MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 10761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019902	ACCT	2	8	364	371	25 %	25 %	0 %	50 %	430759340
2	NC_019902	CGTG	2	8	600	607	0 %	25 %	50 %	25 %	430759340
3	NC_019902	CTGC	2	8	1285	1292	0 %	25 %	25 %	50 %	430759340
4	NC_019902	CATC	2	8	1858	1865	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019902	GATG	2	8	1909	1916	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019902	GATC	2	8	2334	2341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019902	TGGG	2	8	2701	2708	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019902	GATT	2	8	2767	2774	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019902	CGAA	2	8	2780	2787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019902	GCCT	2	8	3217	3224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019902	ATCG	2	8	3374	3381	25 %	25 %	25 %	25 %	430759341
12	NC_019902	CGAC	2	8	3550	3557	25 %	0 %	25 %	50 %	430759341
13	NC_019902	GCCG	2	8	4113	4120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019902	CGGC	2	8	4279	4286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019902	GCCC	2	8	5075	5082	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_019902	CGGC	2	8	5083	5090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019902	AGGT	2	8	6184	6191	25 %	25 %	50 %	0 %	430759344
18	NC_019902	GCCG	2	8	6374	6381	0 %	0 %	50 %	50 %	430759344
19	NC_019902	ATCG	2	8	6483	6490	25 %	25 %	25 %	25 %	430759344
20	NC_019902	TCCG	2	8	6588	6595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019902	GATC	2	8	6731	6738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019902	AGGG	2	8	6964	6971	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019902	GCAG	2	8	7463	7470	25 %	0 %	50 %	25 %	430759345
24	NC_019902	CATC	2	8	8086	8093	25 %	25 %	0 %	50 %	430759347
25	NC_019902	CATC	2	8	8132	8139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019902	AGGC	2	8	8411	8418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019902	GAGC	2	8	8512	8519	25 %	0 %	50 %	25 %	430759349
28	NC_019902	AACC	2	8	8796	8803	50 %	0 %	0 %	50 %	430759349
29	NC_019902	CCAG	2	8	8977	8984	25 %	0 %	25 %	50 %	430759349
30	NC_019902	GCGG	2	8	9008	9015	0 %	0 %	75 %	25 %	430759349
31	NC_019902	AGGA	2	8	10134	10141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019902	GGTG	2	8	10148	10155	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019902	AGGT	2	8	10724	10731	25 %	25 %	50 %	0 %	430759350
34	NC_019902	GGCC	2	8	10943	10950	0 %	0 %	50 %	50 %	430759351
35	NC_019902	GCAC	2	8	11064	11071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019902	GCGA	2	8	11249	11256	25 %	0 %	50 %	25 %	430759352
37	NC_019902	CAGC	2	8	11364	11371	25 %	0 %	25 %	50 %	430759352
38	NC_019902	GCGT	2	8	11611	11618	0 %	25 %	50 %	25 %	430759352
39	NC_019902	GCCA	2	8	12212	12219	25 %	0 %	25 %	50 %	430759352
40	NC_019902	GGTC	2	8	12234	12241	0 %	25 %	50 %	25 %	430759352
41	NC_019902	CGCC	2	8	12394	12401	0 %	0 %	25 %	75 %	430759352
42	NC_019902	GCAA	2	8	13309	13316	50 %	0 %	25 %	25 %	430759353
43	NC_019902	GGCG	2	8	13697	13704	0 %	0 %	75 %	25 %	430759354
44	NC_019902	AGTC	2	8	14088	14095	25 %	25 %	25 %	25 %	430759355
45	NC_019902	CTGG	2	8	14253	14260	0 %	25 %	50 %	25 %	430759355
46	NC_019902	AGCC	2	8	15060	15067	25 %	0 %	25 %	50 %	430759357
47	NC_019902	CGAG	2	8	15075	15082	25 %	0 %	50 %	25 %	430759357
48	NC_019902	GTCG	2	8	15296	15303	0 %	25 %	50 %	25 %	430759357
49	NC_019902	CCCA	2	8	15570	15577	25 %	0 %	0 %	75 %	430759358
50	NC_019902	GCAG	2	8	15647	15654	25 %	0 %	50 %	25 %	430759358
51	NC_019902	CGAT	2	8	16000	16007	25 %	25 %	25 %	25 %	430759358
52	NC_019902	CCAG	2	8	17402	17409	25 %	0 %	25 %	50 %	430759360
53	NC_019902	TGGC	2	8	18125	18132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019902	CGAG	2	8	18882	18889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019902	CGCA	2	8	19342	19349	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019902	GGTC	2	8	20404	20411	0 %	25 %	50 %	25 %	430759367
57	NC_019902	TCGC	2	8	20474	20481	0 %	25 %	25 %	50 %	430759367
58	NC_019902	AGGC	2	8	20798	20805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019902	GGTG	2	8	20943	20950	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019902	GTGG	2	8	20974	20981	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019902	GGCG	2	8	21000	21007	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019902	GCAT	2	8	21488	21495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019902	GCTT	2	8	21758	21765	0 %	50 %	25 %	25 %	430759368
64	NC_019902	GGTT	2	8	22578	22585	0 %	50 %	50 %	0 %	430759370
65	NC_019902	CGCA	2	8	22733	22740	25 %	0 %	25 %	50 %	430759370
66	NC_019902	CGGG	2	8	22931	22938	0 %	0 %	75 %	25 %	430759371
67	NC_019902	CCGG	2	8	22964	22971	0 %	0 %	50 %	50 %	430759371
68	NC_019902	CCAA	2	8	23158	23165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019902	AGGC	2	8	23571	23578	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019902	GTGG	2	8	23746	23753	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019902	CAGG	2	8	23770	23777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019902	CGGC	2	8	24650	24657	0 %	0 %	50 %	50 %	430759374
73	NC_019902	GGCC	2	8	24784	24791	0 %	0 %	50 %	50 %	430759374
74	NC_019902	GATC	2	8	24925	24932	25 %	25 %	25 %	25 %	430759375
75	NC_019902	TGCA	2	8	25575	25582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019902	ATCC	2	8	26184	26191	25 %	25 %	0 %	50 %	430759377
77	NC_019902	CCGT	2	8	26515	26522	0 %	25 %	25 %	50 %	430759378
78	NC_019902	GCCC	2	8	26887	26894	0 %	0 %	25 %	75 %	430759379
79	NC_019902	GTCC	2	8	26945	26952	0 %	25 %	25 %	50 %	430759379
80	NC_019902	GCCG	2	8	27017	27024	0 %	0 %	50 %	50 %	430759379
81	NC_019902	GCCC	2	8	27129	27136	0 %	0 %	25 %	75 %	430759379
82	NC_019902	TGGT	2	8	27334	27341	0 %	50 %	50 %	0 %	430759379
83	NC_019902	CAGC	2	8	27363	27370	25 %	0 %	25 %	50 %	430759379
84	NC_019902	CGAA	2	8	27930	27937	50 %	0 %	25 %	25 %	430759380
85	NC_019902	GGTC	2	8	27963	27970	0 %	25 %	50 %	25 %	430759380
86	NC_019902	TCGA	2	8	28494	28501	25 %	25 %	25 %	25 %	430759380
87	NC_019902	ACGC	2	8	29035	29042	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019902	ACCG	2	8	29835	29842	25 %	0 %	25 %	50 %	430759381
89	NC_019902	CGCC	2	8	30232	30239	0 %	0 %	25 %	75 %	430759382
90	NC_019902	CGTT	2	8	30922	30929	0 %	50 %	25 %	25 %	430759382
91	NC_019902	GGCT	2	8	31856	31863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019902	TTCC	2	8	32012	32019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019902	GGCT	2	8	32758	32765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019902	ACTG	2	8	32840	32847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019902	ATTC	2	8	33081	33088	25 %	50 %	0 %	25 %	430759384
96	NC_019902	GACA	2	8	33286	33293	50 %	0 %	25 %	25 %	430759384
97	NC_019902	GTTG	2	8	33696	33703	0 %	50 %	50 %	0 %	430759384
98	NC_019902	CGAT	2	8	33957	33964	25 %	25 %	25 %	25 %	430759384
99	NC_019902	GTGG	2	8	34045	34052	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019902	CGGT	2	8	34196	34203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019902	GTAC	2	8	34238	34245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019902	GAAC	2	8	35056	35063	50 %	0 %	25 %	25 %	430759385
103	NC_019902	GCCG	2	8	35798	35805	0 %	0 %	50 %	50 %	430759386
104	NC_019902	AGGT	2	8	35812	35819	25 %	25 %	50 %	0 %	430759386
105	NC_019902	ATCG	2	8	36677	36684	25 %	25 %	25 %	25 %	430759387
106	NC_019902	TCGG	2	8	37548	37555	0 %	25 %	50 %	25 %	430759388
107	NC_019902	GCTC	2	8	38112	38119	0 %	25 %	25 %	50 %	430759388
108	NC_019902	CGGT	2	8	38197	38204	0 %	25 %	50 %	25 %	430759388
109	NC_019902	AAGG	2	8	38498	38505	50 %	0 %	50 %	0 %	430759388
110	NC_019902	TTTG	2	8	38631	38638	0 %	75 %	25 %	0 %	430759388
111	NC_019902	GTCG	2	8	39195	39202	0 %	25 %	50 %	25 %	430759389
112	NC_019902	GCGT	2	8	39390	39397	0 %	25 %	50 %	25 %	430759389
113	NC_019902	GATC	2	8	39802	39809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019902	GATC	2	8	39899	39906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019902	GCGA	2	8	40193	40200	25 %	0 %	50 %	25 %	430759390
116	NC_019902	GGGC	2	8	40892	40899	0 %	0 %	75 %	25 %	430759391
117	NC_019902	CCTG	2	8	41084	41091	0 %	25 %	25 %	50 %	430759391
118	NC_019902	GCCA	2	8	41109	41116	25 %	0 %	25 %	50 %	430759391
119	NC_019902	GCGG	2	8	41374	41381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019902	TGAA	2	8	41474	41481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019902	CGGA	2	8	41605	41612	25 %	0 %	50 %	25 %	430759392
122	NC_019902	CGGC	2	8	41733	41740	0 %	0 %	50 %	50 %	430759393
123	NC_019902	GCGA	2	8	42070	42077	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019902	GGCG	2	8	42433	42440	0 %	0 %	75 %	25 %	430759394
125	NC_019902	CAGC	2	8	42503	42510	25 %	0 %	25 %	50 %	430759394
126	NC_019902	GCCG	2	8	42743	42750	0 %	0 %	50 %	50 %	430759394
127	NC_019902	ATCG	2	8	42809	42816	25 %	25 %	25 %	25 %	430759394
128	NC_019902	GCGA	2	8	42864	42871	25 %	0 %	50 %	25 %	430759394
129	NC_019902	AGCC	2	8	43218	43225	25 %	0 %	25 %	50 %	430759394
130	NC_019902	GGCC	2	8	43324	43331	0 %	0 %	50 %	50 %	430759394
131	NC_019902	CCAG	2	8	43717	43724	25 %	0 %	25 %	50 %	430759394
132	NC_019902	TCGC	2	8	44299	44306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019902	GTCG	2	8	44367	44374	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019902	AGGG	2	8	44439	44446	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019902	GCCG	2	8	45013	45020	0 %	0 %	50 %	50 %	430759395
136	NC_019902	CGGG	2	8	45575	45582	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019902	GGGC	2	8	45631	45638	0 %	0 %	75 %	25 %	430759396
138	NC_019902	CGAC	2	8	45848	45855	25 %	0 %	25 %	50 %	430759396
139	NC_019902	CCGC	2	8	45969	45976	0 %	0 %	25 %	75 %	430759397
140	NC_019902	GCCA	2	8	46066	46073	25 %	0 %	25 %	50 %	430759397
141	NC_019902	GGGC	2	8	46125	46132	0 %	0 %	75 %	25 %	430759397
142	NC_019902	CGAG	2	8	46927	46934	25 %	0 %	50 %	25 %	430759398
143	NC_019902	AAGG	2	8	46972	46979	50 %	0 %	50 %	0 %	430759398
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145	NC_019902	GTGC	2	8	47473	47480	0 %	25 %	50 %	25 %	430759399
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