0 %	0 %	40 %	60 %	430759421
34	NC_019902	GTCGA	2	10	69492	69501	20 %	20 %	40 %	20 %	430759422
35	NC_019902	GCCGG	2	10	70446	70455	0 %	0 %	60 %	40 %	430759422
36	NC_019902	CCTGC	2	10	70898	70907	0 %	20 %	20 %	60 %	430759423
37	NC_019902	GATGT	2	10	71305	71314	20 %	40 %	40 %	0 %	430759424
38	NC_019902	CGCGG	2	10	73003	73012	0 %	0 %	60 %	40 %	430759426
39	NC_019902	CGGCG	2	10	77244	77253	0 %	0 %	60 %	40 %	430759428
40	NC_019902	CGGCG	2	10	77480	77489	0 %	0 %	60 %	40 %	430759428
41	NC_019902	GCCCA	2	10	82667	82676	20 %	0 %	20 %	60 %	430759432
42	NC_019902	CTGGG	2	10	86895	86904	0 %	20 %	60 %	20 %	430759439
43	NC_019902	CGGCC	2	10	87419	87428	0 %	0 %	40 %	60 %	430759439
44	NC_019902	CGCGC	2	10	89555	89564	0 %	0 %	40 %	60 %	430759440
45	NC_019902	CGAGC	2	10	92060	92069	20 %	0 %	40 %	40 %	430759444
46	NC_019902	CGCTG	2	10	93714	93723	0 %	20 %	40 %	40 %	430759446
47	NC_019902	TCATC	2	10	95261	95270	20 %	40 %	0 %	40 %	430759447
48	NC_019902	GTGCG	2	10	98345	98354	0 %	20 %	60 %	20 %	430759449
49	NC_019902	CAGCT	2	10	98473	98482	20 %	20 %	20 %	40 %	430759449
50	NC_019902	TGGCT	2	10	105054	105063	0 %	40 %	40 %	20 %	430759454
51	NC_019902	AGATG	2	10	106652	106661	40 %	20 %	40 %	0 %	430759454
52	NC_019902	GGCCG	2	10	107479	107488	0 %	0 %	60 %	40 %	430759454
53	NC_019902	CGGCG	2	10	110555	110564	0 %	0 %	60 %	40 %	430759456
54	NC_019902	GCTCG	2	10	113663	113672	0 %	20 %	40 %	40 %	430759459
55	NC_019902	CGCGC	2	10	113935	113944	0 %	0 %	40 %	60 %	430759459
56	NC_019902	TCCCA	2	10	114167	114176	20 %	20 %	0 %	60 %	430759460
57	NC_019902	TGTGC	2	10	114349	114358	0 %	40 %	40 %	20 %	430759461
58	NC_019902	GCGCC	2	10	114597	114606	0 %	0 %	40 %	60 %	430759461
59	NC_019902	CTGCG	2	10	115189	115198	0 %	20 %	40 %	40 %	430759463
60	NC_019902	CCATC	2	10	118674	118683	20 %	20 %	0 %	60 %	430759465
61	NC_019902	GCGCC	2	10	119272	119281	0 %	0 %	40 %	60 %	430759467
62	NC_019902	ATTTC	2	10	122715	122724	20 %	60 %	0 %	20 %	430759470
63	NC_019902	GCCGG	2	10	123122	123131	0 %	0 %	60 %	40 %	430759470
64	NC_019902	GGTGT	2	10	123383	123392	0 %	40 %	60 %	0 %	430759470
65	NC_019902	TGAAC	2	10	124674	124683	40 %	20 %	20 %	20 %	430759471
66	NC_019902	GCGCT	2	10	126111	126120	0 %	20 %	40 %	40 %	430759472
67	NC_019902	GGCGG	2	10	127125	127134	0 %	0 %	80 %	20 %	430759472
68	NC_019902	CGCTG	2	10	127919	127928	0 %	20 %	40 %	40 %	430759472
69	NC_019902	GGGAC	2	10	129571	129580	20 %	0 %	60 %	20 %	430759474
70	NC_019902	CGTTC	2	10	130135	130144	0 %	40 %	20 %	40 %	430759474
71	NC_019902	GCCGC	2	10	132472	132481	0 %	0 %	40 %	60 %	430759475
72	NC_019902	CGGAC	2	10	132566	132575	20 %	0 %	40 %	40 %	430759475
73	NC_019902	CCGCG	2	10	133155	133164	0 %	0 %	40 %	60 %	430759475
74	NC_019902	CCGGC	2	10	133206	133215	0 %	0 %	40 %	60 %	430759475
75	NC_019902	CGCGG	2	10	133332	133341	0 %	0 %	60 %	40 %	430759475
76	NC_019902	ACCCA	2	10	135292	135301	40 %	0 %	0 %	60 %	430759477
77	NC_019902	TGCGC	2	10	138453	138462	0 %	20 %	40 %	40 %	430759481
78	NC_019902	GCGCG	2	10	138583	138592	0 %	0 %	60 %	40 %	430759481
79	NC_019902	TGCCG	2	10	138607	138616	0 %	20 %	40 %	40 %	430759481
80	NC_019902	GACCT	2	10	138994	139003	20 %	20 %	20 %	40 %	430759481
81	NC_019902	CGCTG	2	10	139511	139520	0 %	20 %	40 %	40 %	430759481
82	NC_019902	ACTGG	2	10	140034	140043	20 %	20 %	40 %	20 %	430759481
83	NC_019902	CGGGG	2	10	140046	140055	0 %	0 %	80 %	20 %	430759481
84	NC_019902	GCCTG	2	10	140105	140114	0 %	20 %	40 %	40 %	430759481
85	NC_019902	CGGGA	2	10	147405	147414	20 %	0 %	60 %	20 %	430759488
86	NC_019902	GAGGC	2	10	147444	147453	20 %	0 %	60 %	20 %	430759488
87	NC_019902	CGGTG	2	10	147848	147857	0 %	20 %	60 %	20 %	430759489
88	NC_019902	GGGCC	2	10	148986	148995	0 %	0 %	60 %	40 %	430759489
89	NC_019902	TGCGC	2	10	149147	149156	0 %	20 %	40 %	40 %	430759489
90	NC_019902	CTGGA	2	10	149461	149470	20 %	20 %	40 %	20 %	430759489
91	NC_019902	CGCGG	2	10	150057	150066	0 %	0 %	60 %	40 %	430759489
92	NC_019902	GGCCG	2	10	150796	150805	0 %	0 %	60 %	40 %	430759490
93	NC_019902	ACCCG	2	10	151008	151017	20 %	0 %	20 %	60 %	430759490
94	NC_019902	ACAGA	2	10	154015	154024	60 %	0 %	20 %	20 %	430759494
95	NC_019902	TGGGC	2	10	155467	155476	0 %	20 %	60 %	20 %	430759495
96	NC_019902	CTGCG	2	10	159228	159237	0 %	20 %	40 %	40 %	430759499
97	NC_019902	CTGCA	2	10	159991	160000	20 %	20 %	20 %	40 %	430759500
98	NC_019902	GGGGC	2	10	160031	160040	0 %	0 %	80 %	20 %	430759500
99	NC_019902	AGCGC	2	10	160841	160850	20 %	0 %	40 %	40 %	430759501
100	NC_019902	CCCGG	2	10	163182	163191	0 %	0 %	40 %	60 %	430759503
101	NC_019902	CGGCG	2	10	163643	163652	0 %	0 %	60 %	40 %	430759504
102	NC_019902	TCCAG	2	10	166294	166303	20 %	20 %	20 %	40 %	430759505
103	NC_019902	GGGCG	2	10	167713	167722	0 %	0 %	80 %	20 %	430759506
104	NC_019902	TGCGC	2	10	171248	171257	0 %	20 %	40 %	40 %	430759510
105	NC_019902	GGCAT	2	10	172925	172934	20 %	20 %	40 %	20 %	430759511
106	NC_019902	ATCGC	2	10	173938	173947	20 %	20 %	20 %	40 %	430759512
107	NC_019902	GGGTC	2	10	177972	177981	0 %	20 %	60 %	20 %	430759517
108	NC_019902	TCGCT	2	10	178574	178583	0 %	40 %	20 %	40 %	430759517
109	NC_019902	CCGGG	2	10	179108	179117	0 %	0 %	60 %	40 %	430759518
110	NC_019902	GGTGT	2	10	179303	179312	0 %	40 %	60 %	0 %	430759518
111	NC_019902	GCGAG	2	10	179434	179443	20 %	0 %	60 %	20 %	430759518
112	NC_019902	GGGCT	2	10	180275	180284	0 %	20 %	60 %	20 %	430759519
113	NC_019902	GCGCC	2	10	180476	180485	0 %	0 %	40 %	60 %	430759519
114	NC_019902	GGCGT	2	10	181016	181025	0 %	20 %	60 %	20 %	430759520
115	NC_019902	GGCCT	2	10	181148	181157	0 %	20 %	40 %	40 %	430759520
116	NC_019902	CCGCG	2	10	182178	182187	0 %	0 %	40 %	60 %	430759521
117	NC_019902	CGAGC	2	10	184862	184871	20 %	0 %	40 %	40 %	430759524
118	NC_019902	CTTCG	2	10	185524	185533	0 %	40 %	20 %	40 %	430759526
119	NC_019902	CTGGC	2	10	187039	187048	0 %	20 %	40 %	40 %	430759528
120	NC_019902	CATGG	2	10	190066	190075	20 %	20 %	40 %	20 %	430759531
121	NC_019902	CGCGC	2	10	193198	193207	0 %	0 %	40 %	60 %	430759534
122	NC_019902	GGGGA	2	10	195286	195295	20 %	0 %	80 %	0 %	430759534
123	NC_019902	GCCCG	2	10	195659	195668	0 %	0 %	40 %	60 %	430759534
124	NC_019902	TTCCT	2	10	196155	196164	0 %	60 %	0 %	40 %	430759537
125	NC_019902	CGCCC	2	10	196187	196196	0 %	0 %	20 %	80 %	430759537
126	NC_019902	CGCAG	2	10	196749	196758	20 %	0 %	40 %	40 %	430759538
127	NC_019902	GAACG	2	10	197602	197611	40 %	0 %	40 %	20 %	430759540
128	NC_019902	CGGCG	2	10	199870	199879	0 %	0 %	60 %	40 %	430759542
129	NC_019902	CGGGT	2	10	201420	201429	0 %	20 %	60 %	20 %	430759544
130	NC_019902	GGGCT	2	10	202449	202458	0 %	20 %	60 %	20 %	430759544
131	NC_019902	ACGGA	2	10	202866	202875	40 %	0 %	40 %	20 %	430759545
132	NC_019902	CTGCG	2	10	207429	207438	0 %	20 %	40 %	40 %	430759550
133	NC_019902	GCACC	2	10	207468	207477	20 %	0 %	20 %	60 %	430759550
134	NC_019902	GCGAT	2	10	209683	209692	20 %	20 %	40 %	20 %	430759552
135	NC_019902	GTACC	2	10	209771	209780	20 %	20 %	20 %	40 %	430759552
136	NC_019902	GTTCC	2	10	210747	210756	0 %	40 %	20 %	40 %	430759553
137	NC_019902	GGGCC	2	10	211927	211936	0 %	0 %	60 %	40 %	430759554
138	NC_019902	GGTCG	2	10	215264	215273	0 %	20 %	60 %	20 %	430759557
139	NC_019902	GCCGC	2	10	215714	215723	0 %	0 %	40 %	60 %	430759557
140	NC_019902	CGATG	2	10	216468	216477	20 %	20 %	40 %	20 %	430759558
141	NC_019902	GTGCG	2	10	218638	218647	0 %	20 %	60 %	20 %	430759560
142	NC_019902	GCCTT	2	10	218780	218789	0 %	40 %	20 %	40 %	430759560
143	NC_019902	GCGCC	2	10	219813	219822	0 %	0 %	40 %	60 %	430759561
144	NC_019902	GGACG	2	10	222427	222436	20 %	0 %	60 %	20 %	430759563
145	NC_019902	TCGGC	2	10	226934	226943	0 %	20 %	40 %	40 %	430759567
146	NC_019902	CGCAG	2	10	227620	227629	20 %	0 %	40 %	40 %	430759568
147	NC_019902	GTCAC	2	10	228372	228381	20 %	20 %	20 %	40 %	430759568
148	NC_019902	TGGTC	2	10	230589	230598	0 %	40 %	40 %	20 %	430759570
149	NC_019902	CCTGG	2	10	230980	230989	0 %	20 %	40 %	40 %	430759570
150	NC_019902	GGCCG	2	10	231726	231735	0 %	0 %	60 %	40 %	430759571
151	NC_019902	GCCGA	2	10	232116	232125	20 %	0 %	40 %	40 %	430759571
152	NC_019902	ACCGC	2	10	233773	233782	20 %	0 %	20 %	60 %	430759573
153	NC_019902	CAGGG	2	10	234708	234717	20 %	0 %	60 %	20 %	430759573
154	NC_019902	CCGAT	2	10	239035	239044	20 %	20 %	20 %	40 %	430759577
155	NC_019902	CGGTC	2	10	241286	241295	0 %	20 %	40 %	40 %	430759579
156	NC_019902	GCAGG	2	10	242374	242383	20 %	0 %	60 %	20 %	430759580
157	NC_019902	CTGTG	2	10	242687	242696	0 %	40 %	40 %	20 %	430759581
158	NC_019902	GCCGA	2	10	243780	243789	20 %	0 %	40 %	40 %	430759583
159	NC_019902	TCCAG	2	10	244054	244063	20 %	20 %	20 %	40 %	430759583
160	NC_019902	TGGCT	2	10	244927	244936	0 %	40 %	40 %	20 %	430759583
161	NC_019902	CCGCA	2	10	245117	245126	20 %	0 %	20 %	60 %	430759584
162	NC_019902	TGCGC	2	10	245386	245395	0 %	20 %	40 %	40 %	430759584
163	NC_019902	GCAGC	2	10	245488	245497	20 %	0 %	40 %	40 %	430759584
164	NC_019902	GCGCG	2	10	245998	246007	0 %	0 %	60 %	40 %	430759584
165	NC_019902	GCGAG	2	10	246309	246318	20 %	0 %	60 %	20 %	430759585
166	NC_019902	CGGCC	2	10	247700	247709	0 %	0 %	40 %	60 %	430759586
167	NC_019902	CCTGC	2	10	249495	249504	0 %	20 %	20 %	60 %	430759588
168	NC_019902	ACCGG	2	10	251718	251727	20 %	0 %	40 %	40 %	430759590
169	NC_019902	GATGC	2	10	255700	255709	20 %	20 %	40 %	20 %	430759594
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172	NC_019902	TGGGC	2	10	258600	258609	0 %	20 %	60 %	20 %	430759596
173	NC_019902	TTGCG	2	10	258869	258878	0 %	40 %	40 %	20 %	430759596
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175	NC_019902	CTGCG	2	10	260117	260126	0 %	20 %	40 %	40 %	430759598
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177	NC_019902	GGCGG	2	10	261953	261962	0 %	0 %	80 %	20 %	430759600
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181	NC_019902	AAGCG	2	10	267322	267331	40 %	0 %	40 %	20 %	430759606
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186	NC_019902	GCAGC	2	10	275815	275824	20 %	0 %	40 %	40 %	430759612
187	NC_019902	ACTCG	2	10	277342	277351	20 %	20 %	20 %	40 %	430759612
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198	NC_019902	GGATC	2	10	294683	294692	20 %	20 %	40 %	20 %	430759635
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206	NC_019902	GCGCA	2	10	307227	307236	20 %	0 %	40 %	40 %	430759649
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246	NC_019902	GTCGG	2	10	391337	391346	0 %	20 %	60 %	20 %	430759737
247	NC_019902	AGATC	2	10	393033	393042	40 %	20 %	20 %	20 %	430759738
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249	NC_019902	GGTAG	2	10	395016	395025	20 %	20 %	60 %	0 %	430759741
250	NC_019902	TCGCC	2	10	396719	396728	0 %	20 %	20 %	60 %	430759742
251	NC_019902	CGTGC	2	10	399598	399607	0 %	20 %	40 %	40 %	430759745
252	NC_019902	ACGCC	2	10	402819	402828	20 %	0 %	20 %	60 %	430759748
253	NC_019902	GCAGC	2	10	402988	402997	20 %	0 %	40 %	40 %	430759748
254	NC_019902	CGGGC	2	10	406230	406239	0 %	0 %	60 %	40 %	430759750
255	NC_019902	CGCGG	2	10	408969	408978	0 %	0 %	60 %	40 %	430759752
256	NC_019902	CTGGC	2	10	409828	409837	0 %	20 %	40 %	40 %	430759754
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258	NC_019902	CGACC	2	10	412413	412422	20 %	0 %	20 %	60 %	430759757
259	NC_019902	CACGA	2	10	415539	415548	40 %	0 %	20 %	40 %	430759761
260	NC_019902	CGCTG	2	10	418011	418020	0 %	20 %	40 %	40 %	430759765
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262	NC_019902	CGGCT	2	10	419898	419907	0 %	20 %	40 %	40 %	430759767
263	NC_019902	GCCGC	2	10	423330	423339	0 %	0 %	40 %	60 %	430759768
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295	NC_019902	AGGGG	2	10	464801	464810	20 %	0 %	80 %	0 %	430759810
296	NC_019902	CGCTG	2	10	465259	465268	0 %	20 %	40 %	40 %	430759811
297	NC_019902	TGCGC	2	10	465298	465307	0 %	20 %	40 %	40 %	430759811
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